Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
HNF1B is a transcription factor which plays a key role in ontogenesis and regulates the expression of numerous genes involved in cell cycle modulation. Epigenetic changes and mutations of HNF1B (TCF2) are involved in the tumorigenesis of certain tumors. Immuno-histochemically, these changes can be associated with the loss or overexpression of the HNF1B protein. The protein exists in several isoforms, whose number and precise characterization are presently not exactly known. Genome-wide association studies have found an association of certain single nucleotide polymorphisms with an increased or conversely decreased incidence of certain solid tumors, such as carcinomas of the prostate and endometrium. However, overall knowledge of the epigenetic and genetic changes of HNF1B and their relation to neoplasms is very limited. In our work we want to build on our previous project focused on the problematics of HNF-1B in female genital tract tumors, and extend the analysis to other types of solid tumors of this and other areas, in which HNF1B involvement in carcinogenesis can be expected.
HNF-1B je transkripční faktor, který hraje klíčovou roli při ontogenezi a reguluje expresi četných genů podílejících se na modulaci buněčného cyklu. Epigenetické změny a mutace HNF-1B (TCF2) se podílí na vzniku některých nádorů a na imunohistochemické úrovni se tyto změny mohou projevit ztrátou nebo zvýšenou expresí proteinu HNF-1ß. Protein se vyskytuje ve více izoformách, jejichž počet a přesná charakterizace však v současné době nejsou přesně známé. Celogenomové asociační studie prokázaly souvislost některých jednonukleotidových polymorfismů se zvýšenou či naopak sníženou incidencí některých solidních nádorů, jako jsou například karcinomy prostaty a endometria. Celkové znalosti týkající se epigenetických a zejména genetických změn HNF1B a jejich vztahu k nádorovým onemocněním jsou však velmi limitované. V naší práci chceme navázat na náš předchozí projekt zabývající se problematikou HNF1B u nádorů ženského genitálu a rozšířit analýzu na další typy solidních epitelových nádorů této a jiných oblastí, u kterých lze účast HNF1B v procesu karcinogeneze očekávat.
- MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- exprese genu MeSH
- hepatocytární jaderný faktor 1-beta genetika MeSH
- imunohistochemie metody MeSH
- lidé MeSH
- nádory genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- onkologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm
The primary objective of the project is to studying of HNF-1 beta expression, mutation and epigenetic changes in some carcinomas of female genital tract. This study will be performed using analysis of archival tissue samples bioptically examined in our department, either in the past during the years 2006-2012, or during the study (2013-2015). Including of the samples in the study is subject to obtaining of informed consent. Total number of samples examined is supposed to be 250-300 (from 220-250 patients). All samples will be anonymised. Methodology includes in all cases immunohistochemical analysis of protein expression. In selected cases, Real-Time PCR analysis will be performed with methyl-profiler primers for analyzing the DNA methylation status of CpG islands. Detection of mutation HNF-1 beta gene will be performed by sequenation analysis.
Navrhovaný projekt se primárně zaměřuje na studium exprese, mutace a epigenetických změn HNF-1ß v některých karcinomech ženského genitálu. Studie bude prováděna na bioptických vzorcích vyšetřených a archivovaných na našem pracovišti. Tato tkáň se odebírá v rámci diagnostických nebo terapeutických zákroků a je vyšetřena v rutinním bioptickém provozu, ať už v minulých letech (v období 2006-2012), nebo v průběhu studie. Celkem se bude jednat o 250-300 vzorků od 220-250 pacientek. Zařazení vzorků do studie je podmíněno podepsáním informovaného souhlasu. Vzorky budou anonymní a v rámci studie nebude možná identifikace jednotlivých pacientek. Metodika bude ve všech případech zahrnovat imunohistochemickou analýzu exprese proteinu. Ve vybraných případech bude provedena analýza real-time PCR s metyl-profilujícími primery ke zjištění metylačního stavu genu. Detekce mutací genu HNF-1ß bude provedena asi u 120 případů vybraných nádorů metodou sekvenační analýzy.
- MeSH
- exprese genu MeSH
- gynekologická onemocnění diagnóza genetika MeSH
- hepatocytární jaderný faktor 1-beta analýza MeSH
- imunohistochemie MeSH
- metylace MeSH
- mutace MeSH
- nádory ženských pohlavních orgánů diagnóza genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce metody využití MeSH
- sekvenční analýza DNA metody využití MeSH
- ženy MeSH
- Konspekt
- Gynekologie. Porodnictví
- NLK Obory
- gynekologie a porodnictví
- onkologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
1 svazek : ilustrace ; 30 cm
The project focuses on rapid direct mutation diagnosis in regulatory genes in polycystic kidney disease and atypical HUS. The knowledge of precise genetics background of these diseases can improve the care of these patients by preventing complications and targeting suitable therapy. 1) Determination of presence/absence of mutations in HNF1B gene in patients with ARPKD and ADPKD and establish HNF1B gene as a modifier gene of PKD. 2) Search for mutations in HNF1B gene in patients with PKD of unknown origin and in children with perinatal detected hyperechogenic kidneys. 3) Search for multigenic disease etiology of aHUS and to determine phenotype-genotype correlations and prognostic factors significant for therapy and risk of recurrence after renal transplantation in patients with aHUS.
Zvolili jsme si dvě závažné choroby ledvin, u nichž předpokládáme přítomnost změn v genech modifikující fenotyp či multigenní efekt postižení. A) Mutační analýza genu HNF1B jako možného chorobu modifikujícího genu u autozomálně dominantní i autozomálně recesivní polycystické choroby ledvin. B) Mutační analýza HNF1B genu u pacientů s polycystózou ledvin s nevysvětleným genetickým pozadím. C) Analýza změn v jednotlivých genech způsobujících atypický hemolyticko-uremický syndrom a jejich souhra v patogenezi onemocnění.
- MeSH
- cílená molekulární terapie MeSH
- dítě MeSH
- genetické nemoci vrozené MeSH
- hemolyticko-uremický syndrom etiologie genetika MeSH
- hepatocytární jaderný faktor 1-beta analýza MeSH
- mutace MeSH
- polycystická choroba ledvin etiologie genetika MeSH
- prognóza MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- Konspekt
- Pediatrie
- NLK Obory
- pediatrie
- genetika, lékařská genetika
- nefrologie
- urologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR