Epigenetické změny vyšetřované u nemalobuněčného karcinomu plic představují především metylace tumor-supresorových genů a modifikace histonů. Tyto změny mohou mít diagnostický i prognostický význam. Metodika a pacienti: Autoři na základě literární rešerše vyšetřovali hypermetylace genů CHFR, CDH13, RARB, APC, RASSF1A, CDKN2A(p16) a MGMT, které nejčastěji vykazují epigenetickou změnu u plicních tumorů. Metylační status byl analyzován v cytologických preparátech vzorků získaných při bronchoskopickém vyšetření metodikou MLPA. Vyšetřeny byly vzorky od pacientů s ověřenou diagnózou nemalobuněčného karcinomu plic. Sledovány byly vztahy mezi přítomností metylací na uvedených genech a pohlavím, typy a stadii nádorů a kuřáckým statusem. Ke statistickému zhodnocení byly použity kontingenční tabulky, χ2 test, Wilcoxonův nepárový test a Kruskal-Wallisův test. Výsledky: Do studie bylo zařazeno 154 nemocných s diagnózou NSCLC III. - IV. stadia, kteří byli indikováni k systémové léčbě, nebo k léčbě biologické. Závěr: Autoři prokázali dobrou výtěžnost a reprodukovatelnost metody MLPA při vyšetřování metylačního statusu některých tumor supresorových genů. Prokázali i významné rozdíly v metylačním stavu těchto genů v závislosti na pohlaví nemocných, morfologických typech nádorů a na kuřáckém statusu pacientů.

Epigenetic changes in non-small cell lung carcinoma (NSCLC) are mainly tumor suppressor gene methylation and histone modification. These changes may have both diagnostic and prognostic value. Methods and patients: Based on a literature search, the authors studied hypermethylation of the CHFR, CDH13, RARE, APC, RASSFIA, CDKN2A(pl6) and MGMT genes, most frequently showing changes in lung cancer. Methylation status was analyzed in cytological preparations of samples obtained by bronchoscopy using the MLPA method. The studied samples were from patients with a confirmed diagnosis of NSCLC. Relations between the presence of methylation on the above genes and sex, cancer type and stage and smoking status were studied. Statistical analysis was performed using contingency tables, chi-square test, Wilcoxon test and Kruskal-Wallis analysis. Results: The study comprised 154 patients diagnosed with stage III-W NSCLC indicated for systemic or biological therapy. Conclusion: The authors showed good yield and reproducibility of the MLPA method for assessing the methylation status of some tumor suppressor genes. They also revealed significant differences in the methylation status of these genes depending on the patients' sex, morphological types of tumors and smoking status.

Centrum aplikované genomiky solidních nádorů Genomac International Praha

Methylation analysis in NSCLC: Frequency of gene-specific hypermethylation depending on the histological type of carcinoma and smoking status

Lit.: 18