-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Kvantifikace HBV DNA metodou real-time PCR na přístrojích LightCycler a Rotorgene
[Quantitation of hepatitis B virus DNA by real-time detection PCR on LightCycler instrument and on Rotorgene instrument]
Kateřina Hrochová, L. Plíšková, B. Friedecký
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu přehledy
- MeSH
- DNA viry imunologie MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody přístrojové vybavení využití MeSH
- techniky in vitro MeSH
- virus hepatitidy B imunologie MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Cíl: Zavedení, charakterizace a porovnaní dvou metod kvantitativního stanovení viru hepatitidy B-HBV DNA. Obě metody používají totožného principu měření na bázi reál time PCR. První z nich je prováděna pomocí analytického systému LightCycler Roche Diagnostics a druhá na přístroji Rotorgene Corbett Research. Předmětem porovnávání metod byla linearita a pracovní rozsah stanovení, mez detekce, klinická senzitivita a specifičnost obou metod a jejich diagnostická správnost. Materiál: Oběma metodami bylo simultánně analyzováno 68 sér pacientů s diagnostikovanou chronickou hepatitidou B v různých fázích choroby. Výsledky: Regresní analýzou jsme stanovili hodnotu korelačního koeficientu r= 0,995 (p < 0,0001), potvrzující velmi úzký vztah mezi souborem výsledků získaných oběma metodami. Přesnost měření obou metod nepřekračuje hodnotu CV = 15 %. Obě metody disponují vysokým rozsahem linearity měření v intervalu lO 3-lO 8 kopií HBV DNA/ml. Diagnostická správnost srovnávaných metod byla vyhodnocena ROC analýzou. Pro obě metody byla zjištěna hodnota klinické sensitivity 100 %, klinická specifičnost metody LightCycler činila 96 % ve srovnání s 95 % u metody Rotorgene. Klinická efektivita, vyjádřená hodnotou AUC (plochy pod krivkou) byla 0,995 (LightCycler) respektive 0,994 (Rotorgene). Metoda LightCycler vykázala vyšší hodnotu pozitivního pravděpodobnostního poměru + LR = 26 oproti hodnotě 19,5 u Rotorgenu. Závěr: Uvedené údaje vypovídají o velmi vysoké hodnotě klinické užitečnosti obou metod.
Objective: Introduce, characterize and compare two methods of hepatitis virus B DNA quantification in serum. Both methods are based on real time PCR principle. Two measurement systems, LightCycler Roche and Rotorgene Corbett Research were used. We evaluated and compared their precision, linearity, limit of detection, clinical sensitivity, clinical specificity and diagnostic accuracy. Materials: By use of mentioned methods we analysed 68 sera from patients with diagnosed chronic hepatitis B in different stages of disease. Results: Correlation coefficient 0,995 (p < 0,0001) obtained by linear regression analysis shows excellent relationship between results of evaluated methods. The coefficients of variation for repeatability and reproducibility indicate very good measurement precision and are in all cases lower than 15 %. Linearity of both methods has very broad range lO 3 -lO 8copies of HBV DNA/ml. It means that majority of samples may be analysed without repeating after sample dilution. By use of ROC analysis we determined AUC value 0,995, clinical sensitivity 100 %, specificity 96 % and positive likelihood ratio (+LR) 26,0 for LightCycler, resp. AUC = 0,994, specificity 95 %, +LR = 19,5 for Rotorgene. Conclusion: All analytical and clinical characteristics of introduced methods show their usefulness for diagnosis and treatment of chronic hepatitis B.
Quantitation of hepatitis B virus DNA by real-time detection PCR on LightCycler instrument and on Rotorgene instrument
Kvantifikace HBV DNA metodou real-time PCR na přístrojích LightCycler a Rotorgene = Quantitation of hepatitis B virus DNA by real-time detection PCR on LightCycler instrument and on Rotorgene instrument /
Quantitation of hepatitis B virus DNA by real-time detection PCR on LightCycler instrument and on Rotorgene instrument /
Lit: 14
Bibliografie atd.Souhrn: eng
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc03003504
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20180307103311.0
- 008
- 030200s2002 xr u cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hrochová, Kateřina $4 aut $7 xx0077285
- 245 10
- $a Kvantifikace HBV DNA metodou real-time PCR na přístrojích LightCycler a Rotorgene = $b Quantitation of hepatitis B virus DNA by real-time detection PCR on LightCycler instrument and on Rotorgene instrument / $c Kateřina Hrochová, L. Plíšková, B. Friedecký
- 246 11
- $a Quantitation of hepatitis B virus DNA by real-time detection PCR on LightCycler instrument and on Rotorgene instrument
- 314 __
- $a Ústav klinické biochemie a diagnostiky, FN, Hradec Králové, CZ
- 504 __
- $a Lit: 14
- 504 __
- $a Souhrn: eng
- 520 3_
- $a Cíl: Zavedení, charakterizace a porovnaní dvou metod kvantitativního stanovení viru hepatitidy B-HBV DNA. Obě metody používají totožného principu měření na bázi reál time PCR. První z nich je prováděna pomocí analytického systému LightCycler Roche Diagnostics a druhá na přístroji Rotorgene Corbett Research. Předmětem porovnávání metod byla linearita a pracovní rozsah stanovení, mez detekce, klinická senzitivita a specifičnost obou metod a jejich diagnostická správnost. Materiál: Oběma metodami bylo simultánně analyzováno 68 sér pacientů s diagnostikovanou chronickou hepatitidou B v různých fázích choroby. Výsledky: Regresní analýzou jsme stanovili hodnotu korelačního koeficientu r= 0,995 (p < 0,0001), potvrzující velmi úzký vztah mezi souborem výsledků získaných oběma metodami. Přesnost měření obou metod nepřekračuje hodnotu CV = 15 %. Obě metody disponují vysokým rozsahem linearity měření v intervalu lO 3-lO 8 kopií HBV DNA/ml. Diagnostická správnost srovnávaných metod byla vyhodnocena ROC analýzou. Pro obě metody byla zjištěna hodnota klinické sensitivity 100 %, klinická specifičnost metody LightCycler činila 96 % ve srovnání s 95 % u metody Rotorgene. Klinická efektivita, vyjádřená hodnotou AUC (plochy pod krivkou) byla 0,995 (LightCycler) respektive 0,994 (Rotorgene). Metoda LightCycler vykázala vyšší hodnotu pozitivního pravděpodobnostního poměru + LR = 26 oproti hodnotě 19,5 u Rotorgenu. Závěr: Uvedené údaje vypovídají o velmi vysoké hodnotě klinické užitečnosti obou metod.
- 520 9_
- $a Objective: Introduce, characterize and compare two methods of hepatitis virus B DNA quantification in serum. Both methods are based on real time PCR principle. Two measurement systems, LightCycler Roche and Rotorgene Corbett Research were used. We evaluated and compared their precision, linearity, limit of detection, clinical sensitivity, clinical specificity and diagnostic accuracy. Materials: By use of mentioned methods we analysed 68 sera from patients with diagnosed chronic hepatitis B in different stages of disease. Results: Correlation coefficient 0,995 (p < 0,0001) obtained by linear regression analysis shows excellent relationship between results of evaluated methods. The coefficients of variation for repeatability and reproducibility indicate very good measurement precision and are in all cases lower than 15 %. Linearity of both methods has very broad range lO 3 -lO 8copies of HBV DNA/ml. It means that majority of samples may be analysed without repeating after sample dilution. By use of ROC analysis we determined AUC value 0,995, clinical sensitivity 100 %, specificity 96 % and positive likelihood ratio (+LR) 26,0 for LightCycler, resp. AUC = 0,994, specificity 95 %, +LR = 19,5 for Rotorgene. Conclusion: All analytical and clinical characteristics of introduced methods show their usefulness for diagnosis and treatment of chronic hepatitis B.
- 650 _2
- $a virus hepatitidy B $x IMUNOLOGIE $7 D006515
- 650 _2
- $a DNA viry $x IMUNOLOGIE $7 D004267
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $x METODY $x PŘÍSTROJOVÉ VYBAVENÍ $x VYUŽITÍ $7 D016133
- 650 _2
- $a techniky in vitro $7 D066298
- 655 _2
- $a přehledy $7 D016454
- 700 1_
- $a Plíšková, L. $4 aut
- 700 1_
- $a Friedecký, B. $4 aut
- 700 1_
- $a Palička, Vladimír, $d 1946- $4 aut $7 jn99240000830
- 773 0_
- $w MED00011029 $t Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $g Roč. 8, č. 5 (2002), s. 205-209 $x 1211-264X
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1913 $c 339b $y 0 $z 0
- 990 __
- $a 20030304 $b ABA008
- 991 __
- $a 20180307103312 $b ABA008
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2002 $b Roč. 8 $c č. 5 $d s. 205-209 $i 1211-264X $m Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $x MED00011029
- LZP __
- $b přidání abstraktu