Molecular analysis at diagnosis and following monitoring of specific gene aberrations represent a standard part of a diagnostic-therapeutic process, especially in cytogenetically normal acute myeloid leukemia (AML) patients. Besides the routinely tested markers with clear prognostic importance, other gene mutations were recently identified. The new generation sequencing allow us to uncover the frequency of these recently described mutations in a very large cohort of AML patients from all major hematological centers in the Czech Republic; and to find coexisting mutations with high benefits of such testing in patients. The possibility to define separate leukemic clones in individual patients will further enable monitoring of their status in the course of the disease and to elucidate the disease clonality. The study of these effects will be supported by xenotransplantation experiments analyzing engraftment of the samples with known clonality. AML patients bearing mutations in the DNA methylation regulators will be examined for subsequent DNA methylation and gene expression analysis.

Molekulární testování v době diagnózy a následné sledování specifických genových aberací představuje standardní součást diagnosticky-terapeutického procesu, zejména u cytogeneticky normálních pacientů s akutní myeloidní leukémií (AML). Kromě rutinně vyšetřovaných znaků se zřejmým prognostickým významem byly nedávno v souvislosti s AML identifikovány nové genové mutace. Sekvenování nové generace má potenciál stanovit frekvenci těchto nově popsaných mutací ve velkém souboru pacientů s AML ze všech hlavních hematologických center České republiky a zjistit vzájemnou koexistenci těchto mutací, což může přinést značné výhody v diagnostice a léčbě pacientů s AML. Možnost definovat oddělené leukemické klony u jednotlivých pacientů dále umožní sledování jejich stavu v průběhu choroby a hodnocení klonality onemocnění. Studium těchto jevů bude podpořeno xenotransplantačními experimenty myších založenými na studiu engraftmentu buněk se známou klonalitou. U vzorků pacientů nesoucích mutaci v regulátorech methylace DNA dále hodnocena úroveň DNA methylace a genové exprese.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie diagnóza   terapie   MeSH
• klonální evoluce MeSH
• metylace DNA MeSH
• mutace MeSH
• myši MeSH
• prognóza MeSH
• sekvenční analýza DNA metody   MeSH
• transplantace heterologní MeSH
• Check Tag
• myši MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• cytologie, klinická cytologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

I. Evaluation of known and newly detected prognostic factors in AML using hematologic, cytogenetic and molecular genetic methods, follow up the response to various kind of induction and consolidation treatment with special focus on hematopoietic cells transplantations. II. Keeping continuity in reporting AML patients data to ALERT database immediately after the diagnosis assignment and during the follow up; to evaluate minimal residual disease in complete remission in patients according to molecular genetic marker availability. III. Performance of statistical analysis of available prognostic factors with special focus on genetics and consolidation treatment strategy used in the group of 2000 patients entering the ALERT study within 1996-2009. IV. Utilising the analysis results on evaluation of quality of AML treatment in Czech republic and on creating of patients stratification treatment proposal according to prognostic factors with focus on transplantations and palliative treatment.

I. Pomocí hematologických, cytogenetických a molekulárně genetických metod vyšetřovat známé i nově odhalené prognostické faktory u AML, sledovat odpověď na různé typy indukční a konzolidační léčby se zvláštním zaměřením na transplantace krvetvorných buněk. II. Data nemocných s AML hlásit při diagnóze a v rámci sledování do databáze nemocných s AML v ČR (ALERT) a udržet kontinuitu projektu; dle dostupnosti molekulárně genetického markeru sledovat u nemocných v kompletní remisi minimální zbytkovou chorobu. III. Provést statistickou analýzu dostupných prognostických faktorů se speciálním zaměřením na genetiku a použitou konsolidační léčebnou strategii na sestavě cca 2000 nemocných hlášených do studie ALERT v letech 1996 - 2009. IV. Výsledky analýz využítpro hodnocení kvality léčby AML v ČR a pro vytvoření návrhu stratifikace léčby nemocných dle prognostických faktorů se zvláštním zaměřením na transplantace a paliativní péči.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie diagnóza   terapie   MeSH
• autologní transplantace MeSH
• časná diagnóza MeSH
• cytogenetické vyšetření MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• sběr dat MeSH
• systémy podporující rozhodování v léčbě MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH
• tretinoin terapeutické užití   MeSH
• věkové faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Keeping continuity of report and data management in national clinical register of acute leukemias, giving precision to ALs epidemiological data, extension of prognostic factors predictive evaluation and individual stratification of treatment approaches.Performance of detailed statistical analysis of genetic changes prognostic importance and contribution of particular genetic methods for their identification. Analysis of stratified consolidation treatment results, especially evaluating indication criteria of haemopoetic stem cells transplantation and concentrating on results achieved and complications in transplantations in different stages of disease. Evaluation of different treatment approaches results in elderly patients with AL.

Udržení kontinuity hlášení a managementu dat v celostátním klinickém registru akutních leukémií, zpřesnění epidemiologických dat o AL a rozšíření prediktivního hodnocení prognostických faktorů a individuální stratifikace léčebných přístupů. Provedení detailní statistické analýzy prognostického významu genetických změn a přínosu jednotlivých genetických metod pro jejich identifikaci. Provádění analýzy výsledků stratifikované konsolidační léčby se zvláštním zaměřením na hodnocení indikačních kritérií transplantací krvetvorných buněk a hodnocení dosažených výsledků a komplikací transplantací v různých fázích choroby. Hodnocení výsledků různých léčebných přístupů u starých nemocných s AL.

• MeSH
• akutní monocytární leukemie epidemiologie   genetika   terapie   MeSH
• analýza nákladů a výnosů MeSH
• analýza přežití MeSH
• klinické zkoušky jako téma MeSH
• přežití po terapii bez příznaků nemoci MeSH
• prognóza MeSH
• spontánní remise MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH
• výsledek terapie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The introduction of new microarray technology ( array-CGH) for determination of human DNA for changes in copy number of specific sequences in patients with acute leukemia. Use of array-CGH technique in patients suffering from acute myeloid and lymphoblastic leukemia with normal karyotype obtained by cytogenetics for precise identification od deletions and amplifications of 300 target clone DNA arrayed in target spots on Ge Application of Array-CGH result for sub classification of acute leukemias and determination of new genes involved in malignant transformation in acute leukemia. Determination of prognostic importance of identified gene changes.

Zavedení nové "čipové" technologie, array-CGH, pro diagnostiku genových změn u nemocných s akutní leukémií(AL). Použití techniky array-CGH pro vyšetření nemocných s akutní myeloidní a lymfoblastickou leukémií s cytogeneticky normálním karyotypem pro přesné určení amplifikací a delecí 300 vybraných genů umístěných na hybridizačním skle GenoSensor Array 300. Využití výsledků array-CGH pro subklasicikaci akutních leukémií a určení nových genů, zahrnutých do maligní transfornace. Určení prognostického významu nalezených genových změn.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie MeSH
• akutní myeloidní leukemie MeSH
• amplifikace genu MeSH
• chromozomální aberace MeSH
• chromozomální delece MeSH
• cytogenetické vyšetření metody   využití   MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   MeSH
• DNA nádorová analýza   MeSH
• hybridizace genetická MeSH
• hybridizace in situ fluorescenční metody   MeSH
• karyotypizace MeSH
• mikročipová analýza metody   využití   MeSH
• software MeSH
• tumor supresorové geny MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR