The number of food-borne outbreaks caused by viruses increased in the European Union. In spite of it, the viruses are rarely determined as causes of food- or water-borne outbreaks in the Czech Republic. The unpreparedness of the national surveillance system for food-borne diseases was revealed recently when a norovirus water-borne outbreak occurred in May 2015 in Prague. The main problem was the amble determination of the causative agents and the source of the contamination. Therefore a rapid multiplex one-step screening methods will be introduced and monitoring together with molecular typing of food-borne viruses originating from clinical material and food- or water-borne outbreaks will be performed. Knowledge about the prevalence and ecology of these viruses will be improved in the Czech Republic. The methodology (molecular biological methods) used in the project will be distributed among the collaborative laboratories, their methodological expertise will be improved and cooperation between human and veterinary laboratories will be strengthen.

Počet virových epidemií způsobených kontaminovanými potravinami či vodou v Evropské unii stále vzrůstá. Přesto jsou virová agens v České republice jen výjimečně stanovena jako příčina takovýchto epidemií. O nepřipravenosti tuzemského systému sledování alimentárních onemocnění svědčí vodní norovirová epidemie v Praze (květen 2015), kde hlavním problémem bylo nedostatečně rychlé stanovení původců a zdroje kontaminace. Proto budou v řešeném projektu zavedeny metody sloužící k rychlé a multiplexní detekci virů způsobujících alimentární infekce a bude proveden monitoring spojený s molekulární typizací těchto virů v klinických vzorcích a vzorcích pocházejících z epidemií. Takto budou v České republice získány znalosti týkající se rozšíření a ekologie virů v souvislosti s alimentárními infekcemi. Molekulárně biologické metody použité v rámci projektu budou sdíleny se spolupracujícími laboratořemi, čímž bude zlepšena jejich metodická odbornost a bude posílena spolupráce mezi humánní a veterinární sférou.

• Klíčová slova
• NGS, NGS, sequencing, potraviny, food, sekvenování, norovirus, virus hepatitidy A, virus hepatitidy E, rychlá multiplexní detekce, RT-qPCR, xMAP suspenzní array, voda, dosledovatelnost, norovirus, hepatitis A virus, hepatitis E virus, rapid multiplex detection, RT-qPCR, xMAP suspension array, water, traceability,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR