Cíl práce: Cílem studie bylo zjistit prevalenci Candida pelliculosa, Candida utilis a Candida fabianii v klinickém materiálu získaném od pacientů Fakultní nemocnice Olomouc a porovnat minimální inhibiční koncentrace (MIC) devíti systémových antimykotik s ohledem na druh kvasinky, pohlaví a věk pacientů a typ klinického materiálu, ze kterého byly kandidy vykultivovány. Materiál a metody: Identifikace byla provedena biochemicky a pomocí hmotnostní spektrometrie (MALDI-TOF MS). MIC byly stanoveny mikrodiluční metodou. Výsledky: Z celkového počtu 163 klinických izolátů bylo 119 biochemicky určeno jako C. pelliculosa a 44 jako C. utilis. S využitím MALDI-TOF MS bylo 152 kvasinek identifikováno jako C. fabianii, 6 jako C. pelliculosa, 3 jako C. utilis a 1 jako Ogataea polymorpha. Nejvyšší průměrné hodnoty MIC byly nalezeny u C. fabianii a obecně u izolátů z hemokultur a centrálních venózních katétrů. Závěry: Pravděpodobnou příčinou nesouladu výsledků obou metod byla absence C. fabianii v druhové databázi biochemické soupravy. Byla zjištěna vyšší prevalence C. fabianii v klinickém materiálu v porovnání s ostatními dvěma druhy. Vyšší hodnoty MIC zaznamenané u C. fabianii demonstrují důležitost přesné identifikace tohoto druhu.
Background: The aims of this study were to determine the prevalence of C. pelliculosa, C. utilis, and C. fabianii in clinical samples collected from patients hospitalized in the Olomouc University Hospital and compare their minimum inhibitory concentrations (MICs ) to nine systemic antifungals with respect to yeast species, patient age, gender, and site of infection. Material and Methods: Identification was performed biochemically and using mass spectrometry (MALDI-TOF MS). MICs were determined by the broth dilution method. Results: Of a total of 163 clinical isolates, 119 were biochemically identified as C. pelliculosa and 44 as C. utilis. Using MALDI-TOF MS, 152 isolates were identified as C. fabianii, six as C. pelliculosa, three as C. utilis, and one as Ogataea polymorpha. The highest mean MICs were found in C. fabianii and in yeasts isolated from blood cultures and central venous catheters. Conclusions: The MALDI-TOF MS found C. fabianii to be most prevalent in clinical samples as compared with the other studied species. The probable cause of discordant results between the two methods was the absence of C. fabianii in the database of the biochemical test kit which led to misidentification of this species. Higher MIC values in C. fabianii demonstrate the importance of the precise identification of this species.
- Klíčová slova
- Candida utilis, Candida pelliculosa, Candida fabianii,
- MeSH
- antifungální látky MeSH
- Candida * izolace a purifikace klasifikace účinky léků MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kandidóza diagnóza epidemiologie farmakoterapie klasifikace MeSH
- kultivované buňky MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- předškolní dítě MeSH
- prevalence MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice * využití MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Clinical yeast isolates belonging to Candida pelliculosa, Candida utilis and Candida fabianii are difficult to distinguish in a routine mycology laboratory using common biochemical tests. The aims of this study were to determine the prevalence of C. pelliculosa, C. utilis and C. fabianii in clinical samples and to compare their minimum inhibitory concentrations (MICs) to systemic antifungals. Two hundred and forty-eight clinical yeast isolates obtained from eight large hospitals in the Czech Republic were included in this study. Identification was performed biochemically using ID 32C kit and by MALDI-TOF MS. MICs were determined using colorimetric broth dilution Sensititre YeastOne panels. From a total number of 248 isolates, 175 were identified as C. pelliculosa and 73 as C. utilis using the biochemical kit. In contrast, MALDI-TOF MS identified 222 isolates as C. fabianii, 20 as C. pelliculosa and 6 as C. utilis. The highest mean MICs were found in C. fabianii and, regardless of the studied species, in isolates from blood cultures and central venous catheters. MALDI-TOF MS revealed C. fabianii to be most prevalent in clinical samples as compared with the other studied species. Higher MIC values in C. fabianii support the importance of correct identification of this species.
- MeSH
- antifungální látky farmakologie MeSH
- Candida klasifikace izolace a purifikace MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kandidóza epidemiologie mikrobiologie MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mykologické určovací techniky MeSH
- nemocnice MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- prevalence MeSH
- prospektivní studie MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- kojenec MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika epidemiologie MeSH
Plasminogen activator ihnibitor (PAI 1) belongs to the plasminogen activator system, which is part of the metastatic cascade and significantly contributes to invasive growth and angiogenesis of malignant tumors. Its plasma level is normally low but 4G/4G homozygotes have higher concentrations of PAI 1. This genotype may be associated with worse prognosis and proximal location of colorectal cancer than 5G/5G homozygotes. In our prospective evaluation we examined plasma level PAI 1 (using photometric microplate method ELISA) pre-surgery and, subsequently, 6-8 weeks later, from 80 patients. For the PAI 1 rs1799889 -675 4G/5G polymorphism test the PCR amplification was used.Analysis of collected data was confirmed that significantly higher plasma levels of PAI 1 were found in patients before starting therapy, which decreased (p=0.004) after initiation of treatment. Patients with higher plasma level PAI 1 before (p=0.013) and after therapy (p=0.004) had significantly shorter survival. We found no relationship between polymorphisms of PAI 1 (-675 4G/5G) in relation to stage, survival or tumor location. PAI 1 is useful as a negative marker of prognosis and could be advantageous when planning adjuvant treatment of patients with colorectal carcinoma. Although opinions on the importance of polymorphisms of PAI 1 in relation to the prognosis are not uniform, it does seem that their role in the prognosis of patients with colorectal cancer is not essential.
