Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Klinický a funkční význam vybraných polymorfizmů CASP8 a CASP9 u karcinomu prsu
[Clinical and functional importance of selected CASP8 and CASP9 polymorphisms in breast carcinoma]

Brynychová V., Václavíková R., Kubáčková K., Mrhalová M., Kodet R., Rauš K., Vrána D., Gatěk J., Bendová M., Souček P.

. 2016 ; 29 (6) : 445-453.

Jazyk čeština Země Česko

Typ dokumentu práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc16035516

Grantová podpora
NV15-25618A MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

Východiska: Kaspázy 8 a 9 (kódované geny CASP8 a CASP9) jsou hlavními iniciačními kaspázami programované buněčné smrti (apoptózy), jejíž deregulace může vést ke vzniku a progresi nádorového onemocnění i k lékové rezistenci pacientek. Cílem práce bylo ověřit, zda existuje vztah mezi výskytem polymorfizmů v CASP8 a CASP9 spojovaných s rizikem vzniku karcinomu prsu, hladinami transkriptu těchto genů (vč. hladin alternativních proti-apoptických variant) v nádorových tkáních karcinomu prsu a klinickým profilem pacientek. Materiál a metody: Polymorfizmy byly stanoveny metodami Sangerova sekvenování, pomocí high resolution melting analýzy (HRM) a alelické diskriminace ve vzorcích DNA nádorových tkání a krevních lymfocytů získaných od 60 pacientek. Hladiny celkového transkriptu CASP8, CASP9 a alternativních variant CASP8L a CASP9B byly stanoveny ve vzorcích nádorové tkáně pomocí kvantitativní PCR (polymerase chain reaction) v reálném čase. Klinicky zajímavé vztahy byly následně ověřeny na souboru vzorků DNA získaných z periferní krve od 615 pacientek. Výsledky: Výskyt haplotypu rs4645978-rs2020903-rs4646034 v CASP9 významně asocioval s hladinou celkového transkriptu CASP9 v nádorech, expresí progesteronového receptoru, expresí ERBB2 a TNBC subtypem karcinomu prsu. Významné vztahy polymorfizmu rs3834129 v CASP8 se stadiem onemocnění, polymorfizmu rs6435074 s expresí estrogenního receptoru, ERBB2 expresí a s gradem nádorů, a polymorfizmu rs6723097 s expresí ERBB2 nebyly validační studií potvrzeny. Nicméně nosičky alely A v polymorfizmu rs6723097 v CASP8 léčené hormonální terapií vykazovaly delší bezpříznakové přežívání než nosičky genotypu CC. Závěr: Současná studie odhalila dosud neznámý a potenciálně (in silico) funkční vztah haplotypu CASP9, složeného ze tří polymorfizmů typu SNP, k molekulárnímu i klinickému fenotypu karcinomu prsu. Tento vztah naznačuje, za předpokladu, že bude ověřen nezávislými studiemi, možné využití v prognostice onemocnění.

Background: Caspase-8 and caspase-9 (encoded by CASP8 and CASP9) are executive caspases of programmed cell death (apoptosis). Dysregulation of apoptosis plays an important role in cancer development, progression, and resistance to anticancer therapy. The goal of this work was to evaluate potential associations between polymorphisms in CASP8 and CASP9, previously linked to breast cancer risk, and the transcript levels of these genes (including their alternative anti-apoptotic variants) in tumor tissues and the clinical characteristics of the patients. Material and Methods: Sanger sequencing, high resolution melting (HRM) analysis, and allelic discrimination were used to identify polymorphisms in DNA samples isolated from tumor tissues and peripheral blood lymphocytes of 60 breast carcinoma patients. Total transcript levels of CASP8 and CASP9, and levels of alternative splicing variants CASP8L and CASP9B, were quantified by real-time PCR in tumor tissues. Clinically interesting associations were validated in DNA from lymphocytes of 615 breast carcinoma patients. Results: A haplotype in CASP9 composed of three polymorphisms rs4645978-rs2020903-rs4646034 was significantly associated with CASP9 expression in tumors, with the expression of the progesterone receptor and ERBB2, and with the TNBC subtype of breast carcinoma in the validation study. The associations between the rs3834129 polymorphism in CASP8 and stage of disease, rs6435074 with grade, expression of estrogen receptor and ERBB2, and rs6723097 with ERBB2 expression have not yet been validated. However, rs6723097 was associated with disease-free survival in patients treated with hormonal therapy. Conclusion: This study reveals a previously unknown and presumably functional (in silico) association between a haplotype in CASP9 and molecular and clinical phenotypes of breast carcinoma. The potential clinical utility of this association for prognostication of breast carcinoma should be evaluated by independent studies.

Clinical and functional importance of selected CASP8 and CASP9 polymorphisms in breast carcinoma

Citace poskytuje Crossref.org

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc16035516
003      
CZ-PrNML
005      
20201013142239.0
007      
ta
008      
161221s2016 xr d f 000 0|cze||
009      
AR
024    7_
$a 10.14735/amko2016445 $2 doi
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a cze $b eng
044    __
$a xr
100    1_
$a Brynychová, Veronika $u Oddělení toxikogenomiky, Státní zdravotní ústav, Praha; 3. lékařská fakulta UK v Praze $7 xx0323150
245    10
$a Klinický a funkční význam vybraných polymorfizmů CASP8 a CASP9 u karcinomu prsu / $c Brynychová V., Václavíková R., Kubáčková K., Mrhalová M., Kodet R., Rauš K., Vrána D., Gatěk J., Bendová M., Souček P.
246    31
$a Clinical and functional importance of selected CASP8 and CASP9 polymorphisms in breast carcinoma
520    3_
$a Východiska: Kaspázy 8 a 9 (kódované geny CASP8 a CASP9) jsou hlavními iniciačními kaspázami programované buněčné smrti (apoptózy), jejíž deregulace může vést ke vzniku a progresi nádorového onemocnění i k lékové rezistenci pacientek. Cílem práce bylo ověřit, zda existuje vztah mezi výskytem polymorfizmů v CASP8 a CASP9 spojovaných s rizikem vzniku karcinomu prsu, hladinami transkriptu těchto genů (vč. hladin alternativních proti-apoptických variant) v nádorových tkáních karcinomu prsu a klinickým profilem pacientek. Materiál a metody: Polymorfizmy byly stanoveny metodami Sangerova sekvenování, pomocí high resolution melting analýzy (HRM) a alelické diskriminace ve vzorcích DNA nádorových tkání a krevních lymfocytů získaných od 60 pacientek. Hladiny celkového transkriptu CASP8, CASP9 a alternativních variant CASP8L a CASP9B byly stanoveny ve vzorcích nádorové tkáně pomocí kvantitativní PCR (polymerase chain reaction) v reálném čase. Klinicky zajímavé vztahy byly následně ověřeny na souboru vzorků DNA získaných z periferní krve od 615 pacientek. Výsledky: Výskyt haplotypu rs4645978-rs2020903-rs4646034 v CASP9 významně asocioval s hladinou celkového transkriptu CASP9 v nádorech, expresí progesteronového receptoru, expresí ERBB2 a TNBC subtypem karcinomu prsu. Významné vztahy polymorfizmu rs3834129 v CASP8 se stadiem onemocnění, polymorfizmu rs6435074 s expresí estrogenního receptoru, ERBB2 expresí a s gradem nádorů, a polymorfizmu rs6723097 s expresí ERBB2 nebyly validační studií potvrzeny. Nicméně nosičky alely A v polymorfizmu rs6723097 v CASP8 léčené hormonální terapií vykazovaly delší bezpříznakové přežívání než nosičky genotypu CC. Závěr: Současná studie odhalila dosud neznámý a potenciálně (in silico) funkční vztah haplotypu CASP9, složeného ze tří polymorfizmů typu SNP, k molekulárnímu i klinickému fenotypu karcinomu prsu. Tento vztah naznačuje, za předpokladu, že bude ověřen nezávislými studiemi, možné využití v prognostice onemocnění.
520    9_
$a Background: Caspase-8 and caspase-9 (encoded by CASP8 and CASP9) are executive caspases of programmed cell death (apoptosis). Dysregulation of apoptosis plays an important role in cancer development, progression, and resistance to anticancer therapy. The goal of this work was to evaluate potential associations between polymorphisms in CASP8 and CASP9, previously linked to breast cancer risk, and the transcript levels of these genes (including their alternative anti-apoptotic variants) in tumor tissues and the clinical characteristics of the patients. Material and Methods: Sanger sequencing, high resolution melting (HRM) analysis, and allelic discrimination were used to identify polymorphisms in DNA samples isolated from tumor tissues and peripheral blood lymphocytes of 60 breast carcinoma patients. Total transcript levels of CASP8 and CASP9, and levels of alternative splicing variants CASP8L and CASP9B, were quantified by real-time PCR in tumor tissues. Clinically interesting associations were validated in DNA from lymphocytes of 615 breast carcinoma patients. Results: A haplotype in CASP9 composed of three polymorphisms rs4645978-rs2020903-rs4646034 was significantly associated with CASP9 expression in tumors, with the expression of the progesterone receptor and ERBB2, and with the TNBC subtype of breast carcinoma in the validation study. The associations between the rs3834129 polymorphism in CASP8 and stage of disease, rs6435074 with grade, expression of estrogen receptor and ERBB2, and rs6723097 with ERBB2 expression have not yet been validated. However, rs6723097 was associated with disease-free survival in patients treated with hormonal therapy. Conclusion: This study reveals a previously unknown and presumably functional (in silico) association between a haplotype in CASP9 and molecular and clinical phenotypes of breast carcinoma. The potential clinical utility of this association for prognostication of breast carcinoma should be evaluated by independent studies.
650    _2
$a lidé $7 D006801
650    _2
$a lidé středního věku $7 D008875
650    _2
$a senioři $7 D000368
650    _2
$a ženské pohlaví $7 D005260
650    12
$a nádory prsu $x genetika $7 D001943
650    12
$a kaspasy $7 D020169
650    12
$a polymorfismus genetický $7 D011110
650    _2
$a validační studie jako téma $7 D054928
650    _2
$a sekvenční analýza $x metody $7 D017421
650    _2
$a haplotypy $7 D006239
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Václavíková, Radka $u Oddělení toxikogenomiky, Státní zdravotní ústav, Praha $7 xx0142918
700    1_
$a Kubáčková, Kateřina $u Onkologická klinika 2. LF UK a FN Motol, Praha $7 xx0083614
700    1_
$a Mrhalová, Marcela $u Ústav patologie a molekulární medicíny, 2. LF UK a FN Motol, Praha $7 xx0062381
700    1_
$a Kodet, Roman, $u Ústav patologie a molekulární medicíny, 2. LF UK a FN Motol, Praha $d 1953- $7 nlk19990073380
700    1_
$a Rauš, Karel $u Ústav pro péči o matku a dítě, Praha $7 xx0128450
700    1_
$a Vrána, David $u Onkologická klinika LF UP a FN Olomouc $7 xx0103187
700    1_
$a Gatěk, Jiří, $u Chirurgické oddělení, Nemocnice Atlas, Zlín $d 1950- $7 xx0052958
700    1_
$a Bendová, Marie, $u Gynekologicko-porodnická klinika 3. LF UK a FN Královské Vinohrady, Praha $d 1957- $7 xx0075729
700    1_
$a Souček, Pavel $u Oddělení toxikogenomiky, Státní zdravotní ústav, Praha $7 xx0060511
773    0_
$w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 29, č. 6 (2016), s. 445-453
856    41
$u https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/419/5102.pdf $y plný text volně přístupný
910    __
$a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y 4 $z 0
990    __
$a 20161221 $b ABA008
991    __
$a 20201013142236 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1179193 $s 960223
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2016 $b 29 $c 6 $d 445-453 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 99619
GRA    __
$a NV15-25618A $p MZ0
LZP    __
$c NLK109 $d 20170111 $b NLK111 $a Meditorial-20161221

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat ...

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...