Detail
Článek
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Molecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines

M. Glasa, L. Predajňa, P. Komínek, A. Nagyová, T. Candresse, A. Olmos,

. 2014 ; 159 (8) : 2103-2107. [pub] 20140306

Jazyk angličtina Země Rakousko

Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc20014823
E-zdroje Online Plný text

NLK ProQuest Central od 2002-01-01 do Před 1 rokem
Medline Complete (EBSCOhost) od 2000-01-01 do Před 1 rokem
Health & Medicine (ProQuest) od 2002-01-01 do Před 1 rokem
Public Health Database (ProQuest) od 2002-01-01 do Před 1 rokem

Analysis of complete genome sequences of three Slovak isolates of grapevine Pinot gris virus (GPGV) showed their low heterogeneity (reaching 1.7 %) and a close relationship to the Italian NC_015782 isolate (4.2-4.5 % divergence). Comparison of Slovak and Italian isolates revealed an unusual accumulation of 21 indel mutations in ORF1, resulting in a localized high divergence in the encoded amino acid sequences. An elevated divergence in the 5' extremity of the GPGV genomes is suggestive of a recombination between Slovak isolates and grapevine berry inner necrosis virus. RT-PCR allowed the frequent detection of closely related GPGV isolates in grapevines from Slovakia and the Czech Republic.

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc20014823
003      
CZ-PrNML
005      
20201103091837.0
007      
ta
008      
200922s2014 au f 000 0|eng||
009      
AR
024    7_
$a 10.1007/s00705-014-2031-5 $2 doi
035    __
$a (PubMed)24599565
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng
044    __
$a au
100    1_
$a Glasa, Miroslav $u Department of Plant Virology, Institute of Virology, Slovak Academy of Sciences, Dúbravská cesta 9, 84505, Bratislava, Slovakia, Miroslav.Glasa@savba.sk.
245    10
$a Molecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines / $c M. Glasa, L. Predajňa, P. Komínek, A. Nagyová, T. Candresse, A. Olmos,
520    9_
$a Analysis of complete genome sequences of three Slovak isolates of grapevine Pinot gris virus (GPGV) showed their low heterogeneity (reaching 1.7 %) and a close relationship to the Italian NC_015782 isolate (4.2-4.5 % divergence). Comparison of Slovak and Italian isolates revealed an unusual accumulation of 21 indel mutations in ORF1, resulting in a localized high divergence in the encoded amino acid sequences. An elevated divergence in the 5' extremity of the GPGV genomes is suggestive of a recombination between Slovak isolates and grapevine berry inner necrosis virus. RT-PCR allowed the frequent detection of closely related GPGV isolates in grapevines from Slovakia and the Czech Republic.
650    _2
$a Flexiviridae $x klasifikace $x genetika $x izolace a purifikace $7 D052677
650    12
$a genetická variace $7 D014644
650    _2
$a genom virový $7 D016679
650    _2
$a molekulární sekvence - údaje $7 D008969
650    _2
$a otevřené čtecí rámce $7 D016366
650    _2
$a fylogeneze $7 D010802
650    _2
$a nemoci rostlin $x virologie $7 D010935
650    _2
$a Vitis $x virologie $7 D027843
651    _2
$a Česká republika $7 D018153
651    _2
$a Slovenská republika $7 D018154
655    _2
$a časopisecké články $7 D016428
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Predajňa, Lukáš
700    1_
$a Komínek, Petr, $d 1971- $7 uzp2009465510
700    1_
$a Nagyová, Alžbeta
700    1_
$a Candresse, Thierry
700    1_
$a Olmos, Antonio
773    0_
$w MED00009266 $t Archives of virology $x 1432-8798 $g Roč. 159, č. 8 (2014), s. 2103-2107
856    41
$u https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24599565 $y Pubmed
910    __
$a ABA008 $b sig $c sign $y a $z 0
990    __
$a 20200922 $b ABA008
991    __
$a 20201103091834 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1567684 $s 1104983
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2014 $b 159 $c 8 $d 2103-2107 $e 20140306 $i 1432-8798 $m Archives of virology $n Arch Virol $x MED00009266
LZP    __
$a Pubmed-20200922

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat...

Možnosti archivace

Nahrávání dat...