Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Using expression profiling arrays we will identify intracellular (from endomyocardial biopsies) as well as circulating (from plasma, urine and peripheral blood mononuclear cells) miRNAs that will distinguish heart transplant patients with graft rejection from those without rejection; different miRNA profile during cellular and antibody-mediated rejection will be identified. We will further validate panel of miRNAs that will enable more comfort and non-invasive detection of both types of rejection without the need of economically and technically demanding invasive diagnostics.
S využitím expresního profilováni identifikujeme intracelulární (z endomyokardiálních biopsií) a cirkulující (z plasmy, moči a periferních mononukleárních buněk) miRNA, které rozliší pacienty po srdeční transplantaci prodělávající rejekci od jedinců bez rejekce; dále identifikujeme profil miRNA, který od sebe odliší buněčnou rejekci od rejekce zprostředkované protilátkami. Následně validujeme panel miRNA, který umožní komfortnější neinvazivní detekci obou typů rejekce srdečního štěpu, bez nutnosti ekonomicky i technicky náročné invazivní diagnostiky.
- MeSH
- analýza moči metody MeSH
- biochemická analýza krve metody MeSH
- biologické markery analýza MeSH
- biopsie metody MeSH
- cirkulující mikroRNA analýza MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA analýza MeSH
- rejekce štěpu diagnóza MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- transplantace srdce MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- transplantologie
- kardiologie
- biochemie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Pancreatic ductal adenocarcinoma is one of the most malignant types of cancer. The main reasons of high mortality are late diagnosis and low effectiveness of conventional radiotherapy and chemotherapy. Therefore, the radical surgical resection together with adjuvant chemotherapy is the only chance for long-term survival. Unfortunately, most of the patients are diagnosed with local advanced or metastatic disease without the possibility of radical surgery. Finally, there is no clear clinical indication for radical resection in case of borderline resectable pancreatic cancer when surgery is associated with significant morbidity. The aim of this project is to determine the classifier enabling the precise classification of pancreatic lesions based on the expression profiles of microRNAs in blood plasma. Moreover, microRNAs with prognostic potential will be identified with the goal to select patients who will not benefit from the surgical resection that will lead to lower morbidity and therefore better quality of life of these patients.
Karcinomy slinivky břišní patří mezi nejzhoubnější nádorová onemocnění. Hlavními důvody vysoké mortality jsou stanovení diagnózy v pokročilých stádiích a nízká účinnost konvenční radioterapie a chemoterapie. Za jedinou potenciálně kurativní léčebnou metodu je proto stále považována radikální chirurgická resekce kombinovaná s adjuvantní chemoterapií. Velká část pacientů je však diagnostikována ve stádiu lokálně pokročilého či metastatického onemocnění, a nemohou tak podstoupit radikální resekční výkon. Otázkou dále zůstává indikace radikální resekce u hraničně resekabilního onemocnění, kdy je potřeba vzít v úvahu vysokou morbiditu spojenou s tímto výkonem. Cílem navrhovaného projektu je sestavit klasifikátor, který umožní přesnou klasifikaci pankreatických lézí pomocí expresních profilů mikroRNA v krevní plazmě. Nedílnou součástí projektu bude nalezení miRNA s prognostickým potenciálem, na základě jejichž exprese bude možné identifikovat pacienty neprofitující z chirurgické léčby, což povede k významnému snížení celkové morbidity, a tedy lepší kvalitě života pacientů.
- MeSH
- adenokarcinom chirurgie diagnóza MeSH
- chirurgie trávicího traktu metody MeSH
- cirkulující mikroRNA analýza MeSH
- duktální karcinom pankreatu chirurgie diagnóza MeSH
- krevní plazma MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery analýza MeSH
- prognóza MeSH
- výběr pacientů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkochirurgie
- gastroenterologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Alteration of the microRNA regulatory network is one of the key events in pathogenesis of wide range of malignancies including rectal cancer. MicroRNAs are abundant and could be determined not only in tumor tissue, but also in blood plasma, where they were proved to be highly stable. In our study, by use of genome-wide expression analysis of microRNAs we plan to identify microRNAs (i) enabling sensitive prediction of therapeutic response to neoadjuvant chemoradiotherapy, and consequently, in combination with results of MRI/TRUS, (ii) to improve diagnostic accuracy of restaging (mainly in regards to T and N stage, positivity of resection margins and CRM) after this treatment. Prediction of therapeutic response would enable more individualized indication of this therapy only to patients expected to have clinical benefit. Improvement of the restaging accuracy will enable more precise planning of the surgery treatment and as a consequence better therapeutic results.
Porucha regulační mikroRNA je jednou z klíčových událostí v patogenezi celé řady nádorových onemocnění včetně karcinomu rekta. MikroRNA jsou abundantní a identifikovatelné nejen v nádorové tkáni, ale také v krevní plazmě a vykazují zde vysokou míru stability. V rámci naší studie chceme pomocí vysokokapacitní analýzy mikroRNA v tkáni/krevní plazmě pacientů s karcinomem rekta identifikovat mikroRNA, které (i) umožní predikovat léčebnou odpověď na neodajuvantní chemoradioterapii a následně v kombinaci s nálezy zobrazovacích metod (TRUS, MRI), (ii) zpřesní hodnocení léčebné odpovědi = restaging (především změny na úrovni T a N stádia a postižení resekčních okrajů, CRM) po ukončení této léčby. Predikce léčebné odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii by umožnila její individualizované podání pouze pacientům, u kterých je předpokládán klinický benefit. Zdokonalení restagingu umožní přesnější plánování chirurgické léčby a následně také lepší léčebné výsledky.
- MeSH
- cirkulující mikroRNA analýza MeSH
- krevní plazma MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery analýza MeSH
- nádory rekta farmakoterapie MeSH
- neoadjuvantní terapie MeSH
- staging nádorů MeSH
- výsledek terapie MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- koloproktologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Circulating microRNAs (miRNAs) are new promising semi-invasive molecular markers of various types of cancer. However, little information is known about their deregulation in myelodysplastic syndromes (MDS). Nowadays, the diagnosis of MDS is based on morphological evidence of bone marrow dysplasia. In the proposed project, we will employ next-generation sequencing for the screening of circulating miRNAs in plasma samples from MDS patients. Comparison of plasma miRNA profiles i) in untreated MDS patients with various disease subtypes, ii) in different risk category, and iii) in MDS patients during treatment will enable to select circulating miRNAs with altered levels associated with the course of the disease. The genome-wide analysis followed by a validation phase performed by digital PCR on the level of particular preselected miRNAs aims to identify novel semi-invasive molecular markers suitable for monitoring of MDS patients, finally contributing to prevention of the disease progression, increase of survival, and improving comfort of the patients.
Cirkulující mikroRNA (miRNA) jsou nové perspektivní semi-invazivní molekulární markery nádorů různých tkání. O jejich deregulaci u myelodysplastického syndromu (MDS) není známo mnoho informací. V současnosti je diagnostika MDS založena na morfologickém průkazu dysplázie v kostní dřeni. V navrhovaném projektu chceme využít sekvenování nové generace pro screening cirkulujících miRNA v krevní plazmě pacientů s MDS. Studiem profilů plasmatických miRNA i) u neléčených pacientů s odlišnými subtypy onemocnění, ii) v různých kategoriích rizika a iii) u pacientů v průběhu léčby chceme vytipovat cirkulující miRNA, jejichž hladina je asociovaná s průběhem choroby. Celogenomová analýza, po které bude následovat validační fáze na úrovni jednotlivých vybraných miRNA pomocí digitálního PCR, si klade za cíl nalézt nové semi-invazivní molekulární markery vhodné pro monitorování pacientů s MDS a tím v důsledku přispět k prevenci progrese onemocnění, zvýšení přežití a zároveň ke zlepšení komfortu pacientů.
- MeSH
- biologické markery krev MeSH
- cirkulující mikroRNA krev škodlivé účinky MeSH
- krevní plazma MeSH
- lidé MeSH
- myelodysplastické syndromy diagnóza MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- hematologie a transfuzní lékařství
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR