Clinostomum complanatum (Rudolphi, 1814) is known as a food-borne zoonotic parasite using freshwater fish as intermediate host, although in its native distribution area in Europe, the Danube and Po basins and the northeast of Italy, no cases have been reported. This study reports a new geographic location outside the native distribution range of this parasite. We detected high infection levels of C. complanatum in wild perch (Perca fluviatilis Linnaeus) from the Doubs River in continental France. Clinostomum complanatum reached a prevalence of 97% and mean intensity of 5.8 cysts per fish in 33 fish examined, with most fish already infected by the age of two years. No correlations were observed between fish traits (standard length, weight, age and sex) and the number of parasites. The distribution of C. complanatum cysts in the fish body was not random. The tissue surrounding the opercula and branchial cavity, and muscles along the lateral line and near the pectoral, dorsal and caudal fins were the preferred sites of infection. Morphological identification was confirmed with molecular data. The French specimens shared identical mt cox1 haplotypes with specimens from Italy. The distribution of this exotic parasite in freshwaters in continental France deserves further research. Under the current French law, the parasite occurrence represents an economic loss for the local freshwater aquaculture industry, and a possible zoonotic risk for consumers if undetected, especially when raw or marinated fish is consumed. We provided a list of all reported hosts for C. complanatum from the western Palaearctic, discussed the knowledge gap regarding the zoonotic risk of C. complanatum in Europe, and highlighted the lack of policy that may increase the hazards posed by food-borne emerging parasites and their broader ecological impacts as alien species in freshwaters in Europe.

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Ligula intestinalis (Cestoda: Diphyllobothriidae) is an emerging model organism for studies on parasite population biology and host-parasite interactions. However, a well-resolved genome and catalogue of its gene content has not been previously developed. Here, we present the first genome assembly of L. intestinalis, based on Oxford Nanopore Technologies, Illumina and Omni-C sequencing methodologies. We use transcriptome profiling to compare plerocercoid larvae and adult worms and identify differentially expressed genes (DEGs) associated with these life stages. The genome assembly is 775.3 mega (M)bp in size, with scaffold N50 value of 118 Mbp and encodes 27 256 predicted protein-coding sequences. Over 60% of the genome consists of repetitive sequences. Synteny analyses showed that the 10 largest scaffolds representing 75% of the genome display high correspondence to full chromosomes of cyclophyllidean tapeworms. Mapping RNA-seq data to the new reference genome, we identified 3922 differentially expressed genes in adults compared with plerocercoids. Gene ontology analyses revealed over-represented genes involved in reproductive development of the adult stage (e.g. sperm production) and significantly enriched DEGs associated with immune evasion of plerocercoids in their fish host. This study provides the first insights into the molecular biology of L. intestinalis and provides the most highly contiguous assembly to date of a diphyllobothriid tapeworm useful for population and comparative genomic investigations of parasitic flatworms.

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Based on light and scanning electron microscopical studies, a new nematode parasite, Paracapillaria (Paracapillaria) gastrica n. sp. (Capillariidae), is described from the stomach of the marine fish (variegated lizardfish) Synodus variegatus (Lacépède) (Aulopiformes: Synodontidae) from off New Caledonia. This species is mainly characterised by the length of the spicule (267 µm), the proximal spicule end expanded to form a conspicuous folded, lobular rim, the presence of a well-developed caudal bursa supported by two lateral projections (rays) not adhering to the posterior border of body and by the size of eggs (54-60 × 24-27 µm) with non-protruding polar plugs. Paracapillaria gastrica n. sp. is the first known capillariid species parasitic in a host belonging to the fish order Aulopiformes and the first species of this genus reported from fishes in New Caledonian waters and the South Pacific Ocean.

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Recent examinations of anisakid nematodes (Anisakidae) from marine fishes off New Caledonia, collected in the years 2003-2008, revealed the presence of the following five new species of Raphidascaris Railliet et Henry, 1915, all belonging to the subgenus Ichthyascaris Wu, 1949: Raphidascaris (Ichthyascaris) spinicauda n. sp. from the redbelly yellowtail fusilier Caesio cuning (Caesionidae, Perciformes); Raphidascaris (Ichthyascaris) fasciati n. sp. from the blacktip grouper Epinephelus fasciatus (Serranidae, Perciformes); Raphidascaris (Ichthyascaris) nudicauda n. sp. from the brushtooth lizardfish Saurida undosquamis (Synodontidae, Aulopiformes); Raphidascaris (Ichthyascaris) euani n. sp. from the Japanese large-eye bream Gymnocranius euanus (Lethrinidae, Perciformes); and Raphidascaris (Ichthyascaris) elopsis n. sp. from the Hawaiian ladyfish Elops hawaiensis (Elopidae, Elopiformes). An additional two congeneric species, R. (I.) etelidis Moravec et Justine, 2012 and R. (I.) sillagoides (Bruce, 1990) were found in the deep-water red snapper Etelis carbunculus (new host record) and the deepwater longtail red snapper Etelis coruscans (both Lutjanidae, Perciformes), and the silver sillago Sillago sihama (Sillaginidae, Perciformes) (new host and geographical records), respectively. Two unidentified congeneric species, Raphidascaris (Ichthyascaris) sp. 1 from the trumpet emperor Lethrinus miniatus (Lethrinidae, Perciformes) and Raphidascaris (Ichthyascaris) sp. 2 from the white-spotted puffer Arothron hispidus (Tetraodontidae, Tetraodontiformes) were recorded. Moreover, two species of Hysterothylacium Ward et Magath, 1917, H. alatum Moravec et Justine, 2015 and H. epinepheli (Yamaguti, 1941), were found in the leopard coralgrouper Plectropomus leopardus (type host) and the highfin grouper Epinephelus maculatus (new host) (both Serranidae, Perciformes), respectively. This is the second finding of H. epinepheli since its original description in Japan 79 years ago. Most species are described based on light and electron microscopical studies.

TITLE: Nouvelles mentions de nématodes anisakidés de poissons marins de Nouvelle-Calédonie, avec description de cinq nouvelles espèces de Raphidascaris (Ichthyascaris) (Nematoda, Anisakidae). ABSTRACT: L’examen récent de nématodes Anisakidae de poissons marins de la Nouvelle-Calédonie, collectés dans les années 2003–2008, a révélé la présence des cinq nouvelles espèces de Raphidascaris Railliet et Henry, 1915, toutes appartenant au sous-genre Ichthyascaris Wu, 1949 : Raphidascaris (Ichthyascaris) spinicauda n. sp. chez le fusilier Caesio cuning (Caesionidae, Perciformes) ; Raphidascaris (Ichthyascaris) fasciati n. sp. chez la loche Epinephelus fasciatus (Serranidae, Perciformes) ; Raphidascaris (Ichthyascaris) nudicauda n. sp. chez le poisson-lézard Saurida undosquamis (Synodontidae, Aulopiformes) ; Raphidascaris (Ichthyascaris) euani n. sp. chez le bossu Gymnocranius euanus (Lethrinidae, Perciformes) ; et Raphidascaris (Ichthyascaris) elopsis n. sp. chez Elops hawaiensis (Elopidae, Elopiformes). Deux autres espèces congénériques, R. (I.) etelidis Moravec et Justine, 2012 et R. (I.) sillagoides (Bruce, 1990) ont été trouvées respectivement chez les vivaneaux de profondeur Etelis carbunculus (nouvel hôte) et Etelis coruscans (Lutjanidae, Perciformes) et chez Sillago sihama (Sillaginidae, Perciformes) (nouvel hôte et nouvelle mention géographique). Deux espèces congénériques non identifiées, Raphidascaris (Ichthyascaris) sp. 1 chez le bossu Lethrinus miniatus (Lethrinidae, Perciformes) et Raphidascaris (Ichthyascaris) sp. 2 chez Arothron hispidus (Tetraodontidae, Tetraodontiformes) sont signalées. De plus, deux espèces d’Hysterothylacium Ward et Magath, 1917, H. alatum Moravec et Justine, 2015 et H. epinepheli (Yamaguti, 1941), ont été trouvées chez la saumonée Plectropomus leopardus (hôte-type) et chez la loche uitoé Epinephelus maculatus (nouvel hôte) (Serranidae, Perciformes), respectivement. Il s’agit de la deuxième mention d’H. epinepheli depuis sa description originale au Japon il y a 79 ans. La plupart des espèces ont été décrites sur la base d’études au microscope optique et électronique.

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Recent examinations of spirurid nematodes (Spirurida) from deep-sea or coral reef marine fishes off New Caledonia, collected in the years 2006-2009, revealed the presence of the following five species: Ichthyofilaroides novaecaledoniensis (Moravec et Justine, 2009) n. gen., n. comb. (transferred from Ichthyofilaria Yamaguti, 1935) (females) (Guyanemidae) from the deep-sea fish Hoplichthys citrinus (Hoplichthyidae, Scorpaeniformes), Philometra sp. (male fourth-stage larva and mature female) (Philometridae) from Epinephelus maculatus (Serranidae, Perciformes), Ascarophis (Dentiascarophis) adioryx Machida, 1981 (female) (Cystidicolidae) from Sargocentron spiniferum (Holocentridae, Beryciformes), Ascarophis (Ascarophis) nasonis Machida, 1981 (males and females) from Naso lituratus and N. unicornis (Acanthuridae, Perciformes), and Ascarophisnema tridentatum Moravec et Justine, 2010 (female) from Gymnocranius grandoculis (Lethrinidae, Perciformes). Two species, I. novaecaledoniensis and A. nasonis, are redescribed based on light microscopical (LM) and scanning electron microscopical (SEM) examinations, the latter used in these species for the first time. Morphological data on the specimen of A. tridentatum from the new host species are provided. Philometra sp. (from E. maculatus) most probably represents a new gonad-infecting species of this genus. The newly established genus Ichthyofilaroides n. gen. is characterized mainly by the presence of a small buccal capsule and by the number and distribution of cephalic papillae in the female; it is the sixth genus in the Guyanemidae.

TITLE: Nouvelles mentions de nématodes spirurides (Nematoda, Spirurida, Guyanemidae, Philometridae & Cystidicolidae) de poissons marins de la Nouvelle-Calédonie, avec redescriptions de deux espèces et érection d’Ichthyofilaroides n. gen. ABSTRACT: L’étude récente de nématodes Spirurida de poissons marins de mer profonde ou des récifs coralliens au large de la Nouvelle-Calédonie, collectés dans les années 2006-2009, a révélé la présence des cinq espèces suivantes : Ichthyofilaroides novaecaledoniensis (Moravec et Justine, 2009) n. gen., n. comb. (transféré depuis Ichthyofilaria Yamaguti, 1935) (femelles) (Guyanemidae) du poisson de profondeur Hoplichthys citrinus (Hoplichthyidae, Scorpaeniformes), Philometra sp. (larve mâle de quatrième stade et femelle mûre) (Philometridae) d’Epinephelus maculatus (Serranidae, Perciformes), Ascarophis (Dentiascarophis) adioryx Machida, 1981 (femelle) (Cystidicolidae) de Sargocentron spiniferum (Holocentridae, Beryciformes), Ascarophis (Ascarophis) nasonis Machida, 1981 (mâles et femelles) de Naso lituratus et N. unicornis (Acanthuridae, Perciformes), et Ascarophisnema tridentatum Moravec et Justine, 2010 (femelle) de Gymnocranius grandoculis (Lethrinidae, Perciformes). Deux espèces, I. novaecaledoniensis et A. nasonis, sont redécrites sur la base de la microscopie optique et de la microscopie électronique à balayage, cette dernière étant utilisée pour la première fois chez ces espèces. Des données morphologiques sur le spécimen d’A. tridentatum de la nouvelle espèce hôte sont fournies. Philometra sp. (d’E. maculatus) représente très probablement une nouvelle espèce infectant les gonades de ce genre. Le genre nouvellement établi Ichthyofilaroides n. gen. se caractérise principalement par la présence d’une petite capsule buccale et par le nombre et la répartition des papilles céphaliques chez la femelle. C’est le sixième genre des Guyanemidae.

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Recent examinations of camallanid nematodes (Camallanidae) from marine fishes off New Caledonia, collected in the years 2003-2011, revealed the presence of the following five new species of Procamallanus Baylis, 1923, all belonging to the subgenus Spirocamallanus Olsen, 1952: Procamallanus (Spirocamallanus) dispar n. sp. from the common ponyfish Leiognathus equulus (type host) and the striped ponyfish Aurigequula fasciata (both Leiognathidae, Perciformes); Procamallanus (Spirocamallanus) bothi n. sp. from the leopard flounder Bothus pantherinus (Bothidae, Pleuronectiformes); Procamallanus (Spirocamallanus) hexophtalmatis n. sp. from the speckled sandperch Parapercis hexophtalma (Pinguipedidae, Perciformes); Procamallanus (Spirocamallanus) synodi n. sp. from the sand lizardfish Synodus dermatogenys (Synodontidae, Aulopiformes); and Procamallanus (Spirocamallanus) thalassomatis n. sp. from the yellow-brown wrasse Thalassoma lutescens (Labridae, Perciformes). These are described based on light and scanning electron microscopical (SEM) studies. An additional three congeneric nematodes unidentifiable to species are reported from perciform fishes and a shark: Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 3 of Moravec et al., 2006, Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 1, and Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 2. Ten fish species are recorded as new hosts for Camallanus carangis Olsen, 1954. Two camallanids, Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 3 (subgravid female) and Camallanus carangis (fourth-stage larva) were also found in the digestive tract of the New Caledonian sea krait Laticauda saintgironsi, serving apparently as postcyclic and paratenic hosts, respectively, for these fish nematodes.

TITLE: Nouvelles espèces et nouveaux signalements de nématodes camallanidés (Nematoda, Camallanidae) provenant de poissons marins et de serpents de mer en Nouvelle-Calédonie. ABSTRACT: L’étude récente de nématodes camallanidés (Camallanidae) de poissons marins capturés au large de la Nouvelle-Calédonie, recueillis de 2003 à 2011, a révélé la présence des cinq nouvelles espèces suivantes de Procamallanus Baylis, 1923, toutes appartenant au sous-genre Spirocamallanus Olsen, 1952 : Procamallanus (Spirocamallanus) dispar n. sp. de Leiognathus equulus (hôte-type) et de Aurigequula fasciata (tous deux Leiognathidae, Perciformes) ; Procamallanus (Spirocamallanus) bothi n. sp. de Bothus pantherinus (Bothidae, Pleuronectiformes) ; Procamallanus (Spirocamallanus) hexophtalmatis n. sp. de Parapercis hexophtalma (Pinguipedidae, Perciformes) ; Procamallanus (Spirocamallanus) synodi n. sp. de Synodus dermatogenys (Synodontidae, Aulopiformes) ; et Procamallanus (Spirocamallanus) thalassomatis n. sp. de Thalassoma lutescens (Labridae, Perciformes). Ces espèces sont décrites sur la base d’études réalisées au microscope électronique à balayage et au microscope photonique. Trois autres nématodes congénères non identifiables au niveau spécifique sont signalés chez des poissons perciformes et un requin : Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 3 de Moravec et al., 2006, Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 1 et Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 2. Dix espèces de poissons sont rapportées comme nouveaux hôtes pour Camallanus carangis Olsen, 1954. Deux camallanidés, Procamallanus (Spirocamallanus) sp. 3 (femelles subgravides) et Camallanus carangis (larve du quatrième stade) ont également été trouvés dans le tube digestif du serpent marin de Nouvelle-Calédonie, Laticauda saintgironsi, qui semble servir respectivement d’hôte post-cyclique et d’hôte paraténique pour ces nématodes de poissons.

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Based on light and scanning electron microscopical studies of nematode specimens from the digestive tract of some rarely collected anguilliform and perciform fishes off New Caledonia, three new species of Cucullanus Müller, 1777 (Cucullanidae) are described: C. austropacificus n. sp. from the longfin African conger Conger cinereus (Congridae), C. gymnothoracis n. sp. from the lipspot moray Gymnothorax chilospilus (Muraenidae), and C. incognitus n. sp. from the seabream Dentex fourmanoiri (Sparidae). Cucullanus austropacificus n. sp. is characterized by the presence of cervical alae, ventral sucker, alate spicules 1.30-1.65 mm long, conspicuous outgrowths of the anterior and posterior cloacal lips and by elongate-oval eggs measuring 89-108 × 48-57 μm; C. gymnothoracis n. sp. is similar to the foregoing species, but differs from it in the absence of cervical alae and the posterior cloacal outgrowth, in the shape and size of the anterior cloacal outgrowth and somewhat shorter spicules 1.12 mm long; C. incognitus n. sp. (based on female morphology) differs from other congeneric species parasitic in the Sparidae mainly in possessing cervical alae, the postequatorial vulva, phasmids situated at the mid-length of the tail and in the size of the eggs (75-84 × 45-66 μm). A key to species of Cucullanus parasitizing anguilliform fishes is provided.

TITLE: Trois nouvelles espèces de Cucullanus (Nematoda: Cucullanidae) de poissons marins au large de la Nouvelle-Calédonie, avec une clé des espèces de Cucullanus d’Anguilliformes. ABSTRACT: Sur la base d’une étude en microscopie photonique et électronique à balayage de spécimens de nématodes provenant du tube digestif de quelques poissons anguilliformes et perciformes rarement pêchés en Nouvelle-Calédonie, trois nouvelles espèces de Cucullanus Müller, 1777 (Cucullanidae) sont décrites : C. austropacificus n. sp. de Conger cinereus (Congridae), C. gymnothoracis n. sp. de Gymnothorax chilospilus (Muraenidae) et C. incognitus n. sp. de Dentex fourmanoiri (Sparidae). Cucullanus austropacificus n. sp. est caractérisé par la présence d’ailes cervicales, une ventouse ventrale, des spicules ailés de 1,30-1,65 mm de long, des excroissances remarquables des lèvres cloacales antérieure et postérieure et d’oeufs ovales et allongés mesurant 89-108 × 48-57 μm. C. gymnothoracis n. sp. est semblable à l’espèce précédente, mais en diffère en l’absence d’ailes cervicales et d’excroissance cloacale postérieure, par la forme et la taille de l’excroissance cloacale antérieure et par des spicules un peu plus courts de 1,12 mm. C. incognitus n. sp. (basé sur la morphologie de la femelle) diffère des autres espèces congénères parasites chez les Sparidae principalement par la possession d’ailes cervicales, une vulve postéquatoriale, des phasmides situés à mi-longueur de la queue et par la taille des oeufs (75–84 × 45–66 μm). Une clé des espèces de Cucullanus parasitant les poissons anguilliformes est fournie.

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Parasitological examination of marine perciform fishes belonging to four species of Carangoides, i.e. C. chrysophrys, C. dinema, C. fulvoguttatus and C. hedlandensis (Carangidae), from off New Caledonia revealed the presence of nematodes. The identification of carangids was confirmed by barcoding of the COI gene. The eight nematode species found were: Capillariidae gen. sp. (females), Cucullanus bulbosus (Lane, 1916) (male and females), Hysterothylacium sp. third-stage larvae, Raphidascaris (Ichthyascaris) sp. (female and larvae), Terranova sp. third-stage larvae, Philometra dispar n. sp. (male), Camallanus carangis Olsen, 1954 (females) and Johnstonmawsonia sp. (female). The new species P. dispar from the abdominal cavity of C. dinema is mainly characterised by the body length (5.14 mm), the lengths of markedly unequal spicules (163 and 96 μm) and gubernaculum (102 μm long) provided with a dorsal protuberance and a small, reflexed dorsal barb on its posterior portion. The finding of C. bulbosus represents the first record of this parasite a century after its discovery; the first study of this species by scanning electron microscopy (SEM) enabled detailed redescription. The finding of Johnstonmawsonia sp. in C. fulvoguttatus is the first record of a rhabdochonid nematode from a host belonging to the Carangidae family. Johnstonmawsonia africana Moravec & Puylaert, 1970 and J. campanae Puylaert, 1973 are transferred to Prosungulonema Roytman, 1963 as P. africanum (Moravec & Puylaert, 1970) comb. n. and P. campanae (Puylaert, 1973) n. comb.

L’examen parasitologique de poissons perciformes marins appartenant à quatre espèces de Carangoides, C. chrysophrys, C. dinema, C. fulvoguttatus et C. hedlandensis (Carangidae) de Nouvelle-Calédonie a révélé la présence de nématodes. L’identification des carangidés a été confirmée par barcoding du gène COI. Les huit espèces de nématodes trouvées étaient: Capillariidae gen. sp. (femelles), Cucullanus bulbosus (Lane, 1916) (mâles et femelles), Hysterothylacium sp. (larves de troisième stade), Raphidascaris (Ichthyascaris) sp. (femelles et larves), Terranova sp. (larves de troisième stade), Philometra dispar n. sp. (mâle), Camallanus carangis Olsen, 1954 (femelles) et Johnstonmawsonia sp. (femelle). La nouvelle espèce P. dispar, de la cavité abdominale de C. dinema, se caractérise principalement par la longueur du corps (5.14 mm), les longueurs des spicules sensiblement inégales (163 et 96 μm) et un gubernaculum (102 μm de long) montrant une protubérance dorsale et un petit ardillon dorsal orienté vers l’arrière sur sa partie postérieure. La trouvaille de C. bulbosus représente la première mention de ce parasite, un siècle après sa découverte; la première étude de cette espèce par MEB a permis une redescription détaillée de l’espèce. La découverte de Johnstonmawsonia sp. chez C. fulvoguttatus est la première mention d’un nématode Rhabdochonidae chez un hôte appartenant à la famille Carangidae. Johnstonmawsonia africana Moravec & Puylaert, 1970 et J. campanae Puylaert, 1973 sont transférés vers Prosungulonema Roytman, 1963 comme P. africanum (Moravec & Puylaert, 1970) n. comb. et P. campanae (Puylaert, 1973) n. comb.

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A recent examination of newly obtained specimens of philometrid nematodes (Philometridae) parasitising carangid and serranid fishes off New Caledonia, South Pacific, revealed the presence of several nematodes of the genus Philometra Costa, 1845, including three new species: P. austropacifica n. sp. (males and females) from the ovary of Alepes vari (Carangidae), P. piscaria n. sp. (males) from the ovary of Epinephelus coioides (Serranidae), and P. selaris n. sp. (males) probably from the abdominal cavity (found in washings) of Selar crumenophthalmus (Carangidae). The new species are characterised mainly by the length and structure of the spicules and gubernaculum, body size, their location in the host and the type of host. Philometra austropacifica n. sp. is the first known nominal gonad-infecting species of Philometra parasitising a carangid fish. In addition, the gravid female of P. fasciati Moravec & Justine, 2008 from the ovary of Epinephelus fasciatus (Serranidae) is described for the first time. Carangid host fish were identified by both morphology and DNA barcoding.

Une étude récente de spécimens nouvellement obtenus de nématodes Philometridae parasitant des poissons Carangidae et Serranidae de Nouvelle-Calédonie, dans le Pacifique Sud, a révélé la présence de plusieurs nématodes du genre Philometra Costa, 1845, dont trois nouvelles espèces : P. austropacifica n. sp. (mâles et femelles) de l’ovaire de Alepes vari (Carangidae), P. piscaria n. sp. (mâles) de l’ovaire d’Epinephelus coioides (Serranidae), et P. selaris n. sp. (mâles) probablement de la cavité abdominale (dans des lavages) de Selar crumenophthalmus (Carangidae). Les nouvelles espèces sont principalement caractérisées par la longueur et la structure des spicules et du gubernaculum, la taille du corps, par leur localisation dans l’hôte et par le type d’hôte. Philometra austropacifica n. sp. est la première espèce nominale connue de Philometra parasitant les gonades d’un Carangidae. En outre, la femelle gravide de P. fasciati Moravec et Justine, 2008 est décrite pour la première fois à partir de l’ovaire d’Epinephelus fasciatus (Serranidae). Les poissons hôtes Carangidae ont été identifiés à la fois par la morphologie et des codes-barres ADN.

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