-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Multiplexní dideoxynukleotidové sekvenování s polyadenylovanými sekvenačními primerym
[Multiplex dideoxynucleotide sequencing using polyadenylated sequencing primers]
M. Beránek, M. Drastíková, J. Petera
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
Grantová podpora
NT11334
MZ0
CEP - Centrální evidence projektů
Digitální knihovna NLK
Plný text - Část
Zdroj
NLK
ROAD: Directory of Open Access Scholarly Resources
od 1997
- MeSH
- 3' nepřekládaná oblast MeSH
- 5' nepřekládaná oblast * MeSH
- DNA vazebné proteiny * MeSH
- DNA-polymerasa I MeSH
- elektroforéza v agarovém gelu * MeSH
- genetické nemoci vrozené diagnóza MeSH
- hemochromatóza * diagnóza epidemiologie prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA MeSH
- mutační analýza DNA * MeSH
- poly(A)-polymerasa MeSH
- polyadenylace MeSH
- polymerázová řetězová reakce * MeSH
- polynukleotidfosforylasa MeSH
- proteiny vázající RNA MeSH
- sekvenční analýza DNA * MeSH
- techniky amplifikace nukleových kyselin * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
The title method is applied to one of the analyzed amplicons. The new approach is used for identification of C282Y (C), H63D (H), and S65C (S) mutations in the HFE gene. In a group of DNA samples from 40 patients with suspected hereditary hemochromatosis we amplified specific parts of HFE exon 2 (208 bp) and exon 4 (189 bp) by multiplex PCR. Purified amplicons were subsequently used in a multiplex cycle sequencing reaction containing a hyperadenylated reverse primer for exon 2. Adenylation with a 105-nucleotide polyadenylated tail attached to the 5' end of the primer significantly prolonged the migration time of the exon 2 amplicons in the electrophoretic capillary. This enabled us to obtain separated sequencing data for both the studied amplicons. The numbers of identified zygotes and allelic frequencies in the patients are given. We found six subjects with the risk of hereditary hemochromatosis (15 %). The new method is a faster and cheap alternative to dideoxynucleotide sequencing using standard sequencing primers. Hyperadenylation makes it possible to obtain complete information about the presence or absence of C282Y, H63D and S65C mutations in the HFE gene from one-capillary electrophoretic analysis.
Multiplex dideoxynucleotide sequencing using polyadenylated sequencing primers
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc13016692
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20240904094202.0
- 007
- ta
- 008
- 130429s2013 xr a f 000 0cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $d ABA008 $e AACR2 $b cze
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Beránek, Martin, $d 1968- $7 xx0044204 $u Ústav klinické biochemie a diagnostiky, Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice Hradec Králové
- 245 10
- $a Multiplexní dideoxynukleotidové sekvenování s polyadenylovanými sekvenačními primerym / $c M. Beránek, M. Drastíková, J. Petera
- 246 31
- $a Multiplex dideoxynucleotide sequencing using polyadenylated sequencing primers
- 520 9_
- $a The title method is applied to one of the analyzed amplicons. The new approach is used for identification of C282Y (C), H63D (H), and S65C (S) mutations in the HFE gene. In a group of DNA samples from 40 patients with suspected hereditary hemochromatosis we amplified specific parts of HFE exon 2 (208 bp) and exon 4 (189 bp) by multiplex PCR. Purified amplicons were subsequently used in a multiplex cycle sequencing reaction containing a hyperadenylated reverse primer for exon 2. Adenylation with a 105-nucleotide polyadenylated tail attached to the 5' end of the primer significantly prolonged the migration time of the exon 2 amplicons in the electrophoretic capillary. This enabled us to obtain separated sequencing data for both the studied amplicons. The numbers of identified zygotes and allelic frequencies in the patients are given. We found six subjects with the risk of hereditary hemochromatosis (15 %). The new method is a faster and cheap alternative to dideoxynucleotide sequencing using standard sequencing primers. Hyperadenylation makes it possible to obtain complete information about the presence or absence of C282Y, H63D and S65C mutations in the HFE gene from one-capillary electrophoretic analysis.
- 650 _2
- $a proteiny vázající RNA $7 D016601
- 650 _2
- $a 3' nepřekládaná oblast $7 D020413
- 650 _2
- $a mikro RNA $7 D035683
- 650 _2
- $a polyadenylace $7 D026723
- 650 _2
- $a poly(A)-polymerasa $7 D011062
- 650 12
- $a DNA vazebné proteiny $7 D004268
- 650 _2
- $a DNA-polymerasa I $7 D004256
- 650 _2
- $a polynukleotidfosforylasa $7 D011117
- 650 12
- $a 5' nepřekládaná oblast $7 D020121
- 650 12
- $a sekvenční analýza DNA $7 D017422
- 650 12
- $a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
- 650 12
- $a techniky amplifikace nukleových kyselin $7 D021141
- 650 12
- $a elektroforéza v agarovém gelu $7 D004587
- 650 12
- $a mutační analýza DNA $7 D004252
- 650 12
- $a hemochromatóza $x diagnóza $x epidemiologie $x prevence a kontrola $7 D006432
- 650 _2
- $a genetické nemoci vrozené $x diagnóza $7 D030342
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 651 _2
- $a Česká republika $7 D018153
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Drastíková, Monika $7 xx0321911 $u Ústav klinické biochemie a diagnostiky, Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice Hradec Králové
- 700 1_
- $a Petera, Jiří, $d 1959- $7 xx0000229 $u Onkologická klinika, Lékařská fakulta Univerzity Karlovy a Fakultní nemocnice Hradec Králové
- 773 0_
- $t Chemické listy $x 0009-2770 $g Roč. 107, č. 1 (2013), s. 62-65 $w MED00011010
- 856 41
- $u http://www.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/790/790 $y domovská stránka časopisu - plný text volně přístupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1918 $c 395 $y 3 $z 0
- 990 __
- $a 20130429082755 $b ABA008
- 991 __
- $a 20240904094158 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 979987 $s 815019
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2013 $b 107 $c 1 $i 0009-2770 $m Chemické listy $n Chem. Listy $x MED00011010 $d 62-65
- GRA __
- $a NT11334 $p MZ0
- LZP __
- $c NLK137 $d 20130529 $a NLK 2013-23/vt