-
Something wrong with this record ?
Molekulární epidemiologie dermatofytóz v České republice – výsledky dvouleté studie
[Molecular epidemiology of dermatophytoses in the Czech republic – two-year-study results]
Hubka V., Větrovský T., Dobiášová S., Skořepová M., Lysková P., Mencl K., Mallátová N., Janouškovcová H., Hanzlíčková J., Dobiáš R., Čmoková A., Stará J., Hamal P., Svobodová L., Kolařík M.
Language Czech Country Czech Republic
Document type Research Support, Non-U.S. Gov't
- Keywords
- Arthroderma benhamiae, zoofilní dermatofyty, tinea unguium, tinea corporis, PCR-fingerprinting, ITS oblast rDNA, geofilní dermatofyty, Trichophyton rubrum,
- MeSH
- Arthrodermataceae genetics isolation & purification classification MeSH
- Dermatomycoses * epidemiology genetics microbiology MeSH
- DNA Fingerprinting MeSH
- DNA, Fungal analysis MeSH
- DNA Primers diagnostic use MeSH
- Species Specificity MeSH
- Fungi * genetics isolation & purification classification MeSH
- Humans MeSH
- Microsporum genetics isolation & purification classification MeSH
- Mycological Typing Techniques methods MeSH
- Polymerase Chain Reaction MeSH
- DNA, Ribosomal MeSH
- Sequence Analysis, DNA MeSH
- Tinea Capitis epidemiology genetics microbiology MeSH
- Tinea Pedis epidemiology genetics microbiology MeSH
- Tinea * epidemiology genetics microbiology MeSH
- Trichophyton genetics isolation & purification classification MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Male MeSH
- Female MeSH
- Publication type
- Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
- Geographicals
- Czech Republic MeSH
Cílem práce bylo zhodnotit molekulárně genetickými metodami (MGM) spektrum původců dermatofytóz na území České republiky s rozdělením podle hlavních klinických forem. Během dvou let (červenec 2011 až červen 2013) bylo na šesti regionálních pracovištích zachyceno 3235 kultivačně pozitivních vzorků s dermatofyty. Nejvyšší počet izolátů pocházel z případů tinea unguium (55,5 %), dále t. corporis (29,2 %), t. pedis (14,6 %) a t. capitis (0,7 %). Druhová identifikace izolátů všech druhů (n = 672) s výjimkou Trichophyton rubrum (n = 2 563) byla provedena MGM (PCR-fingerprinting nebo sekvenace ITS oblasti rDNA). Pro T. rubrum byla molekulárně ověřena jen identifikace morfologicky nejednoznačných izolátů (n = 189). Celkem bylo identifikováno 14 druhů dermatofytů, přičemž nejvýznamnější změnou oproti minulosti bylo vysoké zastoupení zoofilního druhu Arthroderma benhamiae, který působil velkou část případů t. corporis (22,9 %) a t. capitis (29,2 %). Geofilní druhy působily jen 1,3 % všech infekcí, přestože se jednalo o druhově nejpočetnější skupinu, ve které byly odhaleny dva nepopsané druhy a také přehlížené druhy Microsporum persicolor a M. fulvum. Klíčová slova: Arthroderma benhamiae – DNA sekvenace – geofilní dermatofyty – ITS oblast rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguium – zoofilní dermatofyty
The aim of the study was to evaluate the spectrum of causative agents of the main clinical forms of dermatophytoses in the Czech Republic by molecular genetic methods (MGM). During two years (from July 2011 to June 2013), 3255 cultivation specimens were positive for dermatophytes. The highest number of specimens was isolated from tinea unguinum (55,5%), then tinea corporis (29,2%), tinea pedis (14,6%) and tinea capitis (0,7%). The identification of isolated species (n = 672) except for Trichophytom rubrum (n = 2563) was performed by MGM (PCR fingerprinting or sequencing of ITS segments of rDNA). For T. rubrum only morphologically non-clear isolates were identified (n = 189). In total, 14 species of dermatophytes were identified. The most important change noticed compared to previous results was an increased detection of Arthroderma benhamiae in the cases of tinea corporis (22,9%) and tinea capitis (29,2%). Geophilic species caused only 1,3% of all infections even if this group comprised the highest number of species with two newly described ones and also Microsporum persicolor and M. fulvum wich are usually overlooked in the morphological examination. Key words: Arthroderma benhamiae – DNA sequencing – geophilic dermatopytes – ITS region of rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguinum – zoophilic dermatophytes
Katedra botaniky Přírodovědecká fakulta Univerzita Karlova Praha
Laboratoř genetiky a metabolismu hub Mikrobiologický ústav Akademie věd České republiky v v i Praha
Oddělení bakteriologie a mykologie Centrum klinických laboratoří Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě
Oddělení klinické mikrobiologie Pardubická krajská nemocnice a s Pardubice
Pracoviště parazitologie a mykologie Centrální laboratoře Nemocnice České Budějovice a s
Ústav mikrobiologie Fakultní nemocnice Plzeň Lochotín
Ústav mikrobiologie Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci
Molecular epidemiology of dermatophytoses in the Czech republic – two-year-study results
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc14077394
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20200714095025.0
- 007
- ta
- 008
- 141031s2014 xr bd f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hubka, Vít, $d 1986- $7 mzk2016904736 $u Katedra botaniky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze; Laboratoř genetiky a metabolismu hub, Mikrobiologický ústav, Akademie věd České republiky, v. v. i., Praha
- 245 10
- $a Molekulární epidemiologie dermatofytóz v České republice – výsledky dvouleté studie / $c Hubka V., Větrovský T., Dobiášová S., Skořepová M., Lysková P., Mencl K., Mallátová N., Janouškovcová H., Hanzlíčková J., Dobiáš R., Čmoková A., Stará J., Hamal P., Svobodová L., Kolařík M.
- 246 31
- $a Molecular epidemiology of dermatophytoses in the Czech republic – two-year-study results
- 520 3_
- $a Cílem práce bylo zhodnotit molekulárně genetickými metodami (MGM) spektrum původců dermatofytóz na území České republiky s rozdělením podle hlavních klinických forem. Během dvou let (červenec 2011 až červen 2013) bylo na šesti regionálních pracovištích zachyceno 3235 kultivačně pozitivních vzorků s dermatofyty. Nejvyšší počet izolátů pocházel z případů tinea unguium (55,5 %), dále t. corporis (29,2 %), t. pedis (14,6 %) a t. capitis (0,7 %). Druhová identifikace izolátů všech druhů (n = 672) s výjimkou Trichophyton rubrum (n = 2 563) byla provedena MGM (PCR-fingerprinting nebo sekvenace ITS oblasti rDNA). Pro T. rubrum byla molekulárně ověřena jen identifikace morfologicky nejednoznačných izolátů (n = 189). Celkem bylo identifikováno 14 druhů dermatofytů, přičemž nejvýznamnější změnou oproti minulosti bylo vysoké zastoupení zoofilního druhu Arthroderma benhamiae, který působil velkou část případů t. corporis (22,9 %) a t. capitis (29,2 %). Geofilní druhy působily jen 1,3 % všech infekcí, přestože se jednalo o druhově nejpočetnější skupinu, ve které byly odhaleny dva nepopsané druhy a také přehlížené druhy Microsporum persicolor a M. fulvum. Klíčová slova: Arthroderma benhamiae – DNA sekvenace – geofilní dermatofyty – ITS oblast rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguium – zoofilní dermatofyty
- 520 9_
- $a The aim of the study was to evaluate the spectrum of causative agents of the main clinical forms of dermatophytoses in the Czech Republic by molecular genetic methods (MGM). During two years (from July 2011 to June 2013), 3255 cultivation specimens were positive for dermatophytes. The highest number of specimens was isolated from tinea unguinum (55,5%), then tinea corporis (29,2%), tinea pedis (14,6%) and tinea capitis (0,7%). The identification of isolated species (n = 672) except for Trichophytom rubrum (n = 2563) was performed by MGM (PCR fingerprinting or sequencing of ITS segments of rDNA). For T. rubrum only morphologically non-clear isolates were identified (n = 189). In total, 14 species of dermatophytes were identified. The most important change noticed compared to previous results was an increased detection of Arthroderma benhamiae in the cases of tinea corporis (22,9%) and tinea capitis (29,2%). Geophilic species caused only 1,3% of all infections even if this group comprised the highest number of species with two newly described ones and also Microsporum persicolor and M. fulvum wich are usually overlooked in the morphological examination. Key words: Arthroderma benhamiae – DNA sequencing – geophilic dermatopytes – ITS region of rDNA – PCR-fingerprinting – tinea capitis – tinea corporis – tinea pedis – tinea unguinum – zoophilic dermatophytes
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a mužské pohlaví $7 D008297
- 650 _2
- $a ženské pohlaví $7 D005260
- 650 12
- $a dermatomykózy $x epidemiologie $x genetika $x mikrobiologie $7 D003881
- 650 _2
- $a tinea capitis $x epidemiologie $x genetika $x mikrobiologie $7 D014006
- 650 12
- $a tinea $x epidemiologie $x genetika $x mikrobiologie $7 D014005
- 650 _2
- $a tinea pedis $x epidemiologie $x genetika $x mikrobiologie $7 D014008
- 650 12
- $a houby $x genetika $x izolace a purifikace $x klasifikace $7 D005658
- 650 _2
- $a mykologické určovací techniky $x metody $7 D016533
- 650 _2
- $a sekvenční analýza DNA $7 D017422
- 650 _2
- $a DNA fingerprinting $7 D016172
- 650 _2
- $a ribozomální DNA $7 D004275
- 650 _2
- $a DNA fungální $x analýza $7 D004271
- 650 _2
- $a DNA primery $x diagnostické užití $7 D017931
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
- 650 _2
- $a druhová specificita $7 D013045
- 650 _2
- $a Arthrodermataceae $x genetika $x izolace a purifikace $x klasifikace $7 D003883
- 650 _2
- $a Microsporum $x genetika $x izolace a purifikace $x klasifikace $7 D008864
- 650 _2
- $a Trichophyton $x genetika $x izolace a purifikace $x klasifikace $7 D014249
- 651 _2
- $a Česká republika $x epidemiologie $7 D018153
- 653 00
- $a Arthroderma benhamiae
- 653 00
- $a zoofilní dermatofyty
- 653 00
- $a tinea unguium
- 653 00
- $a tinea corporis
- 653 00
- $a PCR-fingerprinting
- 653 00
- $a ITS oblast rDNA
- 653 00
- $a geofilní dermatofyty
- 653 00
- $a Trichophyton rubrum
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Větrovský, Tomáš, $d 1985- $7 xx0205901 $u Laboratoř environmentální mikrobiologie, Mikrobiologický ústav, Akademie věd České republiky, v. v. i., Praha
- 700 1_
- $a Dobiášová, Stanislava $7 xx0075568 $u Oddělení bakteriologie a mykologie, Centrum klinických laboratoří, Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě
- 700 1_
- $a Skořepová, Vítězslava $7 _gn010007431 $u Centrum pro dermatomykózy, Dermatovenerologická klinika 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy a Všeobecné fakultní nemocnice v Praze
- 700 1_
- $a Mosio, Petra $7 ola2012695915 $u Laboratoř lékařské mykologie, oddělení parazitologie, mykologie a mykobakteriologie Praha, Zdravotní ústav se sídlem v Ústí nad Labem, Praha
- 700 1_
- $a Mencl, Karel, $d 1954- $7 xx0101011 $u Oddělení klinické mikrobiologie, Pardubická krajská nemocnice, a. s., Pardubice
- 700 1_
- $a Mallátová, Naděžda $7 xx0119590 $u Pracoviště parazitologie a mykologie, Centrální laboratoře Nemocnice České Budějovice, a. s.
- 700 1_
- $a Janouškovcová, Helena $7 xx0224096 $u Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Plzeň-Lochotín
- 700 1_
- $a Hanzlíčková, Jana. $7 xx0275652 $u Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Plzeň-Lochotín
- 700 1_
- $a Dobiáš, Radim. $7 xx0224073 $u Oddělení bakteriologie a mykologie, Centrum klinických laboratoří, Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě
- 700 1_
- $a Čmoková, Adéla $7 xx0234049 $u Katedra botaniky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze
- 700 1_
- $a Stará, Jiřina. $7 xx0234089 $u Centrum pro dermatomykózy, Dermatovenerologická klinika 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy a Všeobecné fakultní nemocnice v Praze
- 700 1_
- $a Hamal, Petr $7 xx0060595 $u Ústav mikrobiologie, Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci
- 700 1_
- $a Svobodová, Lucie. $7 xx0145292 $u Ústav mikrobiologie, Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci
- 700 1_
- $a Kolařík, Miroslav $7 xx0234047 $u Katedra botaniky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze; Laboratoř genetiky a metabolismu hub, Mikrobiologický ústav, Akademie věd České republiky, v. v. i., Praha
- 773 0_
- $w MED00010989 $t Česko-slovenská dermatologie $x 0009-0514 $g Roč. 89, č. 4 (2014), s. 167-174
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/cesko-slovenska-dermatologie/2014-4/molekularni-epidemiologie-dermatofytoz-v-ceske-republice-vysledky-dvoulete-studie-50048 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 64 $c 115 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20141031 $b ABA008
- 991 __
- $a 20200714095021 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1046354 $s 876368
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2014 $b 89 $c 4 $d 167-174 $i 0009-0514 $m Československá dermatologie $x MED00010989 $y 75069
- LZP __
- $c NLK188 $d 20141112 $b NLK118 $a Meditorial-20141031