-
Something wrong with this record ?
Průkaz specifické DNA Borrelia burgdorferi v moči pacientů s lymeskou boréliózou
[Determination of specific DNA of Borrelia burgdorferi in urine of patients with Lyme borreliosis (LB)]
Lenka Moravcová, Š. Lásiková, D. Pícha
Language Czech Country Czech Republic
Grant support
NI6244
MZ0
CEP Register
Digital library NLK
Full text - Část
Source
- MeSH
- Borrelia burgdorferi MeSH
- DNA, Bacterial urine MeSH
- False Negative Reactions MeSH
- Research Support as Topic MeSH
- Humans MeSH
- Lyme Disease diagnosis urine MeSH
- Polymerase Chain Reaction methods standards MeSH
- Reference Standards MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
Cíl práce: Sestavení a ověření postupu PCR na průkaz Borrelia burgdorferi v moči pacientů s lymeskou boréliózou (LB). Metodika: Na izolaci DNA z moče byla použita suspenze pryskyřice Chelex 100. PCR probíhala jako dvoustupňová amplifikace („nested" PCR). Byly použity dvě sady primerů : pro plazmidový gen kódující Osp C protein a pro chromozomální gen kódující 16S rDNA. Možná přítomnost inhibitorů způsobující falešně negativní výsledky byla kontrolována přidáním lidské DNA do reakční směsi a koamplifikací s lidskými genomickými primery. Výsledky: Z 28 vyšetřovaných pacientů byla DNA prokázána u 20 (11 x u neuroboréliózy, 3 x u lymeské arthritidy, 6 x u pacientů suspektních z LB). Nejvíce pozitivních výsledků bylo dosaženo pro OspC systém (17/20, 85 %), dále pro 16S rDNA systém (7/20, 35 %). Amplifikace s oběma sadami primerů se podařila pouze u 4 pacientů (4/20, 20 %)Závěr: Touto prací jsme ověřili možnost průkazu DNA Borrelia burgdorferi v moči. Současně se nám potvrdil poznatek pozorovaný i jinými autory, že při DNA diagnostice spirochéty je nutno paralelně užít nejméně dva PCR systémy.
Objective: Elaboration and verification of a PCR procedure for the detection of Borrelia burgdorferi in the urine of patients with Lyme borreliosis (LB). Methods: A suspension of the resin Chelex 100 was used for the isolation of DNA from urine. The PCR was designed as a two-step amplification („nested" PCR). Two sets of primers were used: one for the plasmid gene coding Osp C protein, and the other for chromosonal gene coding 16,168 n rDNNA. A possible presence of inhibitors causing false negative results was controlled by adding human DNA to the reaction and by co-amplification with human genome primers. Results: Of the 28 patients examined DNA was detected in 20 of them: 1 Ix in neuroborreliosis, 3x in Lyme arthritis, 6x in patients suspected of LB. Most of the positive results were obtained with the Osp C System (17/20, 85 %), followed by the 16S rDNA system (7/20, 35 %). Amplification with both sets of primers was successful in 4 patients only (4/20, 20 %). Conclclusion: The feasibility of detecting DNA of B. burgdorferi in urine was verified. Further, it was confirmed, that in the DNA diagnostics of spircpchetes at least two PCR systems must be used concurrently, a finding observed by other authors as well.
Determination of specific DNA of Borrelia burgdorferi in urine of patients with Lyme borreliosis (LB)
Průkaz specifické DNA Borrelia burgdorferi v moči pacientů s lymeskou boréliózou = Determination of specific DNA of Borrelia burgdorferi in urine of patients with Lyme borreliosis (LB) /
Determination of specific DNA of Borrelia burgdorferi in urine of patients with Lyme borreliosis (LB) /
Lit: 16
Bibliography, etc.Souhrn: eng
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc01001647
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20180219115935.0
- 008
- 010100s2000 xr u cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Moravcová, Lenka $4 aut
- 245 10
- $a Průkaz specifické DNA Borrelia burgdorferi v moči pacientů s lymeskou boréliózou = $b Determination of specific DNA of Borrelia burgdorferi in urine of patients with Lyme borreliosis (LB) / $c Lenka Moravcová, Š. Lásiková, D. Pícha
- 246 11
- $a Determination of specific DNA of Borrelia burgdorferi in urine of patients with Lyme borreliosis (LB)
- 314 __
- $a 2. LF, 1. infekční klinika FN Bulovka, Praha 8, CZ
- 504 __
- $a Lit: 16
- 504 __
- $a Souhrn: eng
- 520 3_
- $a Cíl práce: Sestavení a ověření postupu PCR na průkaz Borrelia burgdorferi v moči pacientů s lymeskou boréliózou (LB). Metodika: Na izolaci DNA z moče byla použita suspenze pryskyřice Chelex 100. PCR probíhala jako dvoustupňová amplifikace („nested" PCR). Byly použity dvě sady primerů : pro plazmidový gen kódující Osp C protein a pro chromozomální gen kódující 16S rDNA. Možná přítomnost inhibitorů způsobující falešně negativní výsledky byla kontrolována přidáním lidské DNA do reakční směsi a koamplifikací s lidskými genomickými primery. Výsledky: Z 28 vyšetřovaných pacientů byla DNA prokázána u 20 (11 x u neuroboréliózy, 3 x u lymeské arthritidy, 6 x u pacientů suspektních z LB). Nejvíce pozitivních výsledků bylo dosaženo pro OspC systém (17/20, 85 %), dále pro 16S rDNA systém (7/20, 35 %). Amplifikace s oběma sadami primerů se podařila pouze u 4 pacientů (4/20, 20 %)Závěr: Touto prací jsme ověřili možnost průkazu DNA Borrelia burgdorferi v moči. Současně se nám potvrdil poznatek pozorovaný i jinými autory, že při DNA diagnostice spirochéty je nutno paralelně užít nejméně dva PCR systémy.
- 520 9_
- $a Objective: Elaboration and verification of a PCR procedure for the detection of Borrelia burgdorferi in the urine of patients with Lyme borreliosis (LB). Methods: A suspension of the resin Chelex 100 was used for the isolation of DNA from urine. The PCR was designed as a two-step amplification („nested" PCR). Two sets of primers were used: one for the plasmid gene coding Osp C protein, and the other for chromosonal gene coding 16,168 n rDNNA. A possible presence of inhibitors causing false negative results was controlled by adding human DNA to the reaction and by co-amplification with human genome primers. Results: Of the 28 patients examined DNA was detected in 20 of them: 1 Ix in neuroborreliosis, 3x in Lyme arthritis, 6x in patients suspected of LB. Most of the positive results were obtained with the Osp C System (17/20, 85 %), followed by the 16S rDNA system (7/20, 35 %). Amplification with both sets of primers was successful in 4 patients only (4/20, 20 %). Conclclusion: The feasibility of detecting DNA of B. burgdorferi in urine was verified. Further, it was confirmed, that in the DNA diagnostics of spircpchetes at least two PCR systems must be used concurrently, a finding observed by other authors as well.
- 650 _2
- $a Borrelia burgdorferi $7 D025065
- 650 _2
- $a lymeská nemoc $x DIAGNÓZA $x MOČ $7 D008193
- 650 _2
- $a DNA bakterií $x MOČ $7 D004269
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $x METODY $x NORMY $7 D016133
- 650 _2
- $a referenční standardy $7 D012015
- 650 _2
- $a falešně negativní reakce $7 D005188
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a finanční podpora výzkumu jako téma $7 D012109
- 700 1_
- $a Lásiková, Šárka $4 aut $7 xx0074078
- 700 1_
- $a Pícha, Dušan, $d 1957- $4 aut $7 skuk0004583
- 700 1_
- $a Žďárský, E. $4 aut
- 773 0_
- $w MED00011029 $t Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $g Roč. 6, č. 7 (2000), s. 221-224 $x 1211-264X
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1913 $c 339b $y 0 $z 0
- 990 __
- $a 20010310 $b ABA008
- 991 __
- $a 20180219120254 $b ABA008
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2000 $b Roč. 6 $c č. 7 $d s. 221-224 $i 1211-264X $m Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $x MED00011029
- GRA __
- $a NI6244 $p MZ0
- LZP __
- $b přidání abstraktu