Adhesion G protein-coupled receptors (aGPCRs) play an important role in neurodevelopment, immune defence and cancer; however, their role throughout viral infections is mostly unexplored. We have been searching for specific aGPCRs involved in SARS-CoV-2 infection of mammalian cells. In the present study, we infected human epithelial cell lines derived from lung adenocarcinoma (Calu-3) and colorectal carcinoma (Caco-2) with SARS-CoV-2 in order to analyse changes in the level of mRNA encoding individual aGPCRs at 6 and 12 h post infection. Based on significantly altered mRNA levels, we identified four aGPCR candidates-ADGRB3/BAI3, ADGRD1/GPR133, ADGRG7/GPR128 and ADGRV1/GPR98. Of these receptors, ADGRD1/GPR133 and ADGRG7/GPR128 showed the largest increase in mRNA levels in SARS-CoV-2-infected Calu-3 cells, whereas no increase was observed with heat-inactivated SARS-CoV-2 and virus-cleared conditioned media. Next, using specific siRNA, we downregulated the aGPCR candidates and analysed SARS-CoV-2 entry, replication and infectivity in both cell lines. We observed a significant decrease in the amount of SARS-CoV-2 newly released into the culture media by cells with downregulated ADGRD1/GPR133 and ADGRG7/GPR128. In addition, using a plaque assay, we observed a reduction in SARS-CoV-2 infectivity in Calu-3 cells. In summary, our data suggest that selected aGPCRs might play a role during SARS-CoV-2 infection of mammalian cells.
- MeSH
- adenokarcinom plic * genetika virologie patologie metabolismus MeSH
- Caco-2 buňky MeSH
- COVID-19 * genetika virologie metabolismus MeSH
- lidé MeSH
- messenger RNA * genetika metabolismus MeSH
- nádorové buněčné linie MeSH
- nádory plic genetika virologie patologie metabolismus MeSH
- receptory spřažené s G-proteiny * metabolismus genetika MeSH
- SARS-CoV-2 * genetika fyziologie metabolismus MeSH
- upregulace * genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
BACKGROUND: Tobacco is the main risk factor for developing lung cancer. Yet, while some heavy smokers develop lung cancer at a young age, other heavy smokers never develop it, even at an advanced age, suggesting a remarkable variability in the individual susceptibility to the carcinogenic effects of tobacco. We characterized the germline profile of subjects presenting these extreme phenotypes with Whole Exome Sequencing (WES) and Machine Learning (ML). METHODS: We sequenced germline DNA from heavy smokers who either developed lung adenocarcinoma at an early age (extreme cases) or who did not develop lung cancer at an advanced age (extreme controls), selected from databases including over 6600 subjects. We selected individual coding genetic variants and variant-rich genes showing a significantly different distribution between extreme cases and controls. We validated the results from our discovery cohort, in which we analysed by WES extreme cases and controls presenting similar phenotypes. We developed ML models using both cohorts. FINDINGS: Mean age for extreme cases and controls was 50.7 and 79.1 years respectively, and mean tobacco consumption was 34.6 and 62.3 pack-years. We validated 16 individual variants and 33 variant-rich genes. The gene harbouring the most validated variants was HLA-A in extreme controls (4 variants in the discovery cohort, p = 3.46E-07; and 4 in the validation cohort, p = 1.67E-06). We trained ML models using as input the 16 individual variants in the discovery cohort and tested them on the validation cohort, obtaining an accuracy of 76.5% and an AUC-ROC of 83.6%. Functions of validated genes included candidate oncogenes, tumour-suppressors, DNA repair, HLA-mediated antigen presentation and regulation of proliferation, apoptosis, inflammation and immune response. INTERPRETATION: Individuals presenting extreme phenotypes of high and low risk of developing tobacco-associated lung adenocarcinoma show different germline profiles. Our strategy may allow the identification of high-risk subjects and the development of new therapeutic approaches. FUNDING: See a detailed list of funding bodies in the Acknowledgements section at the end of the manuscript.
- MeSH
- adenokarcinom plic * genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory plic * genetika patologie MeSH
- sekvenování exomu MeSH
- senioři MeSH
- zárodečné buňky patologie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- adenokarcinom plic * diagnóza farmakoterapie MeSH
- ipilimumab farmakologie terapeutické užití MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nivolumab farmakologie terapeutické užití MeSH
- protokoly protinádorové kombinované chemoterapie MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Skeletální metastázy se v době diagnózy vyskytují až u 20-30 % pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic (non-smah cell lung cancer, NSCLC); v průběhu onemocnění se vyvinou až u 60 % nemocných s NSCLC, až v polovině případů predilekčně postihují páteř. Ohrožují vybranou skupinu pacientů tzv. kostními příhodami, kdy v popředí jsou obtížně zvládnutelné bolesti, patologické fraktury, míšní komprese, neurologické deficity, hyperkalcemie. Celkově jsou zdrojem výrazné morbidity, značně zhoršují kvalitu života pacientů a jsou indikátorem horší prognózy s mediánem přežití 6-7 měsíců od stanovení diagnózy. Doposud není stanovena účinná léčba cílená na skeletální metastázy NSCLC. V této kazuistice prezentujeme dva pacienty s NSCLC a osovými metastázami skeletu po operační stabilizaci. Systémově byl u obou zvolen pembrolizumab, a přestože si byly zpočátku oba případy podobné, každý se vyvíjel jinak.
