• MeSH
• Betacoronavirus MeSH
• chřipka lidská MeSH
• COVID-19 MeSH
• epidemický výskyt choroby MeSH
• infekce dýchací soustavy MeSH
• jednotky intenzivní péče MeSH
• klinické lékařství MeSH
• koronavirus MERS MeSH

• Konspekt
• Veřejné zdraví a hygiena
• NLK Obory
• veřejné zdravotnictví
• infekční lékařství
• NLK Publikační typ
• publikace WHO

S využitím expresního profilováni identifikujeme intracelulární (z endomyokardiálních biopsií) a cirkulující (z plasmy, moči a periferních mononukleárních buněk) miRNA, které rozliší pacienty po srdeční transplantaci prodělávající rejekci od jedinců bez rejekce; dále identifikujeme profil miRNA, který od sebe odliší buněčnou rejekci od rejekce zprostředkované protilátkami. Následně validujeme panel miRNA, který umožní komfortnější neinvazivní detekci obou typů rejekce srdečního štěpu, bez nutnosti ekonomicky i technicky náročné invazivní diagnostiky.; Using expression profiling arrays we will identify intracellular (from endomyocardial biopsies) as well as circulating (from plasma, urine and peripheral blood mononuclear cells) miRNAs that will distinguish heart transplant patients with graft rejection from those without rejection; different miRNA profile during cellular and antibody-mediated rejection will be identified. We will further validate panel of miRNAs that will enable more comfort and non-invasive detection of both types of rejection without the need of economically and technically demanding invasive diagnostics.

• MeSH
• analýza moči metody   MeSH
• biochemická analýza krve metody   MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• biopsie metody   MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• lidé MeSH
• mikro RNA analýza   MeSH
• rejekce štěpu diagnóza   MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• transplantace srdce MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• transplantologie
• kardiologie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Předčasný odtok plodové vody před 37. týdnem těhotenství je v zhruba 30% komplikován mikrobiální invazí do amniální dutiny která vede k rozvoji intraamniální infekce. Potvrzení či vyloučení intraamniální infekce je zásadní informací determinující optimální management pacientek s předčasným odtokem plodové vody. V současné době jsme schopni potvrdit či vyloučit intraamniální infekci pouze invazivním vyšetřením plodové vody. Naše recentní studie ukázala vztah mezi cervikální mikrobiotou a výskytem intraamniální infekcí. Přítomnost Lactobacillus crispatus jako dominantní bakterie v cervikální tekutině u pacientek s předčasným odtokem plodové vody byla spjato s nepřítomností intraamniální infekce. Naopak, pokud jsou dominantními bakteriemi v cervikální tekutině Sneathia sanguinegens či Gardnerella vaginalis, riziko intraamniální infekce je vysoké. Hlavním cílem grantu je ověřit vztah mezi přítomností tří dominantních bakterií v cervikální tekutině a intraamniální infekcí pomocí specifického real-time PCR. Tento přístup by umožnil optimalizovat a individualizovat management PPROM.; Preterm prelabor rupture of membranes (PPROM) is complicated in approximately 30% by microbial invasion of the amniotic cavity that leads to the development of intraamniotic inflammation followed by histological chorioamnionitis. An optimal management of PPROM is dependent on knowledge about the presence or absence of intraamniotic infection. Unfortunately, only the evaluation of an invasive sample of amniotic fluid can provide this information. Our recent study has shown the association between cervical microbiota and intraamniotic infection. The presence of Lactobacillus crispatus as dominant bacteria in the cervical fluid was associated with the absence of intraamniotic infection. Vice versa, the presence of either Gardnerella vaginalis or Sneathia sanguinegens as dominant bacteria was associated with a higher risk of intraamniotic infection in women with PPROM. Main aim of the project is a validation of these findings by simple method – real time PCR. This approach can optimize and individualize management of PPROM.

• MeSH
• bakteriologické techniky MeSH
• cervix uteri MeSH
• Gardnerella vaginalis MeSH
• infekční komplikace v těhotenství diagnóza   MeSH
• Lactobacillus crispatus MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiota MeSH
• předčasný odtok plodové vody MeSH
• předčasný porod MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Konspekt
• Gynekologie. Porodnictví
• NLK Obory
• infekční lékařství
• gynekologie a porodnictví
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Kondenzát vydechovaného vzduchu (EBC) představuje bohatý zdroj biomarkerů, které mohou poskytnout cenné informace o respiračních stejně jako o systémových onemocněních. Nalezení neinvazivních metod pro včasnou detekci poškození plic, zánětu a infekčních komplikací u chronických onemocnění, jako je cystická fibróza (CF) nebo astma bronchiale (AB) by bylo velmi přínosné. Navrhujeme proměřit proteinové "dechové otisky" z EBC, tvořící molekulární podpisy plicního zánětu a specifických respiračních bakteriálních infekcí u pacientů s CF a AB. Předpokládáme, že analýza EBC může odhalit biomarkery specifické pro tíži zánětu a identifikovat infekce způsobené oportunními patogeny, jako je např. P. aeruginosa (PA). Tyto dechové profily plánujeme korelovat s nálezy plicní mikroflóry pomocí tradičních metod a s tíží onemocnění cystickou fibrózou. Předpokládáme, že naše studie urychlí využití analýzy EBC jako nového nástroje pro stanovení správné diagnózy AB a umožní neinvazivní sledování aktivity onemocnění CF, účinnosti léčby a zpřesní diagnostiku oportunních infekcí.; Exhaled breath condensate (EBC) represents a rich source for countless biomarkers that can provide valuable information about respiratory as well as systemic diseases. Finding non-invasive methods for early detection of lung injury, inflamation and infectious complications in chronic diseases like Cystic fibrosis (CF) or bronchial asthma (AB) would be highly beneficial. We propose to establish EBC “breath-prints” revealing molecular signatures of pulmonary inflammation and specific respiratory bacterial infections of CF patients and AB. We hypothesize that the analysis of EBC can reveal biomarkers specific for severity of the inflammation and infection caused by opportunistic pathogens such as P. aeruginosa. With these breath-prints, we also propose to establish correlations between respiratory microbiota using traditional methods and CF lung disease severity. Together, our studies will advance the development and validation of EBC as a novel tool for the proper diagnosis of AB and monitoring of CF disease activity, treatment efficacy and diagnosis of opportunistic infections.

• MeSH
• biologické markery MeSH
• bronchiální astma diagnóza   genetika   MeSH
• cystická fibróza diagnóza   genetika   MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• lidé MeSH
• proteomika metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• pneumologie a ftizeologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Výdechový plicní kondenzát (exhaled breath condensate, EBC) představuje bohatý zdroj nesčetných biomarkerů, které mohou poskytnout cenné informace o respiračních i systémových onemocněních. Identifikace neinvazivních metod pro sensitivní a specifickou diagnostiku karcinomu plic, která by jej odlišila od jiných plicních nemocí, často doprovázejících nádor (zánět, kouření, infekce), by měla mimořádnou klinickou hodnotu. Proteomická analýza EBC má realistický potenciál detekovat časné změny ve stavu dýchacích cest a pravděpodobně i v dalších orgánech. Tato metoda by mohla nahradit nebo doplnit některé invazivní techniky odběru biologického materiálu v budoucnosti a umožnit neinvazivní skrínink karcinomu plic v rizikových populacích. Předkládaný projekt umožní vývoj a validaci proteomických biomarkerů v EBC pro časnou diagnostiku plicních nádorů, monitorování aktivity onemocnění a stanovení jeho prognózy, případně predikci terapeutické odpovědi.; Exhaled breath condensate (EBC) represents a rich source for countless biomarkers that can provide valuable information about respiratory as well as systemic diseases. Finding non-invasive methods for early detection of lung cancer on the background of underlying lung injury (inflammation, smoking, infections, etc.) would be highly beneficial. Proteomic analysis of EBC has the potential to detect early changes in the status of the respiratory system and possibly other organs. It could also replace or complement some invasive sampling methods in future and provide non-invasive lung cancer screening technique. Together, our studies will advance the development and validation of EBC as a novel tool for the proper diagnosis of lung cancer and monitoring of disease activity, treatment efficacy and prognosis.

• MeSH
• dechové testy metody   MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory plic diagnóza   genetika   MeSH
• proteomika metody   MeSH
• tekutá biopsie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• nádory radioterapie   MeSH
• nukleární lékařství metody   MeSH
• radioterapie metody   MeSH
• Publikační typ
• učebnice MeSH

• Konspekt
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• onkologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

• MeSH
• nádory močového měchýře MeSH
• urologie MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• NLK Obory
• urologie
• onkologie

• MeSH
• patologie ústní dutiny MeSH
• stomatologie MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Stomatologie
• NLK Obory
• zubní lékařství

Neinvazivní vyšetření molekulárních markerů u kolorektálního karcinomu může umožnit efektivní chirurgický zákrok díky včasné diagnóze onemocnění či jeho recidivy. Abychom mohli zaujmout tu nejvhodnější diagnostickou a léčebnou strategii musíme znát molekulární charakteristiku nádoru, stejně jako jeho klinické a histologické chování. Proto je zde naléhavá potřeba hledat nové neinvazivní biomarkery, které by pomohly k včasnému odhalení KRC nebo jeho recidivy. Mezi možné biomarkery pro včasnou detekci KRC by se mohla přiřadit microRNA (miRNA) nebo muciny. Plánovaná studie může vnést světlo do problému časné detekce a diagnózy KRC (nebo detekce KRC relapsu), které jsou nezbytné pro úspěšnou léčbu.; Non-invasive screening of molecular biomarkers may enable effective surgical intervention through an early diagnosis of the disease. To adopt to the most appropriate diagnostic and therapeutic strategy we need to know molecular factors of the tumor as well as its clinical and histological features.Among possible biomarkers for early detection microRNAs (miRNAs) or mucins that exhibit CRC specific expression may be applied. This study may shed light on the problem of early CRC diagnosis and detection (or CRC relapse detection), which is essential for successful treatment.

• MeSH
• časná diagnóza MeSH
• kolorektální nádory diagnóza   MeSH
• mikro RNA analýza   MeSH
• muciny analýza   MeSH
• předoperační vyšetření MeSH
• recidiva MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gastroenterologie
• onkologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

V patogenezi komplikací chronické hepatitidy C hraje roli oxidační stres, indukovaný virem hepatitidy C (HCV). Hemoxygenáza (HMOX), katalyzující degradaci hemu na oxid uhelnatý, železo a biliverdin, který je biliverdinreduktázou A (BVRA) redukován na bilirubin, chrání játra před oxidačním stresem. Dosud bylo prokázáno, že u HCV infekce je exprese HMOX v jaterní tkáni snížena a že biliverdin in vitro interferuje s replikací viru. V naší pilotní retrospektivní studii jsme zjistili, že exprese BVRA v PBMC může predikovat odpověď pacientů s HCV na standardní terapii. V navrhované prospektivní klinické studii (registrované pod ID: NCT01112033) budeme hledat asociaci exprese BVRA před zahájením léčby v jaterní tkáni a PBMC s eliminací viru, histologickým nálezem a s odpovědí na terapii. Pokud studie potvrdí naše předběžná data, analýza exprese BVRA v PBMC by se mohla stát jednoduchým neinvazivním testem, který by mohl přispět k predikci odpovídavosti na protivirovou terapii ještě před jejím zahájením.; Heme oxygenase (HMOX), an enzyme induced in response to oxidative stress, catalyzes degradation of pro-oxidative heme to carbon monoxide (CO), iron and biliverdin, which is reduced to bilirubin by biliverdin reductase A (BVRA). Hepatic expression of HMOX is reduced during hepatitis C infection (HCV) in vivo. Biliverdin seems to interfere with HCV replication in vitro. Recently, in the retrospective pilot study, we have found significant association between BVRA expression in PBMC of HCV infected patients prior to antiviral treatment and the response to the therapy. In the proposed prospective clinical trial (registered under ID: NCT01112033), we will study the association of the pre-treatment expression of BVRA in the liver and PBMC with viral clearance, disease progression and treatment response. Analyzing BVRA expression in PBMC might become a promising diagnostic tool. This simple non-invasive test would help to predict which patients will respond to standard antiviral therapy.

• MeSH
• biopsie MeSH
• časná diagnóza MeSH
• exprese genu MeSH
• hemová oxygenasa (decyklizující) MeSH
• Hepacivirus MeSH
• hepatocelulární karcinom etiologie   prevence a kontrola   MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• oxidační stres MeSH
• oxidoreduktasy působící na CH-NH vazby MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• biochemie
• hepatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR