Together with plague, smallpox and typhus, epidemics of dysentery have been a major scourge of human populations for centuries(1). A previous genomic study concluded that Shigella dysenteriae type 1 (Sd1), the epidemic dysentery bacillus, emerged and spread worldwide after the First World War, with no clear pattern of transmission(2). This is not consistent with the massive cyclic dysentery epidemics reported in Europe during the eighteenth and nineteenth centuries(1,3,4) and the first isolation of Sd1 in Japan in 1897(5). Here, we report a whole-genome analysis of 331 Sd1 isolates from around the world, collected between 1915 and 2011, providing us with unprecedented insight into the historical spread of this pathogen. We show here that Sd1 has existed since at least the eighteenth century and that it swept the globe at the end of the nineteenth century, diversifying into distinct lineages associated with the First World War, Second World War and various conflicts or natural disasters across Africa, Asia and Central America. We also provide a unique historical perspective on the evolution of antibiotic resistance over a 100-year period, beginning decades before the antibiotic era, and identify a prevalent multiple antibiotic-resistant lineage in South Asia that was transmitted in several waves to Africa, where it caused severe outbreaks of disease.
- MeSH
- bacilární dyzentérie epidemiologie dějiny mikrobiologie MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- celosvětové zdraví MeSH
- dějiny 19. století MeSH
- dějiny 20. století MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- fylogeografie * MeSH
- genom bakteriální MeSH
- lidé MeSH
- molekulární epidemiologie MeSH
- molekulární evoluce * MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- séroskupina * MeSH
- Shigella dysenteriae klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- dějiny 19. století MeSH
- dějiny 20. století MeSH
- dějiny 21. století MeSH
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- historické články MeSH
- MeSH
- Enterobacteriaceae izolace a purifikace MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- Shigella boydii izolace a purifikace MeSH
- Shigella dysenteriae izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Československo MeSH
- MeSH
- bacilární dyzentérie diagnóza imunologie MeSH
- časové faktory MeSH
- chemická precipitace MeSH
- imunoglobulin G metabolismus MeSH
- imunoglobulin M metabolismus MeSH
- imunoglobuliny * MeSH
- imunologická tolerance MeSH
- komplement fixační testy MeSH
- lidé MeSH
- maternofetální výměna látek MeSH
- novorozenec MeSH
- protilátky analýza klasifikace MeSH
- reakce antigenu s protilátkou MeSH
- sérologické testy MeSH
- Shigella dysenteriae imunologie izolace a purifikace MeSH
- Shigella sonnei imunologie izolace a purifikace MeSH
- těhotenství MeSH
- tvorba protilátek MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- těhotenství MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Názvy látek
- imunoglobulin G MeSH
- imunoglobulin M MeSH
- imunoglobuliny * MeSH
- protilátky MeSH
- MeSH
- aglutinační testy MeSH
- antigeny bakteriální izolace a purifikace MeSH
- antigeny * MeSH
- bakteriologické techniky MeSH
- kultivační média MeSH
- lidé MeSH
- sérotypizace MeSH
- Shigella dysenteriae izolace a purifikace MeSH
- Shigella sonnei izolace a purifikace MeSH
- Shigella imunologie izolace a purifikace MeSH
- testy inhibice hemaglutinace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Názvy látek
- antigeny bakteriální MeSH
- antigeny * MeSH
- kultivační média MeSH
- MeSH
- antibiotická rezistence MeSH
- bacilární dyzentérie farmakoterapie MeSH
- chloramfenikol terapeutické užití MeSH
- dítě MeSH
- feces mikrobiologie MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- neomycin terapeutické užití MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Shigella dysenteriae izolace a purifikace MeSH
- Shigella sonnei izolace a purifikace MeSH
- synergismus léků MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Názvy látek
- chloramfenikol MeSH
- neomycin MeSH