Investigating genetically-structured diversity in pathogen populations over time is important to better understand disease maintenance and spread. Herd-level surveillance of Mycobacterium bovis genotypes (multi-locus VNTR analysis types, MLVA types) from all culture-confirmed bovine tuberculosis (TB) herd cases was undertaken in Northern Ireland (NI), generating an unparalleled, longitudinal, population-level 14-year survey for this pathogen. Across this population, 295 genetically-distinct M. bovis MLVA types were identified in the 19,717 M. bovis isolates surveyed. Of these, the most frequent was MLVA type 002 (23.0%); 151 MLVA types were represented more than once, in groups ranging from 2 to 4438 isolates. Only 23 MLVA types were isolated in all 14 years. Investigating inter-annual frequency of M. bovis MLVA types, examples of statistically-significant expansions (MLVA types 002, 004, 006, 009 and 027), contractions (MLVA types 001, 007 and 011) and maintenance (MLVA types 003 and 005) were disclosed, during a period of fluctuating bovine TB herd-level incidence at the NI scale. The fixed period frequency distribution of MLVA types remained highly right-skewed. Novel VNTR copy number variant MLVA types (N = 242; an average of 17 per annum) were identified throughout the survey. The MLVA type distribution in the landscape was not random; MLVA types showed statistically-significant geographical localization and strong spatial associations with Divisional Veterinary Office (DVO) regions. There was also evidence of differential risk of particular MLVA types across breeds (Holstein/Friesian vs. other), age-class, and sex and some evidence of an association between the number of animals testing positive for bovine TB during the disclosing test and particular MLVA types, although there was substantial variation.

• MeSH
• chov MeSH
• genotypizační techniky veterinární   MeSH
• longitudinální studie MeSH
• minisatelitní repetice * MeSH
• multilokusová sekvenční typizace veterinární   MeSH
• Mycobacterium bovis klasifikace   genetika   růst a vývoj   izolace a purifikace   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• skot MeSH
• surveillance populace MeSH
• tuberkulóza skotu diagnóza   epidemiologie   MeSH
• variabilita počtu kopií segmentů DNA MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• mužské pohlaví MeSH
• skot MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Severní Irsko MeSH

Molecular cloning, nucleotide sequencing, and characterization of the flaA gene from additional isolates of urease-positive thermophilic Campylobacter (UPTC) were performed. These isolates were obtained from the natural environment in Northern Ireland (n = 9 from mussels) and in England (n = 1 from sea water). All isolates carried the shorter flaA gene, [open reading frames (ORFs), 1,461 to 1,503 base pairs], without any internal termination codons, and did not carry any flaA pseudogenes. The UPTC isolates were well discriminated by the neighbor joining (NJ) phylogenetic tree constructed based on the putative flaA genes ORFs nucleotide sequence information. In addition, the NJ tree constructed based on the flaA-short variable region sequence information discriminated the Campylobacter lari isolates with a similar degree of discrimination power.

• MeSH
• Campylobacter lari klasifikace   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• Campylobacter klasifikace   genetika   izolace a purifikace   metabolismus   MeSH
• flagelin chemie   genetika   metabolismus   MeSH
• fylogeneze MeSH
• klonování DNA MeSH
• mlži mikrobiologie   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• mořská voda mikrobiologie   MeSH
• otevřené čtecí rámce MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• rekombinantní proteiny chemie   genetika   metabolismus   MeSH
• sekvence aminokyselin MeSH
• sekvenční analýza DNA metody   MeSH
• sekvenční seřazení MeSH
• ureasa metabolismus   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Anglie MeSH
• Severní Irsko MeSH

• MeSH
• jednotky intenzivní péče o novorozence MeSH
• neonatologie MeSH
• novorozenecký screening MeSH
• péče o kojence MeSH
• Publikační typ
• novinové články MeSH
• Geografické názvy
• Severní Irsko MeSH

• MeSH
• postižení MeSH
• sluchově postižení MeSH
• sociální prostředí MeSH
• speciální vzdělávání MeSH
• studenti MeSH
• studium vysokoškolské MeSH
• univerzity MeSH
• výchova a vzdělávání MeSH
• zrakově postižení MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH
• Severní Irsko MeSH
• Spojené království MeSH

• MeSH
• stomatologická péče ekonomika   organizace a řízení   MeSH
• zahraniční odborný personál MeSH
• zubní lékaři MeSH
• Geografické názvy
• Severní Irsko MeSH

• MeSH
• komunitní zdraví - plánování metody   trendy   využití   MeSH
• lidé MeSH
• programy národního zdraví organizace a řízení   trendy   využití   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Severní Irsko MeSH

• MeSH
• Campylobacter coli genetika   izolace a purifikace   MeSH
• Campylobacter jejuni genetika   izolace a purifikace   MeSH
• flagelin genetika   MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• otevřené čtecí rámce MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• sekvence aminokyselin MeSH
• sekvenční analýza proteinů MeSH
• ureasa metabolismus   MeSH
• Geografické názvy
• Japonsko MeSH
• Severní Irsko MeSH

The European Influenza Surveillance Scheme (EISS) is based on an integrated clinical and virological surveillance model. To assess the comparability of virological data, a questionnaire was sent to participants in June 2002 enquiring about specimen collection, laboratory diagnosis of influenza and tests for other respiratory infections. The results showed differences, but also uniformity in virological data collection methods. Similarities were reported for the specimen collection procedures; the type of swab and the transport conditions were comparable. The diagnostic methods were diverse; differences were seen in the (sub)typing methods, with PCR used most often in western countries. The findings will be helpful for the interpretation of virological data collected by sentinel physicians and for the creation of a Community Network of Reference Laboratories for Human Influenza in Europe. Important objectives of the Community Network include the harmonisation of virological methods and the application of quality assurance assessments for the national reference laboratories.

• MeSH
• chřipka lidská klasifikace   diagnóza   epidemiologie   virologie   MeSH
• lidé MeSH
• molekulární epidemiologie metody   normy   MeSH
• odběr biologického vzorku metody   normy   MeSH
• Orthomyxoviridae klasifikace   genetika   růst a vývoj   izolace a purifikace   MeSH
• sentinelová surveillance MeSH
• zdravotnické přehledy * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Anglie MeSH
• Belgie MeSH
• Česká republika MeSH
• Dánsko MeSH
• Irsko MeSH
• Itálie MeSH
• Německo MeSH
• Nizozemsko MeSH
• Norsko MeSH
• Polsko MeSH
• Portugalsko MeSH
• Rumunsko MeSH
• Severní Irsko MeSH
• Skotsko MeSH
• Slovenská republika MeSH
• Slovinsko MeSH
• Švýcarsko MeSH
• Wales MeSH

• MeSH
• mortalita epidemiologie   MeSH
• úrazy a nehody epidemiologie   MeSH
• zdravotní politika MeSH
• Geografické názvy
• Severní Irsko MeSH

• MeSH
• beta blokátory terapeutické užití   MeSH
• blokátory kalciových kanálů terapeutické užití   MeSH
• hypolipidemika terapeutické užití   MeSH
• infarkt myokardu farmakoterapie   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH
• Francie MeSH
• Severní Irsko MeSH
• Skandinávie a severské státy MeSH