• Je něco špatně v tomto záznamu ?

Contribution of PCR Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Combined with Mixed Chromatogram Software Separation for Complex Urinary Sample Analysis

I. Kotásková, B. Mališová, H. Obručová, V. Holá, T. Peroutková, F. Růžička, T. Freiberger,

. 2017 ; 27 (6) : 350-355. [pub] 20171220

Jazyk angličtina Země Švýcarsko

Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc19028661

Grantová podpora
NV16-31593A MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

Complex samples are a challenge for sequencing-based broad-range diagnostics. We analysed 19 urinary catheter, ureteral Double-J catheter, and urine samples using 3 methodological approaches. Out of the total 84 operational taxonomic units, 37, 61, and 88% were identified by culture, PCR-DGGE-SS (PCR denaturing gradient gel electrophoresis followed by Sanger sequencing), and PCR-DGGE-RM (PCR- DGGE combined with software chromatogram separation by RipSeq Mixed tool), respectively. The latter approach was shown to be an efficient tool to complement culture in complex sample assessment.

Citace poskytuje Crossref.org

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc19028661
003      
CZ-PrNML
005      
20190823125521.0
007      
ta
008      
190813s2017 sz f 000 0|eng||
009      
AR
024    7_
$a 10.1159/000484524 $2 doi
035    __
$a (PubMed)29258075
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng
044    __
$a sz
100    1_
$a Kotásková, Iva $u Molecular Genetics Laboratory, Centre for Cardiovascular Surgery and Transplantation, Brno, Czech Republic.
245    10
$a Contribution of PCR Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Combined with Mixed Chromatogram Software Separation for Complex Urinary Sample Analysis / $c I. Kotásková, B. Mališová, H. Obručová, V. Holá, T. Peroutková, F. Růžička, T. Freiberger,
520    9_
$a Complex samples are a challenge for sequencing-based broad-range diagnostics. We analysed 19 urinary catheter, ureteral Double-J catheter, and urine samples using 3 methodological approaches. Out of the total 84 operational taxonomic units, 37, 61, and 88% were identified by culture, PCR-DGGE-SS (PCR denaturing gradient gel electrophoresis followed by Sanger sequencing), and PCR-DGGE-RM (PCR- DGGE combined with software chromatogram separation by RipSeq Mixed tool), respectively. The latter approach was shown to be an efficient tool to complement culture in complex sample assessment.
650    _2
$a Bacteria $x klasifikace $x genetika $x izolace a purifikace $7 D001419
650    _2
$a DNA bakterií $7 D004269
650    _2
$a denaturační gradientová gelová elektroforéza $x metody $7 D058645
650    _2
$a diagnostické techniky urologické $7 D003950
650    _2
$a lidé $7 D006801
650    _2
$a diagnostické techniky molekulární $x metody $7 D025202
650    _2
$a polymerázová řetězová reakce $x metody $7 D016133
650    12
$a software $7 D012984
650    _2
$a močové katétry $x mikrobiologie $7 D062885
650    _2
$a moč $x chemie $x mikrobiologie $7 D014556
655    _2
$a časopisecké články $7 D016428
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Mališová, Barbora
700    1_
$a Obručová, Hana
700    1_
$a Holá, Veronika
700    1_
$a Peroutková, Tereza
700    1_
$a Růžička, Filip
700    1_
$a Freiberger, Tomáš
773    0_
$w MED00008016 $t Journal of molecular microbiology and biotechnology $x 1660-2412 $g Roč. 27, č. 6 (2017), s. 350-355
856    41
$u https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29258075 $y Pubmed
910    __
$a ABA008 $b sig $c sign $y a $z 0
990    __
$a 20190813 $b ABA008
991    __
$a 20190823125735 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1433810 $s 1067121
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2017 $b 27 $c 6 $d 350-355 $e 20171220 $i 1660-2412 $m Journal of molecular microbiology and biotechnology $n J Mol Microbiol Biotechnol $x MED00008016
GRA    __
$a NV16-31593A $p MZ0
LZP    __
$a Pubmed-20190813

Najít záznam

Citační ukazatele

Možnosti archivace