• MeSH
• antagonisté kyseliny listové chemie   farmakologie   MeSH
• dihydrofolátreduktasa chemie   MeSH
• kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• molekulární konformace MeSH
• molekulární modely * MeSH
• molekulární struktura MeSH
• objevování léků MeSH
• simulace molekulární dynamiky MeSH
• simulace molekulového dockingu MeSH
• vazba proteinů MeSH
• vodíková vazba MeSH
• Yersinia pestis účinky léků   enzymologie   MeSH
• Publikační typ
• dopisy MeSH

In the present work, we propose to design drugs that target the enzyme dihydrofolate redutase (DHFR) as a means of a novel drug therapy against plague. Potential inhibitors of DHFR from Yersinia pestis (YpDHFR) were selected by virtual screening and subjected to docking, molecular dynamics (MD) simulations, and Poisson-Boltzmann surface area method, in order to evaluate their interactions in the active sites of YpDHFR and human DHFR (HssDHFR). The results suggested selectivity for three compounds that were further used to propose the structures of six new potential selective inhibitors for YpDHFR.

• MeSH
• antagonisté kyseliny listové chemie   MeSH
• dihydrofolátreduktasa chemie   MeSH
• katalytická doména MeSH
• ligandy MeSH
• molekulární konformace MeSH
• racionální návrh léčiv * MeSH
• simulace molekulární dynamiky * MeSH
• simulace molekulového dockingu * MeSH
• vazba proteinů MeSH
• vazebná místa MeSH
• vodíková vazba MeSH
• Yersinia pestis enzymologie   MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

• MeSH
• Bacteria patogenita   MeSH
• bakteriální proteiny chemie   MeSH
• disulfidy chemie   metabolismus   MeSH
• Escherichia coli enzymologie   patogenita   MeSH
• financování organizované MeSH
• Francisella tularensis enzymologie   genetika   patogenita   MeSH
• isomerasy chemie   MeSH
• membránové proteiny chemie   MeSH
• molekulární modely MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• Neisseria meningitidis enzymologie   genetika   patogenita   MeSH
• oxidace-redukce MeSH
• proteindisulfidisomerasy chemie   MeSH
• proteiny z Escherichia coli chemie   MeSH
• proteiny chemie   MeSH
• sbalování proteinů MeSH
• stabilita proteinů MeSH
• virulence MeSH
• Yersinia pestis enzymologie   genetika   patogenita   MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH