Three series of N-(pyrazin-2-yl)benzamides were designed as retro-amide analogues of previously published N-phenylpyrazine-2-carboxamides with in vitro antimycobacterial activity. The synthesized retro-amides were evaluated for in vitro growth inhibiting activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv (Mtb), three non-tuberculous mycobacterial strains (M. avium, M. kansasii, M. smegmatis) and selected bacterial and fungal strains of clinical importance. Regarding activity against Mtb, most N-pyrazinylbenzamides (retro-amides) possessed lower or no activity compared to the corresponding N-phenylpyrazine-2-carboxamides with the same substitution pattern. However, the active retro-amides tended to have lower HepG2 cytotoxicity and better selectivity. Derivatives with 5-chloro substitution on the pyrazine ring were generally more active compared to their 6-cloro positional isomers or non-chlorinated analogues. The best antimycobacterial activity against Mtb was found in N-(5-chloropyrazin-2-yl)benzamides with short alkyl (2h: R2 = Me; 2i: R2 = Et) in position 4 of the benzene ring (MIC = 6.25 and 3.13 μg/mL, respectively, with SI > 10). N-(5-Chloropyrazin-2-ylbenzamides with hydroxy substitution (2b: R2 = 2-OH; 2d: R2 = 4-OH) on the benzene ring or their acetylated synthetic precursors possessed the broadest spectrum of activity, being active in all three groups of mycobacterial, bacterial and fungal strains. The substantial differences in in silico calculated properties (hydrogen-bond pattern analysis, molecular electrostatic potential, HOMO and LUMO) can justify the differences in biological activities between N-pyrazinylbenzamides and N-phenylpyrazine-2-carboxamides.

• MeSH
• antibakteriální látky chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• benzamidy chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• buněčné linie MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• molekulární modely MeSH
• molekulární struktura MeSH
• Mycobacterium tuberculosis účinky léků   MeSH
• racionální návrh léčiv * MeSH
• techniky syntetické chemie * MeSH
• viabilita buněk účinky léků   MeSH
• vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

We prepared a series of substituted N-(pyrazin-2-yl)benzenesulfonamides as an attempt to investigate the effect of different linkers connecting pyrazine to benzene cores on antimicrobial activity when compared to our previous compounds of amide or retro-amide linker type. Only two compounds, 4-amino-N-(pyrazin-2-yl)benzenesulfonamide (MIC = 6.25 μg/mL, 25 μM) and 4-amino-N-(6-chloropyrazin-2-yl)benzenesulfonamide (MIC = 6.25 μg/mL, 22 μM) exerted good antitubercular activity against M. tuberculosis H37Rv. However, they were excluded from the comparison as they-unlike the other compounds-possessed the pharmacophore for the inhibition of folate pathway, which was proven by docking studies. We performed target fishing, where we identified matrix metalloproteinase-8 as a promising target for our title compounds that is worth future exploration.

• MeSH
• antiinfekční látky chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• antituberkulotika chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• chemické jevy MeSH
• mikrobiální testy citlivosti MeSH
• molekulární modely MeSH
• molekulární struktura MeSH
• Mycobacterium tuberculosis účinky léků   MeSH
• sulfonamidy chemická syntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• techniky syntetické chemie MeSH
• vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Rostoucí počet organických sloučenin a mnoho jejich nových struktur vyvolává potřebu zjednodušovat a zobecňovat názvoslovná pravidla. Vzniklo názvosloví Mezinárodní unie pro čistou a užitou chemii, které nepreferuje jeden princip a připouští několik názvů pro stejnou strukturu. Výhodou tohoto názvosloví založeného na více principech je pružnost, avšak současně znesnadňuje orientaci.

• MeSH
• organická chemie klasifikace   MeSH
• terminologie jako téma MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• Konspekt
• Chemie. Mineralogické vědy
• NLK Obory
• chemie

Rostoucí počet organických sloučenin a mnoho jejich nových struktur vyvolává potřebu zjednodušovat a zobecňovat názvoslovná pravidla. Vzniklo názvosloví Mezinárodní unie pro čistou a užitou chemii, které nepreferuje jeden princip a připouští několik názvů pro stejnou strukturu. Výhodou tohoto názvosloví založeného na více principech je pružnost, avšak současně znesnadňuje orientaci.

• MeSH
• organická chemie klasifikace   MeSH
• terminologie jako téma MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• Konspekt
• Chemie. Mineralogické vědy
• NLK Obory
• chemie, klinická chemie

Rostoucí počet organických sloučenin a mnoho jejich nových struktur vyvolává potřebu zjednodušovat a zobecňovat názvoslovná pravidla. Vzniklo názvosloví Mezinárodní unie pro čistou a užitou chemii, které nepreferuje jeden princip a připouští několik názvů pro stejnou strukturu. Výhodou tohoto názvosloví založeného na více principech je pružnost, avšak současně znesnadňuje orientaci.

• MeSH
• organická chemie MeSH

• Konspekt
• Chemie. Mineralogické vědy
• NLK Obory
• chemie, klinická chemie