-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Prevalence ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella pneumoniae v České republice a jejich molekulárně-biologická analýza
[Prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic and their molecular biological analysis]
M. Kolář, T. Látal, N. Bartoníková
Jazyk čeština, angličtina Země Česko
Grantová podpora
1A8258
MZ0
CEP - Centrální evidence projektů
Digitální knihovna NLK
Plný text - Článek
Zdroj
- MeSH
- antibakteriální látky farmakologie terapeutické užití MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody MeSH
- fenotyp MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- Klebsiella pneumoniae izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce MeSH
- prevalence MeSH
- techniky in vitro MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Úvod: Jedním z problémů současné medicíny je zvyšující se počet bakteriálních kmenů s nebezpečnými fenotypy rezistence, včetně Klebsiella pneumoniae s produkcí širokospektrých β -laktamáz AmpA (ESBL). Cílem studie bylo stanovení prevalence a molekulárněbiologická charakteristika ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella. Pneumoniae v České republice. Materiál a metody. Studie probíhala na 16 pracovištích v České republice v období září až říjen 2004. Z kUnického materiálu všech hospitalizovaných pacientů byly izolovány a standardními identifikačními postupy určovány kmeny Klebsiella pneumoniae. Jejich citlivost k antibiotikům byla testována standardní diluční mikrometodou. K fenotypovému průkazu produkce ESBL byl použit Double Disk Synergy Test. Geny biaTEM, biaSHV a bJaOXA, kódující produkci ESBL, byly prokazovány pomocí PCR. Molekulárně-biologická charakteristika ESBL-pozitivních kmenů byla provedena izolací genomové DNA, naštěpením restriktázou Xbal a rozdělením pomocí PFGE. Získané restrikční mapy jednotlivých izolátů byly porovnány pomocí programu GelCompar II, poté byla stanovena jejich příbuznost. Výsledky. Ve sledovaném období bylo izolováno 913 kmenů KlebsieJIa pneumoniae, které vyvolaly klinicky prokazatelné onemocnění, přičemž u 234 (25,6 %) byla prokázána produkce ESBL. Prevalence ESBL-pozitivních kmenů činila na jednotkách intenzivní péče 38,5 %, na standardních odděleních pak 15,8 %. Účinnost na více jak 50 % ESBL-pozitivních izolátů byla prokázána pouze u meropenemu (98 %), cefoperazon/sulbactamu (61 %) a amikacinu (54 %). Naopak ESBL-negativní kmeny vykazovaly dobrou citlivost na všechna testovaná antibiotika (76-99 %). Molekulárně-biologická analýza prokázala výskyt 18 klonálních typů obsahujících 2-6 identických kmenů. 17 klonů obsahovalo izobáty vždy z jedné nemocnice, pouze v 1 klonu byly identifikovány kmeny ze dvou nemocnic. Závér. Na základě uvedených výsledků lze konstatovat, že výskyt ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella pneumoniae je v České republice relativně vysoký, především na jednotkách intenzivní péče. Lze demonstrovat extenzivní šíření „epidemických klonů“ v rámci českých nemocnic a v omezeném rozsahu i mezi nimi.
Background: One of the problems of contemporary medicine is an increasing number of bacterial strains with hazardous phenotypes of resistance. The feared bacterial pathogens include KJebsieiia pneumoniae strains producing AmpA extended-spectrum beta-lactamases. The study focused on the molecular biological characteristics of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae collected in the Czech Republic. Materials and Methods: Clinical material from patients hospitalized in 16 Czech hospitals in September and October 2004 was used to isolate and determine KJebsieIJa pneumoniae strains by standard identification procedures. Their susceptibility to antibiotics was tested using a dilution micromethod. A Double-Disk Synergy Test was used for phenotype determination of ESBL production. The biaTEM, biaSHV and bJaOXA genes coding ESBL production were demonstrated by PCK Molecular biological characteristics of ESBL-positive strains utilized the genomic DNA isolation, Xbal restrictase digestion and PFGE differentiation. The acquired restriction maps of individual isolates were compared using GelCompar II software and their relationship was determined. Results: During the monitored period, 913 Klebsiella pneumoniae strains causing clinically detectable diseases were isolated. Of these, 234 (25.6 %) were determined as ESBL-positive strains. The prevalence of ESBL-positive strains was 38.5 % in ICUs and 15.8 % in standard wards. More than 50 % of ESBL-positive isolates were effectively treated only with meropenem (98 %), cefoperazone/sulbactam (61 %) and amikacin (54 %). Conversely, ESBL-negative strains showed high susceptibility to all tested antibiotics (76-99 %). The molecular biological analysis identified 18 clonal types containing 2-6 identical strains. 17 clones usually contained isolates from one hospital and only in one clone strains from two hospitals were identified. Conclusion: Based on the above mentioned results, the prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic can be perceived as relatively high, especially in the ICUs. An extensive spread of „epidemic clones" within Czech hospitals and, to a limited extent, between them can be demonstrated.
Prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic and their molecular biological analysis
Prevalence ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella pneumoniae v České republice a jejich molekulárně-biologická analýza = Prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic and their molecular biological analysis /
Prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic and their molecular biological analysis /
Lit. 36
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc05011890
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20180326102140.0
- 008
- 051205s2005 xr u cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $a eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Kolář, Milan, $d 1964- $4 aut $7 jn20010310083
- 245 10
- $a Prevalence ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella pneumoniae v České republice a jejich molekulárně-biologická analýza = $b Prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic and their molecular biological analysis / $c M. Kolář, T. Látal, N. Bartoníková
- 246 11
- $a Prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic and their molecular biological analysis
- 314 __
- $a Ústav mikrobiologie FNO a LF UP, Olomouc, CZ
- 504 __
- $a Lit. 36
- 520 3_
- $a Úvod: Jedním z problémů současné medicíny je zvyšující se počet bakteriálních kmenů s nebezpečnými fenotypy rezistence, včetně Klebsiella pneumoniae s produkcí širokospektrých β -laktamáz AmpA (ESBL). Cílem studie bylo stanovení prevalence a molekulárněbiologická charakteristika ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella. Pneumoniae v České republice. Materiál a metody. Studie probíhala na 16 pracovištích v České republice v období září až říjen 2004. Z kUnického materiálu všech hospitalizovaných pacientů byly izolovány a standardními identifikačními postupy určovány kmeny Klebsiella pneumoniae. Jejich citlivost k antibiotikům byla testována standardní diluční mikrometodou. K fenotypovému průkazu produkce ESBL byl použit Double Disk Synergy Test. Geny biaTEM, biaSHV a bJaOXA, kódující produkci ESBL, byly prokazovány pomocí PCR. Molekulárně-biologická charakteristika ESBL-pozitivních kmenů byla provedena izolací genomové DNA, naštěpením restriktázou Xbal a rozdělením pomocí PFGE. Získané restrikční mapy jednotlivých izolátů byly porovnány pomocí programu GelCompar II, poté byla stanovena jejich příbuznost. Výsledky. Ve sledovaném období bylo izolováno 913 kmenů KlebsieJIa pneumoniae, které vyvolaly klinicky prokazatelné onemocnění, přičemž u 234 (25,6 %) byla prokázána produkce ESBL. Prevalence ESBL-pozitivních kmenů činila na jednotkách intenzivní péče 38,5 %, na standardních odděleních pak 15,8 %. Účinnost na více jak 50 % ESBL-pozitivních izolátů byla prokázána pouze u meropenemu (98 %), cefoperazon/sulbactamu (61 %) a amikacinu (54 %). Naopak ESBL-negativní kmeny vykazovaly dobrou citlivost na všechna testovaná antibiotika (76-99 %). Molekulárně-biologická analýza prokázala výskyt 18 klonálních typů obsahujících 2-6 identických kmenů. 17 klonů obsahovalo izobáty vždy z jedné nemocnice, pouze v 1 klonu byly identifikovány kmeny ze dvou nemocnic. Závér. Na základě uvedených výsledků lze konstatovat, že výskyt ESBL-pozitivních kmenů Klebsiella pneumoniae je v České republice relativně vysoký, především na jednotkách intenzivní péče. Lze demonstrovat extenzivní šíření „epidemických klonů“ v rámci českých nemocnic a v omezeném rozsahu i mezi nimi.
- 520 9_
- $a Background: One of the problems of contemporary medicine is an increasing number of bacterial strains with hazardous phenotypes of resistance. The feared bacterial pathogens include KJebsieiia pneumoniae strains producing AmpA extended-spectrum beta-lactamases. The study focused on the molecular biological characteristics of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae collected in the Czech Republic. Materials and Methods: Clinical material from patients hospitalized in 16 Czech hospitals in September and October 2004 was used to isolate and determine KJebsieIJa pneumoniae strains by standard identification procedures. Their susceptibility to antibiotics was tested using a dilution micromethod. A Double-Disk Synergy Test was used for phenotype determination of ESBL production. The biaTEM, biaSHV and bJaOXA genes coding ESBL production were demonstrated by PCK Molecular biological characteristics of ESBL-positive strains utilized the genomic DNA isolation, Xbal restrictase digestion and PFGE differentiation. The acquired restriction maps of individual isolates were compared using GelCompar II software and their relationship was determined. Results: During the monitored period, 913 Klebsiella pneumoniae strains causing clinically detectable diseases were isolated. Of these, 234 (25.6 %) were determined as ESBL-positive strains. The prevalence of ESBL-positive strains was 38.5 % in ICUs and 15.8 % in standard wards. More than 50 % of ESBL-positive isolates were effectively treated only with meropenem (98 %), cefoperazone/sulbactam (61 %) and amikacin (54 %). Conversely, ESBL-negative strains showed high susceptibility to all tested antibiotics (76-99 %). The molecular biological analysis identified 18 clonal types containing 2-6 identical strains. 17 clones usually contained isolates from one hospital and only in one clone strains from two hospitals were identified. Conclusion: Based on the above mentioned results, the prevalence of ESBL-positive strains of Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic can be perceived as relatively high, especially in the ICUs. An extensive spread of „epidemic clones" within Czech hospitals and, to a limited extent, between them can be demonstrated.
- 650 _2
- $a Klebsiella pneumoniae $x izolace a purifikace $x klasifikace $x patogenita $7 D007711
- 650 _2
- $a prevalence $7 D015995
- 650 _2
- $a diagnostické techniky molekulární $x metody $7 D025202
- 650 _2
- $a bakteriální léková rezistence $7 D024881
- 650 _2
- $a fenotyp $7 D010641
- 650 _2
- $a polymerázová řetězová reakce $7 D016133
- 650 _2
- $a antibakteriální látky $x farmakologie $x terapeutické užití $7 D000900
- 650 _2
- $a finanční podpora výzkumu jako téma $7 D012109
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a techniky in vitro $7 D066298
- 651 _2
- $a Česká republika $7 D018153
- 700 1_
- $a Látal, Tomáš $4 aut $7 xx0062308
- 700 1_
- $a Bartoníková, N. $4 aut
- 700 1_
- $a Chmelařová, E. $4 aut
- 700 1_
- $a Sauer, Pavel $4 aut $7 xx0078987
- 700 1_
- $a Kesselová, M. $4 aut
- 700 1_
- $a Čermák, P. $4 aut
- 773 0_
- $w MED00011029 $t Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $g Roč. 11, č. 3 (2005), s. 92-99 $x 1211-264X
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1913 $c 339 b $y 0 $z 0
- 913 __
- $a CZ $b 1A/8258 Česko. Ministerstvo zdravotnictví. Interní grantová agentura
- 990 __
- $a 20051213 $b ABA008
- 991 __
- $a 20180326102206 $b ABA008
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2005 $b Roč. 11 $c č. 3 $d s. 92-99 $i 1211-264X $m Klinická mikrobiologie a infekční lékařství $x MED00011029
- GRA __
- $a 1A8258 $p MZ0
- LZP __
- $b přidání abstraktu