Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
The motive of this multidisciplinary research project is to obtain new knowledge in the field of predictive and prognostic biomarkers of pancreatic cancer, usable for rapid and economical screening of patients and for the treatment individualization. One of the aims is to establish the genetic profile of individual patients with pancreatic cancer using exome sequencing of specific genes of carcinogenesis and the division of patients into well-defined subgroups (molecular subtypes) with different biological behavior of the tumor. Another aim is to verify phenotypic profile of chemoresistance of pancreatic cancer observed in our previous studies by the analysis of gene and protein expressions and correlation of the results with different molecular subtypes. Partial aim is also to evaluate the mechanism of action of validated biomarkers using in silico prediction and functional tests. The proposed approach is at internationally competitive levels and fully met the priorities of Program Domains 07.01 Rare diseases and 1.3. Cancer (subdomains 1.7.2., 2.2.2., and 1.3.2).
Motivem tohoto multidisciplinárního výzkumného projektu je získání nových poznatků v oblasti prediktivních a prognostických biomarkerů karcinomu pankreatu, využitelných pro rychlý a ekonomicky výhodný screening pacientů a pro individualizaci jejich léčby. Jedním z cílů je stanovení genetických profilů jednotlivých pacientů s karcinomem slinivky břišní pomocí exomového sekvenování specifických genů karcinogeneze, tedy rozdělení nemocných do úzce definovaných skupin (molekulárních podtypů) s rozdílným biologickým chováním nádoru. Dalším cílem je ověření fenotypového profilu chemorezistence karcinomu pankreatu, zjištěného v našich předchozích studiích na základě analýzy exprese transkriptů a proteinů, a korelace výsledků s jednotlivými molekulárními podtypy. Dílčím cílem je rovněž vyhodnocení mechanismu účinku validovaných biomarkerů pomocí in silico predikcí a funkčních stanovení. Navrhovaný přístup je na mezinárodně konkurenceschopné úrovni a plně v souladu s prioritami 1.7. Vzácná onemocnění a 1.3. Nádorová onemocnění (1.7.2., 2.2.2. a 1.3.2) Programu zdravotnického výzkumu.
- MeSH
- chemorezistence MeSH
- fenotyp MeSH
- individualizovaná medicína MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza genetika terapie MeSH
- prognóza MeSH
- sekvenování exomu MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- gastroenterologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
Cancers of the upper GIT are common but very difficult to treat cancers. The prognosis of patients with tumors of the upper GIT is uncertain and treatment options are limited. Currently, there is intensive search for biomarkers that allow early diagnosis and monitoring of response to treatment. The project will create a database of patients with cancers of the upper GIT. Intraoperative or endoscopically removed tumor material will be archived in a tumor bank for subsequent validation studies, and part, after processing will be transplanted subcutaneously into immuno-deficient mice which will serve as a model for finding biomarkers. The mouse serum will be subject to the mass spectrometric method (LC-MS/MS, MALDI) to identify human secretory heterologous proteins, released from the transplanted tumor. These proteins will be evaluated and validated for their potential as biomarkers of cancer and thus contribute to earlier diagnosis and improved prognosis of these diseases.
Karcinomy horního gastrointestinálního traktu jsou častým a velmi obtížně léčitelným nádorovým onemocněním. Prognóza pacientů s nádory horního GITu je nejistá, léčebné možnosti omezené. V současnosti probíhá intenzivní hledání biomarkerů, které umožní včasnou diagnostiku a sledování odpovědi na léčbu. V rámci projektu bude vytvořena databáze pacientů s karcinomy horního GITu. Peroperačně nebo při endoskopických výkonech bude odebírán nádorový materiál, který bude archivován v nádorové bance pro pozdější validační studie, a částečně po zpracování bude transplantován imunodeficitním myším, které budou sloužit jako model pro hledání biomarkerů. V myším séru budou hmotnostně spektrometrickými metodami (LC-MS/MS, MALDI) identifikovány heterologní lidské proteiny, uvolněné z transplantovaného nádoru. U těchto proteinů bude hodnocen a validován jejich potenciál stát se biomarkery nádorových onemocnění a přispět ke včasnější diagnostice a tím ke zlepšení prognózy onemocnění.
- MeSH
- banky biologického materiálu MeSH
- gastrointestinální nádory MeSH
- hmotnostní spektrometrie MeSH
- horní gastrointestinální trakt MeSH
- miniinvazivní chirurgické výkony MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- nádory jícnu diagnóza MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza chirurgie terapie MeSH
- nádory žaludku diagnóza MeSH
- proteomika MeSH
- registrace MeSH
- výzkumné techniky MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- gastroenterologie
- onkologie
- biologie
- chirurgie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
Molecular profiles of subpopulations of tumor cells, CTC (circulating tumor cells (CTC) are means of identifying individual changes in cancerogenesis and sensitivity to treatment (so-called "real time" tumor biopsy). The aim is to divide the patients into prognostic groups according to the CTC examination and to identify specific biomarkers of resistance - chemoresistance in tumor cells (CTC) by means of qPCR and digital PCR. Quite innovative is the use of CTC-cultivation in vitro for determining further treatment in patients with colorectal cancer and pancreatic cancer.
Profily subpopulací cirkulujícíh nádorových buněk (circulating tumor cells (CTC) představují prostředek identifikace individuálních změn v kancerogenezi a citlivosti na léčbu (tzv. “real-time” nádorová biopsie). Cílem je pomocí identifikace CTC rozdělit pacienty s CRC a PAC do prognostických skupin. a dentifikovat specifické biomarkery rezistence - chemorezistence CTC pomocí qPCR a digitální PCR. Zcela inovativní je využití CTC- kultivace in vitro v určování další léčby u pacientů s karcinomem kolorekta a pankreatu.
- MeSH
- biopsie MeSH
- chemorezistence MeSH
- gastrointestinální nádory diagnóza MeSH
- individualizovaná medicína MeSH
- kolorektální nádory diagnóza MeSH
- kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
- nádorové cirkulující buňky MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza MeSH
- prognóza MeSH
- simulace molekulového dockingu MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- gastroenterologie
- onkologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
xv, 96 stran : barevné ilustrace ; 24 cm
- MeSH
- cytodiagnostika MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza klasifikace MeSH
- nemoci slinivky břišní diagnóza klasifikace MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- endokrinologie
- gastroenterologie
- cytologie, klinická cytologie
- NLK Publikační typ
- kolektivní monografie
12 stran : ilustrace ; 21 cm
Informační brožura o rakovině slinivky.
- MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza prevence a kontrola MeSH
- primární prevence MeSH
- sekundární prevence MeSH
- Publikační typ
- populární práce MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- gastroenterologie
- onkologie
- NLK Publikační typ
- informační publikace
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
56 l. : il., tab. ; 31 cm
Annotation I: Evaluation of sensitivity and specificity of PET/CT in the preoperative and postoperative diagnosis of pancreatic cancer. Annotation II: Effect on the indications for surgery using preoperative staging by PET/CT, assessment of economic benefits by reducing the number of non-indicated operations. Annotation III: Comparison of the current staging using PET/CT as the sole test for pancreatic cancer. Annotation IV: Assessment of ultrastructual mitochondrial changes of the tumour cells in relation to hypoxia, which could be important for predicting the sensitivity of these cells (pancreatic adenocarcinoma) to treatment.
Anotace I: Zhodnocení sensitivity a specificity PET/CT v předoperační a pooperační diagnostice karcinomu pankreatu. Anotace II: Ovlivnění indikace k chirurgickému výkonu předoperačním ostážováním pomocí PET/CT, zhodnocení ekonomického přínosu snížením neindikovaných operací. Anotace III: Porovnání současného stagingu se stagingem pomocí PET/CT jako jediného vyšetření u karcinomu pankreatu. Anotace IV: Zhodnocení změn ultrastrukturálního obrazu mitochondrií nádorových buněk ve vztahu k hypoxii, které bymohly být důležité při predikci citlivosti těchto buněk (adenokarcinomu pankreatu) na léčbu.
- MeSH
- hypoxie MeSH
- inzulární karcinom pankreatu ekonomika chirurgie MeSH
- mitochondrie ultrastruktura MeSH
- molekulární patologie MeSH
- multimodální zobrazování metody využití MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza chirurgie terapie MeSH
- staging nádorů MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- chirurgie
- gastroenterologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Jessenius
212 s. : il., tab. ; 24 cm
- MeSH
- cytodiagnostika metody MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza MeSH
- nemoci slinivky břišní diagnóza MeSH
- pankreas cytologie MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- senzitivita a specificita MeSH
- tenkojehlová biopsie metody trendy využití MeSH
- Publikační typ
- monografie MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- cytologie, klinická cytologie
- gastroenterologie
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
Přeruš. str. : il., tab. ; 30 cm
Aim of the study: Recently appearing diabetes mellitus can be the very first symptom of otherwise asymptomatic pancreatic cancer. Methodology: 1. Formation of study group of cca 100 patients with recently diagnosed atypical (labile) diabetes mellitus. 2.Complex diabetologic laboratory testing, including the determination of diabetogenic factors. 3. Electrogastrography to exclude diabetic gastroparesis as a etiological factor of the lability of diabetes. 4. Endosonography of the pancreas to detect asymptomatic pancreatic tumors. In case of presence of suspect focal changes fine needle aspiration biopsy to obtain cytologically verified diagnosis.
Předmět řešení: Nově se objevující diabetes mellitus může být prvním příznakem jinak asymptomatického karcinomu pankreatu. Metodika: 1. Vytvoření souboru cca 100 pacientů s recentně diagnostikovaným atypickým (labilním) diabetem. 2. Komplexní laboratornídiabetologické vyšetření, včetně stanovení diabetogenních faktorů v séru, k určení typu diabetu. 3. Elekrogastrografické vyšetření k vyloučení diabetické gastroparézy s následnou labilitou diabetu na podkladě dysmotility žaludku s nepravidelnou evakuacíobsahu do střeva. 4. Endosonografické vyšetření pankreatu k detekci asymptomatických tumorů pankreatu. V případě suspektního nálezu provedení tenkojehlové biopsie ke stanovení diagnózy.
- MeSH
- diferenciální diagnóza MeSH
- elektrofyziologie MeSH
- endosonografie MeSH
- gastrointestinální motilita MeSH
- komplikace diabetu MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza etiologie MeSH
- tenkojehlová biopsie MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- diabetologie
- onkologie
- gastroenterologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR