Hantaviruses are zoonotic pathogens that can cause subclinical to lethal infections in humans. In Europe, five orthohantaviruses are present in rodents: Myodes-associated Puumala orthohantavirus (PUUV), Microtus-associated Tula orthohantavirus, Traemmersee hantavirus (TRAV)/ Tatenale hantavirus (TATV)/ Kielder hantavirus, rat-borne Seoul orthohantavirus, and Apodemus-associated Dobrava-Belgrade orthohantavirus (DOBV). Human PUUV and DOBV infections were detected previously in Lithuania, but the presence of Microtus-associated hantaviruses is not known. For this study we screened 234 Microtus voles, including root voles (Microtus oeconomus), field voles (Microtus agrestis) and common voles (Microtus arvalis) from Lithuania for hantavirus infections. This initial screening was based on reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) targeting the S segment and serological analysis. A novel hantavirus was detected in eight of 79 root voles tentatively named "Rusne virus" according to the capture location and complete genome sequences were determined. In the coding regions of all three genome segments, Rusne virus showed high sequence similarity to TRAV and TATV and clustered with Kielder hantavirus in phylogenetic analyses of partial S and L segment sequences. Pairwise evolutionary distance analysis confirmed Rusne virus as a strain of the species TRAV/TATV. Moreover, we synthesized the entire nucleocapsid (N) protein of Rusne virus in Saccharomyces cerevisiae. We observed cross-reactivity of antibodies raised against other hantaviruses, including PUUV, with this new N protein. ELISA investigation of all 234 voles detected Rusne virus-reactive antibodies exclusively in four of 79 root voles, all being also RNA positive, but not in any other vole species. In conclusion, the detection of Rusne virus RNA in multiple root voles at the same trapping site during three years and its absence in sympatric field voles suggests root voles as the reservoir host of this novel virus. Future investigations should evaluate host association of TRAV, TATV, Kielder virus and the novel Rusne virus and their evolutionary relationships.
- MeSH
- Arvicolinae * MeSH
- druhová specificita MeSH
- genom virový * MeSH
- hantavirové infekce epidemiologie veterinární virologie MeSH
- Hantavirus klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- nemoci hlodavců epidemiologie virologie MeSH
- prevalence MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Litva MeSH
In 2012, Tigray orthohantavirus was discovered in Ethiopia, but its seasonal infection in small mammals, and whether it poses a risk to humans was unknown. The occurrence of small mammals, rodents and shrews, in human inhabitations in northern Ethiopia is affected by season and presence of stone bunds. We sampled small mammals in two seasons from low- and high-density stone bund fields adjacent to houses and community-protected semi-natural habitats in Atsbi and Hagere Selam, where Tigray orthohantavirus was first discovered. We collected blood samples from both small mammals and residents using filter paper. The presence of orthohantavirus-reactive antibodies in blood was then analyzed using immunofluorescence assay (human samples) and enzyme linked immunosorbent assays (small mammal samples) with Puumala orthohantavirus as antigen. Viral RNA was detected by RT-PCR using small mammal blood samples. Total orthohantavirus prevalence (antibodies or virus RNA) in the small mammals was 3.37%. The positive animals were three Stenocephalemys albipes rats (prevalence in this species = 13.04%). The low prevalence made it impossible to determine whether season and stone bunds were associated with orthohantavirus prevalence in the small mammals. In humans, we report the first detection of orthohantavirus-reactive IgG antibodies in Ethiopia (seroprevalence = 5.26%). S. albipes lives in close proximity to humans, likely increasing the risk of zoonotic transmission.
- MeSH
- hantavirové infekce epidemiologie imunologie přenos MeSH
- Hantavirus genetika imunologie MeSH
- imunoglobulin G krev MeSH
- krysa rodu rattus MeSH
- lidé MeSH
- nemoci hlodavců imunologie přenos virologie MeSH
- prevalence MeSH
- protilátky virové krev MeSH
- průřezové studie MeSH
- rizikové faktory MeSH
- RNA virová genetika MeSH
- venkovské obyvatelstvo MeSH
- zdroje nemoci virologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu rattus MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Etiopie MeSH
During 2008-2018, we collected samples from rodents and patients throughout the Czech Republic and characterized hantavirus isolates. We detected Dobrava-Belgrade and Puumala orthohantaviruses in patients and Dobrava-Belgrade, Tula, and Seewis orthohantaviruses in rodents. Increased knowledge of eco-epidemiology of hantaviruses will improve awareness among physicians and better outcomes of patients.
- MeSH
- fylogeneze MeSH
- hantavirové infekce epidemiologie imunologie virologie MeSH
- Hantavirus genetika imunologie MeSH
- imunoglobulin G imunologie MeSH
- imunoglobulin M imunologie MeSH
- lidé MeSH
- molekulární epidemiologie * MeSH
- protilátky virové MeSH
- virové geny MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Orthohantaviruses are RNA viruses that some members are known to cause severe zoonotic diseases in humans. Orthohantaviruses are hosted by rodents, soricomorphs (shrews and moles), and bats. Only two orthohantaviruses associated with murid rodents are known in Africa, Sangassou orthohantavirus (SANGV) in two species of African wood mice (Hylomyscus), and Tigray orthohantavirus (TIGV) in the Ethiopian white-footed rat (Stenocephalemys albipes). In this article, we report evidence that, like SANGV, two strains of TIGV occur in two genetically related rodent species, S. albipes and S. sp. A, occupying different elevational zones in the same mountain. Investigating the other members of the genus Stenocephalemys for TIGV could reveal the real diversity of TIGV in the genus.
- MeSH
- druhová specificita MeSH
- fylogeneze MeSH
- hantavirové infekce epidemiologie veterinární virologie MeSH
- Hantavirus genetika MeSH
- hlodavci MeSH
- lidé MeSH
- nemoci hlodavců epidemiologie virologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Etiopie MeSH
Hantaviry jsou RNA viry z čeledi Bunyaviridae. Jejich hostiteli jsou živočichové ze třídy savci, z řádu hlodavci (norníci, myšice, hraboši, potkani, křečci), hmyzožravci (rejsci, krtci) a letouni (netopýři). Hantaviry se vyskytují na mnoha místech Evropy, Ameriky, Asie a Afriky. Na území České republiky byl prokázán výskyt 5 druhů hantavirů (Dobrava/Belgrade, Puumala, Tula, Seewis a Asikkala), z nich první 3 mohou způsobit lidská onemocnění. Přestože hantavirové nákazy mohou probíhat velmi závažně, v odborné lékařské veřejnosti nejsou příliš známé a na možnost této infekce se nemyslí. V práci je popsána kazuistika hantavirové hemoragické horečky s renálním syndromem (HFRS) s fatálním zakončením. Onemocnění u tohoto pacienta probíhalo pod typickým klinickým obrazem, přesto správná diagnóza byla stanovena až post mortem.
Hantaviruses are RNA viruses of the family Bunyaviridae. Their hosts are mammals of the orders rodents (voles, rats, mice), insectivores (shrews, moles), and chiroptera (bats). Hantaviruses are present in many areas of Europe, the Americas, Asia, and Africa. In the Czech Republic, the occurrence of five species of hantaviruses has been reported (Dobrava/Belgrade, Puumala, Tula, Seewis, and Asikkala), with the first three of them causing human diseases. Although the course of hantavirus infections can be very serious, there is a low awareness of these diseases, even among health professionals, and hantavirus is often not considered in the diagnosis. A case history is reported of a patient who developed hantavirus haemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) with fatal outcome. The patient presented with typical clinical signs, but the correct diagnosis was only made at post mortem.
- MeSH
- antipyretika MeSH
- časná diagnóza MeSH
- fatální výsledek MeSH
- hantavirové infekce epidemiologie patofyziologie přenos MeSH
- Hantavirus * klasifikace patogenita MeSH
- hemoragická horečka s renálním syndromem * diagnóza farmakoterapie MeSH
- infekce močového ústrojí MeSH
- inhibitory beta-laktamasy MeSH
- kombinace amoxicilinu a kyseliny klavulanové terapeutické užití MeSH
- lidé středního věku MeSH
- metamizol terapeutické užití MeSH
- multiorgánové selhání etiologie MeSH
- mydriáza MeSH
- neurologické vyšetření MeSH
- pitva MeSH
- polymerázová řetězová reakce využití MeSH
- septický šok MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Hantaviruses are RNA viruses primarily carried by rodents, soricomorphs, and bats. The data about the distribution and genetic diversity of these viruses are often limited, especially in most regions of sub-Saharan Africa. Moreover, the majority of representatives were identified in western African localities, while only three hantaviruses have been reported in East Africa to date. In this study, a total of 1866 small mammals captured between 2009 and 2014 in various countries of Eastern Africa (Ethiopia, Zambia, Mozambique, Kenya, and Tanzania) were molecularly screened for the presence of hantaviruses. Hantavirus RNA was detected in dried blood samples of the Cape pipistrelle bat (Neoromicia capensis) captured in Ethiopia and the African wood mouse (Hylomyscus endorobae) from Kenya. Phylogenetic analysis of partial genomic segments revealed that the Ethiopian sample represents a sister lineage of the Mouyassué virus (reported previously from the congeneric bat in Côte d'Ivoire), and the Kenyan sample is a sister lineage of the Sangassou virus (described from the same mouse genus in Guinea).
- MeSH
- fylogeneze MeSH
- hantavirové infekce epidemiologie veterinární virologie MeSH
- Hantavirus klasifikace MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- RNA virová izolace a purifikace MeSH
- savci virologie MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- východní Afrika epidemiologie MeSH
- západní Afrika epidemiologie MeSH
Nejčastějším virovým onemocněním přenášeným hlodavci jsou v České republice hantavirózy s průměrnou roční incidencí 0,02 případů/100 000 obyvatel a výskytem specifických protilátek asi u 1 % obyvatel. Na našem území byli doposud popsáni 4 zástupci hantavirů (Puumala, Dobrava--Belgrade, Tula, Seewis), z nichž onemocnění u člověka prokazatelně způsobují viry Puumala (obvykle s mírnou formou onemocnění, nephropathia epidemica) a Dobrava-Belgrade (způsobující hemoragickou horečku spojenou se selháním ledvin). Cílem předkládané práce je podat nejnovější ucelený přehled pro člověka patogenních hantavirů vyskytujících se v České republice ve světle studií, které byly publikovány v posledních třiceti letech, včetně geografického rozšíření hantavirů a popisu klinických onemocnění. Nedávná detekce viru Tula u imunokompromitovaného jedince na Ostravsku nebo současné zprávy o klinických onemocněních způsobených virem Seoul v Evropě zdůrazňují problém možné emergence opomíjených hantavirových nákaz v blízké budoucnosti.
Hantavirus disease is the most common rodent-borne viral infection in the Czech Republic, with a mean annual incidence of 0.02 cases per 100 000 population and specific antibodies detected in 1% of the human population. Four hantaviruses (Puumala, Dobrava-Belgrade, Tula, and Seewis) circulate in this country, of which Puumala virus (responsible for a mild form of hemorrhagic fever with renal syndrome called nephropathia epidemica) and Dobrava-Belgrade virus (causing haemorrhagic fever with renal syndrome) have been proven to cause human disease. The aim of this study is to provide a comprehensive review of the hantaviruses occurring in the Czech Republic, based on the literature published during the past three decades, including their geographical distribution and clinical symptoms. The recent detection of Tula virus in an immunocompromised person as well as reports of Seoul virus infections in Europe highlight the possible emergence of neglected hantavirus infections in the foreseeable future.
- MeSH
- genom virový MeSH
- hantavirové infekce * diagnóza epidemiologie klasifikace patologie prevence a kontrola terapie MeSH
- Hantavirus * genetika klasifikace patogenita MeSH
- hemoragická horečka s renálním syndromem diagnóza mikrobiologie prevence a kontrola terapie MeSH
- hlodavci MeSH
- lékařská geografie MeSH
- lidé MeSH
- nemoci zvířat MeSH
- přenos infekční nemoci MeSH
- vakcinace MeSH
- virus Hantaan MeSH
- virus Puumala MeSH
- zoonózy epidemiologie genetika přenos MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
Virové hemoragické horečky jsou skupinou různorodých onemocnění vyvolávaných viry z několika odlišných virových čeledí. Jedná se o akutní virová horečnatá onemocnění, vyznačující se nevolností, myalgií a vyčerpaností, dominující při generalizované poruše cévní permeability a regulace. Skupina virových hemoragických horeček představuje širokou škálu onemocnění od relativně nepříliš nebezpečných až po nemoci, které ohrožují lidské životy a jejichž mortalita dosahuje vysokých čísel.
Viral haemorrhagic fevers are a group of heterogeneous diseases caused by viruses of several different viral families. They are acute febrile viral disease characterized by nausea, myalgia and fatigue, dominating as a result of the generalized disorder of vascular permeability and regulation. Group of viral hemorrhagic fevers presents a wide range of diseases from relatively benign to extremely dangerous ones, with high mortality.
- MeSH
- Arenavirus patogenita MeSH
- Bunyaviridae patogenita MeSH
- Culicidae parazitologie patogenita MeSH
- dengue diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- Filoviridae patogenita MeSH
- Flavivirus patogenita MeSH
- hantavirové infekce diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- hemoragická horečka dengue MeSH
- hemoragická horečka Ebola diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- hemoragická horečka krymská diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- hemoragické horečky virové * diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- horečka Rift Valley diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- infekce viry z čeledi Arenaviridae diagnóza epidemiologie etiologie farmakoterapie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- infekce viry z čeledi Bunyaviridae diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- infekce viry z čeledi Filoviridae diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- infekce viry z čeledi Flaviviridae diagnóza epidemiologie etiologie přenos terapie MeSH
- lidé MeSH
- marburgská horečka diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- nemoc kyasanurského lesa diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- omská hemoragická horečka diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos terapie MeSH
- ribavirin terapeutické užití MeSH
- virus horečky Rift Valley patogenita MeSH
- virus Junin patogenita MeSH
- virus krymsko-konžské hemoragické horečky patogenita MeSH
- žlutá zimnice diagnóza epidemiologie etiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
