Detail
Článek
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference

L. Grimová, L. Winkowska, P. Ryšánek, P. Svoboda, K. Petrzik,

. 2013 ; 47 (1) : 119-25.

Jazyk angličtina Země Spojené státy americké

Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc14051018

E-zdroje NLK Online Plný text

ProQuest Central od 1997-01-01 do Před 1 rokem
Medline Complete (EBSCOhost) od 2011-02-01 do Před 1 rokem
Health & Medicine (ProQuest) od 1997-01-01 do Před 1 rokem
Public Health Database (ProQuest) od 1997-01-01 do Před 1 rokem

Apple mosaic virus (ApMV) is a widespread ssRNA virus which infects diverse species of Rosales. The phylogenetic analysis of complete capsid protein gene of the largest set of ApMV isolates discriminated two main clusters of isolates: one cluster correlates with Maloideae hosts and Trebouxia lichen algae hosts; a second with hop, Prunus, and other woody tree hosts. No correlation was found between clusters and geographic origin of virus isolates, and positive selection hypothesis in distinct hosts was not confirmed: in all virus populations, purifying selection had occurred. GGT→AAT substitution resulted in Gly→Asn change inside the zinc-finger motif in the capsid protein was revealed specific for discrimination of the clusters and we hypothesise that could influence the host preference.

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc14051018
003      
CZ-PrNML
005      
20140410103840.0
007      
ta
008      
140401s2013 xxu f 000 0|eng||
009      
AR
024    7_
$a 10.1007/s11262-013-0925-z $2 doi
035    __
$a (PubMed)23740269
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng
044    __
$a xxu
100    1_
$a Grimová, L
245    10
$a Reflects the coat protein variability of apple mosaic virus host preference / $c L. Grimová, L. Winkowska, P. Ryšánek, P. Svoboda, K. Petrzik,
520    9_
$a Apple mosaic virus (ApMV) is a widespread ssRNA virus which infects diverse species of Rosales. The phylogenetic analysis of complete capsid protein gene of the largest set of ApMV isolates discriminated two main clusters of isolates: one cluster correlates with Maloideae hosts and Trebouxia lichen algae hosts; a second with hop, Prunus, and other woody tree hosts. No correlation was found between clusters and geographic origin of virus isolates, and positive selection hypothesis in distinct hosts was not confirmed: in all virus populations, purifying selection had occurred. GGT→AAT substitution resulted in Gly→Asn change inside the zinc-finger motif in the capsid protein was revealed specific for discrimination of the clusters and we hypothesise that could influence the host preference.
650    _2
$a sekvence aminokyselin $7 D000595
650    _2
$a virové plášťové proteiny $x genetika $7 D036022
650    12
$a genetická variace $7 D014644
650    12
$a hostitelská specificita $7 D058507
650    _2
$a Ilarvirus $x klasifikace $x genetika $x izolace a purifikace $x fyziologie $7 D019179
650    _2
$a Malus $x virologie $7 D027845
650    _2
$a molekulární sekvence - údaje $7 D008969
650    _2
$a fylogeneze $7 D010802
650    _2
$a nemoci rostlin $x virologie $7 D010935
655    _2
$a časopisecké články $7 D016428
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Winkowska, L $u -
700    1_
$a Ryšánek, P $u -
700    1_
$a Svoboda, P $u -
700    1_
$a Petrzik, K $u -
773    0_
$w MED00004665 $t Virus genes $x 1572-994X $g Roč. 47, č. 1 (2013), s. 119-25
856    41
$u https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23740269 $y Pubmed
910    __
$a ABA008 $b sig $c sign $y a $z 0
990    __
$a 20140401 $b ABA008
991    __
$a 20140410103929 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1018154 $s 849598
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2013 $b 47 $c 1 $d 119-25 $i 1572-994X $m Virus genes $n Virus Genes $x MED00004665
LZP    __
$a Pubmed-20140401

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat...

Možnosti archivace

Nahrávání dat...