Inflammation is an integral part of defense against most infectious diseases. These pathogen-induced immune responses are in very many instances strongly influenced by host's sex. As a consequence, sexual dimorphisms were observed in susceptibility to many infectious diseases. They are pathogen dose-dependent, and their outcomes depend on pathogen and even on its species or subspecies. Sex may differentially affect pathology of various organs and its influence is modified by interaction of host's hormonal status and genotype: sex chromosomes X and Y, as well as autosomal genes. In this Mini Review we summarize the major influences of sex in human infections and subsequently focus on 22 autosomal genes/loci that modify in a sex-dependent way the response to infectious diseases in mouse models. These genes have been observed to influence susceptibility to viruses, bacteria, parasites, fungi and worms. Some sex-dependent genes/loci affect susceptibility only in females or only in males, affect both sexes, but have stronger effect in one sex; still other genes were shown to affect the disease in both sexes, but with opposite direction of effect in females and males. The understanding of mechanisms of sex-dependent differences in the course of infectious diseases may be relevant for their personalized management.
- MeSH
- bakteriální infekce epidemiologie genetika MeSH
- biologické modely MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- druhová specificita MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- helmintóza epidemiologie genetika MeSH
- infekční nemoci epidemiologie genetika MeSH
- interakce hostitele a patogenu genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- lokus kvantitativního znaku MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mykózy epidemiologie genetika MeSH
- myši inbrední C57BL MeSH
- myši MeSH
- parazitární nemoci epidemiologie genetika MeSH
- pohlavní dimorfismus * MeSH
- pohlavní steroidní hormony fyziologie MeSH
- rozložení podle pohlaví MeSH
- virové nemoci epidemiologie genetika MeSH
- zánět MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- myši MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- srovnávací studie MeSH
Základním kamenem laboratorní diagnostiky etiologie infekčních nemocí jsou postupy založené na kultivaci mikrobů. Stále více se však i v běžné klinické praxi uplatňují molekulárně biologické, na kultivaci nezávislé metody detekce mikroorganizmů, které jsou důležitým doplňkem konvenčních postupů a v některých případech se již staly zlatým diagnostickým standardem. Nejčastěji jsou používány metody založené na polymerázové řetězové reakci (PCR – polymerase chain reaction).
The practices based on microbe cultivation are the corner stone of laboratory diagnostics of infectious diseases etiology. However, cultivation-independent molecular methods for microorganism detection are increasingly being used in a routine clinical setting as an important complement to the conventional procedures and, in some cases, they have already become the golden diagnostic standard. The PCR-based methods are used the most frequently.
- MeSH
- bakteriální infekce * diagnóza genetika MeSH
- Cardiobacterium genetika izolace a purifikace MeSH
- DNA bakterií MeSH
- dospělí MeSH
- endokarditida diagnóza etiologie genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mykózy diagnóza genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce * MeSH
- Tropheryma genetika izolace a purifikace MeSH
- virové nemoci * diagnóza genetika MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- přehledy MeSH
BACKGROUND & AIMS: Augmented susceptibility to infections increases mortality in patients with end-stage liver disease (ESLD). We sought to determine the contribution of selected genetic variants involved in inflammatory signalling downstream of the Toll-like receptor 4 (TLR4) to severe bacterial infections (SBIs) in patients with ESLD. METHODS: We retrospectively assessed incidence of SBIs in 336 adult ESLD patients enlisted for orthotopic liver transplantation (OLT) and genotyped them for TLR4 c.+1196C/T, CD14 c.-159C/T, TNFA c.-238G/A, TNFA c.-863C/A, IL1B c.-31C/T and IL1RN variable number of tandem repeats allelic variants. Principal findings were validated in an independent cohort of 332 ESLD patients. RESULTS: Thirty-four percent of patients from the identification cohort and 40% of patients from the validation cohort presented with SBI while enlisted for OLT. The presence of the variant allele TNFA c.-238A (rs361525) was associated with lower serum levels of TNF-α, and with significantly decreased risk of SBI in both cohorts. Multivariate analysis showed that the relative protection from SBI associated with this allele almost completely negated the increased susceptibility to SBI owed to advanced ESLD. Although not predictive of overall mortality, the presence of the TNFA c.-238A allele was associated with a complete prevention of SBI-related pre-transplant deaths. CONCLUSIONS: Our results suggest that genetic variability in inflammatory signalling is associated with the development of SBI in patients with ESLD. Specifically, we identified the importance of the TNFA c.-238A allele as a strong predictor of protection from SBI, and as a genetic marker associated with significantly improved pre-transplant survival in patients with SBI.
- MeSH
- bakteriální infekce genetika imunologie prevence a kontrola MeSH
- dospělí MeSH
- frekvence genu MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- genetická variace MeSH
- genetické asociační studie MeSH
- genetické markery MeSH
- jednonukleotidový polymorfismus MeSH
- kohortové studie MeSH
- konečné stadium selhání jater komplikace genetika imunologie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- retrospektivní studie MeSH
- TNF-alfa krev genetika MeSH
- toll-like receptor 4 genetika MeSH
- transplantace jater * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl práce: Vyvinout metodu detekce genů podmiňujících ESBL (extended spectrum beta lactamase) fenotyp bakterií přímo z klinického materiálu pacienta. Metoda umožňuje detekci genu blaCTX-M kódujícího CTX-M beta-laktamázy a detekci variant blaSHV genu technologií real-time PCR s využitím locked nucleic acid (LNA) oligonukleotidů. Materiál a metody: V pilotní studii byly testovány tracheální aspiráty získané od pacientů s umělou plicní ventilací hospitalizovaných na oddělení KAR FN Olomouc v období 1. 3. až 30. 8. 2010. Každý vzorek byl standardně mikrobiologicky vyšetřen, u enterobakterií bylo provedeno fenotypové stanovení přítomnosti ESBL. Každý klinický materiál byl současně podroben analýze na přítomnost nukleových kyselin (DNA) kódujících CTX-M a SHV ESBL beta-laktamázy metodou real-time PCR. Výsledky: Do testování bylo zařazeno 150 vzorků tracheálního aspirátu od 71 pacientů. V souboru bylo kultivačně identifikováno 13 (8,7 %) ESBL pozitivních vzorků, zatímco metodou real-time PCR jich bylo identifikováno 27 (18 %). Z 27 PCR pozitivních vzorků bylo pozitivních na přítomnost blaCTX-M sekvence 24 vzorků, dva na přítomnost ESBL blaSHV genu a v jednom vzorku byly identifikovány oba geny. Všechny kultivačně pozitivní vzorky byly zároveň PCR pozitivní na přítomnost blaCTX-M a/nebo blaSHV sekvence. Závěr. Nová metoda výrazně zkracuje dobu detekce kmenů enterobakterií s geny pro produkci SHV a CTX-M beta-laktamáz ze 48 na hodin. Umožňuje klinické využití stanovení přítomnosti ESBL-pozitivní enterobakterie v tracheálním aspirátu u pacientů se život ohrožující nozokomiální pneumonií, kde včasné zavedení adekvátní antimikrobiální terapie hraje významnou roli.
Objectives: A new method has been developed for detecting genes determining the extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) phenotype directly from patients' clinical material. The method enables detection of the blaCTX-M gene encoding CTX-M beta-lactamases and the blaSHV gene variants with real-time PCR technology using locked nucleic acid oligonucleotides. Material and methods: In this pilot study, tracheal aspirates obtained from patients with mechanical ventilation hospitalized at Department of Anaesthesiology and Resuscitation of the University Hospital in Olomouc between 1st March and 30th December 2010 period were tested. Each sample was identified with standard microbiological procedures including phenotypic determination of ESBL-positive enterobacteria. At the same time, each sample was analyzed for the presence of nucleic acids (DNA) which encode CTX-M and SHV ESBL using real-time PCR . Results: 150 samples of tracheal aspirates from 71 patients were included into testing. In the set, 13 (8.7 %) ESBL-positive samples were identified by culture methods while 27 (18 %) positive samples were identified by the real-time PCR method. Of the 27 PCR-positive samples, 24 were positive for the blacTx gene; in 2 samples, the ESBL blasHv gene was detected, and both genes were present in 1 sampie. All culture-positive samples were also PCR-positive for the presence of blaCTX and/or blaSHV sequences. Conclusions: The new real-time PCR assay is likely to shorten the time for detection of enterobacteria producing SHV and CTX-M beta-lactamases from 48 to 6 hours. It enables ESBL-positive enterobacteria determination in tracheal aspirates of patients suffered from life-threatening nosocomial pneumonia where the early introduction of adequate antimicrobial treatment plays the important role.
- MeSH
- bakteriální infekce diagnóza etiologie farmakoterapie genetika MeSH
- beta-laktamasy * analýza diagnostické užití genetika MeSH
- enterobakteriální infekce diagnóza etiologie genetika komplikace mikrobiologie MeSH
- fenotyp MeSH
- hlen mikrobiologie MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí * diagnóza etiologie mikrobiologie prevence a kontrola přenos MeSH
- kultivační techniky * metody statistika a číselné údaje trendy MeSH
- lidé MeSH
- oligoribonukleotidy analýza diagnostické užití genetika MeSH
- pneumonie diagnóza etiologie prevence a kontrola MeSH
- tělesné sekrety * mikrobiologie MeSH
- ventilace umělá s výdechovým přetlakem statistika a číselné údaje MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- bakteriální infekce * diagnóza genetika MeSH
- beta-laktamy analýza MeSH
- enterobakteriální infekce * diagnóza MeSH
- fenotyp MeSH
- hlen mikrobiologie MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí diagnóza mikrobiologie MeSH
- kultivační techniky MeSH
- lidé MeSH
- oligoribonukleotidy analýza MeSH
- pneumonie diagnóza MeSH
- tělesné sekrety mikrobiologie MeSH
- ventilace umělá s výdechovým přetlakem MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- bakteriální infekce genetika imunologie mikrobiologie MeSH
- exprese genu genetika imunologie MeSH
- intracelulární prostor enzymologie imunologie mikrobiologie MeSH
- lidé MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- recenze MeSH
- MeSH
- antigeny CD14 genetika imunologie MeSH
- bakteriální infekce genetika imunologie MeSH
- dítě MeSH
- endotoxiny metabolismus MeSH
- finanční podpora výzkumu jako téma MeSH
- lidé MeSH
- lipopolysacharidy genetika chemická syntéza MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- prospektivní studie MeSH
- sepse genetika patologie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH