Cílem projektu je vyvinutí molekulární surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice, zhodnocení účinnosti aktuální vakcinační strategie a doporučení její aktualizace. Vytčené cíle budou dosaženy těmito postupy: sběr kmenů S. pneumoniae izolovaných od nemocných s invazivním pneumokokovým onemocněním v období 2017-2020; implementace molekulární identifikace a typizace (mPCR, rt-PCR) S. pneumoniae přímo z klinických vzorků u pacientů kultivačně negativních; molekulární charakterizace MLST (multilokusová sekvenační typizace), MLVA (multilokusová analýza tandemových repetic) a WGS (sekvenace celého genomu) vybraných kmenů S. pneumoniae izolovaných od nemocných s invazivním pneumokokovým onemocněním v období 2007-2020; analýza molekulárních charakteristik S. pneumoniae izolovaných od nemocných s invazivním pneumokokovým onemocněním v období před a po zavedení pneumokokové konjugované vakcíny do očkovacího schématu malých dětí; zhodnocení účinnosti aktuální vakcinační strategie a doporučení její aktualizace.; The aim is the development of molecular surveillance of invasive pneumococcal disease in the Czech Republic, the assessment of current vaccination strategy effectiveness and recommendations for strategy updating. The following steps will be used: collection of S. pneumoniae strains isolated from patients with invasive pneumococcal disease in the period from 2017-2020; implementation of molecular typing (mPCR, rt-PCR) of S. pneumoniae directly from clinical specimens of culture-negative patients; molecular characterization by MLST (Multi Locus Sequence Typing), MLVA (Multi Locus Variable Analysis), WGS (Whole Genome Sequencing) of selected S. pneumoniae strains isolated from patients with invasive pneumococcal disease in the period 2007-2020; analysis of molecular characteristics of S. pneumoniae strains isolated from patients with invasive pneumococcal disease in the periods before and after introduction of pneumococcal conjugated vaccine into the immunization programme for young children; assessment of current vaccination strategy effectiveness and recommendations for its updating.

Molecular surveillance of invasive pneumococcal disease in the Czech Republic, assessment of vaccination strategy and recommendation for update

Doba řešení: 2017-2021

Obsahuje literaturu