LC MALDI-TOF MS/MS and LC ESI FTMS analyses of HLA-B27 associated peptides isolated from peripheral blood cells
Jazyk angličtina Země Nizozemsko Médium print-electronic
Typ dokumentu srovnávací studie, časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
18160138
DOI
10.1016/j.imlet.2007.11.011
PII: S0165-2478(07)00297-0
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- alkoholoxidoreduktasy MeSH
- ankylózující spondylitida genetika metabolismus MeSH
- autoimunita genetika MeSH
- databáze proteinů MeSH
- dospělí MeSH
- endopeptidasy metabolismus MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- histony genetika metabolismus MeSH
- HLA-B27 antigen analýza imunologie izolace a purifikace MeSH
- hmotnostní spektrometrie s elektrosprejovou ionizací * MeSH
- interakční proteinové domény a motivy MeSH
- krevní buňky imunologie metabolismus MeSH
- lidé MeSH
- peptidové mapování * MeSH
- peptidy analýza imunologie izolace a purifikace MeSH
- proteiny tepelného šoku HSC70 krev genetika imunologie MeSH
- proteiny vázající GTP - alfa-podjednotky Gs krev genetika imunologie MeSH
- sekvenční seřazení MeSH
- software MeSH
- spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- srovnávací studie MeSH
- Názvy látek
- alkoholoxidoreduktasy MeSH
- D-2-hydroxyacid dehydrogenase MeSH Prohlížeč
- endopeptidasy MeSH
- histony MeSH
- HLA-B27 antigen MeSH
- HSPA8 protein, human MeSH Prohlížeč
- peptidy MeSH
- proteiny tepelného šoku HSC70 MeSH
- proteiny vázající GTP - alfa-podjednotky Gs MeSH
Peptides eluted from peripheral blood cells of HLA-B*2705 healthy donor were analyzed by LC MALDI MS/MS and LC ESI FTMS techniques. The sequences of 92 peptide ligands identified from one healthy blood donor by LC MALDI-TOF MS/MS were compared with those previously published from in vitro long-term cell cultures available in SYFPEITHI database and splenocytes. It was found that 18 sequences confirmed within 1ppm mass error by LC ESI FTMS were already described and 3 of them matched with those previously reported from HLA-B*2705 splenocytes. Another 38 sequences validated within the same mass error were not found in SYFPEITHI database and are identified here for the first time. Finally, 36 sequences (5 sequences already published in SYFPEITHI database) were evaluated by LC MALDI-TOF MS/MS but no matches in the list of monoisotopic masses obtained from LC ESI FTMS were found.
Citace poskytuje Crossref.org
Paxillin-dependent regulation of IGF2 and H19 gene cluster expression
