The objective of this study was to use whole-genome sequencing (WGS) to screen for genes encoding for antibiotic resistance, fitness and virulence in Cronobacter sakazakii strains that had been isolated from food and powdered-milk-producing environments. Virulence (VGs) and antibiotic-resistance genes (ARGs) were detected with the Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD) platform, ResFinder and PlasmidFinder tools. Susceptibility testing was performed using disk diffusion. Fifteen presumptive strains of Cronobacter spp. were identified by MALDI-TOF MS and ribosomal-MLST. Nine C. sakazakii strains were found in the meningitic pathovar ST4: two were ST83 and one was ST1. The C. sakazakii ST4 strains were further distinguished using core genome MLST based on 3678 loci. Almost all (93%) strains were resistant to cephalotin and 33% were resistant to ampicillin. In addition, 20 ARGs, mainly involved in regulatory and efflux antibiotics, were detected. Ninety-nine VGs were detected that encoded for OmpA, siderophores and genes involved in metabolism and stress. The IncFIB (pCTU3) plasmid was detected, and the prevalent mobile genetic elements (MGEs) were ISEsa1, ISEc52 and ISEhe3. The C. sakazakii isolates analyzed in this study harbored ARGs and VGs, which could have contributed to their persistence in powdered-milk-producing environments, and increase the risk of infection in susceptible population groups.

• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

OBJECTIVES: Maintaining cleanrooms in a hospital is a key part of preventing healthcare-associated infections (HAIs). The aim of this work was to verify the effectiveness of anti-epidemic measures to ensure air quality in cleanrooms in a tertiary care hospital. METHODS: The study was based on the application of anti-epidemic measures and verification of their effectiveness by regular indoor air monitoring between the years 2014-2019. Monitoring was performed according to a recommended procedure based on European standards for cleanrooms. RESULTS: The results demonstrate a reduction in the number of airborne particles and the number of colonies, as well as the elimination of fungi and conditioned pathogens in air samples. CONCLUSIONS: The authors emphasize the importance of established anti-epidemic measures and regular monitoring for the prevention of HAIs.

• MeSH
• centra terciární péče MeSH
• houby MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí * prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologie vzduchu MeSH
• monitorování životního prostředí metody   MeSH
• znečištění vzduchu ve vnitřním prostředí * analýza   prevence a kontrola   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Akutní leukemie jsou maligní onemocnění hematopoezy, která se tradičně dělí dle postižené buněčné linie na akutní lymfoblastická (ALL) a akutní myeloidní leukemie. Z pohledu incidence se jedná o vzácná onemocnění – v ČR jsou ročně diagnostikovány 2–3 nové případy akutní myeloidní leukemie na 100 tis. obyvatel a méně než 1 nový případ akutní lymfoblastické leukemie na 100 tis. obyvatel. Příčiny vzniku akutní leukemie jsou pouze málo známé. Prokázanými rizikovými faktory jsou věk, ionizující záření nebo Downův syndrom. Kromě nich byla popsána celá řada dalších vlivů či expozic, které se pravděpodobně uplatňují při rozvoji akutní leukemie a až několikanásobně zvyšují riziko vzniku těchto hematologických malignit. Jedná se např. o fyzikální nebo chemické faktory, genetické a familiární predispozice či další onemocnění. Předkládaná přehledová práce shrnuje poznatky o etiologii akutní leukemie publikované od roku 2000. Popisuje jejich epidemiologické charakteristiky a rizikové faktory, zároveň nastiňuje možnosti prevence.

Acute leukaemias are malignant diseases of haematopoiesis, traditionally classified according to the affected cell line as acute lymphoblastic and acute myelogenous leukaemia. In terms of incidence, acute leukaemias are rare diseases – in the Czech Republic, only 2–3 new acute myelogenous leukaemia cases/100 000 population are diagnosed annually and less than 1 new case of acute lymphoblastic leukaemia/100 000 residents. The causes of acute leukaemias are still poorly understood. The established risk factors are age, ionizing radiation or Down’s syndrome. Moreover, a number of potential risk factors have been described to play a role in development of acute leukaemias and to multiply the risk, such as physical factors, chemicals, genetic and familial predispositions or other diseases. The presented review summarizes the knowledge of the aetiology of acute leukaemias published since 2000. It describes their epidemiological characteristics and risk factors and outlines the possibilities for their prevention.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie * epidemiologie   etiologie   prevence a kontrola   MeSH
• incidence MeSH
• lidé MeSH
• rizikové faktory MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Vztah mezi spalničkovým virem a lidským imunitním systémem je značně komplikovaný. Virus buňky imunitního systému potřebuje k navození systémové infekce, ve výsledku je ale imunitními mechanismy z organismu eliminován. Imunitní systém si ale z této interakce odnáší poškození ve formě ztráty části dosud získaného antigenního spektra paměťových buněk. Tato tzv. imunitní amnézie může po dobu minimálně několika měsíců zvyšovat náchylnost k nesouvisejícím infekcím. Účinným nástrojem v boji proti spalničkám je očkování, které vedlo k rozsáhlé eliminaci infekce. V posledních letech ale incidence spalniček vlivem různých faktorů opět narůstá. Pro zvládnutí tohoto trendu je důležité mít přehled o stavu imunity v populaci. Problémem pro jeho získání ale může být variabilita výsledků získaných v různých laboratořích komerčními soupravami různých výrobců, která vyplývá ze srovnání recentně publikovaných séroprevalenčních studií.

The relationship between measles virus and the human immune system is quite complicated. The virus needs cells of the immune system to induce a systemic infection, but as a result it is eliminated from the body by immune mechanisms. However, the immune system takes damage from this interaction in the form of the loss of part of the antigenic spectrum of memory cells acquired so far. This so-called immune amnesia can increase the susceptibility to unrelated infections for at least a few months. Vaccination is the effective tool in the fight against measles, which has led to extensive elimination of the infection. In recent years, however, the incidence of measles has increased again due to various factors. To cope with this trend, it is important to have an overview of the state of immunity in the population. The variability of the results obtained in different laboratories with commercial kits from different manufacturers, which results from a comparison of recently published seroprevalence studies, may be a problem for obtaining it.

• MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• infekce viry z rodu Morbillivirus imunologie   patofyziologie   MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• neutralizační testy metody   statistika a číselné údaje   MeSH
• novorozenec MeSH
• očkovací schéma MeSH
• protilátky virové analýza   MeSH
• séroepidemiologické studie MeSH
• spalničky * epidemiologie   imunologie   patofyziologie   prevence a kontrola   MeSH
• vakcína proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• novorozenec MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Dodržování aseptických podmínek v prostoru operačního sálu je klíčovou součástí v prevenci infekcí spojených se zdravotní péčí. Cílem práce bylo poukázat na efekt monitoringu a hodnocení zavedených protiepidemických opatření na operačních sálech sloužících i jako tkáňová zařízení ve zdravotnickém zařízení terciárního typu za účelem zajištění kvality vnitřního ovzduší v prevenci vzniku závažných pooperačních komplikací u pacienta. Práce metodicky popisuje nastavený monitoring vnitřního ovzduší operačních sálů v periodicitě 1krát za šest měsíců pomocí měření počtu částic ve vznosu a mikrobiologickou kontrolou kvality vnitřního ovzduší aktivní metodou pomocí aeroskopu. Pro hodnocení jsou použity limity platné pro čisté prostory ve farmacii a tkáňová zařízení vycházející ze správné výrobní praxe a technickou normu EN ISO 14644-1: Čisté prostory a příslušné řízení prostředí. Ve výsledcích uvádějí autoři dvě kazuistiky, kterými zdůrazňují význam monitoringu a zejména jeho přínos pro nastavení protiepidemických podmínek na operačních sálech v prevenci šíření infekcí spojených se zdravotní péčí, s ohledem na přítomnost personálu.

Adherence to aseptic conditions in the operating room is a key component in the prevention of healthcare associated infections. The aim of the work was to point out the effect of monitoring and evaluation of established anti-epidemic measures in operating rooms serving as tissue facilities in tertiary-type medical facilities in the order to ensure indoor air quality in preventing serious postoperative complications in patients. The work methodically describes the set monitoring of the indoor air of operating rooms in the periodicity once every six months by measuring the number of particles in the air and microbiological control of indoor air quality by an active method using an aeroscope. The limits applicable to clean rooms in pharmacy and tissue establishments based on good manufacturing practice and the technical standard EN ISO 14644-1: Clean rooms and relevant environmental management are used for evaluation. In the results, the authors present two case reports, which emphasize the importance of monitoring and especially its contribution to the setting of anti-epidemic conditions in operating rooms in the prevention of the spread of healthcare-associated infections, with regards to the presence of staff.

