• Je něco špatně v tomto záznamu ?

Evaluation of reference genes and normalization strategy for quantitative real-time PCR in human pancreatic carcinoma

B. Mohelnikova-Duchonova, M. Oliverius, E. Honsova, P. Soucek,

. 2012 ; 32 (3) : 203-210.

Jazyk angličtina Země Nizozemsko

Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc12024001

Grantová podpora
NS9799 MZ0 CEP - Centrální evidence projektů

Histologically verified pairs (n=10) of pancreatic tumors and non-neoplastic tissues were used for quantitative real-time PCR and the stability of 24 reference genes was analyzed with geNorm and NormFinder software. Raw C{q} values correlated with the degree of RNA degradation. This correlation was abolished by normalization to C{q} of 18S endogenous control gene. Both geNorm and NormFinder programs suggested EIF2B1, ELF1, MRPL19, and POP4 as the same most stable genes. We have thus identified suitable reference genes for future expression studies in pancreatic carcinoma. Normalization method reducing the effects of RNA degradation on the quality of results was also developed.

Citace poskytuje Crossref.org

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc12024001
003      
CZ-PrNML
005      
20140904084716.0
007      
ta
008      
120815s2012 ne f 000 0#eng||
009      
AR
024    7_
$a 10.3233/dma-2011-0875 $2 doi
035    __
$a (PubMed)22377737
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng
044    __
$a ne
100    1_
$a Mohelníková-Duchoňová, Beatrice. $7 xx0233023 $u Department of Toxicogenomics, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic.
245    10
$a Evaluation of reference genes and normalization strategy for quantitative real-time PCR in human pancreatic carcinoma / $c B. Mohelnikova-Duchonova, M. Oliverius, E. Honsova, P. Soucek,
520    9_
$a Histologically verified pairs (n=10) of pancreatic tumors and non-neoplastic tissues were used for quantitative real-time PCR and the stability of 24 reference genes was analyzed with geNorm and NormFinder software. Raw C{q} values correlated with the degree of RNA degradation. This correlation was abolished by normalization to C{q} of 18S endogenous control gene. Both geNorm and NormFinder programs suggested EIF2B1, ELF1, MRPL19, and POP4 as the same most stable genes. We have thus identified suitable reference genes for future expression studies in pancreatic carcinoma. Normalization method reducing the effects of RNA degradation on the quality of results was also developed.
650    _2
$a senioři $7 D000368
650    _2
$a karcinom $x diagnóza $x genetika $x patologie $7 D002277
650    _2
$a eukaryotický iniciační faktor 2B $x genetika $7 D020717
650    _2
$a ženské pohlaví $7 D005260
650    _2
$a exprese genu $7 D015870
650    _2
$a stanovení celkové genové exprese $7 D020869
650    _2
$a lidé $7 D006801
650    _2
$a mužské pohlaví $7 D008297
650    _2
$a lidé středního věku $7 D008875
650    _2
$a mitochondriální proteiny $x genetika $7 D024101
650    _2
$a jaderné proteiny $x genetika $7 D009687
650    _2
$a pankreas $x metabolismus $x patologie $7 D010179
650    _2
$a nádory slinivky břišní $x diagnóza $x genetika $x patologie $7 D010190
650    _2
$a stabilita RNA $7 D020871
650    _2
$a kvantitativní polymerázová řetězová reakce $7 D060888
650    _2
$a ribonukleasy $x genetika $7 D012260
650    _2
$a ribonukleoproteiny $x genetika $7 D012261
650    _2
$a ribozomální proteiny $x genetika $7 D012269
650    _2
$a software $7 D012984
650    _2
$a transkripční faktory $x genetika $7 D014157
650    _2
$a nádorové biomarkery $x genetika $7 D014408
655    _2
$a časopisecké články $7 D016428
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Oliverius, Martin $7 xx0106430
700    1_
$a Honsová, Eva, $d 1956- $7 xx0075648
700    1_
$a Souček, Pavel $7 xx0060511
773    0_
$w MED00001413 $t Disease markers $x 1875-8630 $g Roč. 32, č. 3 (2012), s. 203-210
856    41
$u https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22377737 $y Pubmed
910    __
$a ABA008 $b sig $c sign $y m $z 0
990    __
$a 20120815 $b ABA008
991    __
$a 20140904085111 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 946149 $s 781329
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2012 $b 32 $c 3 $d 203-210 $i 1875-8630 $m Disease markers $n Dis Markers $x MED00001413
GRA    __
$a NS9799 $p MZ0
LZP    __
$a Pubmed-20120815/12/02

Najít záznam

Citační ukazatele

Možnosti archivace