Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Significant effort has been made to understand mechanisms leading to the initiation of autoimmune diseases. One hypothesis determines infection as the triggering cause in genetically predisposed individuals. The main aim of this project is to gain new knowledge of the mechanisms and possibilities of regulation of sight-threatening autoimmune uveitis. Special emphasis will be put on clarifying the influence of microorganisms (including commensal bacteria) and participation of innate immunity in the process of uveitis, and their directed regulation. To achieve these goals, the analysis of intraocular fluids, serum and microbiome of patients with autoimmune uveitis, and model of the experimental autoimmune uveitis (EAU) in mice, including the unique gnotobiotic model, will be used. The experimental results will be compared to those from clinical research of patients with autoimmune uveitis. The acquired data will contribute to the definition of new therapeutic strategies in human uveitis and thus help to attain a higher quality of prevention of blindness in affected patients.
Mechanismus vzniku autoimunitního procesu je stále předmětem intenzívního výzkumu. Jedna z hypotéz určuje za spouštěcí prvek u geneticky predisponovaných jedinců infekční proces. Hlavním cílem navrhovaného projektu je získat nové poznatky o mechanismu vzniku a možnostech ovlivnění zrak-ohrožující autoimunitní uveitidy. Zvláštní důraz bude kladen na objasnění vlivu mikroorganismů (včetně komensálních) a podíl vrozené imunity v procesu uveitidy a na jejich cílenou regulaci. K dosažení těchto cílů bude využita analýza nitroočních tekutin, séra a mikrobiomu pacientů s autoimunitní uveitidou a model experimentální autoimunitní uveitidy (EAU) u myši, včetně unikátního modelu gnotobiotického. Výsledky získané z pokusů na experimentálním modelu budou porovnány s klinickým výzkumem u pacientů s autoimunitní uveitidou. Získané poznatky přispějí k navržení nového léčebného protokolu uveitid v humánní medicíně, a tím k dosažení vyšší kvality prevence slepoty následkem uveitidy.
- MeSH
- autoimunitní nemoci mikrobiologie MeSH
- Escherichia coli MeSH
- gnotobiologické modely MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiota MeSH
- modely nemocí na zvířatech MeSH
- myši MeSH
- přirozená imunita MeSH
- probiotika terapeutické užití MeSH
- uveitida mikrobiologie MeSH
- zánět prevence a kontrola MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- myši MeSH
- Konspekt
- Ortopedie. Chirurgie. Oftalmologie
- NLK Obory
- oftalmologie
- alergologie a imunologie
- mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Multiresistant bacteria, especially of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae and multiresistant Pseudomonas spp. is a threat to current medicine, significantly reducing treatment options in critically ill patients. The project is focused on molecular-epidemiological typing of clinically/epidemiologically important resistance genes encoded on mobile genetic elements in Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp., spreading in bacterial populations in health-care settings, diffusing into the environment by sewage water and colonizing/infecting wildlife, especially water birds. In the project, only bacterial isolates (not primary clinical samples) will be used. All these isolates will be collected anonymously, therefore, patients informed consent will not be a prerequisite for further molecular analysis. Obtained data will be published in international journals, popularized for microbiologists and infectious-disease specialists; and used for education of M.D., D.V.M. and Ph.D. students.
Šíření multirezistentních bakterií, především Enterobacteriaceae produkujících karbapenemázy a multirezistentních pseudomonád, představuje významné ohrožení dalšího rozvoje medicíny zejména u kriticky nemocných pacientů. Projekt je zaměřen na molekulárně-epidemiologickou analýzu klinicky/epidemiologicky významných genů rezistence a mobilních elementů, na nichž jsou kódovány, u enterobakterií a pseudomonád, jejich rozšíření v nemocničních zařízeních, difúzi do prostředí prostřednictvím odpadní vody a kolonizaci/infekci volně žijících zvířat, především vodního ptactva. Během řešení projektu budou zpracovávány pouze bakteriální izoláty (nikoliv primární pacientské vzorky). Tyto izoláty jsou anonymizovány. Z toho důvodu není vyžadován informovaný souhlas. Získaná data budou publikována v mezinárodních časopisech a popularizována pro využití mikrobiology a infekčními lékaři. Zároveň budou využita k výuce v magisterském (MUDr., MDDr., MVDr.) a doktorském (Ph.D.) studijním programu.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- Enterobacteriaceae rezistentní na karbapenemy MeSH
- Enterobacteriaceae MeSH
- farmakoepidemiologie MeSH
- fluorochinolony MeSH
- karbapenemy MeSH
- Pseudomonas MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- molekulární biologie, molekulární medicína
- farmacie a farmakologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
Spread of the genes responsible for resistance to antibiotics can be allowed by mobile genetic elements (e.g. insertion sequences, transposones, integron mobilisation units, etc.). These elements can be spread within the same as well as among the different bacterial species (in the direct way by conjugative transposones and also as a part of conjugative plasmids). Whole clusters of resistance genes diffuse in the bacterial population. The aim of this project is focused on the study of mobile genetic elements carried out metallo-beta-lactamase genes. Based on these analysis, factors responsible for the spreading mobile genetic elements carried out resistance genes in the environment.