• Klíčová slova
• monitoring vnitřního ovzduš,
• MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiologie vzduchu MeSH
• operační sály * MeSH
• prach MeSH
• prostředí kontrolované MeSH
• znečištění vzduchu ve vnitřním prostředí * prevence a kontrola   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

Lymeská borelióza je relativně nedávno popsané multisystémové onemocnění, způsobené spirochetami z druhového komplexu Borrelia burgdor-feri. Přestože u většiny nemocných je efektivní antibiotická terapie, u části pacientů i po jejím prodělání dlouhodobě perzistují některé příznaky. I když příčina tohoto jevu není dosud známá, není prokázáno, že jej způsobuje aktivní infekce. Proto je často používaný termín chronická lymeská borelióza nepřesný a měli bychom upřednostňovat pojem postboreliový syndrom. Variabilita příznaků a diagnostické obtíže vedou k tomu, že je borelióza především mezi příznivci tzv. alternativní medicíny často prezentována jako takřka univerzální původce zdravotních potíží a především na internetu lze nalézt řadu návodů na její léčbu, většinou založených na dlouhodobé kombinované antibiotické terapii či použití nejrůznějších potravinových doplňků. Tyto postupy s sebou nesou řadu rizik, včetně zanedbání jiné reálné diagnózy. Chybí také reálný důkaz o jejich možné efektivitě. Ve světle současných znalostí je tak nelze považovat za postupy lege artis.

Lyme diseases is a relatively recently described multisystem disease caused by Borrelia burgdorferi species complex spirochetes. Although antibiotic therapy is effective among most of the cases, some symptoms may persist even after long-term therapy. Although the cause of this phenomenon is not yet known, it is not shown to be caused by active infection. Therefore, the often used term chronic Lyme diseases is ina-ccurate and we should prefer the term post Lyme disease syndrome. The variability of symptoms and diagnostic difficulties lead to the fact that Lyme disease, especially among the so-called alternative medicine supporters, is often presented as almost universal cause of health problems and above all a number of instructions for its treatment can be found on the Internet, mostly based on long-term combined antibiotic therapy or use of various food supplements. These procedures are associated with number of risks, including neglecting real diagnosis. There is also no real evidence of its possible effectiveness. Thus, those procedures cannot be regarded as lege artis.

• MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• Borrelia burgdorferi patogenita   MeSH
• chronická nemoc MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• ELISA MeSH
• infekce bakteriemi rodu Borrelia terapie   MeSH
• lidé MeSH
• lymeská nemoc terapie   MeSH
• postboreliový syndrom * diagnóza   terapie   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Spalničky jsou vysoce nakažlivé onemocnění virového původu s celosvětovým rozšířením. Vyskytují se zejména v zemích s nízkou proočkovaností, to znamená většinou v zemích rozvojových, ze kterých se mohou dále šířit. Pro spalničky vyskytující se naopak v podmínkách vyspělých zemí je typické, že jsou většinou importovány ze zahraničí; neméně významnou skupinu nákaz však tvoří cirkulace viru ve specifických sociálních skupinách osob odmítajících očkování (z náboženských důvodů, důsledkem dezinformací, volby alternativního způsobu života apod.). V posledních letech je v Evropě hlášen několikanásobný vzestup incidence tohoto onemocnění, zejména na Ukrajině, v Rumunsku, Rakousku, Belgii, Německu, Itálii, Španělsku, České republice a dalších zemích. V souvislosti s nárůstem onemocnění spalničkami jsou zaznamenána i četná úmrtí. Nejvýznamnějším způsobem, jak lze vzniku tohoto onemocnění zabránit, je důsledné očkování celé populace podle platného očkovacího schématu.

Measles is a highly contagious viral disease. It is a worldwide spread disease occurring especially in countries with a low vaccination level, that means developing countries in particular, from which it can be spread further. In developed countries cases of measles are mostly imported; an equally important group of infections, however, is the circulation of the virus in specific social groups rejecting vaccination (e.g.religious reasons, as a result of disinformation, consequence of an alternative lifestyle). In recent years, the incidence of measles is increasing in Europe, especially in Ukraine, Romania, Austria, Belgium, Germany, Italy, Spain, the Czech Republic, and other countries. Deaths due to measles were also recorded. Consistent vaccination of the whole population based on a valid vaccination scheme is the most important measure to prevent measles occurrence.

