Biological effects of manumycin-related compounds will be tested using a tissue culture models with human monocyte/macrophages (THP-1) and epithelial cell lines. For a screening of potential effect of tested compounds on pro-inflammatory cytokines and chemokines production, multiplex qRT-PCR will be used followed by measurement of proinflammatory cytokine concentrations, immunophenotypying and functional tests. Genetic screening will be used for identification of streptomycete strains producing manumycine-related compounds with consequent isolation and characterization of new compounds, construction of cosmid libraries, and genetic manipulations with the upper polyketide chain of manumycins (length, branching, saturation) including gene shuffling between producers.

Biologické účinky látek manumycinového typu budou testovány pomocí modelu tkáňových kultivací s lidskými liniemi monocytů/makrofágů (THP-1) a epiteliálních linií. Pro screening potenciálního efektu testovaných látek na tvorbu prozánětlivých cytokinů a chemokinů bude využita multiplexová kvantitativní RT-PCR s následným měřením koncentrací cytokinů, imunofenotypizací a funkčními testy. Kmeny streptomycet produkující manumycinové látky budou identifikovány pomocí genového screeningu, bude provedena izolace a charakterizace nových látek, konstrukce kosmidových knihoven a genetická manipulace horního polyketidového řetězce manumycinů (délka, štěpení, saturace) včetně genového "shufflingu" mezi producenty.

• MeSH
• azithromycin MeSH
• cytokiny MeSH
• epitelové buňky MeSH
• genetické techniky MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• imunomodulace MeSH
• klarithromycin MeSH
• kosmidy MeSH
• makrofágy MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• Streptomyces MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• biologie
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

1. It will be determined whether polymorphisms in above mentioned genes participate in the genetic predisposition to lower weight loss after diet and physical intervention. 2. To characterize, in a Czech population, the frequencies of alleles in the genes for AHSG, receptor neuropeptide Y and preproorexin. To determine whether genetic variants correlate with BMI and/or WHR.

1.Studium polymorfizmů v genu pro varianty Met/Met v genu pro AHSG, v genu pro receptor neuropeptidu Y 585T>C:T a varianta v promotoru preproorexinu s variantou -909C>T rozšíří naše dosud ne příliš rozsáhlé znalosti o genetické determinaci tělesné hmotnosti. 2.Bude zjištěno, zda se varianty ve vyjmenovaných genech podílí na genetické predispozici k nižšímu poklesu váhy po intervenci dietou a fyzickou aktivitou. 3. Bude zjištěno, a to na rozsáhlém (2600 jedinců) homogenním reprezentativním vzorku české populace, zda varianty Met/Met v genu pro AHSG, v genu pro receptor neuropeptidu Y 585T>C:T a varianty v promotoru preproorexinu s variantou -909C>T, hrají roli v genetické determinaci tělesné hmotnosti .

• MeSH
• fetuin A MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• kardiovaskulární nemoci prevence a kontrola   MeSH
• obezita patofyziologie   MeSH
• pohyb MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• pro-opiomelanokortin MeSH
• redukční dieta MeSH
• ženy MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• vnitřní lékařství
• biologie
• kardiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Those with inherited mutations in the BRCA2 gene have a higher susceptibility to breast, ovarian, pancreatic and other cancer types. The presence of a pathogenic mutation requires lifelong follow-up in order to diagnose their cancer early or even preventit by an organ resection. Missense variants causing only a subtle change of one amino acid are commonly found. It has yet been difficult or impossible to evaluate the clinical significance of such variants. In our study, we will apply a novel in vitro technique to predict clinical significance of BRCA2 variants by evaluating them in functional assays. Application of this technique into clinical practice has a potential to influence the future management of carriers of inherited mutations in the BRCA2 gene.

Osoby s vrozenými mutacemi v BRCA2 genu mají výrazně zvýšenou pravděpodobnost vzniku karcinomu prsu, ovarií, pankreatu či jiných orgánů. Přítomnost patogenní mutace je důvodem k jejich podrobnému sledování ve snaze zachytit nádorové onemocnění včas či dokonce k preventivnímu odstranění rizikového orgánu. Vedle jednozančně patogenních mutací jsou často zjišťovány varianty vedoucí pouze ke změně jedné z aminokyselin, u kterých bylo doposud obtížné či nemožné určit jejich klinický význam. V naší studii budeme aplikovat nově vytvořenou funkční in vitro techniku ke zjištění funkce a klinického významu variant BRCA2 genu. Aplikace této techniky do klinické praxe má potenciál zásadním způsobem ovlivnit budoucí osud pacientů s vrozenými BRCA2 mutacemi.

• MeSH
• geny BRCA2 MeSH
• hodnocení rizik MeSH
• mutace genetika   MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• nádory prsu MeSH
• nádory slinivky břišní MeSH
• nádory vaječníků MeSH
• protein BRCA2 analýza   MeSH
• zárodečné mutace MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biologie
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Under this project, 75 renal graft recipients at risk of developing rejection will be monitored prospectively (at predefined intervals) for the presence of naturally occurring (CD4+CD25+FoxP3+) as well as the degree of expression of mRNA of the gene FoxP3, TOAG and alpha2 mannosidase genes in peripheral blood. Graft biopsy specimens will be analyzed for the expression of the same biomarker genes and proteins. As the above biomarkers are associated with a reduced immune recipient-versus-graft reaction, the expression of these biomarkers will be correlated with renal function, incidence of acute rejection episodes and, finally, with graft survival over the first year post-transplant. The study population will include patients treated using 2 defined immunosuppressive protocols (a triple combination with ATG induction in patients with panel reactive antibody (PRA) >50% (n=25) and in those treated using a triple combination of immunosuppressives (n=50) with PRA <50%.

V tomto projektu bude u 75 nemocných po transplantaci ledviny v riziku rejekce prospektivně sledována (v definovaných intervalech) přítomnost přirozeně se vyskytujících regulačních T lymfocytů (CD4+CD25+FoxP3+) stejně tak jako míra exprese mRNA genu proFoxP3, TOAG a alfa2 manosidázu v periferní krvi. Budou studováni nemocní léčení 2 definovanými imunosupresivními režimy (3-kombinace imunosupresiv (TAC, MMF, steroidy) s indukcí ATG u nemocných s panelreaktivními protilátkami (PRA) >50% (n=25) a nemocníléčení stejnou trojkombinací imunosupresiv (n=50) s PRA<50%, kteří nebudou léčeni indukční imunosupresí. V biopsiích štěpů bude analyzována exprese genů stejných biomarkerů a také jejich proteinů. Uvedené biomarkery jsou spojeny se sníženou imunitní reakcí příjemce proti štěpu a proto bude provedena korelace expresí těchto biomarkerů s renální funkcí, výskytem akutních rejekcí a konečně i s přežitím štěpů v průběhu prvního roku po transplantaci ledviny.

• MeSH
• biologické markery analýza   krev   MeSH
• biopsie MeSH
• diagnostické techniky molekulární metody   využití   MeSH
• exprese genu MeSH
• forkhead transkripční faktory MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• regulační T-lymfocyty MeSH
• separace buněk MeSH
• transplantace ledvin MeSH
• transplantační tolerance MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• transplantologie
• nefrologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

To monitor the levels of BK viral DNA in the serum and urine in renal transplant recipients. To demonstrate, using molecular biology methods - analysis of expression of selected proinflammatory genes, that monitoring of the level of expression of selected genes of proinflammatory cytokines in the urine of patients with active BKV infection in combination with determination of the number of BKV copies is a suitable diagnostic tool for predicting the long-term fate of the kidney graft. To establish whether there is a relation between the levels of expression of these genes in the urine and in the renal parenchyma biopsy sample.

Monitorace hladin BK virové DNA v séru a moči u pacientů po transplantaci ledviny. Molekulárně biologickými metodami (analýza exprese vybraných genů pro cytokiny a chemokiny) prokázat, že sledování míry exprese vybraných genů cytokinů v moči pacientů s aktivní BKV infekcí v kombinaci se stanovením počtu kopií BKV je vhodným diagnostickým nástrojem pro predikci dlouhodobého osudu transplantované ledviny. Zjistit zda existuje vztah mezi mírou exprese genů pro cytokiny a chemokiny v moči a v bioptické tkáni transplantované ledviny.

• MeSH
• časná diagnóza MeSH
• chemokiny analýza   sekrece   MeSH
• cytokiny analýza   sekrece   MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• DNA virů analýza   krev   moč   MeSH
• exprese genu MeSH
• imunologické faktory MeSH
• imunosupresivní léčba MeSH
• nemoci ledvin diagnóza   MeSH
• polyomavirové infekce MeSH
• prognóza MeSH
• transplantace ledvin imunologie   MeSH
• virus BK patogenita   MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• nefrologie
• virologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Determination of the prevalence, development and importance of liver transplant steatosis based on retrospective/prospective follow-up of liver transplant recipients. A histologically-based study. The involvement and importance of factors implicated in theory of two hits of the onset of steatosis: polymorphisms of genes crucial for oxidative stress, hepatocyte apoptosis, and onset of fibrosis (IL-1, IL-6, IL-10, TNF-alpha, activated caspase 3 and 7) and the effect of immunosuppression. Evaluation will be made by comparing values obtained from subjects and paired controls including standard protocol-based biopsy specimens from both study arms.

Hodnocení prevalence, vývoje a významu steatózy jaterního štěpu na základě retrospektivně-prospektivního sledování pacientů po transplantaci jater. Histologicky doložená studie. Budeme zkoumat uplatnění a význam faktorů významných v teorii dvojího zásahuvzniku steatózy: polymorfizmy genů se zásadním významem pro oxidační stress, apoptózu jaterních buněk a vznik fibrózy (IL-1 IL-6, IL-10, TNF-alfa, aktivovaná caspasa 3 a 7) a vlivu podávané imunosuprese. Hodnocení provedeme porovnáním zjištěných hodnotprobandů a párových kontrol včetně standardně prováděných protokolárních biopsii v obou větvích.

• MeSH
• analýza přežití MeSH
• apoptóza MeSH
• biopsie metody   využití   MeSH
• fibróza MeSH
• imunosupresiva MeSH
• interleukin-1 analýza   genetika   MeSH
• interleukin-10 analýza   genetika   MeSH
• inzulinová rezistence MeSH
• kaspasa 3 analýza   genetika   MeSH
• kaspasa 7 analýza   genetika   MeSH
• oxidační stres MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• prospektivní studie MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• TNF-alfa analýza   genetika   MeSH
• transplantace jater MeSH
• ztučnělá játra etiologie   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hepatologie
• transplantologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

To get to know pathophysiology of acute and chronic humoral rejection at the molecular level using analysis of intrarenal expression of TGF-ß1, TNF-alfa, RANTES,MC-1, HO-1, CD3, CD20 and IgJ genes. To assess the effect of upregulation of inflammatory cytokines or markers of invasion by thymocytes or B-lymphocytes at the time of biopsy on future development of renal graft dysfunction or failure.

Poznání patofyziologie akutní a chronické humorální rejekce na molekulární úrovni pomocí analýzy intrarenální exprese genů pro TGF-ß1, TNF-alfa, RANTES,MC-1, HO-1, CD3, CD20 a IgJ. Sledování vlivu výše exprese prozánětlivých cytokinů nebo markerů invazethymocyty nebo B-lymfocyty v době biopsie na budoucí výskyt dysfunkce nebo selhání transplantované ledviny.

• MeSH
• biopsie MeSH
• exprese genu MeSH
• HLA antigeny MeSH
• komplement 4 MeSH
• rejekce štěpu patofyziologie   MeSH
• transplantace ledvin MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• transplantologie
• nefrologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The project is designed to study the dynamics of inflammation and regeneration mediators in patients with liver failure during mechanical assisted management of liver failure using fractionated plasma separation and adsorption.

Akutní selhání jater provází zvýšení plazmatických koncentrací prozánětlivých cytokinů přispívajících k rozvoji syndromu multiorgánového selhání. Předmětem projektu je studium dynamiky mediátorů zánětu a regenerace u pacientů se selháním jater během podpůrné přístrojové terapie jaterního selhání založené na frakcionované plazmatické separaci a adsorbci.

• MeSH
• akutní selhání jater MeSH
• přežití MeSH
• regenerace jater MeSH
• sorpční detoxikace metody   využití   MeSH
• transplantace jater MeSH
• zánět MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hepatologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Determine correlation among intrarenal expression of MCP-1, RANTES, TGF-beta1, HGF and BMP genes, infiltration of leukocyte into renal tissue, proteinuria and short term otcome of IgA nephropathy. Find out if patients with genotype related to high inflammatory cytokines production are in higher risk for higher proteinuria and progression of IgA nephropathy.

Sledovat korelaci mezi intrarenální expresí genů pro MCP-1, RANTES, TGFbeta1, HGF a BMP, infiltací ledvinné tkáně leukocyty, výší proteinurie a progrese IgA nefropatie Zjistit, zda nositelé vlohy pro vysokou produkci prozánětlivých cytokinů mají vyšší riziko vzniku klinicky závažné proteinurie a progrese IgA nefropatie

• MeSH
• biopsie MeSH
• chronická nemoc MeSH
• exprese genu MeSH
• fibróza MeSH
• IgA nefropatie MeSH
• proteinurie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• urologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The expression of genes that respond to dietary cholesterol and those responsible for development of hypercholesterolemia will be studied in experimental model of diet induced hypercholesterolemia - Prague hereditary hypercholesterolemic (PHHC) rat. Themechanism of increase in cholesterol concentration in VLDL, IDL, and LDL after dietary cholesterol load will be studied in experimental model of diet induced hypercholesterolemia - Prague hereditary hypercholesterolemic (PHHC) rat.

Exprese genů, které odpovídají na dietní cholesterol, a genů, které jsou odpovědné za rozvoj hypercholesterolémie, bude studována na modelu dietou indukované hypercholesterolémie - u Pražského hereditárně hypercholesterolemického (PHHC) potkana. Budou studovány mechanismy vedoucí k vzestupu koncentrace cholesterolu ve VLDL, IDL a LDL u Pražského hereditárně hypercholesterolemického (PHHC) potkana po zátěži dietním cholesterolem.

• MeSH
• cholesterol dietní MeSH
• experimenty na zvířatech MeSH
• exprese genu MeSH
• hypercholesterolemie MeSH
• játra metabolismus   MeSH
• krysa rodu rattus MeSH
• lipoproteiny IDL MeSH
• lipoproteiny LDL MeSH
• lipoproteiny VLDL MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• krysa rodu rattus MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• vnitřní lékařství
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR