Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Multiplexní dideoxynukleotidové sekvenování s polyadenylovanými sekvenačními primerym
[Multiplex dideoxynucleotide sequencing using polyadenylated sequencing primers]

M. Beránek, M. Drastíková, J. Petera

. 2013 ; 107 (1) : 62-65.

Jazyk čeština Země Česko

Typ dokumentu práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc13016692

Grantová podpora
NT11334 MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

The title method is applied to one of the analyzed amplicons. The new approach is used for identification of C282Y (C), H63D (H), and S65C (S) mutations in the HFE gene. In a group of DNA samples from 40 patients with suspected hereditary hemochromatosis we amplified specific parts of HFE exon 2 (208 bp) and exon 4 (189 bp) by multiplex PCR. Purified amplicons were subsequently used in a multiplex cycle sequencing reaction containing a hyperadenylated reverse primer for exon 2. Adenylation with a 105-nucleotide polyadenylated tail attached to the 5' end of the primer significantly prolonged the migration time of the exon 2 amplicons in the electrophoretic capillary. This enabled us to obtain separated sequencing data for both the studied amplicons. The numbers of identified zygotes and allelic frequencies in the patients are given. We found six subjects with the risk of hereditary hemochromatosis (15 %). The new method is a faster and cheap alternative to dideoxynucleotide sequencing using standard sequencing primers. Hyperadenylation makes it possible to obtain complete information about the presence or absence of C282Y, H63D and S65C mutations in the HFE gene from one-capillary electrophoretic analysis.

Multiplex dideoxynucleotide sequencing using polyadenylated sequencing primers

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc13016692
003      
CZ-PrNML
005      
20240904094202.0
007      
ta
008      
130429s2013 xr a f 000 0cze||
009      
AR
040    __
$a ABA008 $d ABA008 $e AACR2 $b cze
041    0_
$a cze $b eng
044    __
$a xr
100    1_
$a Beránek, Martin, $d 1968- $7 xx0044204 $u Ústav klinické biochemie a diagnostiky, Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice Hradec Králové
245    10
$a Multiplexní dideoxynukleotidové sekvenování s polyadenylovanými sekvenačními primerym / $c M. Beránek, M. Drastíková, J. Petera
246    31
$a Multiplex dideoxynucleotide sequencing using polyadenylated sequencing primers
520    9_
$a The title method is applied to one of the analyzed amplicons. The new approach is used for identification of C282Y (C), H63D (H), and S65C (S) mutations in the HFE gene. In a group of DNA samples from 40 patients with suspected hereditary hemochromatosis we amplified specific parts of HFE exon 2 (208 bp) and exon 4 (189 bp) by multiplex PCR. Purified amplicons were subsequently used in a multiplex cycle sequencing reaction containing a hyperadenylated reverse primer for exon 2. Adenylation with a 105-nucleotide polyadenylated tail attached to the 5' end of the primer significantly prolonged the migration time of the exon 2 amplicons in the electrophoretic capillary. This enabled us to obtain separated sequencing data for both the studied amplicons. The numbers of identified zygotes and allelic frequencies in the patients are given. We found six subjects with the risk of hereditary hemochromatosis (15 %). The new method is a faster and cheap alternative to dideoxynucleotide sequencing using standard sequencing primers. Hyperadenylation makes it possible to obtain complete information about the presence or absence of C282Y, H63D and S65C mutations in the HFE gene from one-capillary electrophoretic analysis.
650    _2
$a proteiny vázající RNA $7 D016601
650    _2
$a 3' nepřekládaná oblast $7 D020413
650    _2
$a mikro RNA $7 D035683
650    _2
$a polyadenylace $7 D026723
650    _2
$a poly(A)-polymerasa $7 D011062
650    12
$a DNA vazebné proteiny $7 D004268
650    _2
$a DNA-polymerasa I $7 D004256
650    _2
$a polynukleotidfosforylasa $7 D011117
650    12
$a 5' nepřekládaná oblast $7 D020121
650    12
$a sekvenční analýza DNA $7 D017422
650    12
$a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
650    12
$a techniky amplifikace nukleových kyselin $7 D021141
650    12
$a elektroforéza v agarovém gelu $7 D004587
650    12
$a mutační analýza DNA $7 D004252
650    12
$a hemochromatóza $x diagnóza $x epidemiologie $x prevence a kontrola $7 D006432
650    _2
$a genetické nemoci vrozené $x diagnóza $7 D030342
650    _2
$a lidé $7 D006801
651    _2
$a Česká republika $7 D018153
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Drastíková, Monika $7 xx0321911 $u Ústav klinické biochemie a diagnostiky, Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice Hradec Králové
700    1_
$a Petera, Jiří, $d 1959- $7 xx0000229 $u Onkologická klinika, Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice Hradec Králové
773    0_
$t Chemické listy $x 0009-2770 $g Roč. 107, č. 1 (2013), s. 62-65 $w MED00011010
856    41
$u http://www.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/790/790 $y domovská stránka časopisu - plný text volně přístupný
910    __
$a ABA008 $b B 1918 $c 395 $y 3 $z 0
990    __
$a 20130429082755 $b ABA008
991    __
$a 20240904094158 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 979987 $s 815019
BAS    __
$a 3
BMC    __
$a 2013 $b 107 $c 1 $i 0009-2770 $m Chemické listy $n Chem. Listy $x MED00011010 $d 62-65
GRA    __
$a NT11334 $p MZ0
LZP    __
$c NLK137 $d 20130529 $a NLK 2013-23/vt

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat ...

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...