Extent of the tumor and its complete surgical removal are major prognostic factors in rectal cancer treatment. Number of postoperative local recurrences depends on the completeness and quality of mesorectal excision -TME (total mesorectal excision) and tumor free resection margins. The aim of multicenter prospective study is to improve the quality of TME and verify whether the surgical and pathological measures help to reduce local recurrence.

Rozsah nádoru a jeho úplné chirurgické odstranění patří k hlavním prognostickým faktorům v léčbě karcinomu rekta. Počet pooperačních lokálních recidiv závisí na úplnosti odstranění mezorekta –TME (total mesorectal excision) a dosažení bezpečných resekčních okrajů bez nádorů. Prostřednictvím multicentrické prospektivní studie bude parametricky sledována kvalita TME ve vztahu k onkologickému výsledku léčby. Na základě analýzy budou identifikována kritická místa a navržena potřebná opatření. Parametrické sledování má podpořit zvýšení kvality chirurgické léčby a v důsledku snížit počet lokálních recidiv po operacích karcinomu rekta.

• MeSH
• klinické protokoly MeSH
• kolorektální chirurgie MeSH
• kritické cesty MeSH
• lokální recidiva nádoru MeSH
• multicentrické studie jako téma MeSH
• nádory rekta chirurgie   terapie   MeSH
• prognóza MeSH
• prospektivní studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• gastroenterologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Testicular germ-cell tumors are the most frequent solid tumors in young men. Despite that, the present knowledge of their biology is still rather limited, no molecular prognostic or predictive factors have been defined in them and no biologic therapy is available for them. In this project, we would like to prospectively collect samples of these tumors and, along with non-malignant testicular tissue samples, store them in parallel fresh-frozen in liquid nitrogen and paraffin-embedded, so as a wide spectrum of different analyses may be carried out. An associated database of clinical and laboratory findings of the enrolled patients will be built-up at the same time. In the collected samples, we will detect expression of Wilms' tumor gene 1 (WT1), including its isoforms and mutations, and other aberrations with potential clinical implication like BRAF and PT53 mutations to demonstrate if any of them could act as independent prognostic and/or predictive factor in patients with testicular germ-cell tumors.

Germinální nádory varlat jsou nejčastěji se vyskytující solidní tumory u mladých dospělých mužů, přesto jsou současné poznatky o jejich biologii omezené, molekulárně-biologické prognostické nebo prediktivní faktory u nich nebyly dosud definované a biologická léčba pro ně zatím neexistuje. V tomto projektu chceme systematicky prospektivně shromažďovat vzorky těchto nádorů a také nemaligní vzorky varlat, které budou uchovávané paralelně v parafinu i v tekutém dusíku tak, aby byly k dispozici pro široké spektrum analýz. Společně s nimi bude vedena databáze klinických a laboratorních údajů. Ve vzorcích vyšetříme expresi genu Wilmsova tumoru 1 (WT1), včetně jeho izoforem a mutací, a dalších aberace jako například mutace BRAF a TP53 s cílem prokázat, zda mohou mít klinický význam ve smyslu nezávislých prognostických a/nebo prediktivních faktorů. Shromážděné vzorky mohou být navíc dále využíváné k detekci nových aberací v budoucnu.

• MeSH
• geny Wilmsova nádoru MeSH
• nádorový supresorový protein p53 MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• prognóza MeSH
• protoonkogenní proteiny B-raf MeSH
• testikulární nádory MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• andrologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Cathepsin B (CB) is a thiol-dependent protease that - under normal conditions - may be found in lysosomes of mammal cells. CB is studied not only for its place in physiology of protein metabolism, it is also thought to play a role in many pathological processes, such as cancer growth. Its activity in malign tumors was studied in patients with breast, lung and colorectal cancer. However, it is not known enough about its role in urological cancers. After evaluation of pre-tests of our study, we would liketo define its role as a diagnostic and prognostic marker by analysis of CB activity in cancer tissue and body fluids in large sample of patients with bladder cancer. We assume that CB could help the possibility to make a diagnosis of bladder cancer earlier and to lower the occurrence of cystoscopic examination while monitoring patients.

Katepsin B (KB) je thiol?dependentní proteáza nalézající se za normálních okolností v lysosomech savčích buněk. V popředí zájmu je katepsin B nejenom pro své fyziologické místo v metabolismu proteinů. Je mu přisuzována i významná úloha v řadě patologických procesů, včetně nádorového bujení. Jeho aktivita u maligních nádorů byla studována především u karcinomu prsu, plic a u kolorektálního karcinomu. O jeho významu u urologických nádorů je málo zpráv. Po zhodnocení průběžných výsledků naší studie chcemestanovením aktivity KB v nádorové tkáni a v tělních tekutinách u velkého souboru pacientů s karcinomem močového měchýře definovat jeho význam jako diagnostického a prognostického markeru. Předpokládáme možnost dřívejšího stanovení diagnózy karcinomu močového měchýře a snížení frekvence cystoskopických vyšetření při monitorování pacientů.

• MeSH
• ELISA MeSH
• kathepsin B diagnostické užití   krev   moč   MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory močového měchýře diagnóza   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• urologie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Flow cytometry is an important and fast method in diagnostic process of hematological malignancies. We will analyze by flow cytometry tumor cells and composition of non malignant background in children with lymphomas. The findings will be correlated withpathological investigation. Tumor tissue, bone marrow and peripheral blood will be analyzed by polychromatic flow cytometry. In all patients we will evaluate immune status at diagnosis with primary aim to exclude underlying immunodeficiency.

Průtoková cytometrie je významnou diagnostickou metodou v hematonkologii. Navrhovaný projekt má za cíl imunologicky charakterizovat nádorové buňky a složení nemaligních subpopulací u lymfomů dětského věku a porovnat nálezy s patologickou diagnostikou. Vyšetřovat budeme jak vlastní nádorovou tkáň, tak i periferní krev a kostní dřeň. Součástí diagnostického algoritmu bude rovněž zhodnocení imunitního stavu pacienta s cílem odhalit případný imunodeficit. Tímto projektem přispějeme ke zkvalitnění diagnostiky a zefektivnění léčby maligních lymfomů u dětí.

• MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• dítě MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• lymfom diagnóza   MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The subject of the study is to define possible therapy changes related to the integration of PET scanning into staging and tumor response monitoring of children with ML. The aim of the project is to refine the therapeutic strategy of childhood lymphomas.The project has the character of prospective study, and is planned for 3.5 years. Approximately 100 children and adolescents with ML are expected to be assessed repeatedly during their treatment. Results of PET examination will be compared with the results of standard imaging methods, clinical data and histology. The effect on the clinical management will be analyzed.

Předmětem projektu je definovat možné modifikace protinádorové léčby na základě využití PET vyšetření při stanovení rozsahu onemocnění před léčbou a hodnocení odpovědi na léčbu. Smyslem projektu je optimalizace léčby u dětí a dospívajích s maligními lymfomy. Projekt má charakter prospektivní studie plánované na 3,5 roku. Před léčbou, v jejím průběhu a po ní zhodnotíme průběh a efektivitu léčby u cca 100 dětí a dospívajícich s ML. Výsledky PET vyšetření (FDG-PET nebo FDG-PET/CT) porovnáme s nálezy standardních zobrazovacích metod, klinickým průběhem onemocnění a dostupnými histologickými nálezy. Zhodnotíme praktický přínos PET vyšetření pro zvýšení efektivity léčby ML.

• MeSH
• dítě MeSH
• fluorodeoxyglukosa F18 MeSH
• lymfom terapie   MeSH
• mladiství MeSH
• monitorování léčiv MeSH
• multimodální zobrazování metody   využití   MeSH
• pozitronová emisní tomografie metody   využití   MeSH
• prospektivní studie MeSH
• tomografie MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• mladiství MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Retrospectively, the expression of selected genes in patients with DLBCL will be studied from FFPE (formalin fixed, paraffin embedded) tissue. The results will be compared with immunohistochemical findings (GC and nonGC subtypes) and with clinical data and patients' survival.

V rámci retrospektivní analýzy bude studována exprese vybraných genů u nemocných s DLBCL ze vzorků RNA získaných z fixovaného v parafinu zalitého materiálu. Bude provedeno srovnání s imunohistochemickými nálezy, rozdělení do podskupin DLBCL a srovnání sklinickými daty a osudem nemocných.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• difúzní velkobuněčný B-lymfom diagnóza   genetika   MeSH
• epigeneze genetická MeSH
• exprese genu MeSH
• imunohistochemie metody   MeSH
• prognóza MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The study will verify the differences between the group of patients with HPV positive and negative oral/oropharyngeal tumors from the clinical point of view. The results of the project will contribute to earlier diagnosis especially of recurrences and more precise follow-up after treatment by means of molecular biological and serological methods. They could also influence the choice of optimal method and intensity of the treatment. Introduction of a biomarker for early diagnosis of these tumors would have substantial benefits. Results of our study will be an important contribution to the growing body of knowledge on the possible role of HPV as an etiological factor of oropharyngeal and oral cancer. The study also finds out the HPV type specific prevalence in the Czech population, which represents valuable information for the future vaccination. It also enables to specify the number of patients with HPV associated head and neck tumors in the Czech Republic.

Studie ověří, zda se z klinického hlediska skupina pacientů s HPV pozitivními nádory liší od nemocných s HPV negativními nádory. Výsledky studie přispějí k časnější diagnostice především recidiv a k přesnějšímu sledování po léčbě pomocí molekulárně biologických a sérologických metod a tím k prevenci recidiv. Mohou mít vliv i na volbu optimální léčebné metody a radikality léčby. Zlepšení základních ukazatelů výsledků onkologické léčby je evidentním přínosem z pohledu pacienta, ale i z hlediska socioekonomického. Zavedení biomarkeru pro včasnou diagnostiku těchto nádorů by mělo vliv i na snížení nákladů na léčbu. Výsledky budou významným příspěvkem k řadě výzkumů zjišťujících možnou roli HPV jako etiologického faktoru orofaryngeálního a orálního karcinomu. Studie též zjistí typovou specificitu HPV v české populaci, což představuje cennou informaci pro přípravu vakcinace v ČR. Umožní rovněž vyčíslit počet pacientů s HPV asociovanými nádory ORL oblasti v ČR.

• MeSH
• hybridizace genetická MeSH
• infekce papilomavirem diagnóza   MeSH
• lidský papilomavirus 16 MeSH
• nádory orofaryngu diagnóza   MeSH
• nádory úst diagnóza   MeSH
• následné studie MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• sérologie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• otorinolaryngologie
• virologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

To determine the differences in clinical outcome in cases with HPV positive and negative oral/oropharyngeal tumors, to determine the role of further risk factors in both groups of cases. To determine the relationship between HPV infection and regional metastatic process with respect to further parameters of lymph node affection. To determine prevalence and type of HPV DNA in the tissue removed from oropharyngeal/oral tumors by PCR, DNA hybridization and sequencing. To detect and type HPV DNA in cytological materials of patients and controls. To determine the prevalence of HPV specific antibodies, to follow the changes in antibody levels in relation to clinical outcome, to define if HPV antibodies might serve as a marker for oropharyngeal/oral cancer recurrence.

Zjistit rozdíly v klinickém průběhu u nemocných s HPV pozitivními a HPV negativními nádory, zjistit úlohu dalších rizikových faktorů v obou skupinách pacientů. Zjistit vztah HPV infekce k regionálnímu metastazování s ohledem na další parametry uzlinovéhopostižení (počet pozitivních uzlin, kapsulární ruptura). Zjistit výskyt a typ HPV DNA pomocí PCR, DNA hybridizace a sekvenování v materiálu získaném z výplachu dutiny ústní u pacientů a zdravých kontrol, u pacientů rovněž v tkáni odebrané z nádorů orofaryngu a dutiny ústní. Zjistit prevalenci specifických anti-HPV protilátek, sledovat změny v hladinách protilátek v závislosti na klinickém vývoji; definovat typ anti-HPV protilátek, které jsou nejvhodnější jako marker rizika recidivy nádoru.

• MeSH
• biologické markery krev   MeSH
• DNA virů MeSH
• nádory orofaryngu MeSH
• nádory úst MeSH
• Papillomaviridae MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• otorinolaryngologie
• histologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The subject of the study is to define the role of positron emission tomography (PET) with fluorodeoxyglucose (18FDG) for staging and follow-up of children with malignant lymphomas. The aim of the project is to refine the therapeutic strategy for childrenwith Hodgkin´s disease and non-Hodgkin´s lymphomas. The project has the character of prospective blind study, and is planned for 3 years. Approximately 40 children are anticipated to have PET study before beginning of chemotherapy, during therapy and after the completion of their treatment.

Předmětem projektu je definovat úlohu pozitronové emisní tomografie (PET) s pomocí fluorodeoxyglukosy (18FDG) v diagnostice maligních lymfomů dětí a dospívajících. Smyslem projektu je upřesnit terapeutický postup u dětí s Hodgkinovou chorobou a non-Hodgkinskými lymfomy. Projekt má charakter prospektivní slepé studie plánované na 3 roky. Předpokládá se opakované PET vyšetření cca 40 dětí před léčbou, v jejím průběhu a po ní a vzájemné porovnání nálezů včetně kvantifikace.

• MeSH
• dítě MeSH
• fluorodeoxyglukosa F18 MeSH
• Hodgkinova nemoc diagnóza   terapie   MeSH
• lymfoproliferativní nemoci diagnóza   MeSH
• mladiství MeSH
• pozitronová emisní tomografie metody   využití   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• mladiství MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pediatrie
• hematologie a transfuzní lékařství
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

To detect prevalence and type of HPV in the tissue removed from oropharyngeal/oral carcinoma by PCR,DNA hybridization and sequencing.To detect in the same group of patients and in the group of controls presence and type of HPV in cytology material. To determine whether presence and type of HPV is an independent risk factor of oropharyngeal/oral cancer.To determine whether some other factors (kife style and habits) are also an independent risk factors of oropharyngeal/oral cancer. To determine the presence of HPV antibodies in cancer patients and in healthy controls. To follow-up the antibody level in relation to clinical outcome.To find out whether HPV antibodies might serve as a marker for oropharyngeal/oral cancer risk or for its recurrence.

Zjistit výskyt a typ HPV v tkáni odebrané z nádorů orofaryngu a dutiny ústní pomocí PCR a DNA hybridizace a sekvenace. U stejných pacientů a u zdravých kontrol zjistit výskyt a typ HPV v cytologickém materiálu získaném z výplachu dutiny ústní. Zjistit, zda přítomnost a typ HPV je nezávislým rizikovým faktorem vzniku orofaryngeálního a orálního karcinomu. Zjistit, zda některé další faktory (životní styl a návyky) jsou také nezávislými rizikovými faktory pro vznik těchto nádorů. U pacientů s nádory a u zdravých kontrol zjistit prevalenci protilátek proti HPV. Sledovat hladinu protilátek v závislosti na klinickém vývoji. Zjistit, zda přítomnost anti-HPV protilátek může sloužit jako marker rizika vzniku karcinomu nebo jeho recidivy.

• MeSH
• hybridizace genetická MeSH
• infekce papilomavirem MeSH
• nádory orofaryngu MeSH
• orální zdraví MeSH
• Papillomaviridae MeSH
• polymerázová řetězová reakce MeSH
• rizikové faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• otorinolaryngologie
• onkologie
• virologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR