• MeSH
• biochemie MeSH
• ligandy MeSH
• radioligandová zkouška MeSH
• receptory léků fyziologie   MeSH
• vztahy mezi strukturou a aktivitou MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie

• Klíčová slova
• albumin - struktura - studie experimentální,

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie

Diplomová práce, která se zaměřila na možnou vazbu mezi Hsp65 a z něj odvozených peptidů na protein CD69 a na úlohu chaperoninu Hsp60.

• MeSH
• bakteriální proteiny MeSH
• chaperoniny MeSH
• chemické techniky analytické MeSH
• leukocyty MeSH
• ligandy MeSH
• proteiny tepelného šoku MeSH
• vazba proteinů MeSH
• Publikační typ
• vysokoškolské kvalifikační práce MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• alergologie a imunologie

Non-canonical DNA structures in regulatory regions of the human genome, such as DNA i-motifs, DNA G-quadruplexes, and mismatch/abasic sites containing double stranded DNAs, are important therapeutic targets for design and development of anti-cancer drugs. Currently established procedures for the identification of DNA targets and development of DNA-binding ligands/drugs are either based on data that abstracts from the influence of the specific intracellular microenvironment of cancer cells or on data that do not connect the ligand-induced biological phenotype to the direct action of the ligand on the desired DNA target. These shortcomings in the process of the therapeutic target identification as well as in the process of the drug development constitute significant source of bias being in part responsible for: i) high failure-rate of potential drugs in pre-clinical trials, ii) undesirable side-affects of drugs encountered in clinical practice, and iii) clinical manifestations of cancer cells’ drug insensitivity/resistance.

Nekanonické struktury DNA vyskytující se v regulačních oblastech lidského genomu, jako jsou DNA i-motivy, DNA G-kvadruplexy a dvou-řetězcové úseky DNA obsahující nepárující se báze či abazická místa, jsou důležitými cíli pro vývoj protinádorových léčiv. Současné postupy pro identifikaci cílových struktur DNA a vývoj DNA vazebných ligandů (léčiv) nezohledňují vliv specifického vnitrobuněčného prostředí nádorových buněk a neumožňují jednoznačně určit, zda-li je léčivem vyvolaný fenotyp následkem přímé interakce ligandu s vybranou cílovou strukturou DNA. Tyto nedostatky v procesu identifikace cílů protinádorové terapie a vývoje příslušných léčiv mají za následek: i) vysoký podíl potenciálních léčiv, které neuspějí v preklinických testech, ii) nežádoucí vedlejší účinky již zavedených léčiv v klinické praxi a iii) klinické projevy necitlivosti/resistence rakovinných buněk k danému léčivu.

• Klíčová slova
• non-B DNA, in-cell NMR spectroscopy, léčiva vazající DNA, interakce léčivo-DNA in vivo, DNA binding drugs, non-B DNA, in-cell NMR spectroscopy, DNA-ligand interactions in vivo,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• neurologie

The aim of the proposed study is to find combination(s) of genetic variants in 7 genes responsible for the genetic disposition to the development or serious course of ALD. Twelve polymorphisms in the 7 key genes will be analysed in min. 200 patients withALD and 450 healthy controls. The obtained allelic frequencies will be evaluated by statistical methods.

Cílem studie je nalezení kombinací genetických variant 7 genů zodpovědných za dědičnou dispozici k rozvoji alkoholového poškození jater (ALD), které představují zvýšené riziko pro vznik či závažný průběh ALD. U 200 pacientů s ALD a ve dvojnásobném vzorkukontrolní populace bude provedena analýza 12 polymorfismů v 7 klíčových genech. Nalezené frekvence alel u pacientů a kontrol budou porovnány statistickými metodami.

• MeSH
• alkoholická cirhóza jater etiologie   genetika   MeSH
• Kupfferovy buňky MeSH
• oxidační stres MeSH
• TNF-alfa MeSH
• transportní proteiny MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• hepatologie
• biologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The ultimate goal of this project is to improve care about the patients with cancer by developing new noninvasive diagnostic and possibly also theranostic imaging tools based on polysaccharide materials. They may serve as customizable toolbox-like carriers selectively delivering active imaging components (such as gadolinium complexes suitable for magnetic resonance imaging, fluorescent dyes or radionuclides) to the solid tumor tissue with self-targeting effect due to size (EPR effect) or due to selective binding to cancer cell-specific structures (ligand targeting). Polysaccharides represent nontoxic natural-sourced biodegradable biocompatible polymer carriers from renewable resources with promising properties for such use in medicine. The active ligand-based targeting will be due to affinity of D-galactosylated structures (such as guar gum itself) to asialoglycoprotein receptors highly overexpressed in hepatocellular carcinomas or based on muscarinic and benzodiazepine receptor ligands that tightly bind to melanoma cells.

Hlavním cílem projektu je zlepšení péče o onkologické pacienty vyvinutím nových diagnostik pro neinvazivní zobrazování založených na polysacharidických materiálech. Tyto systémy mohou sloužit jako adaptovatelné molekulární stavebnice pro cílené doručení aktivních komponent (gadoliniové komplexy pro zobrazování magnetickou rezonancí, fluorescenční barviva nebo radionuklidy) do tkáně pevných nádorů se samocílícím efektem díky velikosti (EPR efekt) nebo díky selektivní vazbě na nádorové buňky (ligandové cílení). Polysacharidy představují biodegradovatelné polymerní nosiče přírodního původu z obnovitelných zdrojů s výhodnými vlastnostmi pro taková použití v medicíně. Aktivní cílení bude dáno afinitou D-galaktosylovaných struktur k asialoglykoproteinovým receptorům, které jsou vysoce exprimované v hepatocelulárních karcinomech, a na pevné vazbě ligandů pro muskarinové a benzodiazepinové receptory na melanomové buňky.

• MeSH
• glykogen MeSH
• karcinom diagnostické zobrazování   MeSH
• magnetická rezonanční tomografie metody   MeSH
• melanom diagnostické zobrazování   MeSH
• nádory diagnostické zobrazování   MeSH
• polysacharidy MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The project outlines the role of CD14+CD16+ monocyte subpopulation in transplant reactions against the kidney allograft and in antibody mediated rejection. Monitoring of peripheral monocyte subpopulations will be performed with respect to clinical parameters, occurence of allospecific antibodies, and immunosupressive schedule. The determination of T regulatory cells (CD4+CD25+Foxp3+) and gene polymorphisms of CD16 molecule will be assessed. In a model of human monocyte/macrophage cell line THP-1, the expression of CD14+CD16+ phenotype will be induced by cytokines and the genotype will be assessed with respect to chemokine and cytokine production. Cytokines from IL-1 family (IL-1beta, IL-18, IL-33) and TNF alfa and furthermore, cytokines associated withTh1/Th2/Th17 polarization (IFN gama, IL-4, IL-13, IL-23, IL-17) will be used as stimuli. The project may contribute to better monitoring of kidney transplant patients and new information on cytokine interactions in mononuclear phagocyte differentiation.

Projekt vymezuje úlohu monocytární subpopulace CD14+CD16+ v transplantačních reakcích proti ledvinnému alotransplantátu a u protilátkové rejekce. Monitorováno bude zastoupení subpopulací monocytů v periferní krvi osob po transplantaci ledviny s ohledem na klinický stav, výskyt alospecifických protilátek a imunosupresivní režim. Stanoveno bude také zastoupení T regulačních buněk (CD3+CD25+Foxp3+) a vyšetřeny genové polymorfismy CD16 molekuly. Na modelu lidské monocyto-makrofágové line THP-1 bude pomocí cytokinů indukována a dále modulována exprese CD14+CD16+ fenotypu s ohledem na současné změny v cytokinovém a chemokinovém genotypu. Ke stimulaci budou využity prozánětlivé cytokiny z rodiny IL-1 (IL-1beta, IL-18, IL-33) a TNF alfa a dále i cytokiny související s koncepcí Th1/Th2/Th17 polarizace (IFN gama, IL-4, IL-13, IL-23, IL-17). Projekt může přispět ke kvalitnějšímu monitorování pacientů po transplantaci ledviny a novým poznatkům o cytokinových interakcích při diferenciaci mononukleárních fagocytů.

• MeSH
• buněčná diferenciace MeSH
• CD antigeny analýza   krev   MeSH
• cytokiny analýza   MeSH
• interleukin-12 sekrece   MeSH
• monitorování imunologické MeSH
• NF-kappa B fyziologie   MeSH
• podskupiny lymfocytů MeSH
• prekurzorové buňky monocytů-makrofágů MeSH
• rejekce štěpu MeSH
• TNF-alfa sekrece   MeSH
• transplantace ledvin imunologie   MeSH
• výběr pacientů MeSH
• zkracování telomer MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• nefrologie
• transplantologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The research aim of the multidisciplinary project is to develop advanced nanoparticle systems for rapid imaging of thrombi in the cardiovascular system, especially in the brain (cerebral ictus), using in vivo imaging technique MRI. The efficacy of the system will be tested on preclinical rat and rabbit animal models. Contrast agents are based on nanoliposomes labelled with gadolinium complexes for rapid and sensitive imaging with the use of MRI. Targeting of nanoliposomes to thrombi will be achieved by binding of specific ligands to the nanoliposomal surface by means of activated polyethylene glycol spacers. The size of liposomes will be approximately 80 nm. This will ensure their easy penetration through the clot network structure, and decrease penetration to the liver through fenestrations in the endothelial lining of capillary vessels in the hepatic vascular system. RGD peptides will be targeted by specific ligands to both activated thrombocytes and fibrin fibres. New ligands will be protein binders, specifically recognizing fibrin fibres.

Výzkumným cílem tohoto multidisciplinárního projektu bude vývoj pokročilých nanočásticových systémů pro rychlé zobrazení trombů v kardiovaskulárním systému, zejména v mozku (cerebrální iktus), za použití in vivo zobrazovacích techniky MRI. Efektivita těchto systémů bude testována na preklinických animálních modelech potkanů a králíků. Pro rychlé a citlivé zobrazování pomocí MRI budou pro kontrastní látky využity nanoliposomy značené komplexy gadolinia. Cílení k trombu bude dosaženo vazbou specifických ligandů na povrch nanoliposomů pomocí aktivovaných polyetylenglykolových spacerů. Velikost připravených nanoliposomů bude přibližně 80 nm, která zajistí snadné proniknutí nanoliposomů do struktury trombu a sníží pronikání do jater prostřednictvím fenestrací v endoteliální výstelce kapilár jaterního cévního systému. RGD peptidy představují specifické ligandy cílené k aktivovaným krevním destičkám a vláknům fibrinu. Nové ligandy budou představovat proteinové bindery, které specificky rozpoznávají fibrinová vlákna.

• MeSH
• cévní mozková příhoda MeSH
• intravitální mikroskopie MeSH
• kontrastní látky MeSH
• králíci MeSH
• krysa rodu rattus MeSH
• liposomy MeSH
• magnetická rezonanční tomografie metody   MeSH
• magnetické nanočástice MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• trombóza diagnostické zobrazování   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• králíci MeSH
• krysa rodu rattus MeSH
• zvířata MeSH

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Inactivation of acetylcholinestarse (AChE) in nerve and muscle by organophosphates is the toxic mechanism common to both nerve agents and pesticides. Standard countermeasures against OP poisoning involves muscarinic inhibition and the use of oxime a reactivator. The latter, however, is limited by a versatility ox oximes and by the low penetration of reactivators into the brain. The aim of this project is to develop oxime reactivators with better penetration of the blood brain barrier (BBB). Namely, monoquaternary oximes with balanced physico-chemical properties containing selected nuclophile capable of AChE reactivation and a ligand of peripherial anionic site ensuring the binding to the enzyme. Unique reactivators will be prepared and by application of series of in vitro and in vivo tests compounds will be evaluated and described. The best candidate of the preclinical development and with practical potential will be indentified

Otrava organofosfáty (OP) tedy inaktivace acetylcholinesterasy (AChE) v nervových zakončeních a svalech, je toxický mechanismus společný pro nervově paralytické látky (NPL) a pesticidy. Standardní protiopatření proti otravě OP zahrnuje inhibici muskarinových receptorů a využití reaktivátoru AChE ( oximu). Použití posledně jmenovaného je však limitováno (ne)univerzálností reaktivátorů vůči různým OP a jejich nízká penetrace do mozku. Cílem tohoto projektu je vývoj oximů s lepší penetrací přes hematoencefalickou bariéru, (HEB). Konkrétně se jedná o monokvarterní oximy s vyváženými fyz.-chem vlastnostmi obsahující vytipovaný nuklofil zajišťující reaktivaci a ligand periferního anionického místa zajišťující vazbu na enzym. Budou připraveny unikátních monokvarterní reaktivátory, u kterých lze očekávat výrazně lepší permeaci přes HEB v porovnání s běžně používanými biskvarterními reaktivátory. Kombinací in vitro a in vivo technik zajistíme hodnocení účinnosti, popíšeme vlastnosti nových oximů a

• MeSH
• antidota chemická syntéza   terapeutické užití   MeSH
• enzymové reaktivátory terapeutické užití   MeSH
• hematoencefalická bariéra účinky léků   MeSH
• intravitální mikroskopie MeSH
• lidé MeSH
• otrava organofosfáty farmakoterapie   MeSH
• oximy terapeutické užití   MeSH
• techniky in vitro MeSH
• vyvíjení léků MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• hodnotící studie MeSH

• Konspekt
• Farmacie. Farmakologie
• NLK Obory
• farmacie a farmakologie
• veřejné zdravotnictví
• toxikologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR