• MeSH
• karbapenemy farmakologie   aplikace a dávkování   MeSH
• monobaktamy farmakologie   aplikace a dávkování   MeSH

• Konspekt
• Farmacie. Farmakologie
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• farmacie a farmakologie

• MeSH
• karbapenemy biosyntéza   chemie   farmakologie   MeSH
• Publikační typ
• vysokoškolské kvalifikační práce MeSH

• Konspekt
• Farmacie. Farmakologie
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• chemie, klinická chemie
• farmacie a farmakologie

• MeSH
• farmakoterapie MeSH
• karbapenemy MeSH
• Publikační typ
• kongresy MeSH

• Konspekt
• Farmacie. Farmakologie
• NLK Obory
• farmakoterapie
• farmacie a farmakologie

Šíření multirezistentních bakterií, především Enterobacteriaceae produkujících karbapenemázy a multirezistentních pseudomonád, představuje významné ohrožení dalšího rozvoje medicíny zejména u kriticky nemocných pacientů. Projekt je zaměřen na molekulárně-epidemiologickou analýzu klinicky/epidemiologicky významných genů rezistence a mobilních elementů, na nichž jsou kódovány, u enterobakterií a pseudomonád, jejich rozšíření v nemocničních zařízeních, difúzi do prostředí prostřednictvím odpadní vody a kolonizaci/infekci volně žijících zvířat, především vodního ptactva. Během řešení projektu budou zpracovávány pouze bakteriální izoláty (nikoliv primární pacientské vzorky). Tyto izoláty jsou anonymizovány. Z toho důvodu není vyžadován informovaný souhlas. Získaná data budou publikována v mezinárodních časopisech a popularizována pro využití mikrobiology a infekčními lékaři. Zároveň budou využita k výuce v magisterském (MUDr., MDDr., MVDr.) a doktorském (Ph.D.) studijním programu.; Multiresistant bacteria, especially of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae and multiresistant Pseudomonas spp. is a threat to current medicine, significantly reducing treatment options in critically ill patients. The project is focused on molecular-epidemiological typing of clinically/epidemiologically important resistance genes encoded on mobile genetic elements in Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp., spreading in bacterial populations in health-care settings, diffusing into the environment by sewage water and colonizing/infecting wildlife, especially water birds. In the project, only bacterial isolates (not primary clinical samples) will be used. All these isolates will be collected anonymously, therefore, patients informed consent will not be a prerequisite for further molecular analysis. Obtained data will be published in international journals, popularized for microbiologists and infectious-disease specialists; and used for education of M.D., D.V.M. and Ph.D. students.

• MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• Enterobacteriaceae rezistentní na karbapenemy MeSH
• Enterobacteriaceae MeSH
• farmakoepidemiologie MeSH
• fluorochinolony MeSH
• karbapenemy MeSH
• Pseudomonas MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Detailní geneticko-populační analýza s cílem získat komplexní informaci o stavu, povaze a způsobech šíření rezistence ke karbapenemům u klinických izolátů A. baumannii v České republice. Bude vytvořen soubor reprezentující současnou populaci klinicky významných kmenů, určena prevalence rezistence ke karbapenemům a ostatním léčebně významným antibiotikům. Budou identifikovány enzymatické mechanismy a prostudována molekulární epidemiologie rezistence ke karbapenemům.; Detailed genetic population analysis with the aim to obtain comprehensive information on the status, nature and modes of spread of resistance to carbapenems in clinically relevant A. baumannii strains in the Czech Republic. A set representative of the current population of clinically relevant strains will be selected and the current resistance prevalence to carbapenems and other relevant antibiotics will be determined. Enzymatic mechanisms of carbapenem resistance will be identified and molecular epidemiology of this resistance will be studied.

• MeSH
• Acinetobacter baumannii MeSH
• buněčné klony MeSH
• epidemiologické metody MeSH
• fyziologie bakterií MeSH
• genotyp MeSH
• karbapenemy MeSH
• mnohočetná léková rezistence MeSH
• prevalence MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Mikrobiologie
• NLK Obory
• epidemiologie
• infekční lékařství
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• veřejné zdravotnictví
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Problematika multirezistencie baktérií na antibiotiká nadobúda v súčasnosti pandemický charakter. Výskyt bakteriálnych kmeňov s klinicky a epidemiologicky významnými mechanizmami rezistencie produkujúcich karbapenemázy je novým a nebezpečným fenoménom pozorovaným na Slovensku od konca roka 2013. Baktérie produkujúce tieto enzýmy sú schopné degradovať účinok antibiotík, čím sa liečba v súčasnosti dostupnými antibiotikami stáva neúčinnou. V roku 2014 bolo MZ SR vypracované Odborné usmernenie, ktoré zahŕňa organizačné a protiepidemiologické postupy eliminujúce proces šírenia týchto nebezpečných kmeňov. Organizačné opatrenia sú zamerané na vzdelávanie zdravotníckych pracovníkov, podmienky laboratórnych analýz a materiálno– technické vybavenie pre osobitný ošetrovateľský režim. Protiepidemiologické postupy zahŕňajú vstupný laboratórny skríning, včasnú identifikáciu a izoláciu rizikového pacienta a účinné hygienické postupy. K povinnosti poskytovateľa patrí hlásenie výskytu týchto nebezpečných bakteriálnych kmeňov.

The issue of bacterial multiresistance to antibiotics is currently pandemic. The emergence of bacterial stems with clinically and epidemiologically important resistance mechanisms producing carbapenemases is a new and dangerous phenomenon observed in Slovakia since the end of 2013. The bacteria producing these enzymes can degrade the effect of antibiotics, making current treatment with available antibiotics ineffective. In 2014, the Ministry of Health of the SR prepared the Expert Guideline, which includes organizational and anti-epidemiological procedures eliminating the process of spreading these dangerous stems. Organizational measures are focused on educating of health care workers, on conditions of laboratory analyses and material-technical equipment for the distinct nursing regimen. Anti-epidemiological procedures include initial laboratory screening, early identification and isolation of the patient at risk and effective hygiene procedures. It is the responsibility of the provider to report the presence of these dangerous bacterial stems.

• MeSH
• bakteriální infekce epidemiologie   klasifikace   komplikace   ošetřování   prevence a kontrola   přenos   terapie   MeSH
• karbapenemy škodlivé účinky   MeSH
• mnohočetná bakteriální léková rezistence MeSH
• nemocnice MeSH

Narůstající incidence bakterií rezistentních k antibiotikům poslední volby představuje jeden z nejvýznamnějších medicínských problémů, který komplikuje úspěšnou léčbu život ohrožujících infekcí. V rámci navrhovaného projektu bude provedena molekulárně-epidemiologická/genomická analýza Enterobacterales produkujících karbapenemázy (CPE) izolovaných z pacientů hospitalizovaných v českých nemocnicích a srovnání s bakteriální populací citlivou ke karbapenemům. S využitím nejmodernějších postupů celogenomového sekvenování a bioinformatické analýzy budou identifikovány jedinečné rysy CPE, vysoce rizikové klony se zvýšeným významem pro zdraví populace a mobilní genetické elementy spojené s šířením rezistence ke karbapenemům v nemocnicích. Komplexní genomická analýza umožní popsat genetickou strukturu sledovaných bakteriálních populací včetně její dynamiky prostřednictvím mikroevolučních změn během šíření nemocničních nákaz. Výsledky projektu budou bezprostředně využity pro zlepšení a zpřesnění diagnostiky infekčních nemocí a návrh účinnějších postupů v prevenci a kontrole šíření patogenů.; Growing incidence of bacteria resistant to last-line antibiotics represents one of the most important medical issue, complicating the successful treatment of life-threatening infections. In this project, molecular-epidemiological and genomic analysis of carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) isolated from patients in Czech hospitals and its comparison with the carbapenem-susceptible population will be performed. Whole genome sequencing and bioinformatics analysis will allow to identify specific features of CPE, high-risk clones with increased importance for public health and mobile genetic elements associated with the dissemination of resistance to carbapenems in hospitals. Complex genomic analysis will reveal genetic structure of the studied bacterial populations including their dynamics through microevolutionary changes in the clinical context of a hospital outbreak. The project outcomes will be used to improve the diagnostics of infectious diseases and to outline effective interventions for the prevention and control of the transmission of bacterial pathogens.

• Klíčová slova
• Whole-genome sequencing, antibiotic resistance, antibiotická rezistence, karbapenemy, populační studie, carbapenems, genomika, genomics, Enterobacterales, celogenomová sekvenace, Enterobacterales, population study,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Rostoucí incidence gramnegativních bakterií rezistentních k antibiotikům poslední volby, karbapenemům a kolistinu, představuje jeden z nejzávažnějších problémů současné medicíny. Do nedávna byly tyto rezistentní bakterie nacházeny zejména u hospitalizovaných pacientů, v posledních letech je však pozorováno jejich šíření mezi zvířaty a v prostředí. Projekt je zaměřen na sledování zdrojů a cest šíření plazmidově kódované rezistence ke karbapenemům a kolistinu u Enterobacteriaceae z člověka, potravinových zvířat, potravin, prostředí a volně žijících živočichů v České republice. Selektivní kultivace rezistentních izolátů bude doplněna komplexní molekulárně-epidemiologickou typizací, celogenomovým sekvenováním a komparativní analýzou plazmidů. Bude zhodnocen význam potravinového řetězce a prostředí jako sekundárních zdrojů bakterií s klinicky významnými mechanizmy rezistence a rizika pro veřejné zdraví. Budou studovány faktory přispívající k jejich selekci a udržování v humánních i nehumánních zdrojích a navržena opatření k omezení jejich šíření.; Growing incidence of Gram-negative bacteria resistant to drugs of last resort, carbapenems and colistin, represents one of the major issues of current medicine. Until recently, these bacteria were associated mainly with hospitalized patients, however, their spreading among animals and in the environment is being increasingly reported over last years. The project is focused on the evaluation of sources and transmission pathways of Enterobacteriace carrying plasmid-mediated genes for resistance to colistin and carbapenems in humans, food-producing animals, food, the environment and wildlife in the Czech Republic. Selective cultivation of resistant isolates will be followed by complex molecular-epidemiological typing, whole-genome sequencing and comparative plasmid analysis. The role of food chain and the environment as secondary reservoirs of clinically relevant resistance mechanisms and risks for public health will be determined. Factors favouring their selection and maintenance in human and non-human sources will be evaluated, and interventions to limit their spread will be proposed.

• MeSH
• antibakteriální látky MeSH
• bakteriální léková rezistence MeSH
• bioznečištění MeSH
• Enterobacteriaceae účinky léků   MeSH
• karbapenemy MeSH
• kolistin MeSH
• One Health MeSH
• plazmidy MeSH
• rizikové faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• environmentální vědy
• bakteriologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• antibiotická rezistence MeSH
• infekce spojené se zdravotní péčí farmakoterapie   MeSH
• karbapenemy aplikace a dávkování   terapeutické užití   MeSH
• ventilátorová pneumonie MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství

• MeSH
• antibakteriální látky aplikace a dávkování   farmakokinetika   farmakologie   MeSH
• bakteriální infekce farmakoterapie   MeSH
• karbapenemy farmakokinetika   farmakologie   terapeutické užití   MeSH
• management farmakoterapie trendy   MeSH
• Publikační typ
• směrnice MeSH

• Konspekt
• Farmacie. Farmakologie
• NLK Obory
• infekční lékařství
• farmacie a farmakologie