• MeSH
• horečka etiologie   MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae * epidemiologie   komplikace   patologie   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• předškolní dítě MeSH
• pyelonefritida komplikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• přehledy MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Úvod: Noroviry jsou společně s rotaviry nejčastějšími původci virových gastroenteritid v České republice (ČR). Cílem studie bylo analyzovat data ohledně výskytu norovirových gastroenteritid v ČR a tím přispět ke znalostem o jejich významu. Materiál a metody: Byla provedena deskriptivní analýza základních charakteristik u norovirových gastroenteritid, které byly hlášeny pod kódem A08.1 podle MKN10 do informačních systémů Epidat, resp. ISIN, v letech 2008–2020. Na základě hlášení z 5 mikrobiologických laboratoří byly analyzovány údaje o počtu potvrzených norovirových infekcí v jednotlivých týdnech v letech 2010–2020. Z podkladů mikrobiologických laboratoří v celé ČR byl analyzován počet laboratoří diagnostikujících v letech 2008–2020 norovirové infekce a používané laboratorní metody. Výsledky: V letech 2008–2020 bylo do informačních systémů infekčních nemocí nahlášeno 33 575 norovirových gastroenteritid, což odpovídá incidenci 24,5/100 000 obyvatel a rok – incidence v jednotlivých letech kolísala mezi 8,2–77,1/100 000. Muži byli mezi nemocnými zastoupeni v 40,2 % – incidence u mužů byla 20,1/100 000; žen 28,8/100 000. Z celkového počtu hlášených onemocnění byl u 14 282 osob (42,5 %) uveden údaj o hospitalizaci ve zdravotnických zařízeních. Za celé období bylo podchyceno 7 431 onemocnění u dětí do 5 let věku – v jednotlivých letech onemocnění v této věkové skupině tvořila 13,7–38,9 % všech evidovaných onemocnění. Incidence v této věkové skupině byla 101,8/100 000, ve věkových skupinách 5–14 let 40,1; 15–64 let 12,7; 65 let a více 38,2/100 000. V souvislosti s norovirovou gastroenteritidou bylo hlášeno 24 úmrtí (smrtnost 0,07 %) ve věku 42–94 let, ve věkové skupině 15–64 let byla zjištěna smrtnost 0,02 %, ve věkové skupině 65letých a starších 0,24 %. Během sledovaného období bylo zaznamenáno 274 epidemií, ve kterých bylo z celkového počtu 33 575 evidovaných norovirových gastroenteritid hlášeno 16 893 (50,3 %). V rámci epidemických výskytů bylo z celkového počtu nemocných hospitalizováno 1 694 osob (10,0 %). Největší epidemie byla zaznamenána v roce 2015; v souvislosti s kontaminací pražské vodovodní sítě bylo nahlášeno 5 248 onemocnění. Norovirové infekce byly laboratorně diagnostikovány celoročně, k jejich maximálnímu výskytu docházelo během podzimních a zimních měsíců. V současnosti jsou norovirové infekce v ČR diagnostikovány v 81 laboratořích, 90,1 % laboratoří používá imunochromatografické testy. Závěr: Studie potvrdila nejvyšší výskyt norovirových gastroenteritid u dětí do 5 let věku a jejich nejvyšší smrtnost ve věkové skupině 65letých a starších osob. Více než polovina hlášených onemocnění se vyskytla v rámci epidemií. Většina laboratoří využívá imunochromatografické testy – používání citlivějších laboratorních metod by přispělo ke zlepšení diagnostiky.

Introduction: Noroviruses, together with rotaviruses, are the most common cause of viral gastroenteritis in the Czech Republic (CR). The aim of this study was to analyse data on the incidence of norovirus gastroenteritis in the CR and thus to add to the body of knowledge about its significance. Material and Methods: A descriptive analysis was performed of the basic characteristics of norovirus gastroenteritis reported under ICD-10 code A08.1 to the Epidat or ISIN electronic infectious diseases information system between 2008 and 2020. On the basis of reports from five microbiological laboratories, weekly data on confirmed cases of norovirus infection from 2010–2020 were analysed. Databases of microbiology laboratories from across the Czech Republic were searched to determine the number of the laboratories where norovirus infections were diagnosed and the methods used for this purpose in 2008–2020. Results: From 2008 to 2020, 33,575 cases of norovirus gastroenteritis were reported to the infectious diseases information systems, which equates to an annual incidence of 24.5/100,000 population, varying between years from 8.2 to 77.1/100,000. Men accounted for 40.2% of cases with an incidence of 20.1/100,000 compared to 28.8/100,000 recorded in women. Of the total of reported cases, 14,282 patients (42.5%) required hospital admission. Over the whole study period, 7,431 cases of norovirus gastroenteritis were recorded in children under 5 years of age. This age category accounted for 13.7–38.9% of the annual totals of reported cases. The incidences were 101.8/100,000 in children under 5 years of age, 40.1/100,000 in 5-14-year-olds, 12.7/100,000 in 15-64-year-olds, and 38.2/100,000 in the age group 65 years and over. Twenty-four deaths (case fatality rate of 0.07%) were reported as associated with norovirus gastroenteritis at the ages 42-94. In the age categories 15-64 years and 65 years and over, the case fatality rates were 0.02% and 0.24%, respectively. Over the study period, 274 epidemics occurred, during which 16,893 (50.3%) of the total of 33,575 cases were reported. In the epidemic outbreaks, 1,694 (10.0%) patients required hospital admission. The largest outbreak with 5,248 reported cases in 2015 was associated with contamination of the Prague water supply system. Norovirus infections were laboratory diagnosed year-round, peaking in the autumn and winter months. They are currently diagnosed by 81 laboratories in the Czech Republic, 90.1% of which use immunochromatographic tests. Conclusion: The study confirmed the highest incidence of norovirus gastroenteritis among children under 5 years of age and the highest case fatality rate in the age group 65 years and over. Over half of the reported cases were outbreak associated. Most laboratories use immunochromatographic tests. The use of more sensitive laboratory methods would improve diagnosis.

• Klíčová slova
• sezónní výskyt,
• MeSH
• epidemiologické studie MeSH
• gastroenteritida etiologie   MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae * epidemiologie   mortalita   MeSH
• lidé MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Cíl práce: Noroviry patří do čeledi Caliciviridae. V současnosti jsou tyto viry klasifikovány minimálně do 10 genoskupin. Význam norovirů v České republice není zatím intenzivně sledován. Cílem studie bylo přispět ke znalostem o jejich cirkulaci v naší populaci na základě určení jednotlivých genotypů u pacientů, u kterých byla norovirová infekce diagnostikována rutinním vyšetřením během hospitalizace ve Fakultní nemocnici v Plzni. Materiál a metody: Od června 2017 do března 2020 byla diagnóza norovirové infekce potvrzena u 118 pacientů. Laboratorní vyšetření: Vzorky nativní stolice nemocných s projevy gastroenteritidy byly rutinně zpracovány kvalitativním imunochromatografickým testem RIDAQuick Norovirus (R-Biopharm AG) na stanovení noroviru genoskupiny I a II podle pokynu výrobce. Následně byla provedena molekulárně-biologická analýza vzorků. Ze vzorků stolice byla připravena 10% suspenze v roztoku fosfátového pufru, ze které byla soupravou QIAamp Viral RNA Mini Kit (Qiagen) izolována nukleová kyselina podle návodu výrobce. Dále byla provedena reverzní transkripce a amplifikace (PCR) specifické oblasti genomu norovirů (tzv. region C). PCR produkty o specifické velikosti byly přečištěny pomocí QIAquick PCR Purification Kit (Qiagen) a odeslány na sekvenování (Eurofins Genomics). Získané sekvence byly analyzovány v programu MEGA verze X. Zařazení prokázaných virů do jednotlivých genotypů bylo ověřeno s použitím Norovirus Typing Tool Version 2.0 (https://www.rivm.nl/mpf/typingtool/norovirus/). Výsledky: Během sledovaného období bylo prokázáno 14 různých genotypů, resp. variant z genoskupin GI, GII a GIX (dříve GII.15). Nejčastěji byly potvrzeny infekce vyvolané noroviry (NoV) GII.4 Sydney-2012, které vyvolaly 70,3 % onemocnění. Tato varianta norovirů byla prokázána ve 24 měsících z celkového počtu 34 měsíců sledování. Norovirové infekce se vyskytovaly především v podzimních a zimních měsících (říjen-březen), v tomto období bylo diagnostikováno 68, tj. 57,6 % onemocnění. Norovirová infekce byla potvrzena ve všech věkových skupinách, věk pacientů se pohyboval od 0 do 96 let (medián 8, průměr 27,9 let). Analýza zastoupení nejčastější varianty NoV GII.4 Sydney-2012 potvrdila statisticky významný rozdíl ve výskytu této varianty ve věkové skupině 0-4 let při porovnání se staršími osobami (χ2 = 5,37, P = 0,02). Pacienti s norovirovou infekcí měli bydliště vesměs v okrese Plzeň-město (51 osob). Z anamnézy nemocných vyplynulo, že 35 z nich (29,7 %) mělo v době prvních příznaků dalšího nemocného s příznaky gastroenteritidy v rodině. Závěr: Studie je prvním pokusem o zmapování molekulární epidemiologie norovirů nejen v Plzeňském kraji, ale v celé České republice. I přes relativně nízké počty oficiálně hlášených onemocnění patří nepochybně noroviry i u nás k velmi důležitým původcem gastroenteritid, je proto žádoucí rozšiřovat spektrum našich znalostí o jejich cirkulaci.

Objective: Noroviruses are members of the Caliciviridae family and are currently segregated into at least 10 genogroups. The distribution of these viruses in the Czech Republic has not yet been investigated in detail. A pilot study was performed to contribute to the overall knowledge and understanding of norovirus circulation in the population. Clinical specimens from patients diagnosed with norovirus infection during their hospitalization at the Pilsen University Hospital were genotyped. Material and methods: A total of 118 patients were diagnosed with norovirus infection between July 2017 and March 2020. Stool samples from patients presenting with gastroenteritis were routinely screened by the RIDA®QUICK Norovirus Test (R-Biopharm AG), a rapid chromatographic immunoassay for the qualitative detection of Norovirus genogroups I and II, according to the manufacturer’s instructions. Norovirus positive samples were subsequently analysed by molecular biological methods. Stool suspensions (10%) were prepared with phosphate-buffered saline, and nucleic acid was extracted using the QIAamp Viral RNA kit (Qiagen) according to the manufacturer’s instructions. To investigate the genotype distribution, RT-PCR targeting specific sections of the norovirus genome (region C) was employed, followed by purification of PCR products using the QIAquick PCR Purification Kit (Qiagen) and sequencing (Eurofins Genomics). The sequences obtained were analysed by the MEGA X software, and the results of phylogenetic analyses were confirmed by Norovirus Typing Tool Version 2.0 (https://www.rivm.nl/mpf/typingtool/ norovirus/. Results: During the study period, 14 norovirus genotypes or genogroup variants NoV GI, NoV GII and NoV GIX (previously NoV GII.15) were identified. The major genotype NoV GII.4 Sydney-2012 accounted for a total of 70.3% of norovirus gastroenteritis cases. This norovirus variant was detected in 24 months out of 34 months of the study period. In general, the number of norovirus infections increased during autumn and winter months (October to March) when 68 (57.6%) cases were diagnosed. Although norovirus infection was confirmed in all age categories (age range 0–96 years, median 8, mean 27.9), the statistical analysis revealed a significant difference in the incidence of NoV GII.4 infection between the age group 0–4 years and older patients (χ2 = 3.95, P = 0.047). Many patients (51) were residents of the Pilsen-city district. The case history data showed that 35 of them (29.7%) had another family member who developed symptoms of gastroenteritis at the time of the onset of their infection. Conclusion: The pilot study is the first attempt to map the molecular epidemiology of noroviruses, not only in the Pilsen Region but also in the whole Czech Republic. Despite the relatively low number of officially reported cases, noroviruses are undoubtedly one of the most important causes of gastroenteritis in this country. Further studies are therefore necessary to expand the body of knowledge of their ecology and circulation.

• MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• epidemiologické modely MeSH
• feces mikrobiologie   MeSH
• gastroenteritida etiologie   mikrobiologie   MeSH
• genotyp MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae * epidemiologie   MeSH
• lidé MeSH
• Norovirus izolace a purifikace   MeSH
• pacienti hospitalizovaní MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• lidé MeSH

• MeSH
• gastroenteritida epidemiologie   virologie   MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae * epidemiologie   etiologie   MeSH
• kohortové studie MeSH
• lidé MeSH
• pitná voda analýza   virologie   MeSH
• přenos infekční nemoci MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• zásobování vodou MeSH
• zdroje nemoci virologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Cíl: analýza výskytu nejběžnějších alimentárních onemocnění v České republice v letech 2007-2017. Metody: Provedli jsme deskriptivní analýzu dat nejběžnějších alimentárních onemocnění v rámci systému hlášení pro infekční nemoci (EpiDat) za období 2007-2017 a zvlášť pak s detailním zaměřením na rok 2017. Výsledky: Z analýzy dat systému hlášení pro infekční nemoci (EpiDat) vyplývá, že v České republice (ČR) patří mezi nejvýznamnější onemocnění alimentárního původu s nejvyšším počtem případů kampylobakteriózy, salmonelózy a průjmy virového původu. Trend výskytu těchto onemocnění se v letech 2007-2017 měnil pouze mírně. V letech 2007-2017 byl v ČR v rámci alimentárních nákaz zaznamenán nejvyšší výskyt kampylobakterióz (celkem 232 380 případů) a salmonelóz (127 788 případů), jež byly následovány virovými a jinými specifikovanými střevními infekcemi (99 631 případů). Závěr: Trendy alimentárních nákaz se v České republice v posledních letech nemění. Z hlediska jejich prevence má nadále zásadní význam dodržování správné hygienické praxe při manipulaci s potravinami, přepravě, skladování a podávání potravy. Rizikovými skupinami jsou zejména děti mladší 5 let a imunokompromitované osoby.

Aim: Analysis of trends and other main epidemiological characteristics of the most prevalent food-and water-borne diseases in the Czech Republic in the years 2007-2017. Methods: We performed descriptive analysis of most prevalent food-and water-borne diseases in the Czech Republic in the years 2007-2017. The data used for the analysis were taken from Czech National Electronic Surveillance System called EpiDat. Results: The most common food-and water-borne diseases captured within the Czech National Electronic Surveillance System with the highest number of cases reported per year were campylobacteriosis (total 232 380 cases), salmonelosis (total 127 788 cases) and viral gastrointestinal infections (total 99 631 cases) caused mainly by rotaviruses and noroviruses. The epidemiological trends changed only slightly in the analyzed years. No significant differences were observed. Conclusions: The epidemiological trends of the most common food-and water-borne diseases in the Czech Republic changed only slightly in the years 2007-2017. Main prevention measures for food-and water-borne diseases control in the Czech Republic remains the same with special attention to the risk groups, particularly immunocompromised and children younger than 5 years old.

• MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae epidemiologie   MeSH
• kampylobakterové infekce epidemiologie   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• nemoci přenášené potravou * epidemiologie   mortalita   MeSH
• rotavirové infekce epidemiologie   MeSH
• salmonelóza epidemiologie   patologie   MeSH
• statistika jako téma MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Článek představuje méně obvyklou formu mimořádné události s hromadným postižením osob ve formě akutní gastroenteritidy, která je způsobená noroviry. Noroviry jsou malé neobalené RNA viry, které jsou u lidí častým původcem akutní gastroenteritidy. Vzplanutí hromadné nákazy je lehké z důvodu snadného přenosu, velmi nízké infekční dávky, krátké inkubační doby, snadné­ho přežívání v prostředí a chybění trvalé imunity po překonaném onemocnění. Kazuistika představuje zásah poskytovatele zdravotnické záchranné služby v místě mimořádné události s hromadnou nákazou způsobenou noroviry. Jednalo se o školu v přírodě na území bývalého okresu Plzeň-sever, kde bylo stiženo akutní gastroenteritidou 56 dětí a 2 dospělé osoby. Popsána je reakce spádového zdravotnického operačního střediska, nasazování sil a prostředků zdravotnické složky, postup v místě události, organizace odsunu do zdravotnických zařízení a postup při příjmu nemocných dětí a jejich léčbě na Klinice infekčních nemocí a cestovní medicíny Fakultní nemocnice Plzeň.

The article presents a less common emergency situation with a mass casualty in the form of acute gastroenteritis caused by norovirus infection. Noroviruses are small non covered RNA viruses that are common source of acute gastroentritis. The spreading of mass infection is easy because of simple transmission, very low infective dose, short time of incubation, easy survival in the environment and lack of permanent immunity after overcoming the disease. The case report describes emergency medical service provider´s intervention on scene of multiple victim incident caused by norovirus infection. The incident was situated in the school camp in the former district of Pilsen – North, where 56 children and 2 adults suffered from acute gastroenteritis. The reaction of regional Medical Dispatch Center, deployed resources of Emergency Medical Service, on scene management and organization of transport to medical centers are described in the paper. The articela also deals with the procces of ill children´s admission and treatment at the Department of Infectious Diseases and Travel Medicine of the University Hospital and Medical School Plzeň.

• MeSH
• dítě MeSH
• epidemie MeSH
• gastroenteritida MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae * epidemiologie   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• Norovirus MeSH
• transport pacientů MeSH
• třídění pacientů MeSH
• urgentní zdravotnické služby * MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

• MeSH
• břišní tyfus epidemiologie   MeSH
• dengue epidemiologie   MeSH
• hepatitida A epidemiologie   MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae epidemiologie   MeSH
• infekční nemoci * epidemiologie   MeSH
• lidé MeSH
• tetanus epidemiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Itálie MeSH
• Nový Zéland MeSH
• Skotsko MeSH
• Srí Lanka MeSH

The objective of the study is to analyze molecular epidemiologic surveillance for norovirus infection in Belarus over the past five years (2009-2013). Laboratory diagnostics was carried out by RT-PCR in 684 patients. Two regions of norovirus genome, localized in RNA-polymerase and capsid protein genes, were used for phylogenetic analysis. Noroviruses were predominant causative agents in adults and second only to rotaviruses in children, they also prevailed among aetiological agents of outbreaks (66.7% of outbreaks). In 2009-2013, the major norovirus genotype was GII.4 (58.3% of all genotyped isolates). Genovariant GII.4 2006b circulated in 2009 and 2010, genovariant GII.4 2009 New Orleans - in 2010 and 2012. In addition to GII.4, genotypes GII.6 (16.6%), GII.2 (4.1%), GII.3 (2.2%), and recombinant genotypes GII.g-GII.12 and GII.g-GII.1 (10.4% and 8.3%, respectively) circulated in Belarus. The findings indicate a significant contribution of noroviruses in development of sporadic morbidity and outbreaks of acute gastroenteritis in Belarus. Outbreaks or prominent increases of sporadic morbidity were mostly due to the emergence of a new genotype, or an epidemic genovariant.

• MeSH
• dítě MeSH
• fylogeneze MeSH
• genotyp MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae epidemiologie   virologie   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• molekulární epidemiologie * MeSH
• Norovirus genetika   izolace a purifikace   MeSH
• předškolní dítě MeSH
• surveillance populace MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• Geografické názvy
• Běloruská republika MeSH

• MeSH
• gastroenteritida * epidemiologie   etiologie   prevence a kontrola   MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae epidemiologie   etiologie   prevence a kontrola   MeSH
• lidé MeSH
• Norovirus * izolace a purifikace   MeSH
• přenos infekční nemoci prevence a kontrola   MeSH
• zdravotnická zařízení * MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

Small, non-enveloped RNA viruses belonging to the genera Sapovirus, Kobuvirus, and Mamastrovirus are usually associated with gastroenteritis in humans and animals. These enteric pathogens are considered potential zoonotic agents. In this study, the prevalence and genetic diversity of sapoviruses (SaVs), kobuviruses (KoVs), and astroviruses (AstVs) in asymptomatic pigs were investigated using a PCR approach. KoV was found to be the most prevalent virus (87.3 %), followed by AstV (34.2 %) and SaV (10.2 %). Interestingly, the intra- and inter-cluster distances between porcine SaV capsid sequences revealed one strain (P38/11/CZ) that formed a new genotype within genogroup III of porcine SaVs, and it is tentatively called "P38/11-like" genotype. Moreover, this is the first report of porcine kobuvirus detection on Czech pig farms. The high prevalence rate of gastroenteritis-producing viruses in clinically healthy pigs represents a continuous source of infection of pigs, and possibly to humans.

• MeSH
• Astroviridae genetika   MeSH
• fylogeneze MeSH
• gastroenteritida epidemiologie   veterinární   virologie   MeSH
• genetická variace * MeSH
• genotyp MeSH
• infekce viry z čeledi Astroviridae epidemiologie   veterinární   virologie   MeSH
• infekce viry z čeledi Caliciviridae epidemiologie   veterinární   virologie   MeSH
• Kobuvirus genetika   MeSH
• nemoci prasat epidemiologie   virologie   MeSH
• pikornavirové infekce epidemiologie   veterinární   virologie   MeSH
• prasata MeSH
• RNA virová genetika   MeSH
• Sapovirus klasifikace   genetika   MeSH
• sekvenční analýza RNA MeSH
• Sus scrofa MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH