-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Klinický a funkční význam vybraných polymorfizmů CASP8 a CASP9 u karcinomu prsu
[Clinical and functional importance of selected CASP8 and CASP9 polymorphisms in breast carcinoma]
Brynychová V., Václavíková R., Kubáčková K., Mrhalová M., Kodet R., Rauš K., Vrána D., Gatěk J., Bendová M., Souček P.
Jazyk čeština Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
Grantová podpora
NV15-25618A
MZ0
CEP - Centrální evidence projektů
Digitální knihovna NLK
Plný text - Článek
Ročník
Zdroj
Zdroj
NLK
Medline Complete (EBSCOhost)
od 2011-01-01
- MeSH
- haplotypy MeSH
- kaspasy * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * genetika MeSH
- polymorfismus genetický * MeSH
- sekvenční analýza metody MeSH
- senioři MeSH
- validační studie jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Východiska: Kaspázy 8 a 9 (kódované geny CASP8 a CASP9) jsou hlavními iniciačními kaspázami programované buněčné smrti (apoptózy), jejíž deregulace může vést ke vzniku a progresi nádorového onemocnění i k lékové rezistenci pacientek. Cílem práce bylo ověřit, zda existuje vztah mezi výskytem polymorfizmů v CASP8 a CASP9 spojovaných s rizikem vzniku karcinomu prsu, hladinami transkriptu těchto genů (vč. hladin alternativních proti-apoptických variant) v nádorových tkáních karcinomu prsu a klinickým profilem pacientek. Materiál a metody: Polymorfizmy byly stanoveny metodami Sangerova sekvenování, pomocí high resolution melting analýzy (HRM) a alelické diskriminace ve vzorcích DNA nádorových tkání a krevních lymfocytů získaných od 60 pacientek. Hladiny celkového transkriptu CASP8, CASP9 a alternativních variant CASP8L a CASP9B byly stanoveny ve vzorcích nádorové tkáně pomocí kvantitativní PCR (polymerase chain reaction) v reálném čase. Klinicky zajímavé vztahy byly následně ověřeny na souboru vzorků DNA získaných z periferní krve od 615 pacientek. Výsledky: Výskyt haplotypu rs4645978-rs2020903-rs4646034 v CASP9 významně asocioval s hladinou celkového transkriptu CASP9 v nádorech, expresí progesteronového receptoru, expresí ERBB2 a TNBC subtypem karcinomu prsu. Významné vztahy polymorfizmu rs3834129 v CASP8 se stadiem onemocnění, polymorfizmu rs6435074 s expresí estrogenního receptoru, ERBB2 expresí a s gradem nádorů, a polymorfizmu rs6723097 s expresí ERBB2 nebyly validační studií potvrzeny. Nicméně nosičky alely A v polymorfizmu rs6723097 v CASP8 léčené hormonální terapií vykazovaly delší bezpříznakové přežívání než nosičky genotypu CC. Závěr: Současná studie odhalila dosud neznámý a potenciálně (in silico) funkční vztah haplotypu CASP9, složeného ze tří polymorfizmů typu SNP, k molekulárnímu i klinickému fenotypu karcinomu prsu. Tento vztah naznačuje, za předpokladu, že bude ověřen nezávislými studiemi, možné využití v prognostice onemocnění.
Background: Caspase-8 and caspase-9 (encoded by CASP8 and CASP9) are executive caspases of programmed cell death (apoptosis). Dysregulation of apoptosis plays an important role in cancer development, progression, and resistance to anticancer therapy. The goal of this work was to evaluate potential associations between polymorphisms in CASP8 and CASP9, previously linked to breast cancer risk, and the transcript levels of these genes (including their alternative anti-apoptotic variants) in tumor tissues and the clinical characteristics of the patients. Material and Methods: Sanger sequencing, high resolution melting (HRM) analysis, and allelic discrimination were used to identify polymorphisms in DNA samples isolated from tumor tissues and peripheral blood lymphocytes of 60 breast carcinoma patients. Total transcript levels of CASP8 and CASP9, and levels of alternative splicing variants CASP8L and CASP9B, were quantified by real-time PCR in tumor tissues. Clinically interesting associations were validated in DNA from lymphocytes of 615 breast carcinoma patients. Results: A haplotype in CASP9 composed of three polymorphisms rs4645978-rs2020903-rs4646034 was significantly associated with CASP9 expression in tumors, with the expression of the progesterone receptor and ERBB2, and with the TNBC subtype of breast carcinoma in the validation study. The associations between the rs3834129 polymorphism in CASP8 and stage of disease, rs6435074 with grade, expression of estrogen receptor and ERBB2, and rs6723097 with ERBB2 expression have not yet been validated. However, rs6723097 was associated with disease-free survival in patients treated with hormonal therapy. Conclusion: This study reveals a previously unknown and presumably functional (in silico) association between a haplotype in CASP9 and molecular and clinical phenotypes of breast carcinoma. The potential clinical utility of this association for prognostication of breast carcinoma should be evaluated by independent studies.
Chirurgické oddělení Nemocnice Atlas Zlín
Gynekologicko porodnická klinika 3 LF UK a FN Královské Vinohrady Praha
Oddělení toxikogenomiky Státní zdravotní ústav Praha
Onkologická klinika 2 LF UK a FN Motol Praha
Onkologická klinika LF UP a FN Olomouc
Ústav patologie a molekulární medicíny 2 LF UK a FN Motol Praha
Clinical and functional importance of selected CASP8 and CASP9 polymorphisms in breast carcinoma
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc16035516
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20201013142239.0
- 007
- ta
- 008
- 161221s2016 xr d f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.14735/amko2016445 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Brynychová, Veronika $u Oddělení toxikogenomiky, Státní zdravotní ústav, Praha; 3. lékařská fakulta UK v Praze $7 xx0323150
- 245 10
- $a Klinický a funkční význam vybraných polymorfizmů CASP8 a CASP9 u karcinomu prsu / $c Brynychová V., Václavíková R., Kubáčková K., Mrhalová M., Kodet R., Rauš K., Vrána D., Gatěk J., Bendová M., Souček P.
- 246 31
- $a Clinical and functional importance of selected CASP8 and CASP9 polymorphisms in breast carcinoma
- 520 3_
- $a Východiska: Kaspázy 8 a 9 (kódované geny CASP8 a CASP9) jsou hlavními iniciačními kaspázami programované buněčné smrti (apoptózy), jejíž deregulace může vést ke vzniku a progresi nádorového onemocnění i k lékové rezistenci pacientek. Cílem práce bylo ověřit, zda existuje vztah mezi výskytem polymorfizmů v CASP8 a CASP9 spojovaných s rizikem vzniku karcinomu prsu, hladinami transkriptu těchto genů (vč. hladin alternativních proti-apoptických variant) v nádorových tkáních karcinomu prsu a klinickým profilem pacientek. Materiál a metody: Polymorfizmy byly stanoveny metodami Sangerova sekvenování, pomocí high resolution melting analýzy (HRM) a alelické diskriminace ve vzorcích DNA nádorových tkání a krevních lymfocytů získaných od 60 pacientek. Hladiny celkového transkriptu CASP8, CASP9 a alternativních variant CASP8L a CASP9B byly stanoveny ve vzorcích nádorové tkáně pomocí kvantitativní PCR (polymerase chain reaction) v reálném čase. Klinicky zajímavé vztahy byly následně ověřeny na souboru vzorků DNA získaných z periferní krve od 615 pacientek. Výsledky: Výskyt haplotypu rs4645978-rs2020903-rs4646034 v CASP9 významně asocioval s hladinou celkového transkriptu CASP9 v nádorech, expresí progesteronového receptoru, expresí ERBB2 a TNBC subtypem karcinomu prsu. Významné vztahy polymorfizmu rs3834129 v CASP8 se stadiem onemocnění, polymorfizmu rs6435074 s expresí estrogenního receptoru, ERBB2 expresí a s gradem nádorů, a polymorfizmu rs6723097 s expresí ERBB2 nebyly validační studií potvrzeny. Nicméně nosičky alely A v polymorfizmu rs6723097 v CASP8 léčené hormonální terapií vykazovaly delší bezpříznakové přežívání než nosičky genotypu CC. Závěr: Současná studie odhalila dosud neznámý a potenciálně (in silico) funkční vztah haplotypu CASP9, složeného ze tří polymorfizmů typu SNP, k molekulárnímu i klinickému fenotypu karcinomu prsu. Tento vztah naznačuje, za předpokladu, že bude ověřen nezávislými studiemi, možné využití v prognostice onemocnění.
- 520 9_
- $a Background: Caspase-8 and caspase-9 (encoded by CASP8 and CASP9) are executive caspases of programmed cell death (apoptosis). Dysregulation of apoptosis plays an important role in cancer development, progression, and resistance to anticancer therapy. The goal of this work was to evaluate potential associations between polymorphisms in CASP8 and CASP9, previously linked to breast cancer risk, and the transcript levels of these genes (including their alternative anti-apoptotic variants) in tumor tissues and the clinical characteristics of the patients. Material and Methods: Sanger sequencing, high resolution melting (HRM) analysis, and allelic discrimination were used to identify polymorphisms in DNA samples isolated from tumor tissues and peripheral blood lymphocytes of 60 breast carcinoma patients. Total transcript levels of CASP8 and CASP9, and levels of alternative splicing variants CASP8L and CASP9B, were quantified by real-time PCR in tumor tissues. Clinically interesting associations were validated in DNA from lymphocytes of 615 breast carcinoma patients. Results: A haplotype in CASP9 composed of three polymorphisms rs4645978-rs2020903-rs4646034 was significantly associated with CASP9 expression in tumors, with the expression of the progesterone receptor and ERBB2, and with the TNBC subtype of breast carcinoma in the validation study. The associations between the rs3834129 polymorphism in CASP8 and stage of disease, rs6435074 with grade, expression of estrogen receptor and ERBB2, and rs6723097 with ERBB2 expression have not yet been validated. However, rs6723097 was associated with disease-free survival in patients treated with hormonal therapy. Conclusion: This study reveals a previously unknown and presumably functional (in silico) association between a haplotype in CASP9 and molecular and clinical phenotypes of breast carcinoma. The potential clinical utility of this association for prognostication of breast carcinoma should be evaluated by independent studies.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a lidé středního věku $7 D008875
- 650 _2
- $a senioři $7 D000368
- 650 _2
- $a ženské pohlaví $7 D005260
- 650 12
- $a nádory prsu $x genetika $7 D001943
- 650 12
- $a kaspasy $7 D020169
- 650 12
- $a polymorfismus genetický $7 D011110
- 650 _2
- $a validační studie jako téma $7 D054928
- 650 _2
- $a sekvenční analýza $x metody $7 D017421
- 650 _2
- $a haplotypy $7 D006239
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Václavíková, Radka $u Oddělení toxikogenomiky, Státní zdravotní ústav, Praha $7 xx0142918
- 700 1_
- $a Kubáčková, Kateřina $u Onkologická klinika 2. LF UK a FN Motol, Praha $7 xx0083614
- 700 1_
- $a Mrhalová, Marcela $u Ústav patologie a molekulární medicíny, 2. LF UK a FN Motol, Praha $7 xx0062381
- 700 1_
- $a Kodet, Roman, $u Ústav patologie a molekulární medicíny, 2. LF UK a FN Motol, Praha $d 1953- $7 nlk19990073380
- 700 1_
- $a Rauš, Karel $u Ústav pro péči o matku a dítě, Praha $7 xx0128450
- 700 1_
- $a Vrána, David $u Onkologická klinika LF UP a FN Olomouc $7 xx0103187
- 700 1_
- $a Gatěk, Jiří, $u Chirurgické oddělení, Nemocnice Atlas, Zlín $d 1950- $7 xx0052958
- 700 1_
- $a Bendová, Marie, $u Gynekologicko-porodnická klinika 3. LF UK a FN Královské Vinohrady, Praha $d 1957- $7 xx0075729
- 700 1_
- $a Souček, Pavel $u Oddělení toxikogenomiky, Státní zdravotní ústav, Praha $7 xx0060511
- 773 0_
- $w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 29, č. 6 (2016), s. 445-453
- 856 41
- $u https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/419/5102.pdf $y plný text volně přístupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20161221 $b ABA008
- 991 __
- $a 20201013142236 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1179193 $s 960223
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2016 $b 29 $c 6 $d 445-453 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 99619
- GRA __
- $a NV15-25618A $p MZ0
- LZP __
- $c NLK109 $d 20170111 $b NLK111 $a Meditorial-20161221