Současný trend a zvyšující se znalosti o genetických příčinách vzniku a progresi zhoubných nádorů otevírá nové možnosti pro jejich léčbu. Nicméně je nutné výsledky získané pomocí klasických metod spojit s citlivými, molekulárně patologickými metodami. Metodou, která splňuje požadovaná kritéria, je multiplexní na ligaci závislá PCR reakce (MLPA) založená na multiplexní PCR reakci. Touto metodou jsou detekovány jak změny v počtu kopií genu, tak i metylační status DNA ve specifických oblastech a v neposlední řadě i bodové mutace. MLPA reakce je použitelná i na vysoce fragmentované DNA. Zároveň se jedná o metodu robustní, kterou lze provádět na standardních termocyklerech, fluorescenční značení vyžaduje analýzu pomocí automatického sekvenátoru. V jedné reakci lze testovat až 50 genetických markerů, což je počet, který umožňuje diagnostický a prognostický závěr. Všechny tyto vlastnosti vedou k rutinnímu využití MLPA analýzy nejen při diagnostice, ale i ve výzkumu nádorů. Předkládaný článek si klade za cíl popsat jednotlivé typy MLPA reakcí, její výhody, ale i potenciální úskalí.

The current progress and increasing knowledge about the genetic causes of cancer opens up new possibilities for its treatment. However, it is necessary to combine the results obtained using classical pathological methods with sensitive, multiplex molecular pathological methods. The method that meets the required criteria is MLPA based on multiplex PCR reaction. This method detects both changes in gene copy number and DNA methylation and, last but not least, point mutations. The MLPA reaction is applicable to even highly fragmented DNA. At the same time, it is a robust method that can be performed on standard thermocyclers, the fluorescent tip label requires automatic sequencers. Up to 50 genetic markers can be tested in one reaction, a number that allows a diagnostic and prognostic conclusion. All these features lead to the routine use of MLPA analysis not only in diagnosis but also in cancer research. The present article aims to summarize the different types of MLPA reactions, its benefits, but also the potential pitfalls.

Klinika dětské hematologie a onkologie 2 LF UK a Fakultní nemocnice Motol Praha

Oddělení molekulární genetiky a diagnostiky Centrum PATOS Krajská nemocnice Liberec a s

Oddělení patologie Centrum PATOS Krajská nemocnice Liberec a s

Ústav patologie a molekulární medicíny 2 LF UK a Fakultní nemocnice Motol Praha

Molecular pathological profiling of selected tumors of the central nervous system using the MLPA method