The inter- and intraspecies variability of lactate dehydrogenase (ldh) gene was determined among the predominant ruminal lactate utilizing bacteria. Nearly complete nucleotide sequences of ldh gene, encoding NAD-dependent lactate dehydrogenase of three Megasphaera elsdenii and six Selenomonas ruminantium strains, were obtained and compared. Phylogenetic analyses revealed a limited variability between the ldh sequences studied. The majority of differences observed were silent mutations at the 3rd position of codons. Surprisingly, the intraspecies diversity of the ldh gene among S. ruminantium isolates was higher than the interspecies level between S. ruminantium and M. elsdenii, which strongly suggests the possibility of acquisition of this gene by horizontal gene transfer.

• MeSH
• bachor mikrobiologie   MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• bodová mutace MeSH
• DNA bakterií chemie   genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• genetická variace * MeSH
• kyselina mléčná metabolismus   MeSH
• L-laktátdehydrogenasa genetika   MeSH
• Megasphaera enzymologie   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• sekvenční homologie MeSH
• Selenomonas enzymologie   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• shluková analýza MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Názvy látek
• bakteriální proteiny MeSH
• DNA bakterií MeSH
• kyselina mléčná MeSH
• L-laktátdehydrogenasa MeSH

Bacterial 16S rDNA from fecal samples of two calves were amplified by PCR and analyzed by denaturing gradient gel electrophoresis; selected bands were sequenced. Escherichia coli and Bifidobacterium animalis were the initial colonizers, followed by species closely related to the genera Bacteroides, Clostridium and Faecalibacterium. Change of diet was connected with shifts of bacterial population and with the occurrence of many bacterial species that have not been cultured up to now. The diet change corresponded with an alteration in a volatile-fatty-acid concentration in fecal samples.

• MeSH
• Bacteria klasifikace   genetika   růst a vývoj   izolace a purifikace   MeSH
• Bifidobacterium genetika   růst a vývoj   izolace a purifikace   MeSH
• DNA bakterií analýza   MeSH
• ekosystém MeSH
• elektroforéza metody   MeSH
• Escherichia coli genetika   růst a vývoj   izolace a purifikace   MeSH
• feces mikrobiologie   MeSH
• gastrointestinální trakt mikrobiologie   MeSH
• novorozená zvířata * MeSH
• polymerázová řetězová reakce metody   MeSH
• ribozomální DNA analýza   MeSH
• RNA ribozomální 16S genetika   MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• skot * MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• skot * MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Názvy látek
• DNA bakterií MeSH
• ribozomální DNA MeSH
• RNA ribozomální 16S MeSH