-
Something wrong with this record ?
Prevalence study on carbapenemase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates in Czech hospitals – results from Czech Part of European Survey on Carbapenemase--Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) [Prevalenční studie kmenů Escherichia coli a Klebsiella pneumoniae produkujících karbapenemázu v českých nemocnicích – výsledky české části studie EuSCAPE (European Survey on Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae)]
Hrabák J., Študentová V., Jakubů V., Adámková V., Dvořáková L., Balejova M., Bergerová T., Chmelařová E., Ježek P., Kabelíková P., Kolář M., Paterová P., Tejkalová R., Papagiannitsis C., Žemličková H.
Language English Country Czech Republic
Document type Research Support, Non-U.S. Gov't, Multicenter Study
Grant support
NT11032
MZ0
CEP Register
Digital library NLK
Full text - Article
Source
Source
NLK
Medline Complete (EBSCOhost)
from 2011-02-01
- Keywords
- karbapenemázy, MALDI-TOF,
- MeSH
- Drug Resistance, Bacterial MeSH
- Bacterial Proteins genetics MeSH
- beta-Lactamases genetics MeSH
- beta-Lactam Resistance * MeSH
- Enterobacteriaceae MeSH
- Escherichia coli * genetics isolation & purification MeSH
- Genetic Loci MeSH
- Klebsiella pneumoniae * genetics isolation & purification MeSH
- Humans MeSH
- Microbial Sensitivity Tests MeSH
- Hospitals MeSH
- Cross-Sectional Studies MeSH
- Sequence Analysis MeSH
- Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
- Publication type
- Multicenter Study MeSH
- Research Support, Non-U.S. Gov't MeSH
- Geographicals
- Czech Republic MeSH
Cíl: Jedním z faktorů ohrožujících současnou medicínu je šíření multirezistentních gramnegativních bakterií. V článku jsou shrnuty výsledky 6měsíční prevalenční studie zaměřené na kmeny K. pneumoniae a E. coli provedené v českých nemocnicích v rámci projektu EuSCAPE (European Survey on Carbapenemase-Producing Bacteria). Metodika: Do studie bylo zapojeno 10 nemocnic ze všech krajů České republiky. Během sledovaného období (1. listopad 2013 až 30. duben 2014) bylo shromažďováno deset prvozáchytů K. pneumoniae a E. coli necitlivých ke karba-penemům z klinických vzorků (krev, dolní cesty dýchací, moč, punktát, stěry z ran). Zároveň byl deponován první citlivý izolát zachycený od téhož pacienta a vybraného bakteriálního druhu. Byla stanovena citlivost k 15 různým antibiotikům podle metodiky EUCAST. Karbapenemázy byly identifikovány metodou MALDI-TOF MS hydrolýzy meropenemu. Kmeny produkující karbapenemázy byly podrobeny multilokusové sekvenační typizaci a byly identifikovány geny karpapenemáz. Výsledky: Během sledovaného období bylo shromážděno 30 izolátů (K. pneumoniae n = 28, E. coli n = 2) necitlivých ke karbapenemům. U pacienta přeloženého z Ukrajiny po zranění během revoluce na Majdanu byl identifikován sekvenční typ (ST) 11 K. pneumoniae produkující karbapenemázu NDM-1. Druhý izolát produkující karbapenemázu produkoval enzym OXA-48. Jednalo se o kmen K. pneumoniae ST101 identifikovaný u pacienta přijatého z komunity. Závěr: Tato prevalenční studie opět potvrdila nízkou prevalenci enterobakterií produkujících karbapenemázy (CPE) v České republice. Zároveň opět ukazuje na riziko spojené s importem CPE ze zemí s vysokou prevalencí nebo neznámou epidemiologickou situací..
Objective: One of the most important threats of current medicine is the spread of multiresistant Gram-negative bacteria. We report here data from a six-month prevalence study on carbapenemase-producing K. pneumoniae and E. coli performed in Czech hospitals participating on European Survey on Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE). Methods: Ten hospitals covering all regions of the Czech Republic were selected. During the study period (1st November 2013 to 30th April 2014), first ten carbapenem non-susceptible isolates of K. pneumoniae or E. coli isolated from non-surveillance specimens (i.e., blood, lower respiratory tract secretions, urine, puncture fluids, and wound secretions) of single successive patients were collected. Successive carbapenem-susceptible isolates of the same species were also preserved as controls. Susceptibility to 15 antibiotics was determined using EUCAST recommendations. Carbapenemase activity was detected by MALDI-TOF MS meropenem hydrolysis assay. Positive isolates were subjected for molecular typing (multi-locus sequence typing, identification of carbapenemase gene). Results: During the study period, thirty non-susceptible isolates (K. pneumoniae n = 28, E. coli n = 2) were identified in 5 hospitals. Only two of them were confirmed to be carbapenemase producers. A NDM-1-producing K. pneumoniae ST11 was recovered from a patient, transferred from Ukraine, being injured during a Maidan revolution. The second isolate, an OXA-48-producing K. pneumoniae, belonging to ST101, was recovered from a patient admitted to a hospital for an ischemic stroke. Conclusions: This study again confirmed that the Czech Republic still belongs to the countries with low prevalence of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE). Cases of CPE are usually restricted to an import from high-prevalence countries or countries with unknown epidemiological situation.
Department of Clinical Microbiology General University Hospital Prague Czech Republic
Department of Microbiology Faculty of Medicine and University Hospital in Plzen Plzen Czech Republic
Department of Microbiology Institute of Public Health Ostrava Czech Republic
Department of Microbiology Masaryk's Hospital Ústí nad Labem Czech Republic
Department of Microbiology Regional Hospital in Příbram Příbram Czech Republic
Laboratory of Bacteriology České Budějovice Hospital České Budějovice Czech Republic
Prevalenční studie kmenů Escherichia coli a Klebsiella pneumoniae produkujících karbapenemázu v českých nemocnicích – výsledky české části studie EuSCAPE (European Survey on Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae)
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc15022021
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20221031093839.0
- 007
- ta
- 008
- 150629s2015 xr b f 000 0|eng||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a eng $b cze
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hrabák, Jaroslav, $d 1981- $7 xx0025811 $u Department of Microbiology, Faculty of Medicine and University Hospital in Plzen, Plzen, Czech Republic
- 245 10
- $a Prevalence study on carbapenemase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates in Czech hospitals – results from Czech Part of European Survey on Carbapenemase--Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) / $c Hrabák J., Študentová V., Jakubů V., Adámková V., Dvořáková L., Balejova M., Bergerová T., Chmelařová E., Ježek P., Kabelíková P., Kolář M., Paterová P., Tejkalová R., Papagiannitsis C., Žemličková H.
- 246 31
- $a Prevalenční studie kmenů Escherichia coli a Klebsiella pneumoniae produkujících karbapenemázu v českých nemocnicích – výsledky české části studie EuSCAPE (European Survey on Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae)
- 520 3_
- $a Cíl: Jedním z faktorů ohrožujících současnou medicínu je šíření multirezistentních gramnegativních bakterií. V článku jsou shrnuty výsledky 6měsíční prevalenční studie zaměřené na kmeny K. pneumoniae a E. coli provedené v českých nemocnicích v rámci projektu EuSCAPE (European Survey on Carbapenemase-Producing Bacteria). Metodika: Do studie bylo zapojeno 10 nemocnic ze všech krajů České republiky. Během sledovaného období (1. listopad 2013 až 30. duben 2014) bylo shromažďováno deset prvozáchytů K. pneumoniae a E. coli necitlivých ke karba-penemům z klinických vzorků (krev, dolní cesty dýchací, moč, punktát, stěry z ran). Zároveň byl deponován první citlivý izolát zachycený od téhož pacienta a vybraného bakteriálního druhu. Byla stanovena citlivost k 15 různým antibiotikům podle metodiky EUCAST. Karbapenemázy byly identifikovány metodou MALDI-TOF MS hydrolýzy meropenemu. Kmeny produkující karbapenemázy byly podrobeny multilokusové sekvenační typizaci a byly identifikovány geny karpapenemáz. Výsledky: Během sledovaného období bylo shromážděno 30 izolátů (K. pneumoniae n = 28, E. coli n = 2) necitlivých ke karbapenemům. U pacienta přeloženého z Ukrajiny po zranění během revoluce na Majdanu byl identifikován sekvenční typ (ST) 11 K. pneumoniae produkující karbapenemázu NDM-1. Druhý izolát produkující karbapenemázu produkoval enzym OXA-48. Jednalo se o kmen K. pneumoniae ST101 identifikovaný u pacienta přijatého z komunity. Závěr: Tato prevalenční studie opět potvrdila nízkou prevalenci enterobakterií produkujících karbapenemázy (CPE) v České republice. Zároveň opět ukazuje na riziko spojené s importem CPE ze zemí s vysokou prevalencí nebo neznámou epidemiologickou situací..
- 520 9_
- $a Objective: One of the most important threats of current medicine is the spread of multiresistant Gram-negative bacteria. We report here data from a six-month prevalence study on carbapenemase-producing K. pneumoniae and E. coli performed in Czech hospitals participating on European Survey on Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE). Methods: Ten hospitals covering all regions of the Czech Republic were selected. During the study period (1st November 2013 to 30th April 2014), first ten carbapenem non-susceptible isolates of K. pneumoniae or E. coli isolated from non-surveillance specimens (i.e., blood, lower respiratory tract secretions, urine, puncture fluids, and wound secretions) of single successive patients were collected. Successive carbapenem-susceptible isolates of the same species were also preserved as controls. Susceptibility to 15 antibiotics was determined using EUCAST recommendations. Carbapenemase activity was detected by MALDI-TOF MS meropenem hydrolysis assay. Positive isolates were subjected for molecular typing (multi-locus sequence typing, identification of carbapenemase gene). Results: During the study period, thirty non-susceptible isolates (K. pneumoniae n = 28, E. coli n = 2) were identified in 5 hospitals. Only two of them were confirmed to be carbapenemase producers. A NDM-1-producing K. pneumoniae ST11 was recovered from a patient, transferred from Ukraine, being injured during a Maidan revolution. The second isolate, an OXA-48-producing K. pneumoniae, belonging to ST101, was recovered from a patient admitted to a hospital for an ischemic stroke. Conclusions: This study again confirmed that the Czech Republic still belongs to the countries with low prevalence of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE). Cases of CPE are usually restricted to an import from high-prevalence countries or countries with unknown epidemiological situation.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a průřezové studie $7 D003430
- 650 12
- $a Escherichia coli $x genetika $x izolace a purifikace $7 D004926
- 650 12
- $a Klebsiella pneumoniae $x genetika $x izolace a purifikace $7 D007711
- 650 _2
- $a Enterobacteriaceae $7 D004755
- 650 _2
- $a bakteriální proteiny $x genetika $7 D001426
- 650 _2
- $a beta-laktamasy $x genetika $7 D001618
- 650 12
- $a beta-laktamová rezistence $7 D018440
- 650 _2
- $a bakteriální léková rezistence $7 D024881
- 650 _2
- $a nemocnice $7 D006761
- 650 _2
- $a spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice $7 D019032
- 650 _2
- $a mikrobiální testy citlivosti $7 D008826
- 650 _2
- $a genetické lokusy $7 D056426
- 650 _2
- $a sekvenční analýza $7 D017421
- 651 _2
- $a Česká republika $7 D018153
- 653 00
- $a karbapenemázy
- 653 00
- $a MALDI-TOF
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 655 _2
- $a multicentrická studie $7 D016448
- 700 1_
- $a Študentová, Vendula $7 xx0247066 $u Department of Microbiology, Faculty of Medicine and University Hospital in Plzen, Plzen, Czech Republic
- 700 1_
- $a Jakubů, Vladislav $7 xx0092227 $u National Reference Laboratory for Antibiotics, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic
- 700 1_
- $a Adámková, Václava $7 xx0070151 $u Department of Clinical Microbiology, General University Hospital, Prague, Czech Republic
- 700 1_
- $a Dvořáková, Lenka $7 xx0278158 $u Department of Microbiology, Masaryk's Hospital, Ústí nad Labem, Czech Republic
- 700 1_
- $a Balejová, Magda $7 xx0256924 $u Laboratory of Bacteriology, České Budějovice Hospital, České Budějovice, Czech Republic
- 700 1_
- $a Bergerová, Tamara $7 xx0077771 $u Department of Microbiology, Faculty of Medicine and University Hospital in Plzen, Plzen, Czech Republic
- 700 1_
- $a Chmelařová, Eva $7 xx0096676 $u Department of Microbiology, Institute of Public Health, Ostrava, Czech Republic
- 700 1_
- $a Ježek, Petr $7 xx0092207 $u Department of Microbiology, Regional Hospital in Příbram, Příbram, Czech Republic
- 700 1_
- $a Kabelíková, P. $7 _AN083257 $u Department of Medical Microbiology, Motol University Hospital, Charles University, Prague, Czech Republic
- 700 1_
- $a Kolář, Milan, $d 1964- $7 jn20010310083 $u Department of Microbiology, Faculty of Medicine and Dentistry, Palacky University Olomouc and University Hospital Omouc, Olomouc, Czech Republic
- 700 1_
- $a Paterová, Pavla $7 xx0138094 $u Department of Clinical Microbiology, Faculty of Medicine and University Hospital in Hradec Králové, Hradec Králové, Charles University, Czech Republic
- 700 1_
- $a Tejkalová, Renata $7 xx0071625 $u Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Masaryk University and St. Anne's University Hospital, Brno, Czech Republic
- 700 1_
- $a Papagiannitsis, Costas C. $7 _AN079343 $u Department of Microbiology, Faculty of Medicine and University Hospital in Plzen, Plzen, Czech Republic
- 700 1_
- $a Žemličková, Helena, $7 xx0092228 $u National Reference Laboratory for Antibiotics, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic $d 1970-
- 773 0_
- $w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 64, č. 2 (2015), s. 87-91
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2015-2-6/prevalence-study-on-carbapenemase-producing-escherichia-coli-and-klebsiella-pneumoniae-isolates-in-czech-hospitals-results-from-czech-part-of-european-survey-on-carbapenemase-producing-enterobacteriaceae-euscape-52448 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 981 $c 560 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20150629 $b ABA008
- 991 __
- $a 20221031093837 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1082796 $s 904996
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2015 $b 64 $c 2 $d 87-91 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 76484
- GRA __
- $a NT11032 $p MZ0
- LZP __
- $c NLK188 $d 20150715 $b NLK118 $a Meditorial-20150629