-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Prevalence and the role of CCR5Δ32 heterozygosity in disease progression in HIV positive patients in the Czech Republic [Prevalence a role CCR5Δ32 v progresi onemocnění u HIV pozitivních pacientů v České republice]
L. Sácká, J. Hodek, L. Machala, M. Malý, J. Weber
Jazyk angličtina Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- MeSH
- genotypizační techniky MeSH
- HIV-1 * genetika izolace a purifikace MeSH
- kohortové studie MeSH
- lidé MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- progrese nemoci MeSH
- receptory CCR5 genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Úvod: Vstup viru lidské imunitní nedostatečnosti typu 1 (HIV-1) do cílových buněk je umožněn CD4 receptorem a jedním ze dvou koreceptorů CXCR4 nebo CCR5. Delece úseku 32 nukleotidů v genu pro CCR5 (CCR5Δ32) v obou alelách poskytuje silnou, avšak ne absolutní odolnost proti infekci HIV-1 a delece v jedné alele zpomaluje postup nemoci směřující k rozvinutí AIDS. Zde jsme analyzovali prevalenci a roli heterozygotního výskytu CCR5Δ32 na postup onemocnění u HIV pozitivních jedinců v České republice. Metody: Celkem 92 HIV-1 séropozitivních osob včetně 80 Čechů z AIDS centra v Nemocnici Na Bulovce v Praze bylo zařazeno do genotypizace CCR5, která byla součástí studie role HIV fitness na průběh onemocnění. Z periferních mononukleárních buněk pacienta byla získána DNA, která byla použita k amplifikaci pomocí PCR v reálném čase použitím specifických sond, které detekovaly divokou variantu CCR5 a variantu s 32 nt delecí. Podmnožina 74 pacientů bez antiretrovirové léčby, kteří byli sledováni déle než jeden rok, byla použita k určení role heterozygotního fenotypu CCR5 na průběh nemoci. Výsledky: Heterozygotní CCR5Δ32 varianta byla nalezena u 23,8 % z 80 českých HIV-1 séropozitivních osob, což je velmi podobné jako publikovaná 21 % a 24 % prevalence u HIV negativní české populace. Homozygotní mutovaná varianta nebyla nalezena. U skupiny osob s heterozygotním CCR5 fenotypem jsme pozorovali slabě zvýšený průměrný počet CD4-pozitivních T-lymfocytů a nižší průměrné hodnoty virémie v plazmě. Závěr: Celkově, naše studie neukázala žádný zřejmý užitek přítomnosti heterozygotní CCR5Δ32 varianty na přenos HIV a pouze malý užitek na průběh nemoci u české HIV-1 pozitivní kohorty.
Background: Entry of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) in target cells is enabled by CD4 receptor and one of two co-receptors, CXCR4 or CCR5. Deletion of 32 bp in CCR5 gene (CCR5Δ32) in both alleles provides strong but not absolute resi-stance to HIV-1 infection and deletion in one allele slows disease progression to AIDS. Here, we analyzed the prevalence and the role of CCR5Δ32 heterozygosity on the disease progression in HIV positive patients in the Czech Republic. Patients and methods: A total of 92 HIV-1 seropositive subjects that included 80 Czech individuals from the AIDS center in the Hospital Na Bulovce in Prague were enrolled in CCR5 genoty-ping as a part of a study of the role of HIV fitness on disease progression. DNA was extracted from patient’s peripheral blood mononuclear cells and subjected to real-time PCR with specific probes detecting wild-type and 32 bp-deleted CCR5 variants. A subgroup of 74 antiretroviral therapy-naive patients with more than one year of follow-up was used to determine the role of the CCR5Δ32 heterozygous phenotype in disease progression. Results: CCR5Δ32 was found heterozygous in 23.8% of 80 Czech HIV-1 seropositive individuals which is very similar to 21% and 24% prevalence reported in HIV negative Czech population. Homozygous mutant variant was not detected. In CCR5Δ32 he-terozygous group we observed slightly higher mean CD4+ T-cell count and lower mean plasma viremia levels.Conclusions: Overall, our study indicates no obvious benefit of CCR5Δ32 heterozygosity on HIV transmission and only small benefit on disease progression in the Czech HIV-1 cohort.
Prevalence a role CCR5Δ32 v progresi onemocnění u HIV pozitivních pacientů v České republice
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc19044408
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20200205135630.0
- 007
- ta
- 008
- 200109s2019 xr d f 000 0|eng||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a eng $b cze
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Sácká, Lenka. $u Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Czech Academy of Sciences, Prague, Czech Republic $7 xx0244053
- 245 10
- $a Prevalence and the role of CCR5Δ32 heterozygosity in disease progression in HIV positive patients in the Czech Republic / $c L. Sácká, J. Hodek, L. Machala, M. Malý, J. Weber
- 246 31
- $a Prevalence a role CCR5Δ32 v progresi onemocnění u HIV pozitivních pacientů v České republice
- 520 3_
- $a Úvod: Vstup viru lidské imunitní nedostatečnosti typu 1 (HIV-1) do cílových buněk je umožněn CD4 receptorem a jedním ze dvou koreceptorů CXCR4 nebo CCR5. Delece úseku 32 nukleotidů v genu pro CCR5 (CCR5Δ32) v obou alelách poskytuje silnou, avšak ne absolutní odolnost proti infekci HIV-1 a delece v jedné alele zpomaluje postup nemoci směřující k rozvinutí AIDS. Zde jsme analyzovali prevalenci a roli heterozygotního výskytu CCR5Δ32 na postup onemocnění u HIV pozitivních jedinců v České republice. Metody: Celkem 92 HIV-1 séropozitivních osob včetně 80 Čechů z AIDS centra v Nemocnici Na Bulovce v Praze bylo zařazeno do genotypizace CCR5, která byla součástí studie role HIV fitness na průběh onemocnění. Z periferních mononukleárních buněk pacienta byla získána DNA, která byla použita k amplifikaci pomocí PCR v reálném čase použitím specifických sond, které detekovaly divokou variantu CCR5 a variantu s 32 nt delecí. Podmnožina 74 pacientů bez antiretrovirové léčby, kteří byli sledováni déle než jeden rok, byla použita k určení role heterozygotního fenotypu CCR5 na průběh nemoci. Výsledky: Heterozygotní CCR5Δ32 varianta byla nalezena u 23,8 % z 80 českých HIV-1 séropozitivních osob, což je velmi podobné jako publikovaná 21 % a 24 % prevalence u HIV negativní české populace. Homozygotní mutovaná varianta nebyla nalezena. U skupiny osob s heterozygotním CCR5 fenotypem jsme pozorovali slabě zvýšený průměrný počet CD4-pozitivních T-lymfocytů a nižší průměrné hodnoty virémie v plazmě. Závěr: Celkově, naše studie neukázala žádný zřejmý užitek přítomnosti heterozygotní CCR5Δ32 varianty na přenos HIV a pouze malý užitek na průběh nemoci u české HIV-1 pozitivní kohorty.
- 520 9_
- $a Background: Entry of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) in target cells is enabled by CD4 receptor and one of two co-receptors, CXCR4 or CCR5. Deletion of 32 bp in CCR5 gene (CCR5Δ32) in both alleles provides strong but not absolute resi-stance to HIV-1 infection and deletion in one allele slows disease progression to AIDS. Here, we analyzed the prevalence and the role of CCR5Δ32 heterozygosity on the disease progression in HIV positive patients in the Czech Republic. Patients and methods: A total of 92 HIV-1 seropositive subjects that included 80 Czech individuals from the AIDS center in the Hospital Na Bulovce in Prague were enrolled in CCR5 genoty-ping as a part of a study of the role of HIV fitness on disease progression. DNA was extracted from patient’s peripheral blood mononuclear cells and subjected to real-time PCR with specific probes detecting wild-type and 32 bp-deleted CCR5 variants. A subgroup of 74 antiretroviral therapy-naive patients with more than one year of follow-up was used to determine the role of the CCR5Δ32 heterozygous phenotype in disease progression. Results: CCR5Δ32 was found heterozygous in 23.8% of 80 Czech HIV-1 seropositive individuals which is very similar to 21% and 24% prevalence reported in HIV negative Czech population. Homozygous mutant variant was not detected. In CCR5Δ32 he-terozygous group we observed slightly higher mean CD4+ T-cell count and lower mean plasma viremia levels.Conclusions: Overall, our study indicates no obvious benefit of CCR5Δ32 heterozygosity on HIV transmission and only small benefit on disease progression in the Czech HIV-1 cohort.
- 650 12
- $a HIV-1 $x genetika $x izolace a purifikace $7 D015497
- 650 _2
- $a progrese nemoci $7 D018450
- 650 _2
- $a polymorfismus genetický $7 D011110
- 650 _2
- $a receptory CCR5 $x genetika $7 D019713
- 650 _2
- $a genotypizační techniky $7 D060005
- 650 _2
- $a kohortové studie $7 D015331
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 651 _2
- $a Česká republika $7 D018153
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Hodek, Jan $u Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Czech Academy of Sciences, Prague, Czech Republic $7 jx20080523020
- 700 1_
- $a Machala, Ladislav, $u Department of Infectious Diseases, Third Faculty of Medicine, Charles University and Hospital Na Bulovce, Prague, Czech Republic $d 1954- $7 xx0011470
- 700 1_
- $a Malý, Marek $u National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic $7 jn20001103265
- 700 1_
- $a Weber, Jan $u Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Czech Academy of Sciences, Prague, Czech Republic $7 xx0102542
- 773 0_
- $w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 68, č. 3 (2019), s. 138-143
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2019-3-23/prevalence-a-role-ccr5-32-v-progresi-onemocneni-u-hiv-pozitivnich-pacientu-v-ceske-republice-119851 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 981 $c 560 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20200109 $b ABA008
- 991 __
- $a 20200205140018 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1486358 $s 1083081
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2019 $b 68 $c 3 $d 138-143 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 119851
- LZP __
- $c NLK182 $d 20200205 $b NLK111 $a Meditorial-20200109