Východiska: Karcinom ovaria, závažné nádorové onemocnění s vysokou mortalitou, je v České republice diagnostikováno každým rokem přibližně u 1 000 žen. Riziko vzniku onemocnění je zvýšeno u nosiček mutací v některých nádorových predispozičních genech. S vysokým relativním rizikem (RR > 5) jsou spojeny mutace v genech BRCA1, BRCA2, BRIP1, geny Lynchova syndromu, RAD51C, RAD51D, STK11; s možným zvýšením rizika mutace v genech ATM, CHEK2, NBN, PALB2, BARD1. Cílem práce bylo určit frekvenci mutací v nádorových predispozičních genech v naší populaci. Metody a výsledky: Celkem 1 057 pacientek s karcinomem ovaria a 617 nenádorových kontrol bylo vyšetřeno pomocí panelového sekvenování nové generace na platformě Illumina. Patogenní mutace ve vysoko rizikových genech, vč. velkých genomových přestaveb, byly v našem souboru zachyceny u 30,6 % pacientek; u neselektovaných pacientek byla frekvence mutací téměř 25 %, u pacientek s negativní rodinnou anamnézou 18 %. Nejčastěji mutovanými predispozičními geny byly BRCA1 a BRCA2, součet frekvence mutací v ostatních ovariálních predispozičních genech odpovídal frekvenci mutací v genu BRCA2. Záchyt mutací u pacientek starších 70 let byl více než třikrát vyšší v porovnání s pacientkami ve věku pod 30 let. Závěr: Karcinom ovaria je heterogenní onemocnění s vysokým podílem dědičné formy onemocnění. Vzhledem k nedostatku adekvátních screeningových modalit pro včasnou diagnostiku onemocnění je identifikace nosiček mutací v ovariálních predispozičních genech klíčová, s vysokým potenciálem k celkovému snížení mortality z důvodu karcinomu ovaria.

Background: Ovarian cancer is a disease with high mortality. Approximately 1,000 women are diagnosed with ovarian cancer in the Czech Republic annually. Women harboring a mutation in cancer-predisposing genes face an increased risk of tumor development. Mutations in BRCA1, BRCA2, BRIP1, and Lynch syndrome genes (RAD51C, RAD51D, and STK11) are associated with a high risk of ovarian cancer, and mutations in ATM, CHEK2, NBN, PALB2, and BARD1 appear to increase the risk. Our aim was to examine the frequency of mutations in cancer-predisposing genes in the Czech Republic. Materials and methods: We analyzed 1,057 individuals including ovarian cancer patients and 617 non-cancer controls using CZECANCA panel next-generation sequencing on the Illumina platform. Pathogenic mutations in high-risk genes, including CNVs, were detected in 30.6% of patients. The mutation frequency reached 25.0% and 18.2% in subgroups of unselected ovarian cancer patients and patients with a negative family cancer history, respectively. The most frequently mutated genes were BRCA1 and BRCA2. The overall frequency of mutations in non-BRCA genes was comparable to that in BRCA2. The mutation frequency in ovarian cancer patients aged > 70 years was three times higher than that in patients diagnosed before the age of 30. Conclusion: Ovarian cancer is a heterogeneous disease with a high proportion of hereditary cases. The lack of efficient screening for early diagnosis emphasizes the importance of identifying carriers of mutations in ovarian cancer-predisposing genes; this is because proper follow-up and prevention strategies can reduce overall ovarian cancer-related mortality.

Centrum lékařské genetiky a reprodukční medicíny GENNET Praha

Gynekologicko porodnická klinika 1 LF UK a Nemocnice Na Bulovce Praha

Oddělení epidemiologie a genetiky nádorů Masarykův onkologický ústav Brno

Oddělení lékařské genetiky Laboratoře AGEL Nový Jičín

Onkologická klinika 1 LF UK a VFN Praha

Radioterapeutická a onkologická klinika FN Královské Vinohrady Praha

Ústav biochemie a experimentální onkologie 1 LF UK Praha

Ústav biologie a lékařské genetiky 1 LF UK a VFN Praha

Ústav dědičných metabolických poruch 1 LF UK a VFN Praha

Contribution of massive parallel sequencing to diagnosis of hereditary ovarian cancer in the Czech Republic