• MeSH
• lidé MeSH
• spalničky * diagnóza   epidemiologie   patofyziologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH
• Geografické názvy
• Evropa MeSH

Východiska: Akutní leukemie (AL) je heterogenní skupina maligních onemocnění hematopoézy, rozděluje se na dva základní typy, a to akutní myeloidní leukemie (AML) a akutní lymfoidní leukemie (ALL). Pacienti s těmito onemocněními patří mezi těžce imunosuprimované a je u nich velké riziko vzniku závažných infekcí. Cílem studie bylo sledování výskytu enterobakterií - původců těchto infekcí - u pacientů s AL hospitalizovanými na Hemato-onkologické klinice Fakultní nemocnice v Olomouci a zjištění jejich antibiotické rezistence. Materiál a metodika: Do studie bylo zapojeno 49 pacientů s AL, z toho 37 s AML (16 žen a 21 mužů) a 12 s ALL (6 žen a 6 mužů); průměrný věk pacientů byl 50,5 roku. V průběhu 12 měsíců (od září 2015 do srpna 2016) by od těchto pacientů získávány vzorky klinického materiálu, které byly podrobeny základnímu mikrobiologickému vyšetření. Bakteriální kmeny byly identifikovány pomocí MALDI-TOF MS. Citlivost na antibiotika byla stanovena pomocí mikrodiluční metody. Výsledky: Celkově bylo od pacientů s AL získáno 292 vzorků, které byly dále podrobeny selekci na základě několika kritérií, aby bylo zamezeno zahrnutí identických kmenů získaných od téhož pacienta. Výsledkem byl výběr 146 klinických vzorků z 9 typů klinických materiálů (47x výtěr z krku, 40x stolice, 33x moč, 11x hemokultura, 5x výtěr z dutiny ústní, 4x perianální stěr, 3x; stěr z rány, 2x sputum, 1x punktát). Nejvíce prevalentní enterobakterií byla Escherichia coli (42x), dále zástupci Klebsiella spp. (46x), a to Klebsiella pneumoniae (34x) a Klebsiella oxytoca (12x), a Enterobacter cloacae (19x). Mnohé izoláty vykazovaly rezistenci na testovaná antibiotika. Závěr: Pacienti s hematoonkologickými onemocněními jsou kolonizováni rezistentními enterobakteriemi, což pro ně představuje potenciální nebezpečí vzniku závažných infekcí. Obecně je výskyt těchto rezistentních zástupců z čeledi Enterobacteriaceae v dnešní době závažným problémem se zvyšujícím se výskytem. Tato fakta a vysoká imunosuprese jsou faktory, které hematoonkologické pacienty řadí do zvlášť ohrožené skupiny, v níž je aktivní surveillance naprosto klíčová.

Background: Acute leukemia (AL) is a heterogeneous group of malignant hematopoietic diseases and is divided into two basic types: acute myeloid leukemia (AML) and acute lymphoblastic leukemia (ALL). Patients with these diseases are highly immunosuppressed and therefore at a high risk of serious infections. This study aimed to perform active surveillance of enterobacteria, which cause these infections, and to determine their antibiotic resistance in patients with AL who were hospitalized at the Hemato-Oncology Center of University Hospital Olomouc. Materials and methods: This study involved 49 patients with AL, of whom 37 had AML (16 women and 21 men) and 12 had ALL (6 women and 6 men). The mean age of the patients was 50.5 years. Samples of clinical material were obtained over 12 months (September 2015 to August 2016) and subjected to standard microbiological examinations. Bacterial strains were identified by MALDI-TOF MS, and their antibiotic susceptibility was established by microdilution method. Results: A total of 292 samples were obtained from patients with AL. Some of these samples were excluded from analysis to prevent the inclusion of identical strains from the same patient. Consequently, 146 clinical samples obtained from the following nine types of clinical materials were analyzed - throat swabs (n = 47), stools (n = 40), urine (n = 33), hemocultures (n = 11), buccal swabs (n = 5), perianal swabs (n = 4), wound swabs (n = 3), sputum (n = 2), and puncture fluid (n = 1). The most prevalent enterobacteria was Escherichia coli (n = 42), followed by Klebsiella spp. (n = 46), specifically Klebsiella pneumoniae (n = 34) and Klebsiella oxytoca (n = 12), and Enterobacter cloacae (n = 19). The most of enterobacteria were highly resistant to many tested antibiotics. Conclusions: Antibiotic-resistant enterobacteria colonize patients with hemato-oncological diseases and can cause serious infections. These antibiotic-resistant microorganisms are a serious and frequent problem. These findings together with the high level of immunosuppression mean that patients with hemato-oncological diseases are at a high risk of developing serious infections and consequently active surveillance is crucial.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie * komplikace   mikrobiologie   MeSH
• akutní myeloidní leukemie * komplikace   mikrobiologie   MeSH
• antibakteriální látky klasifikace   škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• bakteriální léková rezistence * účinky léků   MeSH
• dospělí MeSH
• Enterobacteriaceae * klasifikace   patogenita   MeSH
• Escherichia coli patogenita   MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí mikrobiologie   patologie   prevence a kontrola   MeSH
• Klebsiella patogenita   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• výzkum MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH