Genomic DNA regions whose complementary strands are prone to UV light-induced crosslinking
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
11368157
DOI
10.1006/abbi.2001.2280
PII: S0003-9861(01)92280-5
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- denaturace nukleových kyselin MeSH
- DNA chemie účinky záření MeSH
- elektroforéza v agarovém gelu MeSH
- genom virový MeSH
- opičí virus SV40 genetika účinky záření MeSH
- plazmidy genetika účinky záření MeSH
- restrikční enzymy metabolismus MeSH
- ultrafialové záření * MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- DNA MeSH
- restrikční enzymy MeSH
We prepared an extensive set of DNA restriction fragments, irradiated them with UV light, and detected crosslinked complementary strands by electrophoresis in denaturing agarose gels. These experimental data were quantified by densitometry to determine tetranucleotide contributions to crosslinking. The tetranucleotide contributions were used to predict genomic maps of the crosslinking probability that permitted us to identify two strongly crosslinking genomic regions having 295 and 389 base pairs in length. The two sequences shared the (ATTTTATA).(TATAAAAT) octamer, which is a candidate for the hotspot of UV light-induced crosslinking between the complementary strands of DNA.
Citace poskytuje Crossref.org
Mapping the B-A conformational transition along plasmid DNA
