Distinctive archaebacterial species associated with anaerobic rumen protozoan Entodinium caudatum
Jazyk angličtina Země Spojené státy americké Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- MeSH
- anaerobióza MeSH
- Archaea klasifikace genetika růst a vývoj izolace a purifikace MeSH
- bachor mikrobiologie parazitologie MeSH
- Ciliophora genetika růst a vývoj izolace a purifikace MeSH
- DNA archebakterií analýza izolace a purifikace MeSH
- druhová specificita MeSH
- fylogeneze MeSH
- kultivační média MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- ovce MeSH
- protozoální DNA analýza izolace a purifikace MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- symbióza MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- DNA archebakterií MeSH
- kultivační média MeSH
- protozoální DNA MeSH
- RNA ribozomální 16S MeSH
The diversity of archaebacteria associated with anaerobic rumen protozoan Entodinium caudatum in long term in vitro culture was investigated by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis of hypervariable V3 region of archaebacterial 16S rRNA gene. PCR was accomplished directly from DNA extracted from a single protozoal cell and from total community genomic DNA and the obtained fingerprints were compared. The analysis indicated the presence of a solitary intensive band present in Entodinium caudatum single cell DNA, which had no counterparts in the profile from total DNA. The identity of archaebacterium represented by this band was determined by sequence analysis which showed that the sequence fell to the cluster of ciliate symbiotic methanogens identified recently by 16S gene library approach.
Zobrazit více v PubMed
FEMS Microbiol Lett. 1994 Apr 1;117(2):157-61 PubMed
Lett Appl Microbiol. 2004;39(2):144-7 PubMed
Folia Microbiol (Praha). 2006;51(4):313-6 PubMed
Br J Nutr. 1965;19(4):511-22 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1980 Sep;40(3):608-12 PubMed
Appl Environ Microbiol. 1993 Mar;59(3):695-700 PubMed
FEMS Microbiol Lett. 2004 Sep 15;238(2):307-13 PubMed
Curr Microbiol. 2000 May;40(5):327-32 PubMed
Trends Genet. 1995 Jun;11(6):217-8 PubMed
Folia Microbiol (Praha). 2000;45(3):269-74 PubMed
Mol Biol Evol. 2000 Feb;17(2):251-8 PubMed
GENBANK
EF657886
