OBJECTIVES: The aim of the study is to characterise the genomic features of three GES-producing Enterobacterales isolates from Czech hospitals. METHODS: In 2020, during a routine screening of the hospital's surfaces in Prague General Hospital, two strains (CZ862 and CZ863) that belonged to the Enterobacter cloacae complex were found to be blaGES positive. Another blaGES positive strain identified as Klebsiella oxytoca was recovered from a patient hospitalised in Pilsen. Antibiotic susceptibility profiling was done with broth microdilution assay. Conjugation/transformation experiments were performed on all three strains. Genomic DNA of the three isolates was subjected to whole genome sequencing using PacBio platform. RESULTS: Multilocus sequence types typing of CZ862 and CZ863 identified the strains as ST837 and a novel ST (ST1622). Both blaGES harbouring plasmids showed high sequence similarity and complete query coverage (100% and 99.98%) with pEcl-35771cz. Both plasmids had two copies of blaGES instead of one copy as found in pEcl-35771cz. The clinical isolate CZ598 belonged to ST180. The plasmid harboured blaGES-7 gene, cat and aac(6')-lb and the novel variant blaOXA-1011. No similar sequences were observed, suggesting a novel plasmid. CONCLUSION: The detection of the two blaGES-positive plasmids in the same hospital environment, the first report after 3 years, suggests a hidden source. This highlights the importance of the hidden sources and evolution of such plasmids on the route of spreading into clinical settings. Also, the detection of the new blaOXA-1011, which is thought in this case to be associated with carbapenem resistance, imposes a health risk if disseminated, limiting therapeutic options.

• MeSH
• beta-laktamasy * genetika   MeSH
• genomika MeSH
• Klebsiella oxytoca * genetika   MeSH
• lidé MeSH
• plazmidy genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

ST252 Enterobacter cloacae, producing GES-5 carbapenemase, was isolated in a Czech hospital. blaGES-5was part of a novel class 1 integron, In1406, which also included a new allele of the aadA15 gene cassette. In1406 was located on a ColE2-like plasmid, pEcl-35771cz (6953bp).

• MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• beta-laktamasy genetika   MeSH
• Enterobacter cloacae enzymologie   genetika   MeSH
• enterobakteriální infekce mikrobiologie   MeSH
• integrony genetika   MeSH
• lidé MeSH
• multilokusová sekvenční typizace MeSH
• nemocnice MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• MeSH
• antibakteriální látky farmakologie   MeSH
• bakteriální léková rezistence účinky léků   genetika   MeSH
• bakteriální proteiny genetika   metabolismus   MeSH
• beta-laktamasy genetika   metabolismus   MeSH
• DNA bakterií MeSH
• Enterobacter účinky léků   enzymologie   genetika   MeSH
• Enterobacteriaceae účinky léků   enzymologie   genetika   MeSH
• karbapenemy farmakologie   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Spread of carbapenemase-producing bacteria has been described all over the world. This phenomenon may be accelerated by many factors, including wars and natural disasters. In this report, we described an NDM-1-producing Klebsiella pneumonia ST11 recovered from a patient injured during the Maidan revolution in Ukraine. To our knowledge, this is the first report of a carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in Ukraine and one of several reports describing wound colonization/infection of humans injured during war.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Cíl: Jedním z faktorů ohrožujících současnou medicínu je šíření multirezistentních gramnegativních bakterií. V článku jsou shrnuty výsledky 6měsíční prevalenční studie zaměřené na kmeny K. pneumoniae a E. coli provedené v českých nemocnicích v rámci projektu EuSCAPE (European Survey on Carbapenemase-Producing Bacteria). Metodika: Do studie bylo zapojeno 10 nemocnic ze všech krajů České republiky. Během sledovaného období (1. listopad 2013 až 30. duben 2014) bylo shromažďováno deset prvozáchytů K. pneumoniae a E. coli necitlivých ke karba-penemům z klinických vzorků (krev, dolní cesty dýchací, moč, punktát, stěry z ran). Zároveň byl deponován první citlivý izolát zachycený od téhož pacienta a vybraného bakteriálního druhu. Byla stanovena citlivost k 15 různým antibiotikům podle metodiky EUCAST. Karbapenemázy byly identifikovány metodou MALDI-TOF MS hydrolýzy meropenemu. Kmeny produkující karbapenemázy byly podrobeny multilokusové sekvenační typizaci a byly identifikovány geny karpapenemáz. Výsledky: Během sledovaného období bylo shromážděno 30 izolátů (K. pneumoniae n = 28, E. coli n = 2) necitlivých ke karbapenemům. U pacienta přeloženého z Ukrajiny po zranění během revoluce na Majdanu byl identifikován sekvenční typ (ST) 11 K. pneumoniae produkující karbapenemázu NDM-1. Druhý izolát produkující karbapenemázu produkoval enzym OXA-48. Jednalo se o kmen K. pneumoniae ST101 identifikovaný u pacienta přijatého z komunity. Závěr: Tato prevalenční studie opět potvrdila nízkou prevalenci enterobakterií produkujících karbapenemázy (CPE) v České republice. Zároveň opět ukazuje na riziko spojené s importem CPE ze zemí s vysokou prevalencí nebo neznámou epidemiologickou situací..

Objective: One of the most important threats of current medicine is the spread of multiresistant Gram-negative bacteria. We report here data from a six-month prevalence study on carbapenemase-producing K. pneumoniae and E. coli performed in Czech hospitals participating on European Survey on Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE). Methods: Ten hospitals covering all regions of the Czech Republic were selected. During the study period (1st November 2013 to 30th April 2014), first ten carbapenem non-susceptible isolates of K. pneumoniae or E. coli isolated from non-surveillance specimens (i.e., blood, lower respiratory tract secretions, urine, puncture fluids, and wound secretions) of single successive patients were collected. Successive carbapenem-susceptible isolates of the same species were also preserved as controls. Susceptibility to 15 antibiotics was determined using EUCAST recommendations. Carbapenemase activity was detected by MALDI-TOF MS meropenem hydrolysis assay. Positive isolates were subjected for molecular typing (multi-locus sequence typing, identification of carbapenemase gene). Results: During the study period, thirty non-susceptible isolates (K. pneumoniae n = 28, E. coli n = 2) were identified in 5 hospitals. Only two of them were confirmed to be carbapenemase producers. A NDM-1-producing K. pneumoniae ST11 was recovered from a patient, transferred from Ukraine, being injured during a Maidan revolution. The second isolate, an OXA-48-producing K. pneumoniae, belonging to ST101, was recovered from a patient admitted to a hospital for an ischemic stroke. Conclusions: This study again confirmed that the Czech Republic still belongs to the countries with low prevalence of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE). Cases of CPE are usually restricted to an import from high-prevalence countries or countries with unknown epidemiological situation.

• Klíčová slova
• karbapenemázy, MALDI-TOF,
• MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• bakteriální proteiny genetika   MeSH
• beta-laktamasy genetika   MeSH
• beta-laktamová rezistence * MeSH
• Enterobacteriaceae MeSH
• Escherichia coli * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• genetické lokusy MeSH
• Klebsiella pneumoniae * genetika   izolace a purifikace   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• nemocnice MeSH
• průřezové studie MeSH
• sekvenční analýza MeSH
• spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• multicentrická studie MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH