The proposed one health approach project is the sentinel testing survey of the occurrence of Enterobacteriaceae with plasmid-mediated transferable resistance to colistin ( a reserve antibiotic used in human medicine but also in the veterinary sector) in hospitalised patients and travellers, livestock, retail meat and in the environment.

Projekt je sentinelovou studií zaměřenou na vyhledávání Enterobacteriaceae s přenositelnou na plazmid vázanou rezistencí ke kolistinu (rezervnímu antibiotiku v humánní medicíně avšak antibiotiku používaném i ve veterinárním sektoru) u hospitalizovaných pacientů a cestovatelů, potravinových zvířat a jejich mase a v prostředí.

• MeSH
• Anti-Bacterial Agents MeSH
• Drug Resistance, Bacterial MeSH
• Enterobacteriaceae drug effects   MeSH
• Colistin MeSH
• Plasmids MeSH
• Sentinel Surveillance MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• farmacie a farmakologie
• epidemiologie
• bakteriologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Growing incidence of Gram-negative bacteria resistant to drugs of last resort, carbapenems and colistin, represents one of the major issues of current medicine. Until recently, these bacteria were associated mainly with hospitalized patients, however, their spreading among animals and in the environment is being increasingly reported over last years. The project is focused on the evaluation of sources and transmission pathways of Enterobacteriace carrying plasmid-mediated genes for resistance to colistin and carbapenems in humans, food-producing animals, food, the environment and wildlife in the Czech Republic. Selective cultivation of resistant isolates will be followed by complex molecular-epidemiological typing, whole-genome sequencing and comparative plasmid analysis. The role of food chain and the environment as secondary reservoirs of clinically relevant resistance mechanisms and risks for public health will be determined. Factors favouring their selection and maintenance in human and non-human sources will be evaluated, and interventions to limit their spread will be proposed.

Rostoucí incidence gramnegativních bakterií rezistentních k antibiotikům poslední volby, karbapenemům a kolistinu, představuje jeden z nejzávažnějších problémů současné medicíny. Do nedávna byly tyto rezistentní bakterie nacházeny zejména u hospitalizovaných pacientů, v posledních letech je však pozorováno jejich šíření mezi zvířaty a v prostředí. Projekt je zaměřen na sledování zdrojů a cest šíření plazmidově kódované rezistence ke karbapenemům a kolistinu u Enterobacteriaceae z člověka, potravinových zvířat, potravin, prostředí a volně žijících živočichů v České republice. Selektivní kultivace rezistentních izolátů bude doplněna komplexní molekulárně-epidemiologickou typizací, celogenomovým sekvenováním a komparativní analýzou plazmidů. Bude zhodnocen význam potravinového řetězce a prostředí jako sekundárních zdrojů bakterií s klinicky významnými mechanizmy rezistence a rizika pro veřejné zdraví. Budou studovány faktory přispívající k jejich selekci a udržování v humánních i nehumánních zdrojích a navržena opatření k omezení jejich šíření.

• MeSH
• Anti-Bacterial Agents MeSH
• Drug Resistance, Bacterial MeSH
• Biofouling MeSH
• Enterobacteriaceae drug effects   MeSH
• Carbapenems MeSH
• Colistin MeSH
• One Health MeSH
• Plasmids MeSH
• Risk Factors MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• farmacie a farmakologie
• environmentální vědy
• bakteriologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Health-care associated infections (HCAIs) significantly influence current medicine and may limit the progress in many medical procedures. Treatment of such infections has been increasingly complicated by the spread of antimicrobial resistance (AMR). To reduce risks of inappropriate initial therapy, the availability of rapid diagnostic microbiological assays is of utmost importance. Especially, functional diagnostics (i.e., detection of enzyme activity) is important in era of horizontal gene transfer. Functional assays for detection of selected bacterial toxins (ToxB of C. difficile and YopT of Y. enterocolitica) using affinity MALDI will be developed and validated. Simultaneously, functional assay for detection of carbapenemase activity developed in the laboratory of co-investigator will be further optimized and validated. Further, a new assay for functional detection of lipid A modification detecting colistin resistance will be also developed. All of those assays and tests represent a challenge for symptom-based microbiology and functional detection of important antibiotic resistance. Introduction of such assays to routine diagnostics will help to detect potentially unknown pathogens emerged because of horizontal gene transfer.

Infekce spojené se zdravotní péčí (HCAI) významně ovlivňují současnou medicínu a limitují rozvoj některých invazivních zákroků. Léčba HCAI je obvykle komplikovaná rezistencí původců na dostupná antibiotika. Ke snížení nevhodné iniciální terapie, která často vede k selhání léčby, je nutné se zaměřit na vývoj nových rychlých diagnostických testů. Především se jedná o metody funkční diagnostiky, které reagují na současný stav horizontálního toku genetické informace. V rámci řešení projektu budou vyvinuty a validovány testy pro detekci některých bakteriálních toxinů (např. toxin B produkovaný Clostridium difficile, YopT produkovaný Yersinia enterocolitica) pomocí metody afinitní MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Zároveň budou optimalizovány metody pro detekci karbapenemáz dříve vyvinuté v laboratoři spoluřešitele. Pro detekci kolistinové rezistence bude vyvinuta metoda umožňující detekci modifikace lipidu A. Všechny zmíněné metodiky reagují na urgentní potřebu rutinní mikrobiologické diagnostiky a umožní detekovat i potenciálně neznámé patogeny s ohledem na horizontální přenos genetické informace.

• Keywords
• antibiotická terapie, antibiotic therapy, Kolistin, colistin, antibiotic resistance, Hmotnostní spektrometrie, Mass Spectrometry, antibiotická rezistence, karbapenemázy, lipid A, carbapenemase, lipid A, Funkční diagnostika, Functional diagnostics,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• Adrenergic beta-Agonists therapeutic use   MeSH
• Anti-Bacterial Agents therapeutic use   MeSH
• Anti-Infective Agents therapeutic use   MeSH
• Exercise MeSH
• Cystic Fibrosis MeSH
• Diabetes Mellitus therapy   MeSH
• Adult MeSH
• Energy Intake MeSH
• Expectorants therapeutic use   MeSH
• Gastrointestinal Diseases complications   MeSH
• Colistin therapeutic use   MeSH
• Diabetes Complications MeSH
• Bone Density MeSH
• Liver Diseases complications   MeSH
• Nutritional Support MeSH
• Oxygen Inhalation Therapy MeSH
• Palliative Care MeSH
• Insurance, Disability MeSH
• Advance Care Planning MeSH
• Family Planning Services MeSH
• Physical Fitness MeSH
• Patient Care Team MeSH
• Respiration, Artificial MeSH
• Career Choice MeSH
• Education MeSH
• Employment legislation & jurisprudence   MeSH
• Check Tag
• Adult MeSH
• Publication type
• Lecture MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• pneumologie a ftizeologie
• endokrinologie