V článku je uvedena aplikace simulačních modelů vytvořených v prostředí MATLAB SIMULINK ve výuce biosystémů. Modely jsou rozděleny do dvou skupin - fyziologických a socioekonomických systémů, zpracovaných v rámci diplomových prací na katedře kybernetiky, fakulty elektrotechnické, ČVUT v Praze. Práce s těmito modely je ilustrována na několika příkladech řešených úloh vytvořených pro laboratorní cvičení. Následně jsou popsány perspektivní metody inicializace a zobrazování simulačních prúběhů uvedených modelů prostřednictvim INTERNETU. Tento výzkum je podporován výzkumným záměrem J04/98:21 0000012 - Transdisciplinárni výzkum v oblasti biomedicínského inženýrství.