Detail
Článek
Článek online
FT
Medvik - BMČ
  • Je něco špatně v tomto záznamu ?

Génový polymorfizmus NOD2/CARD15 významne vplýva na skorší vznik Crohnovej choroby v populácii slovenských pacientov
[NOD2/CARD15 gene polymorphimsms are significantly associated with the early- onset Crohn's disesase in Slovak patients population]

Marian Bátovský, Barbora Desatová, Igor Páv, Táňa Novotná, Peter Celec, Gabriel Minárik, Denisa Baláková, Tomáš Szemes, Ladislava Bartošová, Zuzana Zelinková

Jazyk slovenština Země Česko

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc09003247

Grantová podpora
NR9342 MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

Úvod: Vplyv genetických faktorov na etiológiu nešpecifických črevných zápalov (IBD) je významnejší pri Crohnovej chorobe (CD) ako pri ulceróznej kolitíde (UC). Klinickí gastroenterológovia sa zamerali najmä na nosičstvo polymorfizmu génu NOD2/CARD15 a jeho fenotypovú manifestáciu vzhľadom na vek vzniku ochorenia, jeho lokalizáciu a priebeh. Ciele práce: 1. Zistiť prevalenciu polymorfizmov génu NOD2/CARD15 v súbore pacientov s CD a s UC v porovnaní s kontrolnou skupinou, 2. Potvrdiť vzťah medzi nosičstvom génového polymorfizmu NOD2/CARD15 a a) predpokladaným vznikom ochorenia v nižšom veku, b) so suponovanou častejšou lokalizáciou v terminálnom ileu ako aj c) s predominantne strikturizujúcou formou ochorenia. Materiál a metódy: Vyšetrovaný súbor tvorilo 52 pacientov s CD, 41 pacientov s UC a 22 kontrolných jedincov bez IBD. Jednotlivé nukleotidové polymorfizmy génu NOD2/CARD15 spojené s CD (R703W, G9O8R a 1007fs) boli zisťované metódou polymerázovej reťazovej reakcie s následným štiepením špecifickými reštrikčnými endonukleázami. Po stanovení alelovej frekvencie týchto polymorfizmov bola špecifikovaná genotypovo-fenotypová korelácia. Rozdiely vo výskyte alelových frekvencií medzi IBD pacientmi a kontrolami ako aj fenotypové rozdiely boli štatisticky analyzované pomocou ANOVA testu. Výsledky: Alelová frekvencia sledovaných génových polymorfizmov NOD2/CARD15 bola signifikantne vyššia v súbore CD pacientov (30/52) než u UC pacientov (8/41, p = 0,007) ako aj v porovnaní s kontrolnou skupinou (3/22, p = 0,003), čo platilo najmä pre polymorfizmus génu 1007fs (p = 0,004, resp. p = 0,023) a pre homozygótov (p = 0,072, p = 0,014). Analýza genotypovo-fenotypových korelácii dokázala, že polymorfizmus génu NOD2/ CARD15 bol štatisticky významne spojený s nižším vekom pri vzniku CD (do 16 rokov, p = 0,001), Asociácie s lokalizáciou v terminálnom ileu a so strikturizujúcou formou CD neboli potvrdené (p = 0,189 a p = 0,270). Záver: V predkladanej štúdii sme potvrdili na Slovensku doteraz nezisťovanú asociáciu variant génu NOD2/CARD15 s CD, ktorá sa fenotypovo manifestuje nižším vekom pri vzniku tohto ochorenia.

Introduction: Influence of genetic factors in the aethiology of inflammatory bowel disease (IBD) is more important in Crohn's disease (CD) than in ulcerative colitis (UC). Clinical gastroenterologists have focused on the consequences of being a NOD2/CARD15 gene polymorphism carrier with respect to onset, localisation and behaviour of CD. The aims of the study: 1. To investigate the prevalence of polymorphisms in NOD2/CARD15 gene in Slovak patients with CD and with UC in comparison with healthy controls, 2. confirm the link between NOD2/CARD15 gene mutations and a) the supposedly lower age at disease onset, b) localisation in terminal ileum, c) the predominatly stricturizing form of CD. Set of patients and methods: In total 93 IBD patients (52 CD and 41 UC) and 22 controls without IBD were genotyped. The single nucleotide polymorphisms (SNP) NOD2/CARD15 gene associated with CD (R702W, G908R and 1007fs) were assessed using the restriction fragments lenght polymorphisms polymerase chain reaction in IBD patients and in healthy controls. The allele frequency of these polymorphisms was determined and genotype-phenotype correlation was specified. The difference in allele frequencies between IBD patients and the controls as well as differences between phenotypes were analysed statistically using ANOVA test. Results: The allele frequencies of studied NOD2/ CARD15 SNP were significantly higher in CD (30/52) compared with UC patients (8/41, p = 0.007) and with healthy controls (3/22, p = 0.003). This applied for the frequency of 1007fs polymorphism in particular (p = 0.004 and p = 0.023 respectively for UC and healthy controls), especially for homozygotes (p = 0.072, p = 0.014). In the analysis of genotype-phenotype correlations, NOD2/CARD15 gene polymorphisms were significantly associated with early-onset CD (under 16 years, p = 0.001). The association with terminal ileum localisation and stricturizing form of disease was not found (p = 0.1989 and 0.270 irresp.). Conclusion: In the present study, we confirmed the association of NOD2/CARD15 variants with CD in a population not studied so far. In addition, this association is characterized by a gene dose effect and the studied NOD2/CARD15 variants are related to early-onset disease.

NOD2/CARD15 gene polymorphimsms are significantly associated with the early- onset Crohn's disesase in Slovak patients population

Bibliografie atd.

Lit.: 26

000      
00000naa 2200000 a 4500
001      
bmc09003247
003      
CZ-PrNML
005      
20140721132344.0
008      
091118s2009 xr e slo||
009      
AR
040    __
$a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a slo $b eng
044    __
$a xr
100    1_
$a Bátovský, Marián, $d 1951- $7 jo2007286430
245    10
$a Génový polymorfizmus NOD2/CARD15 významne vplýva na skorší vznik Crohnovej choroby v populácii slovenských pacientov / $c Marian Bátovský, Barbora Desatová, Igor Páv, Táňa Novotná, Peter Celec, Gabriel Minárik, Denisa Baláková, Tomáš Szemes, Ladislava Bartošová, Zuzana Zelinková
246    11
$a NOD2/CARD15 gene polymorphimsms are significantly associated with the early- onset Crohn's disesase in Slovak patients population
314    __
$a Gastroenterologická klinika SZU a FNsP, Bratislava
504    __
$a Lit.: 26
520    3_
$a Úvod: Vplyv genetických faktorov na etiológiu nešpecifických črevných zápalov (IBD) je významnejší pri Crohnovej chorobe (CD) ako pri ulceróznej kolitíde (UC). Klinickí gastroenterológovia sa zamerali najmä na nosičstvo polymorfizmu génu NOD2/CARD15 a jeho fenotypovú manifestáciu vzhľadom na vek vzniku ochorenia, jeho lokalizáciu a priebeh. Ciele práce: 1. Zistiť prevalenciu polymorfizmov génu NOD2/CARD15 v súbore pacientov s CD a s UC v porovnaní s kontrolnou skupinou, 2. Potvrdiť vzťah medzi nosičstvom génového polymorfizmu NOD2/CARD15 a a) predpokladaným vznikom ochorenia v nižšom veku, b) so suponovanou častejšou lokalizáciou v terminálnom ileu ako aj c) s predominantne strikturizujúcou formou ochorenia. Materiál a metódy: Vyšetrovaný súbor tvorilo 52 pacientov s CD, 41 pacientov s UC a 22 kontrolných jedincov bez IBD. Jednotlivé nukleotidové polymorfizmy génu NOD2/CARD15 spojené s CD (R703W, G9O8R a 1007fs) boli zisťované metódou polymerázovej reťazovej reakcie s následným štiepením špecifickými reštrikčnými endonukleázami. Po stanovení alelovej frekvencie týchto polymorfizmov bola špecifikovaná genotypovo-fenotypová korelácia. Rozdiely vo výskyte alelových frekvencií medzi IBD pacientmi a kontrolami ako aj fenotypové rozdiely boli štatisticky analyzované pomocou ANOVA testu. Výsledky: Alelová frekvencia sledovaných génových polymorfizmov NOD2/CARD15 bola signifikantne vyššia v súbore CD pacientov (30/52) než u UC pacientov (8/41, p = 0,007) ako aj v porovnaní s kontrolnou skupinou (3/22, p = 0,003), čo platilo najmä pre polymorfizmus génu 1007fs (p = 0,004, resp. p = 0,023) a pre homozygótov (p = 0,072, p = 0,014). Analýza genotypovo-fenotypových korelácii dokázala, že polymorfizmus génu NOD2/ CARD15 bol štatisticky významne spojený s nižším vekom pri vzniku CD (do 16 rokov, p = 0,001), Asociácie s lokalizáciou v terminálnom ileu a so strikturizujúcou formou CD neboli potvrdené (p = 0,189 a p = 0,270). Záver: V predkladanej štúdii sme potvrdili na Slovensku doteraz nezisťovanú asociáciu variant génu NOD2/CARD15 s CD, ktorá sa fenotypovo manifestuje nižším vekom pri vzniku tohto ochorenia.
520    9_
$a Introduction: Influence of genetic factors in the aethiology of inflammatory bowel disease (IBD) is more important in Crohn's disease (CD) than in ulcerative colitis (UC). Clinical gastroenterologists have focused on the consequences of being a NOD2/CARD15 gene polymorphism carrier with respect to onset, localisation and behaviour of CD. The aims of the study: 1. To investigate the prevalence of polymorphisms in NOD2/CARD15 gene in Slovak patients with CD and with UC in comparison with healthy controls, 2. confirm the link between NOD2/CARD15 gene mutations and a) the supposedly lower age at disease onset, b) localisation in terminal ileum, c) the predominatly stricturizing form of CD. Set of patients and methods: In total 93 IBD patients (52 CD and 41 UC) and 22 controls without IBD were genotyped. The single nucleotide polymorphisms (SNP) NOD2/CARD15 gene associated with CD (R702W, G908R and 1007fs) were assessed using the restriction fragments lenght polymorphisms polymerase chain reaction in IBD patients and in healthy controls. The allele frequency of these polymorphisms was determined and genotype-phenotype correlation was specified. The difference in allele frequencies between IBD patients and the controls as well as differences between phenotypes were analysed statistically using ANOVA test. Results: The allele frequencies of studied NOD2/ CARD15 SNP were significantly higher in CD (30/52) compared with UC patients (8/41, p = 0.007) and with healthy controls (3/22, p = 0.003). This applied for the frequency of 1007fs polymorphism in particular (p = 0.004 and p = 0.023 respectively for UC and healthy controls), especially for homozygotes (p = 0.072, p = 0.014). In the analysis of genotype-phenotype correlations, NOD2/CARD15 gene polymorphisms were significantly associated with early-onset CD (under 16 years, p = 0.001). The association with terminal ileum localisation and stricturizing form of disease was not found (p = 0.1989 and 0.270 irresp.). Conclusion: In the present study, we confirmed the association of NOD2/CARD15 variants with CD in a population not studied so far. In addition, this association is characterized by a gene dose effect and the studied NOD2/CARD15 variants are related to early-onset disease.
650    _2
$a polymorfismus genetický $x genetika $x imunologie $7 D011110
650    _2
$a signální adaptorový protein Nod2 $x genetika $x imunologie $7 D053473
650    _2
$a Crohnova nemoc $x diagnóza $x etiologie $x genetika $7 D003424
650    _2
$a ulcerózní kolitida $x diagnóza $x etiologie $x genetika $7 D003093
650    _2
$a věkové faktory $7 D000367
650    _2
$a studie případů a kontrol $7 D016022
650    _2
$a statistika jako téma $7 D013223
650    _2
$a financování organizované $7 D005381
650    _2
$a lidé $7 D006801
651    _2
$a Slovenská republika $7 D018154
700    1_
$a Desatová, Barbora. $7 _BN001587
700    1_
$a Páv, Igor. $7 xx0201239
700    1_
$a Novotná, Tatiana. $7 _AN035968
700    1_
$a Celec, Peter $7 xx0073731
700    1_
$a Minárik, G. $7 _AN036756
700    1_
$a Baláková, Denisa. $7 _AN040527
700    1_
$a Szemes, Tomáš $7 xx0145944
700    1_
$a Bartošová, Ladislava $7 ola2006340376
700    0_
$a Zelinková, Zuzana. $7 xx0190555
773    0_
$w MED00012036 $t Česká a slovenská gastroenterologie a hepatologie $g Roč. 63, č. 5 (2009), s. 208-215 $x 1213-323X
856    41
$u https://www.csgh.info/cs/clanek/genovy-polymorfizmus-nod2-card15-vyznamne-vplyva-na-skorsi-vznik-crohnovej-choroby-v-populacii-slovenskych-pacientov-406 $y plný text volně přístupný
910    __
$a ABA008 $b B 222 $c 979 $y 8 $z 0
990    __
$a 20091118062412 $b ABA008
991    __
$a 20140721132651 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 692415 $s 554327
BAS    __
$a 3
BMC    __
$a 2009 $b 63 $c 5 $d 208-215 $i 1213-323X $m Česká a slovenská gastroenterologie a hepatologie $x MED00012036
GRA    __
$a NR9342 $p MZ0
LZP    __
$a 2009-54/ipal

Najít záznam

Citační ukazatele

Nahrávání dat ...

Možnosti archivace

Nahrávání dat ...