Horizontal gene transfer (HGT) is a key driver in the evolution of bacterial genomes. The acquisition of genes mediated by HGT may enable bacteria to adapt to ever-changing environmental conditions. Long-term application of antibiotics in intensive agriculture is associated with the dissemination of antibiotic resistance genes among bacteria with the consequences causing public health concern. Commensal farm-animal-associated gut microbiota are considered the reservoir of the resistance genes. Therefore, in this study, we identified known and not-yet characterized mobilized genes originating from chicken and porcine fecal samples using our innovative pipeline followed by network analysis to provide appropriate visualization to support proper interpretation.
- MeSH
- antibakteriální látky MeSH
- Bacteria genetika MeSH
- bakteriální geny MeSH
- genom bakteriální MeSH
- mikrobiota * MeSH
- prasata MeSH
- přenos genů horizontální * MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
INTRODUCTION: Acute tubulointerstitial nephritis (ATIN) is a well-recognized cause of acute kidney injury (AKI) due to the tubulointerstitial inflammation. The aim of this study was to explore the clinical features, outcomes, and responses to corticosteroid treatment in patients with ATIN. METHODS: Patients with biopsy-proven ATIN, who were diagnosed between 1994 and 2016 at the Department of Nephrology, Charles University, First Faculty of Medicine, and General University Hospital in Prague, were included in the study. Patient demographics, the aetiological and clinical features, the treatment given, and the outcome at 1 year of follow-up were extracted from patient records. RESULTS: A total of 103 ATIN patients were analysed, of which 68 had been treated with corticosteroids. There was no significant difference in the median serum creatinine 280 (169-569) μmol/L in the conservatively managed group versus 374 (249-558) μmol/L in the corticosteroid-treated group, p = 0.18, and dependence on dialysis treatment at baseline at the time of biopsy (10.3 vs. 8.6%). During the 1 year of follow-up, those ATIN patients who had been treated with corticosteroids did better and showed greater improvement in kidney function, determined as serum creatinine difference from baseline and from 1 month over 1-year period (p = 0.001). CONCLUSIONS: This single-centre retrospective cohort study supports the beneficial role of the administration of corticosteroid therapy in the management of ATIN.
- MeSH
- dialýza ledvin * škodlivé účinky MeSH
- hormony kůry nadledvin terapeutické užití MeSH
- intersticiální nefritida * farmakoterapie diagnóza MeSH
- kreatinin MeSH
- ledviny patologie MeSH
- lidé MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
V populaci diabetiků 2. typu je častěji než v běžné populaci diagnostikováno jak srdeční selhání, tak i chronické onemocnění ledvin (CKD). Screening CKD musí směřovat k časnému záchytu onemocnění s cílem zvrátit, nebo alespoň významně zpomalit jeho průběh a oddálit přechod do selhání ledvin s nutností chronické dialyzační anebo transplantační léčby. Finerenon je nesteroidní, selektivní antagonista mineralokortikoidního receptoru. Efekty finerenonu u nemocných s diabetem 2. typu byly zkoumány ve velkých registračních klinických studiích fáze III FIDELIO-DKD, FIGARO-DKD a následně v jejich sdružené analýze FIDELITY. Na základě výsledků publikovaných prospektivních randomizovaných kontrolovaných studií s finerenonem je jeho použití u pacientů s CKD a diabetem 2. typu zmíněno v několika recentních doporučeních. Zástupci expertního panelu zahrnujícího Českou nefrologickou společnost, Českou diabetologickou společnost ČLS JEP, Českou internistickou společnost ČLS JEP a Českou kardiologickou společnost v souladu s recentními mezinárodními doporučeními považují finerenon za jeden z pilířů léčby pacientů s chronickým onemocněním ledvin a diabetem 2. typu pro jeho nefroprotektivní a kardioprotektivní účinky.
Both heart failure and chronic kidney disease (CKD) are detected more often in the type 2 diabetic population than in the general population. CKD screening should focus on its early detection to reverse, or at least significantly slow down its course and delay stage 5 CKD with the need for chronic dialysis or transplant treatment. Finerenone is a nonsteroidal, selective mineralocorticoid receptor antagonist. The effects of finerenone in patients with type 2 diabetes were investigated in the large registration phase III clinical trials FIDELIO-DKD, FIGARO-DKD and subsequently in their pooled analysis FIDELITY. Based on the results of published prospective randomized controlled trials with finerenone, its use in patients with CKD and type 2 diabetes is mentioned in several recent recommendations. Representatives of an expert panel including the Czech Nephrological Society, the Czech Diabetological Society, the Czech Internal Medicine Society and the Czech Cardiology Society, in accordance with recent international recommendations, consider finerenone to be one of the pillars of the treatment of patients with chronic kidney disease and type 2 diabetes for its nephroprotective and cardioprotective effects.
- Klíčová slova
- finerenon,
- MeSH
- chronická renální insuficience * farmakoterapie prevence a kontrola MeSH
- diabetes mellitus 2. typu * farmakoterapie komplikace MeSH
- dialýza ledvin MeSH
- komplikace diabetu farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- naftyridiny farmakologie terapeutické užití MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Nová generace vysoce selektivních inhibitorů mineralokortikoidních receptorů zastoupená nesteroidním přípravkem finerenonem představuje další významný posun v ovlivnění patogenetických mechanismů progrese chronického onemocnění ledvin. Finerenon díky farmakokinetickému a farmakodynamickému profilu vysoce účinně ovlivňuje expresi genů majících úlohu v prozánětlivých a profibrotických procesech, současně s minimálním výskytem nežádoucích účinků.
Úvod: Výroba a použití rekonvalescentní plazmy (RP) získané od osob, které prodělaly onemocnění COVID-19, se v době pandemie SARS-CoV-2 stala rychle dostupnou léčebnou metodou v řadě zemí, vč. České republiky. V období od dubna 2020 do dubna 2021 bylo v ČR vyrobeno celkem 19 079 transfuzních jednotek (T.U.) RP, z toho 14 197 T.U. bylo vydáno pro cca 7 100 pacientů v 61 nemocnicích. Z celkového počtu 131 000 hospitalizovaných pacientů s COVID-19 za dané období byla RP podána 5,4 % pacientům. Pro zhodnocení účinnosti a bezpečnosti léčby RP onemocnění COVID-19 byla provedena retrospektivní multicentrická studie RESCOVID-19. Materiál a metodika: Primárním cílem studie, do které se zapojilo 6 nemocnic, bylo zhodnocení klinické účinnosti RP v léčbě COVID-19 oproti shodné standardní terapii bez podání RP. Sekundárním cílem bylo zhodnocení vlivu výše hladiny anti-SARS-CoV-2 protilátek (VNP) v RP na přežití a rychlost zotavení. Dále byl zjištěn výskyt a závažnost nežádoucích reakcí spojených s podáním RP. Výsledky: Do studie bylo zařazeno celkem 1 506 pacientů, z toho 414 (27,3 %) léčených RP a 1 092 (72,7 %) bez této léčby (kontrolní skupina). Výsledky modelu logistické regrese ukázaly odhad střední hodnoty pravděpodobnosti přežití 91,8 % u pacientů skupiny s RP podanou do 3 dnů od počátku příznaků (n = 100), což je podobné jako u kontrolní skupiny s pravděpodobností přežití 91,7 %. Nejhorší výsledky pak byly zjištěny u skupiny pacientů s podanou RP po 3. dnu (n = 313), kdy přežití bylo pouze 82,3 %. Nicméně pacienti s RP aplikovanou do 3. dne se zotavili významně dříve oproti kontrolám i nemocným s RP podanou po 3. dnu. Ve studii nebyl prokázán vliv obsahu anti-SARS-CoV-2 protilátek v RP na přežití (78% přežití při VNP ≤ 320, 78% přežití u VNP ≥ 320). Nežádoucí účinky související s podáním RP byly zaznamenány u 2,17 % pacientů; ve všech případech klinicky málo závažné. Závěr: Výsledky studie prokázaly, že podání RP nemělo příznivý vliv na přežití COVID-19, ale pokud byla podána do 3 dnů od počátku příznaků infekce SARS-CoV-2, alespoň vedla k časnějšímu zotavení. Koncentrace anti-SARS-CoV-2 protilátek v RP neměla vliv na přežití ani na rychlost zotavení z COVID-19.
Introduction: The production and use of convalescent plasma (CP) collected from persons after COVID-19 disease became a rapidly available treatment modality in a number of countries, including the Czech Republic, during the SARS-CoV-2 pandemic. Between April 2020 and April 2021, a total of 19,079 CP units were produced in the Czech Republic, of which 14,197 units were dispensed to approximately 7,100 patients in 61 hospitals. Of the total number of 131,000 hospitalized patients with COVID-19 during the given period, CP was administered to 5.4%. The retrospective multicentre RESCOVID-19 study was conducted to evaluate the eff ectiveness and safety of CP treatment of COVID-19 disease. Material and methods: The primary objective of the study, which involved 6 hospitals, was to evaluate the clinical eff ectiveness of CP in the treatment of COVID-19 compared to standard therapy without the administration of CP. The secondary objective was to evaluate the impact of the level of anti-SARS-CoV-2 antibodies in CP on survival and speed of recovery. The incidence and severity of adverse reactions associated with the administration of CP were also determined. Results: A total of 1,506 patients were enrolled in the study, of which 414 (27.3%) were treated with CP and 1092 (72.7%) were without this treatment (control group). The results of the logistic regression model showed a mean survival probability estimate of 91.8% for patients in the CP group administered within 3 days of symptom onset (N = 100), which is similar to the control group with a survival probability of 91.7%. The worst results were found in the group of patients with CP administered after the 3rd day (N = 313) where survival was only 82.3%. However, patients with CP transfused by the 3rd day recovered signifi cantly earlier compared to controls and patients with CP transfused after the 3rd day. The study did not demonstrate an eff ect of the amount of anti-SARS-CoV-2 antibodies in the CP on survival (78% survival with VNP ≤ 320, 78% survival with VNP ≥ 320). Adverse eff ects related to CP administration were recorded in 2.17% of patients; clinically mild in all cases. Conclusion: The results of the study showed that early application of CP accelerated recovery but had no eff ect on COVID-19 survival. The anti-SARS-CoV-2 antibody concentration in CP had no eff ect on survival and speed of recovery.
- Klíčová slova
- rekonvalescentní plazma, studie RESCOVID-19,
- MeSH
- analýza přežití MeSH
- COVID-19 * krev terapie MeSH
- dospělí MeSH
- komorbidita MeSH
- krevní plazma * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- multicentrické studie jako téma MeSH
- protilátky virové analýza krev MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Náhle vzniklé akutní selhání ledvin u pacientů ve vyšším věku může být způsobeno širokým spektrem chorob, které mají obvykle příčinu mimo ledviny. Mezi nejčastější patří postižení ledvin jako součást ANCA vaskulitid, další kategorie zahrnuje klonální onemocnění plasmatických buněk s nadprodukcí lehkých řetězců (light chain cast nephropathy, tzv. myelomová ledvina) a také stále narůstající počet polékových poškození tubulointersticia ledvin. Prezentujeme případ iatrogenní, méně obvyklé formy akutního selhání u 73 leté ženy, která do té doby netrpěla žádným závažným onemocněním. I když biopsie napomohla určit příčinu selhání a tím ovlivnit následující terapii, funkce ledvin se do předchozího stavu nevrátila a pacientka progredovala do CKD G3bA1 s hodnotami sérového kreatininu kolem 170-140 μmol/l.
Acute renal failure in elderly patients can be caused by a wide spectrum of diseases that usually have a cause outside the kidney. The most common causes include renal impairment as part of ANCA vasculitis, another category includes clonal plasmatic cell disease with light chain cast nephropathy; and there also exists an increasing number of drug-induced tubulointerstial damage. We present a case of iatrogenic less common form of acute failure in a 73-year-old woman, who did not suffer from any serious disease until then. Although the biopsy helped to determine the cause of the failure and thus affect subsequent therapy, the function did not return to the previous state and the patient progressed to CKD G3bA1 with serum creatinine values of around 170-140 μmol/l.
- MeSH
- akutní poškození ledvin * chemicky indukované diagnóza etiologie terapie MeSH
- biopsie metody MeSH
- ledvinové kanálky MeSH
- lidé MeSH
- nežádoucí účinky léčiv MeSH
- rhabdomyolýza * chemicky indukované komplikace MeSH
- sběrací ledvinové kanálky MeSH
- senioři MeSH
- statiny škodlivé účinky toxicita MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Chickens in commercial production are subjected to constant interaction with their environment, including the exchange of microbiota. In this review, we therefore focused on microbiota composition in different niches along the whole line of chicken production. We included a comparison of microbiota of intact eggshells, eggshell waste from hatcheries, bedding, drinking water, feed, litter, poultry house air and chicken skin, trachea, crop, small intestine, and cecum. Such a comparison showed the most frequent interactions and allowed for the identification of microbiota members that are the most characteristic for each type of sample as well as those that are the most widespread in chicken production. Not surprisingly, Escherichia coli was the most widely distributed species in chicken production, although its dominance was in the external aerobic environment and not in the intestinal tract. Other broadly distributed species included Ruminococcus torque, Clostridium disporicum, and different Lactobacillus species. The consequence and meaning of these and other observations are evaluated and discussed.
- MeSH
- cékum MeSH
- drůbež MeSH
- Escherichia coli MeSH
- kur domácí MeSH
- mikrobiota * MeSH
- nemoci drůbeže * MeSH
- RNA ribozomální 16S MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH