Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Stochastic models for low level DNA mixtures [Stochastické modely pro smesné vzorky s nízkým obsahem DNA]

Dalibor Slovák, Jana Zvárová

. 2012 ; 8 (5) : 25-30.

Jazyk angličtina, čeština Země Česko Médium elektronický zdroj

Typ dokumentu práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc13000367

Cíle: Rostoucí citlivost metod forenzní analýzy umožnuje vyšetrit stále menší množství biologických stop. U vzorku nízké kvality ci kvantity dochází ke stochastickým jevum, které si vyžadují nárocnejší statistickou analýzu. Metody: Existuje nekolik modelu, jež pocítají pravdepodobnost daného souboru alel. Popsali jsme zde tri z nich, porovnali je a overili jejich správnost. Výsledky: Oba modely navržené v [1] rozširují dosud nejpoužívanejší model o možnost zahrnutí dropoutu a velikostí hrotu jednotlivých alel. První z nich je chybný, naopak druhý model velmi dobre rozširuje možnosti analýzy DNA smesí. Záver: Ukázali jsme chybnost jednoho z nedávno navržených modelu. Druhý model jsme doplnili o možnost stanovení pravdepodobnosti dropoutu, nebot jinak by i tento model nadhodnocoval pocítané pravdepodobnosti.

Objectives: The increasing sensitivity of forensic analysis methods allows to investigate less and less amount of biological samples. For samples of low quality or quantity, there are stochastic events that require intensive statistical analysis. Methods: There are several models how to calculate the probability of a given set of alleles. We have described three of them and compared them to verify their accuracy. Results: The two models proposed in [1] extend so far the most widely used model by the possibility of dropout and peak areas of individual alleles. The first one is incorrect, while the second model highly improves the possibility of DNA mixture analysis. Conclusions: We have shown the inaccuracy of one of the recently proposed models. We have added the possibility of determining the dropout probability into the second model, otherwise this model overestimates the probabilities calculated.

Stochastické modely pro smesné vzorky s nízkým obsahem DNA

Stochastic models for low level DNA mixtures [elektronický zdroj] /

Citace poskytuje Crossref.org

Obsahuje 1 tabulku

Bibliografie atd.

Literatura

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc13000367
003      
CZ-PrNML
005      
20180615084702.0
007      
cr|cn|
008      
130104s2012 xr fd fs 000 0eng||
009      
eAR
024    7_
$a 10.24105/ejbi.2012.08.5.5 $2 doi
040    __
$a ABA008 $d ABA008 $e AACR2 $b cze
041    0_
$a eng $a cze
044    __
$a xr
100    1_
$a Slovák, Dalibor $7 xx0225345 $u EuroMISE Centre, Institute of Computer Science AS CR, Prague, Czech Republic; Institute of Hygiene and Epidemiology, First Faculty of Medicine, Charles University, Prague, Czech Republic
245    10
$a Stochastic models for low level DNA mixtures $h [elektronický zdroj] / $c Dalibor Slovák, Jana Zvárová
246    31
$a Stochastické modely pro smesné vzorky s nízkým obsahem DNA
500    __
$a Obsahuje 1 tabulku
504    __
$a Literatura $b 10
520    3_
$a Cíle: Rostoucí citlivost metod forenzní analýzy umožnuje vyšetrit stále menší množství biologických stop. U vzorku nízké kvality ci kvantity dochází ke stochastickým jevum, které si vyžadují nárocnejší statistickou analýzu. Metody: Existuje nekolik modelu, jež pocítají pravdepodobnost daného souboru alel. Popsali jsme zde tri z nich, porovnali je a overili jejich správnost. Výsledky: Oba modely navržené v [1] rozširují dosud nejpoužívanejší model o možnost zahrnutí dropoutu a velikostí hrotu jednotlivých alel. První z nich je chybný, naopak druhý model velmi dobre rozširuje možnosti analýzy DNA smesí. Záver: Ukázali jsme chybnost jednoho z nedávno navržených modelu. Druhý model jsme doplnili o možnost stanovení pravdepodobnosti dropoutu, nebot jinak by i tento model nadhodnocoval pocítané pravdepodobnosti.
520    9_
$a Objectives: The increasing sensitivity of forensic analysis methods allows to investigate less and less amount of biological samples. For samples of low quality or quantity, there are stochastic events that require intensive statistical analysis. Methods: There are several models how to calculate the probability of a given set of alleles. We have described three of them and compared them to verify their accuracy. Results: The two models proposed in [1] extend so far the most widely used model by the possibility of dropout and peak areas of individual alleles. The first one is incorrect, while the second model highly improves the possibility of DNA mixture analysis. Conclusions: We have shown the inaccuracy of one of the recently proposed models. We have added the possibility of determining the dropout probability into the second model, otherwise this model overestimates the probabilities calculated.
650    _2
$a lidé $7 D006801
650    _2
$a software $7 D012984
650    _2
$a DNA $7 D004247
650    12
$a soudní lékařství $7 D005554
650    _2
$a soudní vědy $x metody $7 D044707
650    _2
$a statistika jako téma $7 D013223
650    12
$a matematika $7 D008433
653    00
$a forenzní interpretace DNA
653    00
$a velikost alelických hrotů
653    00
$a pravděpodobnost dropoutu
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Zvárová, Jana, $d 1943-2017 $7 nlk19990074087 $u EuroMISE Centre, Institute of Computer Science AS CR, Prague, Czech Republic; Institute of Hygiene and Epidemiology, First Faculty of Medicine, Charles University, Prague, Czech Republic
773    0_
$t European journal for biomedical informatics $x 1801-5603 $g Roč. 8, č. 5 (2012), s. 25-30 $w MED00173462
856    41
$u http://www.ejbi.org/img/ejbi/2012/5/Slovak_en.pdf $y plný text volně přístupný
856    41
$u http://www.ejbi.org/img/ejbi/2012/5/Slovak_cs.pdf $y plný text volně přístupný
910    __
$a ABA008 $y 3 $z 0
990    __
$a 20130104083259 $b ABA008
991    __
$a 20180615084918 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 963104 $s 798527
BAS    __
$a 3 $a 4
BMC    __
$a 2012 $b 8 $c 5 $d 25-30 $i 1801-5603 $m European Journal for Biomedical Informatics $n Eur. J. Biomed. Inform. (Praha) $x MED00173462
LZP    __
$c NLK183 $d 20130205 $a NLK 2013-01/vt

Najít záznam

Citační ukazatele

Možnosti archivace