Šíření genů rezistence v bakteriálních populacích je umožněno jejich mobilizací mobilními genetickými elementy (inserční sekvence, traspozony, jednotky mobilizující integrony, atp.). Ty mohou být následně horizontálně šířeny vnitro- i mezidruhově (přímo - konjugativní transpozony, případně neseny na konjugativním plasmidu). Dochází tak k přenosu celých klusterů sdružujících geny rezistence. Projekt je zaměřen na studium mobilních elementů nesoucích geny metalo-beta-laktamáz. Tyto analýzy povedou k identifikaci rizikových faktorů šíření studovaných genetických elementů v prostředí.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- beta-laktamasy MeSH
- Enterobacteriaceae MeSH
- hmotnostní spektrometrie MeSH
- karbapenemy analýza MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Konspekt
- Mikrobiologie
- NLK Obory
- bakteriologie
- epidemiologie
- biologie
- genetika, lékařská genetika
- farmacie a farmakologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace ; 30 cm
Public health protection against bacteria with significant resistance to antibiotics is one of the most important challenges in current medicine. Fluoroquinolones (FQs) are frequently used antibiotic agents necessary for the treatment of severe infections. The project plans to map the prevalence of the indicator bacterium Escherichia coli in livestock (poultry), wild animals (rook), humans – both in the community of the Olomouc Region and in patients hospitalized in the University Hospital Olomouc, and in sewage water from hospitals in the region. In the above groups, the prevalence of E. coli resistant to FQs will be studied. The isolates will be subjected to genetic analysis in order to characterize the type of resistance. These analyses will determine the degree of identity between animal, human and environmental strains. The results will make up a set of scientifically confirmed findings for determination of the sources and ways of spread of resistance to FQs and their subsequent application in pu
Ochrana zdraví obyvatel před bakteriemi s významnou rezistencí k antibiotikům patří mezi nejdůležitější úkoly současné medicíny. Fluorochinolony (FQ) patří mezi často používaná antibiotika, která jsou nezbytná pro léčbu závažných infekcí. Projekt předpokládá zmapování výskytu indikátorové bakterie Escherichia coli u hospodářských (drůbež) i divokých (havran) zvířat, u lidí v komunitě Olomouckého regionu, u pacientů hospitalizovaných ve Fakultní nemocnici Olomouc a v odpadních vodách nemocnic regionu. Bude sledována prevalence E. coli rezistentní k FQ ve sledovaných skupinách. Izoláty budou podrobeny genetické analýze s cílem charakterizovat typ rezistence. Tyto analýzy stanoví míru identity mezi animálními, humánními kmeny a kmeny z prostředí. Z výsledků vznikne soubor vědecky podložených závěrů pro určení zdrojů a cest šíření rezistence k FQ a následnou aplikaci do ochrany zdraví populace, včetně návrhů na další omezení používání FQ, případně návrhu na úplný zákaz používání FQ u zvířat.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- Escherichia coli účinky léků MeSH
- farmakoepidemiologie MeSH
- fluorochinolony MeSH
- lidé MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Konspekt
- Mikrobiologie
- NLK Obory
- mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
- bakteriologie
- farmacie a farmakologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
91 l. : tab. ; 30 cm
More than 1600 E. coli strains from clinical and environmental sources will be tested on production of bacteriocin types and on spectra of resistance to antibiotics. 31 bacteriocin types and more than 10 antibiotics are to be tested in each strain. The goal of this proposal is to identify bacteriocin types and spectra of antibiotic resistance associated with the sets of E. coli strains examined, just as to find relation between bacteriocin types and antibiotic resistance patterns.
Projekt předpokládá vyšetření více než 1600 kmenů E. coli z klinických a environmentálních vzorků na typy bakteriocinů a na citlivost na antibiotika. Celkem je plánováno diagnostikovat 31 typů bakteriocinů a několik řad antibiotik u každého kmene. Cílemprojektu je nalézt bakteriocinové typy a spektra bakteriální rezistence asociované s jednotlivými typy vyšetřených kmenů a zejména otestovat vztah mezi produkovanými bakteriociny a rezistencí na antibiotika.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- bakteriociny analýza MeSH
- Escherichia coli MeSH
- infekce močového ústrojí MeSH
- infekce vyvolané Escherichia coli diagnóza MeSH
- koliciny analýza MeSH
- molekulární typizace MeSH
- NLK Obory
- biologie
- bakteriologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Clinical microbiology and infection, ISSN 1198-743X ; Volume 14, Supplement 1, January 2008
202 stran : ilustrace ; 28 cm
- MeSH
- bakteriální proteiny MeSH
- beta-laktamasy MeSH
- beta-laktamová rezistence MeSH
- Enterobacteriaceae MeSH
- enterobakteriální infekce MeSH
- gramnegativní bakteriální infekce MeSH
- Publikační typ
- sborníky MeSH
- Konspekt
- Mikrobiologie
- NLK Obory
- mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
- infekční lékařství
- biochemie
Clinical infectious diseases, ISSN 1058-4838 ; vol. 45, suppl. 1, July 2007
95 s. : il., tab. ; 28 cm
- MeSH
- aktivní imunoterapie MeSH
- břišní tyfus prevence a kontrola terapie MeSH
- infekční nemoci MeSH
- průjem prevence a kontrola terapie MeSH
- Rickettsia patogenita MeSH
- rickettsiové infekce prevence a kontrola MeSH
- Salmonella paratyphi B genetika imunologie MeSH
- salmonelóza prevence a kontrola MeSH
- tularemie epidemiologie etiologie terapie MeSH
- Publikační typ
- sborníky MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- infekční lékařství
- O autorovi
- Woodward, Theodore E. 1914-2005 Autorita
Microbiological risk assessment series, ISSN 1726-5274 ; no. 6
xvii, 59 s. : tab., grafy ; 24 cm
- MeSH
- bakteriologie MeSH
- Cronobacter sakazakii patogenita MeSH
- Enterobacteriaceae patogenita MeSH
- hodnocení rizik MeSH
- kontaminace potravin MeSH
- náhražky mateřského mléka MeSH
- potrava pro kojence mikrobiologie MeSH
- Konspekt
- Mikrobiologie
- NLK Obory
- mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
- bakteriologie
- zemědělství a potravinářství
- NLK Publikační typ
- publikace WHO
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
Přeruš. str. : il., tab. ; 32 cm
The introduction of a suitable system of STM subtyping will enable a more detailed identification of strains for epidemiological purposes. In selected localities clinical isolates will be collected, accompanied with sheets of epidemiological investigatioStrains will be screened using selected typing methods and will be analysed together with epidemiological data.
Zavedení vhodného systému subtypizace STM umožní detailnější identifikaci kmenů pro epidemiologické účely. Ve sledovaných lokalitách bude prováděn sběr klinických izolátů doprovázených listy epidemiologického šetření. Kmeny budou vyšetřeny vybranými typizačními metodami a společně s epidemiologickými daty analyzovány.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- Salmonella typhimurium patogenita MeSH
- salmonelóza epidemiologie MeSH
- sérotypizace MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- epidemiologie
- infekční lékařství
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
135 s. : tab., grafy ; 22 cm
- MeSH
- beta-laktamasy MeSH
- Enterobacteriaceae MeSH
- enterobakteriální infekce terapie epidemiologie MeSH
- enzymy MeSH
- plazmidy MeSH
- transpozibilní elementy DNA MeSH
- Publikační typ
- vysokoškolské kvalifikační práce MeSH
- Konspekt
- Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
- NLK Obory
- biochemie
- bakteriologie
- biologie