Skeletal metastases are prevalent in 20-30 % of patients with non-smaii cell lung cancer (NSCLC) at the time of diagnosis, up to 60 % of patients will develop bone metastases - up to half of those are presenting with spine metastases. Selected demographic of patients is at great risk of developing skeletal related events, that include severe chronic pain, pathological fractures, spinal compression, neurologic deficit, hypercalcemia. They are a source of great morbidity and significantly worsen patients’ quality of life, with overall survival median of 6-7 months at the time of diagnosis. Here we are presenting two cases of patients with NSCLC with bone metastases, who underwent surgical spine stabilization, and were subsequently treated with pembrolizumab in the first line of treatment.
- Klíčová slova
- pembrolizumab,
- MeSH
- adenokarcinom plic * diagnóza farmakoterapie sekundární MeSH
- inhibitory kontrolních bodů * farmakologie klasifikace terapeutické užití MeSH
- karboplatina farmakologie terapeutické užití MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory páteře diagnóza farmakoterapie sekundární MeSH
- Pancoastův syndrom diagnóza farmakoterapie MeSH
- pemetrexed farmakologie terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
BACKGROUND/AIM: Targeted therapy has become increasingly important in treating lung adenocarcinoma, the most common subtype of lung cancer. Next-generation sequencing (NGS) enables precise identification of specific genetic alterations in individual tumor tissues, thereby guiding targeted therapy selection. This study aimed to analyze mutations present in adenocarcinoma tissues using NGS, assess the benefit of targeted therapy and evaluate the progress in availability of targeted therapies over last five years. PATIENTS AND METHODS: The study included 237 lung adenocarcinoma patients treated between 2018-2020. The Archer FusionPlex CTL panel was used for NGS analysis. RESULTS: Gene variants covered by the panel were detected in 57% patients and fusion genes in 5.9% patients. At the time of the study, 34 patients (14.3% of patients) were identified with a targetable variant. Twenty-five patients with EGFR variants, 8 patients with EML4-ALK fusion and one patient with CD74-ROS1 fusion received targeted therapy. Prognosis of patients at advanced stages with EGFR variants treated by tyrosine kinase inhibitors and patients with EML4-ALK fusion treated by alectinib was significantly favorable compared to patients without any targetable variant treated by chemotherapy (p=0.0172, p=0.0096, respectively). Based on treatment guidelines applicable in May 2023, the number of patients who could profit from targeted therapy would be 64 (27.0% of patients), this is an increase by 88% in comparison to recommendations valid in 2018-2020. CONCLUSION: As lung adenocarcinoma patients significantly benefit from targeted therapy, the assessment of mutational profiles using NGS could become a crucial approach in the routine management of oncological patients.
- MeSH
- adenokarcinom plic * farmakoterapie genetika MeSH
- erbB receptory genetika MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nádory plic * farmakoterapie genetika patologie MeSH
- protoonkogenní proteiny genetika MeSH
- tyrosinkinasové receptory genetika MeSH
- tyrosinkinasy genetika MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Klíčová slova
- osimertinib, studie ADAURA,
- MeSH
- adenokarcinom plic diagnóza farmakoterapie MeSH
- adjuvantní chemoterapie metody MeSH
- inhibitory proteinkinas terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- metastázy nádorů MeSH
- nádory ledvin chirurgie diagnóza farmakoterapie sekundární MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic * farmakoterapie MeSH
- protinádorové látky terapeutické užití MeSH
- randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- komentáře MeSH
- souhrny MeSH
Východiska: U nádorů, pro něž je stanovena standardní léčba, nelze indikovat samotnou podpůrnou léčbu, pokud pro to neexistuje zvláštní důvod. Protože pacientka s adenokarcinomem plic a mutací receptoru epidermálního růstového faktoru (epidermal growth factor receptor – EGFR) odmítla standardní terapii, získali jsme zkušenost s dlouhodobým sledováním pacientky pouze na podpůrné léčbě, které trvalo > 10 let. Případ: Sedmdesátiletá žena k nám byla odeslána pro výskyt opacit mléčného skla (ground glass opacities – GGO) v pravé plíci. U jedné z GGO, která byla resekována v jiné nemocnici, byl potvrzen EGFR mutovaný adenokarcinom plic. Ačkoli jí bylo vysvětleno, že standardní terapií je EGFR tyrozinkinázový inhibitor (TKI), pacientka tuto terapii odmítla a přála si zbylé GCO sledovat pomocí zobrazovacích technik. Během dlouhodobého sledování, které trvalo 13 let, bylo u každé GGO pozorováno mírné zvětšení. Zdvojovací čas největší GGO a karcinoembryonálního antigenu v séru byl > 2 000 dní. Závěr: I když je to velmi vzácné, některé EGFR mutované adenokarcinomy plic mohou mít velmi pomalou progresi. Klinický průběh u této pacientky poskytuje užitečnou informaci pro klinickou praxi u budoucích pacientů, u kterých může být klinický průběh podobný.
Background: Supportive care alone cannot be indicated for cancers for which established standard therapy exists unless there is a specific reason. Due to the refusal of standard therapy by the patient after proper explanation of the therapy, we experienced a long-term follow-up of >10 years with supportive care alone in an epidermal growth factor receptor (EGFR) mutated lung cancer patient. Case: A 70-year-old woman was referred due to the right lung with some ground glass opacities (GGOs). One of the GGOs which was resected in another hospital had been confirmed to be EGFR mutation-positive lung adenocarcinoma. Although EGFR-tyrosine kinase inhibitor (TKI) was explained to be the standard therapy, the patient refused receiving the therapy and wished to follow up imaging of the remaining GGOs. During the follow-up period of 13 years, the each GGO showed a gradual increase. The doubling time of the largest GGO and that of serum carcinoembryonic antigen was > 2,000 days, respectively. Conclusion: Although very rare, some of EGFR mutated lung adenocarcinoma might have a very slow progression. Clinical course of this patient provides useful information to the clinical practice of future patients who may have similar clinical courses.
- MeSH
- adenokarcinom plic * diagnóza terapie MeSH
- geny erbB-1 MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- pozorné vyčkávání MeSH
- senioři MeSH
- výsledek terapie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
BACKGROUND: Transformation of EGFR (epidermal growth factor receptor) - mutant non-small cell lung cancer (NSCLC) into small-cell lung cancer (SCLC) is one mechanism of resistance to tyrosine kinase inhibitor (TKI) treatment, seen in approximately 3-10% cases. Such transformed SCLC often retains the original EGFR mutation (EGFRM), which is not otherwise observed in SCLC. CASE REPORT: We present a 67 y/o woman with pulmonary adenocarcinoma (AC) and EGFRM deletion on exon 19. After initial treatment with whole brain radiotherapy and 7 months of TKI afatinib, progression was observed. Liquid biopsy detected deletion on exon 19 and T790M mutation. Chemotherapy carboplatin plus pemetrexed was administered, with no response. Genetics from a rebiopsy of lung revealed deletion on exon 19. After 12 months treatment with TKI osimertinib, a progression in lung and pancreas lesions was detected, docetaxel was used, with followig progression. The lung biopsy revealed SCLC. Significant elevation of serum markers carcinoembryonic antigen (CEA) and neuron-specific enolase (NSE) was observed at the time of the SCLC diagnosis. Treatment with carboplatin and etoposide was not effective. The next biopsy found two populations of cells: SCLC and AC. The biopsy from the pancreatic lesion revealed metastasis of SCLC. PCR confirmed EGFRM deletion on exon 19 in the lung SCLC tissue sample. The following treatment lines of topotecan, erlotinib were not effective. The patient survived 36 months from diagnosis, 7 months from detection of SCLC. CONCLUSION: Screening for transformation of EGFR-mutant NSCLC to SCLC should be considered in resistance to TKI. In the presented case, this rare transformation was confirmed by histopathologic examination and by PCR. EGFRM in the lung SCLC, identical to that found in the original lung AC, was detected. Further, the observed elevation of serum tumor markers NSE and CEA can indicate this infrequent transformation and help to decide on rebiopsy.
- MeSH
- adenokarcinom plic * genetika farmakoterapie MeSH
- chemorezistence genetika MeSH
- erbB receptory genetika terapeutické užití MeSH
- inhibitory proteinkinas MeSH
- karboplatina terapeutické užití MeSH
- karcinoembryonální antigen genetika terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- malobuněčný karcinom plic * genetika farmakoterapie patologie MeSH
- mutace MeSH
- nádory plic * farmakoterapie genetika patologie MeSH
- nemalobuněčný karcinom plic * genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Léčba pomocí tyrosinkinázových inhibitorů (TKI) patří mezi zavedené standardy u pacientů s tzv. častými mutacemi genu pro epidermální růstový faktor (EGFR) – tj. bodová mutace vedoucí k aminokyselinové záměně L858R (dle stávající nomenklatury p. (Leu858Arg)) a delece na exonu 19 – generalizovaného nemalobuněčného plicního karcinomu (NSCLC). Nicméně pro ostatní (tzv. vzácné) EGFR mutace je situace ohledně účinnost EGFR-TKI u NSCLC v řadě případů nejistá. Naše kazuistika, popisující případ pacientky se vzácnou krátkou duplikací (dříve inzercí) genu EGFR na exonu 19, potvrzuje v předchozí literatuře uváděný možný pozitivní účinek při léčbě afatinibem. Dále pak popisujeme poměrně vzácnou příčinu rezistence na tuto léčbu – bodovou mutaci v genu NRAS c.35G>A, p.(Gly12Asp) (dle starší nomenklatury G12D), prokázanou metodou sekvenování nové generace (NGS) z cirkulující nádorové DNA (ctDNA) z krevního odběru. I přes probíhající výzkum není zatím bohužel znám spolehlivý TKI cílící na tuto mutaci.
