-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Génový polymorfizmus NOD2/CARD15 významne vplýva na skorší vznik Crohnovej choroby v populácii slovenských pacientov
[NOD2/CARD15 gene polymorphimsms are significantly associated with the early- onset Crohn's disesase in Slovak patients population]
Marian Bátovský, Barbora Desatová, Igor Páv, Táňa Novotná, Peter Celec, Gabriel Minárik, Denisa Baláková, Tomáš Szemes, Ladislava Bartošová, Zuzana Zelinková
Jazyk slovenština Země Česko
Grantová podpora
NR9342
MZ0
CEP - Centrální evidence projektů
Digitální knihovna NLK
Plný text - Článek
Zdroj
Zdroj
Zdroj
- MeSH
- Crohnova nemoc diagnóza etiologie genetika MeSH
- financování organizované MeSH
- lidé MeSH
- polymorfismus genetický genetika imunologie MeSH
- signální adaptorový protein Nod2 genetika imunologie MeSH
- statistika jako téma MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- ulcerózní kolitida diagnóza etiologie genetika MeSH
- věkové faktory MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Slovenská republika MeSH
Úvod: Vplyv genetických faktorov na etiológiu nešpecifických črevných zápalov (IBD) je významnejší pri Crohnovej chorobe (CD) ako pri ulceróznej kolitíde (UC). Klinickí gastroenterológovia sa zamerali najmä na nosičstvo polymorfizmu génu NOD2/CARD15 a jeho fenotypovú manifestáciu vzhľadom na vek vzniku ochorenia, jeho lokalizáciu a priebeh. Ciele práce: 1. Zistiť prevalenciu polymorfizmov génu NOD2/CARD15 v súbore pacientov s CD a s UC v porovnaní s kontrolnou skupinou, 2. Potvrdiť vzťah medzi nosičstvom génového polymorfizmu NOD2/CARD15 a a) predpokladaným vznikom ochorenia v nižšom veku, b) so suponovanou častejšou lokalizáciou v terminálnom ileu ako aj c) s predominantne strikturizujúcou formou ochorenia. Materiál a metódy: Vyšetrovaný súbor tvorilo 52 pacientov s CD, 41 pacientov s UC a 22 kontrolných jedincov bez IBD. Jednotlivé nukleotidové polymorfizmy génu NOD2/CARD15 spojené s CD (R703W, G9O8R a 1007fs) boli zisťované metódou polymerázovej reťazovej reakcie s následným štiepením špecifickými reštrikčnými endonukleázami. Po stanovení alelovej frekvencie týchto polymorfizmov bola špecifikovaná genotypovo-fenotypová korelácia. Rozdiely vo výskyte alelových frekvencií medzi IBD pacientmi a kontrolami ako aj fenotypové rozdiely boli štatisticky analyzované pomocou ANOVA testu. Výsledky: Alelová frekvencia sledovaných génových polymorfizmov NOD2/CARD15 bola signifikantne vyššia v súbore CD pacientov (30/52) než u UC pacientov (8/41, p = 0,007) ako aj v porovnaní s kontrolnou skupinou (3/22, p = 0,003), čo platilo najmä pre polymorfizmus génu 1007fs (p = 0,004, resp. p = 0,023) a pre homozygótov (p = 0,072, p = 0,014). Analýza genotypovo-fenotypových korelácii dokázala, že polymorfizmus génu NOD2/ CARD15 bol štatisticky významne spojený s nižším vekom pri vzniku CD (do 16 rokov, p = 0,001), Asociácie s lokalizáciou v terminálnom ileu a so strikturizujúcou formou CD neboli potvrdené (p = 0,189 a p = 0,270). Záver: V predkladanej štúdii sme potvrdili na Slovensku doteraz nezisťovanú asociáciu variant génu NOD2/CARD15 s CD, ktorá sa fenotypovo manifestuje nižším vekom pri vzniku tohto ochorenia.
Introduction: Influence of genetic factors in the aethiology of inflammatory bowel disease (IBD) is more important in Crohn's disease (CD) than in ulcerative colitis (UC). Clinical gastroenterologists have focused on the consequences of being a NOD2/CARD15 gene polymorphism carrier with respect to onset, localisation and behaviour of CD. The aims of the study: 1. To investigate the prevalence of polymorphisms in NOD2/CARD15 gene in Slovak patients with CD and with UC in comparison with healthy controls, 2. confirm the link between NOD2/CARD15 gene mutations and a) the supposedly lower age at disease onset, b) localisation in terminal ileum, c) the predominatly stricturizing form of CD. Set of patients and methods: In total 93 IBD patients (52 CD and 41 UC) and 22 controls without IBD were genotyped. The single nucleotide polymorphisms (SNP) NOD2/CARD15 gene associated with CD (R702W, G908R and 1007fs) were assessed using the restriction fragments lenght polymorphisms polymerase chain reaction in IBD patients and in healthy controls. The allele frequency of these polymorphisms was determined and genotype-phenotype correlation was specified. The difference in allele frequencies between IBD patients and the controls as well as differences between phenotypes were analysed statistically using ANOVA test. Results: The allele frequencies of studied NOD2/ CARD15 SNP were significantly higher in CD (30/52) compared with UC patients (8/41, p = 0.007) and with healthy controls (3/22, p = 0.003). This applied for the frequency of 1007fs polymorphism in particular (p = 0.004 and p = 0.023 respectively for UC and healthy controls), especially for homozygotes (p = 0.072, p = 0.014). In the analysis of genotype-phenotype correlations, NOD2/CARD15 gene polymorphisms were significantly associated with early-onset CD (under 16 years, p = 0.001). The association with terminal ileum localisation and stricturizing form of disease was not found (p = 0.1989 and 0.270 irresp.). Conclusion: In the present study, we confirmed the association of NOD2/CARD15 variants with CD in a population not studied so far. In addition, this association is characterized by a gene dose effect and the studied NOD2/CARD15 variants are related to early-onset disease.
NOD2/CARD15 gene polymorphimsms are significantly associated with the early- onset Crohn's disesase in Slovak patients population
Lit.: 26
- 000
- 00000naa 2200000 a 4500
- 001
- bmc09003247
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20140721132344.0
- 008
- 091118s2009 xr e slo||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a slo $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Bátovský, Marián, $d 1951- $7 jo2007286430
- 245 10
- $a Génový polymorfizmus NOD2/CARD15 významne vplýva na skorší vznik Crohnovej choroby v populácii slovenských pacientov / $c Marian Bátovský, Barbora Desatová, Igor Páv, Táňa Novotná, Peter Celec, Gabriel Minárik, Denisa Baláková, Tomáš Szemes, Ladislava Bartošová, Zuzana Zelinková
- 246 11
- $a NOD2/CARD15 gene polymorphimsms are significantly associated with the early- onset Crohn's disesase in Slovak patients population
- 314 __
- $a Gastroenterologická klinika SZU a FNsP, Bratislava
- 504 __
- $a Lit.: 26
- 520 3_
- $a Úvod: Vplyv genetických faktorov na etiológiu nešpecifických črevných zápalov (IBD) je významnejší pri Crohnovej chorobe (CD) ako pri ulceróznej kolitíde (UC). Klinickí gastroenterológovia sa zamerali najmä na nosičstvo polymorfizmu génu NOD2/CARD15 a jeho fenotypovú manifestáciu vzhľadom na vek vzniku ochorenia, jeho lokalizáciu a priebeh. Ciele práce: 1. Zistiť prevalenciu polymorfizmov génu NOD2/CARD15 v súbore pacientov s CD a s UC v porovnaní s kontrolnou skupinou, 2. Potvrdiť vzťah medzi nosičstvom génového polymorfizmu NOD2/CARD15 a a) predpokladaným vznikom ochorenia v nižšom veku, b) so suponovanou častejšou lokalizáciou v terminálnom ileu ako aj c) s predominantne strikturizujúcou formou ochorenia. Materiál a metódy: Vyšetrovaný súbor tvorilo 52 pacientov s CD, 41 pacientov s UC a 22 kontrolných jedincov bez IBD. Jednotlivé nukleotidové polymorfizmy génu NOD2/CARD15 spojené s CD (R703W, G9O8R a 1007fs) boli zisťované metódou polymerázovej reťazovej reakcie s následným štiepením špecifickými reštrikčnými endonukleázami. Po stanovení alelovej frekvencie týchto polymorfizmov bola špecifikovaná genotypovo-fenotypová korelácia. Rozdiely vo výskyte alelových frekvencií medzi IBD pacientmi a kontrolami ako aj fenotypové rozdiely boli štatisticky analyzované pomocou ANOVA testu. Výsledky: Alelová frekvencia sledovaných génových polymorfizmov NOD2/CARD15 bola signifikantne vyššia v súbore CD pacientov (30/52) než u UC pacientov (8/41, p = 0,007) ako aj v porovnaní s kontrolnou skupinou (3/22, p = 0,003), čo platilo najmä pre polymorfizmus génu 1007fs (p = 0,004, resp. p = 0,023) a pre homozygótov (p = 0,072, p = 0,014). Analýza genotypovo-fenotypových korelácii dokázala, že polymorfizmus génu NOD2/ CARD15 bol štatisticky významne spojený s nižším vekom pri vzniku CD (do 16 rokov, p = 0,001), Asociácie s lokalizáciou v terminálnom ileu a so strikturizujúcou formou CD neboli potvrdené (p = 0,189 a p = 0,270). Záver: V predkladanej štúdii sme potvrdili na Slovensku doteraz nezisťovanú asociáciu variant génu NOD2/CARD15 s CD, ktorá sa fenotypovo manifestuje nižším vekom pri vzniku tohto ochorenia.
- 520 9_
- $a Introduction: Influence of genetic factors in the aethiology of inflammatory bowel disease (IBD) is more important in Crohn's disease (CD) than in ulcerative colitis (UC). Clinical gastroenterologists have focused on the consequences of being a NOD2/CARD15 gene polymorphism carrier with respect to onset, localisation and behaviour of CD. The aims of the study: 1. To investigate the prevalence of polymorphisms in NOD2/CARD15 gene in Slovak patients with CD and with UC in comparison with healthy controls, 2. confirm the link between NOD2/CARD15 gene mutations and a) the supposedly lower age at disease onset, b) localisation in terminal ileum, c) the predominatly stricturizing form of CD. Set of patients and methods: In total 93 IBD patients (52 CD and 41 UC) and 22 controls without IBD were genotyped. The single nucleotide polymorphisms (SNP) NOD2/CARD15 gene associated with CD (R702W, G908R and 1007fs) were assessed using the restriction fragments lenght polymorphisms polymerase chain reaction in IBD patients and in healthy controls. The allele frequency of these polymorphisms was determined and genotype-phenotype correlation was specified. The difference in allele frequencies between IBD patients and the controls as well as differences between phenotypes were analysed statistically using ANOVA test. Results: The allele frequencies of studied NOD2/ CARD15 SNP were significantly higher in CD (30/52) compared with UC patients (8/41, p = 0.007) and with healthy controls (3/22, p = 0.003). This applied for the frequency of 1007fs polymorphism in particular (p = 0.004 and p = 0.023 respectively for UC and healthy controls), especially for homozygotes (p = 0.072, p = 0.014). In the analysis of genotype-phenotype correlations, NOD2/CARD15 gene polymorphisms were significantly associated with early-onset CD (under 16 years, p = 0.001). The association with terminal ileum localisation and stricturizing form of disease was not found (p = 0.1989 and 0.270 irresp.). Conclusion: In the present study, we confirmed the association of NOD2/CARD15 variants with CD in a population not studied so far. In addition, this association is characterized by a gene dose effect and the studied NOD2/CARD15 variants are related to early-onset disease.
- 650 _2
- $a polymorfismus genetický $x genetika $x imunologie $7 D011110
- 650 _2
- $a signální adaptorový protein Nod2 $x genetika $x imunologie $7 D053473
- 650 _2
- $a Crohnova nemoc $x diagnóza $x etiologie $x genetika $7 D003424
- 650 _2
- $a ulcerózní kolitida $x diagnóza $x etiologie $x genetika $7 D003093
- 650 _2
- $a věkové faktory $7 D000367
- 650 _2
- $a studie případů a kontrol $7 D016022
- 650 _2
- $a statistika jako téma $7 D013223
- 650 _2
- $a financování organizované $7 D005381
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 651 _2
- $a Slovenská republika $7 D018154
- 700 1_
- $a Desatová, Barbora. $7 _BN001587
- 700 1_
- $a Páv, Igor. $7 xx0201239
- 700 1_
- $a Novotná, Tatiana. $7 _AN035968
- 700 1_
- $a Celec, Peter $7 xx0073731
- 700 1_
- $a Minárik, G. $7 _AN036756
- 700 1_
- $a Baláková, Denisa. $7 _AN040527
- 700 1_
- $a Szemes, Tomáš $7 xx0145944
- 700 1_
- $a Bartošová, Ladislava $7 ola2006340376
- 700 0_
- $a Zelinková, Zuzana. $7 xx0190555
- 773 0_
- $w MED00012036 $t Česká a slovenská gastroenterologie a hepatologie $g Roč. 63, č. 5 (2009), s. 208-215 $x 1213-323X
- 856 41
- $u https://www.csgh.info/cs/clanek/genovy-polymorfizmus-nod2-card15-vyznamne-vplyva-na-skorsi-vznik-crohnovej-choroby-v-populacii-slovenskych-pacientov-406 $y plný text volně přístupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 222 $c 979 $y 8 $z 0
- 990 __
- $a 20091118062412 $b ABA008
- 991 __
- $a 20140721132651 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 692415 $s 554327
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2009 $b 63 $c 5 $d 208-215 $i 1213-323X $m Česká a slovenská gastroenterologie a hepatologie $x MED00012036
- GRA __
- $a NR9342 $p MZ0
- LZP __
- $a 2009-54/ipal