000      

00000naa a2200000 a 4500

001      

bmc19029251

003      

CZ-PrNML

005      

20220411133209.0

007      

ta

008      

190815s2019 xr d f 000 0|cze||

009      

AR

024    7_

$a 10.14735/amko2019S72 $2 doi

040    __

$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2

041    0_

$a cze $b eng

044    __

$a xr

100    1_

$a Soukupová, Jana $7 xx0239539 $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze

245    10

$a Přínos masivního paralelního sekvenování pro diagnostiku dědičných forem nádorů ovaria v České republice / $c Jana Soukupová, Klára Lhotová, Petra Zemánková, Michal Vočka, Markéta Janatová, Lenka Stolařová, Marianna Borecká, Petra Kleiblová, Eva Macháčková, Lenka Foretová, Monika Koudová, Filip Lhota, Spiros Tavandzis, Michal Zikán, Viktor Stránecký, Kamila Veselá, Aleš Panczak, Jaroslav Kotlas, Zdeněk Kleibl

246    31

$a Contribution of massive parallel sequencing to diagnosis of hereditary ovarian cancer in the Czech Republic

520    3_

$a Východiska: Karcinom ovaria, závažné nádorové onemocnění s vysokou mortalitou, je v České republice diagnostikováno každým rokem přibližně u 1 000 žen. Riziko vzniku onemocnění je zvýšeno u nosiček mutací v některých nádorových predispozičních genech. S vysokým relativním rizikem (RR > 5) jsou spojeny mutace v genech BRCA1, BRCA2, BRIP1, geny Lynchova syndromu, RAD51C, RAD51D, STK11; s možným zvýšením rizika mutace v genech ATM, CHEK2, NBN, PALB2, BARD1. Cílem práce bylo určit frekvenci mutací v nádorových predispozičních genech v naší populaci. Metody a výsledky: Celkem 1 057 pacientek s karcinomem ovaria a 617 nenádorových kontrol bylo vyšetřeno pomocí panelového sekvenování nové generace na platformě Illumina. Patogenní mutace ve vysoko rizikových genech, vč. velkých genomových přestaveb, byly v našem souboru zachyceny u 30,6 % pacientek; u neselektovaných pacientek byla frekvence mutací téměř 25 %, u pacientek s negativní rodinnou anamnézou 18 %. Nejčastěji mutovanými predispozičními geny byly BRCA1 a BRCA2, součet frekvence mutací v ostatních ovariálních predispozičních genech odpovídal frekvenci mutací v genu BRCA2. Záchyt mutací u pacientek starších 70 let byl více než třikrát vyšší v porovnání s pacientkami ve věku pod 30 let. Závěr: Karcinom ovaria je heterogenní onemocnění s vysokým podílem dědičné formy onemocnění. Vzhledem k nedostatku adekvátních screeningových modalit pro včasnou diagnostiku onemocnění je identifikace nosiček mutací v ovariálních predispozičních genech klíčová, s vysokým potenciálem k celkovému snížení mortality z důvodu karcinomu ovaria.

520    9_

$a Background: Ovarian cancer is a disease with high mortality. Approximately 1,000 women are diagnosed with ovarian cancer in the Czech Republic annually. Women harboring a mutation in cancer-predisposing genes face an increased risk of tumor development. Mutations in BRCA1, BRCA2, BRIP1, and Lynch syndrome genes (RAD51C, RAD51D, and STK11) are associated with a high risk of ovarian cancer, and mutations in ATM, CHEK2, NBN, PALB2, and BARD1 appear to increase the risk. Our aim was to examine the frequency of mutations in cancer-predisposing genes in the Czech Republic. Materials and methods: We analyzed 1,057 individuals including ovarian cancer patients and 617 non-cancer controls using CZECANCA panel next-generation sequencing on the Illumina platform. Pathogenic mutations in high-risk genes, including CNVs, were detected in 30.6% of patients. The mutation frequency reached 25.0% and 18.2% in subgroups of unselected ovarian cancer patients and patients with a negative family cancer history, respectively. The most frequently mutated genes were BRCA1 and BRCA2. The overall frequency of mutations in non-BRCA genes was comparable to that in BRCA2. The mutation frequency in ovarian cancer patients aged > 70 years was three times higher than that in patients diagnosed before the age of 30. Conclusion: Ovarian cancer is a heterogeneous disease with a high proportion of hereditary cases. The lack of efficient screening for early diagnosis emphasizes the importance of identifying carriers of mutations in ovarian cancer-predisposing genes; this is because proper follow-up and prevention strategies can reduce overall ovarian cancer-related mortality.

650    _2

$a lidé $7 D006801

650    _2

$a ženské pohlaví $7 D005260

650    12

$a nádory vaječníků $x genetika $7 D010051

650    _2

$a geny nádorové $7 D052138

650    _2

$a mutace $7 D009154

650    _2

$a vysoce účinné nukleotidové sekvenování $x metody $7 D059014

650    _2

$a klinická studie jako téma $7 D000068456

651    _2

$a Česká republika $7 D018153

653    00

$a panel genů

655    _2

$a práce podpořená grantem $7 D013485

700    1_

$a Lhotová, Klára $7 xx0239557 $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze

700    1_

$a Zemánková, Petra $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze $7 xx0239540

700    1_

$a Vočka, Michal $u Onkologická klinika 1. LF UK a VFN v Praze $7 xx0181880

700    1_

$a Janatová, Markéta $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze $7 stk2008428924

700    1_

$a Stolařová, Lenka $7 xx0239560 $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze

700    1_

$a Borecká, Marianna $7 xx0239525 $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze

700    1_

$a Kleiblová, Petra $u Ústav biologie a lékařské genetiky, 1. LF UK a VFN v Praze $7 xx0125463

700    1_

$a Macháčková, Eva $u Oddělení epidemiologie a genetiky nádorů, Masarykův onkologický ústav, Brno $7 xx0082043

700    1_

$a Foretová, Lenka, $u Oddělení epidemiologie a genetiky nádorů, Masarykův onkologický ústav, Brno $d 1957- $7 nlk20000084855

700    1_

$a Koudová, Monika $u Centrum lékařské genetiky a reprodukční medicíny GENNET, Praha $7 xx0107902

700    1_

$a Lhota, Filip $7 xx0239524 $u Centrum lékařské genetiky a reprodukční medicíny GENNET, Praha

700    1_

$a Tavandzis, Spiros, $d 1974- $7 xx0239521 $u Oddělení lékařské genetiky, Laboratoře AGEL, Nový Jičín

700    1_

$a Zikán, Michal, $u Gynekologicko-porodnická klinika 1. LF UK a Nemocnice Na Bulovce, Praha $d 1976- $7 xx0096708

700    1_

$a Stránecký, Viktor $u Ústav dědičných metabolických poruch, 1. LF UK a VFN v Praze $7 xx0128943

700    1_

$a Veselá, Kamila $u Ústav biologie a lékařské genetiky, 1. LF UK a VFN v Praze $7 xx0173309

700    1_

$a Panczak, Aleš, $u Ústav biologie a lékařské genetiky, 1. LF UK a VFN v Praze; Radioterapeutická a onkologická klinika FN Královské Vinohrady, Praha $d 1953- $7 ja20020046920

700    1_

$a Kotlas, Jaroslav, $u Ústav biologie a lékařské genetiky, 1. LF UK a VFN v Praze $d 1959- $7 ja20020044979

700    1_

$a Kleibl, Zdeněk, $u Ústav biochemie a experimentální onkologie, 1. LF UK v Praze $d 1969- $7 jo2003183974

773    0_

$w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 32, Suppl. 2 (2019), s. 72-78

773    0_

$t Hereditární nádorová onemocnění V. $g (2019), s. 72-78 $w MED00208470

856    41

$u https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/460/5585.pdf $y plný text volně přístupný

910    __

$a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y 4 $z 0

990    __

$a 20190815 $b ABA008

991    __

$a 20220411133207 $b ABA008

999    __

$a ok $b bmc $g 1435882 $s 1067711

BAS    __

$a 3

BAS    __

$a PreBMC

BMC    __

$a 2019 $b 32 $c Suppl. 2 $d 72-78 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 113305

BMC    __

$a 2019 $d 72-78 $m Hereditární nádorová onemocnění V. $x MED00208470

GRA    __

$a NV15-27695A $p MZ0

LZP    __

$c NLK109 $d 20190827 $b NLK111 $a Meditorial-20190815