Identification of tunnels in proteins, nucleic acids, inorganic materials and molecular ensembles
Jazyk angličtina Země Německo Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem, technické zprávy
PubMed
17183511
DOI
10.1002/biot.200600208
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- algoritmy MeSH
- anorganické látky chemie MeSH
- chemické modely * MeSH
- makromolekulární látky chemie MeSH
- molekulární konformace * MeSH
- molekulární modely * MeSH
- nukleové kyseliny chemie ultrastruktura MeSH
- počítačová grafika MeSH
- počítačová simulace MeSH
- proteiny chemie ultrastruktura MeSH
- software MeSH
- uživatelské rozhraní počítače MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- technické zprávy MeSH
- Názvy látek
- anorganické látky MeSH
- makromolekulární látky MeSH
- nukleové kyseliny MeSH
- proteiny MeSH
The knowledge of the access paths connecting interior of molecular systems with surrounding environment is important for the understanding of structurefunction relationships and engineering of molecules for biotechnological applications. CAVER is a computer program developed for calculations of tunnels, channels or pores in the biomolecules, inorganic materials and molecular ensembles. The algorithm performs a skeleton search based on a reciprocal distance function grid. The algorithm is implemented in the stand-alone version, web version and as plug-in for PyMol. CAVER is available from the website http://loschmidt.chemi.muni.cz/caver.
Citace poskytuje Crossref.org
CAVER 3.0: a tool for the analysis of transport pathways in dynamic protein structures
MOLEonline 2.0: interactive web-based analysis of biomacromolecular channels
