Detail
Report
Web resource
FT
Medvik - Catalogs
  • Something wrong with this record ?

KLASIFIKACE VARIANT NEJASNÉHO VÝZNAMU V GENU CHEK2 A FENOTYPOVÁ CHARAKTERIZACE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ U NOSIČŮ PATOGENNÍCH VARIANT [Variants of unknown significance in the CHEK2 gene: their functional classification and characterization of tumors in carriers of pathogenic mutations]

řešitel Libor Macůrek, příjemce Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Published
2023
Series
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Pagination
nestr.

Status minimal Language Czech Country Czech Republic

Grant support
NV19-03-00279 MZ0 CEP Register

Gen CHEK2 kóduje kinázu CHK2, fosforylující řadu intracelulárních proteinů v odpovědi na poškození DNA. Patogenní, zárodečné mutace v CHEK2 zvyšují riziko vzniku karcinomu prsu a některých dalších nádorů. Analýza CHEK2 je v současnosti součástí genetické analýzy nádorové predispozice v ČR. V předchozích analýzách jsme mutace v CHEK2 nalezli u více jak 6,5% nemocných s ca prsu a/nebo ovaria a ukázali jsme, že většinu alterací tvoří varianty nejasného významu (VUS). Pro jejich funkční klasifikaci jsme vyvinuli unikátní systém založený na kvantifikaci fosforylace KAP1 katalyzované CHK2 v buněčné linii. Ve studii uzpůsobíme modelový systém pro vysokokapacitní analýzu a provedeme klasifikaci všech VUS v CHEK2 detekovaných spolupracujícími pracovišti u pacientů v ČR a zahraničí. Výsledky studie zvýší diagnostickou výtěžnost analýz nádorové predispozice a umožní charakterizovat pacienty s patogenními mutacemi CHEK2, což je základním předpokladem pro genetické poradenství v rodinách nosičů, stanovení rizika nádorů asociovaných s mutacemi v genu CHEK2 a racionalizaci preventivních opatření.; The CHEK2 gene codes for a checkpoint kinase CHK2 phosphorylating various intracellular proteins in response to DNA damage. Pathogenic germ-line CHEK2 mutations confer an increased breast and other cancer risk. CHEK2 mutation analysis is currently an obligatory procedure required for diagnostics in Czech hereditary cancer patients. We have shown that the prevalence of germline CHEK2 variants exceeds 6.5% in high-risk breast/ovarian Czech cancer patients and that the majority of found alterations represent variants of unknown significance (VUS). We developed a unique cell-based approach quantifying CHK2-mediated phosphorylation of KAP1 protein in vivo that enables reliable functional classification of CHEK2 VUS. Here we aim to optimize the assay for the high throughput analysis and classify all CHEK2 VUS identified by Czech and international collaborators. This study will enable clinical characterization of individuals carrying deleterious CHEK2 mutations, increasing diagnostic utility of CHEK2 analysis, improving risk estimation, and enabling optimal follow-up and prevention set-up.

Variants of unknown significance in the CHEK2 gene: their functional classification and characterization of tumors in carriers of pathogenic mutations

Doba řešení: 2019-2022

Bibliography, etc.

Obsahuje literaturu

Owner Details Services
NLK NLK Shelf no. online [0] in processing
000      
00000ntm 2200000 i 4500
001      
MED00215355
003      
CZ-PrNML
005      
20240919233050.0
007      
ta
008      
240919s2023 xr f 000 0|cze||
009      
ND
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e rda
041    0_
$a cze
044    __
$a xr
086    __
$a NV19-03-00279 $p MZ0
100    1_
$a Macůrek, Libor $4 aut
245    10
$a KLASIFIKACE VARIANT NEJASNÉHO VÝZNAMU V GENU CHEK2 A FENOTYPOVÁ CHARAKTERIZACE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ U NOSIČŮ PATOGENNÍCH VARIANT / $c řešitel Libor Macůrek, příjemce Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
246    31
$a Variants of unknown significance in the CHEK2 gene: their functional classification and characterization of tumors in carriers of pathogenic mutations
264    _0
$c 2023
300    __
$a nestr.
336    __
$a text $b txt $2 rdacontent
337    __
$a počítač $b c $2 rdamedia
338    __
$a online zdroj $b cr $2 rdacarrier
347    __
$a textový soubor $b PDF $2 rda
490    1_
$a Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
500    __
$a Doba řešení: 2019-2022
504    __
$a Obsahuje literaturu
520    0_
$a Gen CHEK2 kóduje kinázu CHK2, fosforylující řadu intracelulárních proteinů v odpovědi na poškození DNA. Patogenní, zárodečné mutace v CHEK2 zvyšují riziko vzniku karcinomu prsu a některých dalších nádorů. Analýza CHEK2 je v současnosti součástí genetické analýzy nádorové predispozice v ČR. V předchozích analýzách jsme mutace v CHEK2 nalezli u více jak 6,5% nemocných s ca prsu a/nebo ovaria a ukázali jsme, že většinu alterací tvoří varianty nejasného významu (VUS). Pro jejich funkční klasifikaci jsme vyvinuli unikátní systém založený na kvantifikaci fosforylace KAP1 katalyzované CHK2 v buněčné linii. Ve studii uzpůsobíme modelový systém pro vysokokapacitní analýzu a provedeme klasifikaci všech VUS v CHEK2 detekovaných spolupracujícími pracovišti u pacientů v ČR a zahraničí. Výsledky studie zvýší diagnostickou výtěžnost analýz nádorové predispozice a umožní charakterizovat pacienty s patogenními mutacemi CHEK2, což je základním předpokladem pro genetické poradenství v rodinách nosičů, stanovení rizika nádorů asociovaných s mutacemi v genu CHEK2 a racionalizaci preventivních opatření.
520    9_
$a The CHEK2 gene codes for a checkpoint kinase CHK2 phosphorylating various intracellular proteins in response to DNA damage. Pathogenic germ-line CHEK2 mutations confer an increased breast and other cancer risk. CHEK2 mutation analysis is currently an obligatory procedure required for diagnostics in Czech hereditary cancer patients. We have shown that the prevalence of germline CHEK2 variants exceeds 6.5% in high-risk breast/ovarian Czech cancer patients and that the majority of found alterations represent variants of unknown significance (VUS). We developed a unique cell-based approach quantifying CHK2-mediated phosphorylation of KAP1 protein in vivo that enables reliable functional classification of CHEK2 VUS. Here we aim to optimize the assay for the high throughput analysis and classify all CHEK2 VUS identified by Czech and international collaborators. This study will enable clinical characterization of individuals carrying deleterious CHEK2 mutations, increasing diagnostic utility of CHEK2 analysis, improving risk estimation, and enabling optimal follow-up and prevention set-up.
653    __
$a breast cancer $a karcinom prsu $a varianta nejasného významu $a hereditary cancer syndromes $a functional analysis $a dědičné nádorové syndromy $a nádorová predispozice $a CHEK2 $a CHK2 kináza $a funkční ananlýza $a CHEK2 $a CHK2 kinase $a cancer predisposition $a variant of uncertain significance
655    _4
$a závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR $7 nlk-pt193
700    1_
$a Kleibl, Zdeněk $4 aut
700    1_
$a Kleiblová, Petra $4 aut
710    2_
$a Univerzita Karlova $b 1. lékařská fakulta
710    2_
$a Všeobecná fakultní nemocnice v Praze
710    2_
$a Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
810    1_
$a Česko. $b Ministerstvo zdravotnictví. $b Agentura pro zdravotnický výzkum. $t Závěrečná zpráva o řešení grantu
856    4_
$u https://kramerius.medvik.cz/ $y Digitalizace plánována
910    __
$a ABA008 $b online $y 0
990    __
$a 20240919 $b ABA008
999    __
$a min $b medvik21 $g 2151899 $s 234144
BAS    __
$a 30
LZP    __
$b AZV-2022-20240919